MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014323	TGC	2	6	257650	257655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6502	NC_014323	CAG	2	6	257720	257725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6503	NC_014323	TGT	2	6	257775	257780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309592
6504	NC_014323	CCA	2	6	257842	257847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309592
6505	NC_014323	GC	3	6	257859	257864	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6506	NC_014323	ATG	2	6	257951	257956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309592
6507	NC_014323	GGC	2	6	257960	257965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6508	NC_014323	GC	3	6	258024	258029	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6509	NC_014323	GC	3	6	258090	258095	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6510	NC_014323	CGC	2	6	258133	258138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
6511	NC_014323	CCG	2	6	258153	258158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
6512	NC_014323	GCTG	2	8	258190	258197	0 %	25 %	50 %	25 %	300309592
6513	NC_014323	GC	3	6	258266	258271	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6514	NC_014323	CCG	2	6	258273	258278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
6515	NC_014323	GC	3	6	258341	258346	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6516	NC_014323	CGC	2	6	258400	258405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
6517	NC_014323	TCG	2	6	258594	258599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6518	NC_014323	CCT	2	6	258607	258612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309592
6519	NC_014323	GGC	2	6	258654	258659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6520	NC_014323	GCG	2	6	258691	258696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6521	NC_014323	GCG	2	6	258701	258706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6522	NC_014323	GCA	2	6	258802	258807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6523	NC_014323	CTG	3	9	258830	258838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6524	NC_014323	TGCG	2	8	259028	259035	0 %	25 %	50 %	25 %	300309592
6525	NC_014323	GCT	2	6	259109	259114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6526	NC_014323	TCC	2	6	259119	259124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309592
6527	NC_014323	GC	3	6	259125	259130	0 %	0 %	50 %	50 %	300309592
6528	NC_014323	GCG	2	6	259151	259156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6529	NC_014323	GGC	2	6	259186	259191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6530	NC_014323	CGG	2	6	259255	259260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309592
6531	NC_014323	GCA	2	6	259267	259272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6532	NC_014323	GGCT	2	8	259274	259281	0 %	25 %	50 %	25 %	300309592
6533	NC_014323	AGA	2	6	259288	259293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309592
6534	NC_014323	CTG	2	6	259346	259351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6535	NC_014323	TGA	2	6	259399	259404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309592
6536	NC_014323	GTC	2	6	259460	259465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6537	NC_014323	CGC	2	6	259490	259495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309592
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6539	NC_014323	TGA	2	6	259672	259677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309592
6540	NC_014323	TCGG	2	8	259703	259710	0 %	25 %	50 %	25 %	300309592
6541	NC_014323	CAG	2	6	259739	259744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6542	NC_014323	GCA	3	9	259834	259842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309592
6543	NC_014323	CGG	3	9	260009	260017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_014323	AG	3	6	260046	260051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_014323	A	6	6	260082	260087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_014323	ACC	2	6	260134	260139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309593
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6551	NC_014323	CGCC	2	8	260388	260395	0 %	0 %	25 %	75 %	300309593
6552	NC_014323	GCC	2	6	260398	260403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309593
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6554	NC_014323	CTG	2	6	260479	260484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309593
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6557	NC_014323	GCCC	2	8	260663	260670	0 %	0 %	25 %	75 %	300309594
6558	NC_014323	GCT	2	6	260697	260702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309594
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6560	NC_014323	GCTA	2	8	260788	260795	25 %	25 %	25 %	25 %	300309594
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6562	NC_014323	CTG	2	6	260803	260808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309594
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6570	NC_014323	GC	3	6	261089	261094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_014323	GCC	2	6	261098	261103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_014323	T	6	6	261107	261112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_014323	GCG	2	6	261124	261129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_014323	AAT	2	6	261135	261140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_014323	GAA	2	6	261169	261174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_014323	TTCC	2	8	261228	261235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_014323	CCCG	2	8	261239	261246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6578	NC_014323	CAAG	2	8	261281	261288	50 %	0 %	25 %	25 %	300309595
6579	NC_014323	ACC	2	6	261292	261297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309595
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6581	NC_014323	CGC	2	6	261342	261347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309595
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6586	NC_014323	CG	3	6	261579	261584	0 %	0 %	50 %	50 %	300309595
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6591	NC_014323	GC	3	6	261826	261831	0 %	0 %	50 %	50 %	300309595
6592	NC_014323	CCG	2	6	261876	261881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309595
6593	NC_014323	CAG	2	6	261921	261926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309595
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6599	NC_014323	GGC	2	6	262126	262131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309596
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6607	NC_014323	ACG	2	6	262604	262609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309596
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6609	NC_014323	GC	3	6	262639	262644	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6610	NC_014323	GC	4	8	262727	262734	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6611	NC_014323	TCT	2	6	262742	262747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309596
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6613	NC_014323	GAAGA	2	10	262759	262768	60 %	0 %	40 %	0 %	300309596
6614	NC_014323	GGCT	2	8	262819	262826	0 %	25 %	50 %	25 %	300309596
6615	NC_014323	GGCCTG	2	12	262903	262914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309596
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6617	NC_014323	GCCG	2	8	263001	263008	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6618	NC_014323	ATC	2	6	263014	263019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309596
6619	NC_014323	TGC	2	6	263042	263047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6620	NC_014323	GCTGGA	2	12	263100	263111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300309596
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6623	NC_014323	CTG	2	6	263170	263175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6624	NC_014323	GGT	2	6	263181	263186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309596
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6735	NC_014323	CTTC	2	8	267028	267035	0 %	50 %	0 %	50 %	300309598
6736	NC_014323	TCG	2	6	267040	267045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
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6740	NC_014323	CGGCGC	2	12	267212	267223	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6741	NC_014323	ATC	2	6	267228	267233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309598
6742	NC_014323	GCG	2	6	267301	267306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309598
6743	NC_014323	GCC	2	6	267308	267313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
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6990	NC_014323	CGC	2	6	276361	276366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309605
6991	NC_014323	GCC	2	6	276368	276373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309605
6992	NC_014323	GC	3	6	276408	276413	0 %	0 %	50 %	50 %	300309605
6993	NC_014323	TGA	2	6	276414	276419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309605
6994	NC_014323	CGA	2	6	276436	276441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309605
6995	NC_014323	CTG	2	6	276443	276448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309605
6996	NC_014323	GGT	2	6	276454	276459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309605
6997	NC_014323	TCA	3	9	276540	276548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309605
6998	NC_014323	CGC	2	6	276553	276558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309605
6999	NC_014323	CTG	2	6	276617	276622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309605
7000	NC_014323	GGC	2	6	276661	276666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309605

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