MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014323	GGC	2	6	295406	295411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309620
7502	NC_014323	GCT	3	9	295412	295420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309620
7503	NC_014323	GC	3	6	295433	295438	0 %	0 %	50 %	50 %	300309620
7504	NC_014323	CCG	2	6	295457	295462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309620
7505	NC_014323	GGGGCT	2	12	295502	295513	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300309620
7506	NC_014323	TCA	2	6	295540	295545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309620
7507	NC_014323	CATTG	2	10	295553	295562	20 %	40 %	20 %	20 %	300309620
7508	NC_014323	CG	4	8	295571	295578	0 %	0 %	50 %	50 %	300309620
7509	NC_014323	TGT	2	6	295639	295644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309620
7510	NC_014323	CGG	2	6	295667	295672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309620
7511	NC_014323	CG	4	8	295673	295680	0 %	0 %	50 %	50 %	300309620
7512	NC_014323	AGC	2	6	295706	295711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309620
7513	NC_014323	CTG	2	6	295719	295724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309620
7514	NC_014323	CG	3	6	295827	295832	0 %	0 %	50 %	50 %	300309620
7515	NC_014323	CCG	2	6	295833	295838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309620
7516	NC_014323	TGG	2	6	295987	295992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309620
7517	NC_014323	TTCA	2	8	296005	296012	25 %	50 %	0 %	25 %	300309620
7518	NC_014323	AGTG	2	8	296057	296064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_014323	AAT	2	6	296089	296094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_014323	CCT	2	6	296166	296171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309621
7521	NC_014323	CGT	2	6	296184	296189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7522	NC_014323	TCT	2	6	296206	296211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309621
7523	NC_014323	CAG	2	6	296344	296349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7524	NC_014323	CGC	2	6	296350	296355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309621
7525	NC_014323	AGG	2	6	296406	296411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309621
7526	NC_014323	TGGCC	2	10	296437	296446	0 %	20 %	40 %	40 %	300309621
7527	NC_014323	TTG	2	6	296519	296524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309621
7528	NC_014323	TCT	2	6	296547	296552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309621
7529	NC_014323	GGC	2	6	296620	296625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7530	NC_014323	GGC	2	6	296727	296732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7531	NC_014323	AGG	2	6	296733	296738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309621
7532	NC_014323	CAT	2	6	296786	296791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309621
7533	NC_014323	ACC	2	6	296805	296810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309621
7534	NC_014323	CGC	2	6	297061	297066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309621
7535	NC_014323	CAG	2	6	297083	297088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7536	NC_014323	GGC	2	6	297121	297126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7537	NC_014323	CGT	2	6	297148	297153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7538	NC_014323	ATGG	2	8	297289	297296	25 %	25 %	50 %	0 %	300309621
7539	NC_014323	TGA	2	6	297303	297308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309621
7540	NC_014323	TGA	2	6	297450	297455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309621
7541	NC_014323	GTC	2	6	297461	297466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7542	NC_014323	CGA	2	6	297496	297501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7543	NC_014323	CG	3	6	297552	297557	0 %	0 %	50 %	50 %	300309621
7544	NC_014323	CAC	2	6	297574	297579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309621
7545	NC_014323	CGTATC	2	12	297593	297604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309621
7546	NC_014323	ATC	2	6	297687	297692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309621
7547	NC_014323	G	7	7	297712	297718	0 %	0 %	100 %	0 %	300309621
7548	NC_014323	ACG	2	6	297723	297728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7549	NC_014323	ACC	2	6	297828	297833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309621
7550	NC_014323	CGC	2	6	297886	297891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309621
7551	NC_014323	TCAA	2	8	297900	297907	50 %	25 %	0 %	25 %	300309621
7552	NC_014323	CG	3	6	297948	297953	0 %	0 %	50 %	50 %	300309621
7553	NC_014323	CTGC	2	8	297988	297995	0 %	25 %	25 %	50 %	300309621
7554	NC_014323	GAG	2	6	298064	298069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309621
7555	NC_014323	GCA	2	6	298084	298089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7556	NC_014323	TGC	2	6	298123	298128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7557	NC_014323	TGG	2	6	298231	298236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309621
7558	NC_014323	ACGC	2	8	298301	298308	25 %	0 %	25 %	50 %	300309621
7559	NC_014323	GCA	2	6	298459	298464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7560	NC_014323	GCC	3	9	298481	298489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309621
7561	NC_014323	GCG	2	6	298512	298517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7562	NC_014323	CGA	2	6	298540	298545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309621
7563	NC_014323	GCTG	2	8	298552	298559	0 %	25 %	50 %	25 %	300309621
7564	NC_014323	GCG	2	6	298619	298624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7565	NC_014323	GAT	2	6	298697	298702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309621
7566	NC_014323	CCGA	2	8	298730	298737	25 %	0 %	25 %	50 %	300309621
7567	NC_014323	AGA	2	6	298743	298748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309621
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7569	NC_014323	GGC	2	6	298784	298789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7570	NC_014323	GCG	2	6	298823	298828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309621
7571	NC_014323	TGA	2	6	298879	298884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309621
7572	NC_014323	CCG	2	6	298916	298921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309622
7573	NC_014323	CGG	2	6	298944	298949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309622
7574	NC_014323	TCA	2	6	299018	299023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309622
7575	NC_014323	TCA	2	6	299228	299233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309622
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7579	NC_014323	CTA	2	6	299490	299495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309622
7580	NC_014323	CGC	2	6	299502	299507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309622
7581	NC_014323	GGCTC	2	10	299517	299526	0 %	20 %	40 %	40 %	300309622
7582	NC_014323	TCT	2	6	299652	299657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309622
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7585	NC_014323	GCA	2	6	299717	299722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309622
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7587	NC_014323	CTT	2	6	299784	299789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309622
7588	NC_014323	CTG	2	6	299794	299799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309622
7589	NC_014323	CGC	2	6	299808	299813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309622
7590	NC_014323	CCA	2	6	299978	299983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309622
7591	NC_014323	GGA	2	6	300018	300023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309622
7592	NC_014323	TGG	2	6	300083	300088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309622
7593	NC_014323	GAC	2	6	300121	300126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309622
7594	NC_014323	AGG	2	6	300137	300142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309622
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7596	NC_014323	TGG	2	6	300230	300235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309622
7597	NC_014323	AGA	2	6	300236	300241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309622
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7601	NC_014323	CAGGC	2	10	300595	300604	20 %	0 %	40 %	40 %	300309622
7602	NC_014323	GAAG	2	8	300711	300718	50 %	0 %	50 %	0 %	300309622
7603	NC_014323	GGC	3	9	300780	300788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309622
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7605	NC_014323	GAG	2	6	300967	300972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309622
7606	NC_014323	GAA	2	6	301011	301016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309622
7607	NC_014323	ATTT	2	8	301125	301132	25 %	75 %	0 %	0 %	300309623
7608	NC_014323	TGA	2	6	301174	301179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309623
7609	NC_014323	CTAT	2	8	301200	301207	25 %	50 %	0 %	25 %	300309623
7610	NC_014323	CGC	2	6	301208	301213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309623
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7616	NC_014323	GCA	2	6	302017	302022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309623
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7619	NC_014323	GCC	2	6	302170	302175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309623
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7621	NC_014323	TGG	2	6	302341	302346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309623
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7867	NC_014323	GC	3	6	312936	312941	0 %	0 %	50 %	50 %	300309633
7868	NC_014323	TCC	2	6	312952	312957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309633
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7992	NC_014323	GCA	2	6	317524	317529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309639
7993	NC_014323	ATG	2	6	317547	317552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309639
7994	NC_014323	GCA	2	6	317634	317639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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