MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 6

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014303	CGGG	2	8	203	210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014303	CGG	2	6	347	352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014303	GAG	2	6	384	389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014303	CGGAGC	2	12	433	444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014303	ACCG	2	8	478	485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014303	AAC	2	6	486	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014303	CGA	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014303	AAC	2	6	507	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014303	TTA	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014303	GTG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014303	GTC	2	6	604	609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014303	TAG	3	9	610	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014303	GTA	3	9	620	628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014303	GTA	16	48	631	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014303	GGT	2	6	725	730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014303	GGT	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014303	GCC	2	6	832	837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014303	GGT	2	6	860	865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014303	GTTC	2	8	914	921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014303	CGGA	2	8	970	977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014303	GTGG	2	8	991	998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014303	ACC	2	6	1003	1008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014303	CTGT	2	8	1073	1080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014303	CT	3	6	1082	1087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014303	CTGTC	2	10	1091	1100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014303	CT	3	6	1107	1112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014303	TCC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014303	CT	3	6	1120	1125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014303	TC	3	6	1142	1147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014303	CT	3	6	1166	1171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014303	CTCTC	2	10	1177	1186	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014303	CA	3	6	1252	1257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014303	AGT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014303	TG	3	6	1487	1492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014303	CGT	2	6	1506	1511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014303	TAC	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014303	TCG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014303	GCG	2	6	1556	1561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014303	GCCA	2	8	1595	1602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014303	CGGT	2	8	1660	1667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014303	GGCC	2	8	1668	1675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014303	CG	3	6	1708	1713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014303	CGC	2	6	1735	1740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014303	CAC	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014303	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014303	CG	3	6	1844	1849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014303	CCCTC	2	10	1855	1864	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_014303	GC	3	6	1955	1960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014303	GT	3	6	1993	1998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014303	GC	3	6	2010	2015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014303	ACC	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014303	ACTCT	3	15	2139	2153	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014303	CCA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
54	NC_014303	GTCG	2	8	2250	2257	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
55	NC_014303	CGTC	2	8	2259	2266	0 %	25 %	25 %	50 %	299883500
56	NC_014303	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
57	NC_014303	GCGG	2	8	2376	2383	0 %	0 %	75 %	25 %	299883500
58	NC_014303	TCG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883500
59	NC_014303	GGT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883500
60	NC_014303	GA	3	6	2486	2491	50 %	0 %	50 %	0 %	299883500
61	NC_014303	CGGCCA	2	12	2495	2506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	299883500
62	NC_014303	GCCC	2	8	2525	2532	0 %	0 %	25 %	75 %	299883500
63	NC_014303	CGAC	2	8	2559	2566	25 %	0 %	25 %	50 %	299883500
64	NC_014303	CGG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
65	NC_014303	CT	3	6	2726	2731	0 %	50 %	0 %	50 %	299883500
66	NC_014303	GAC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883500
67	NC_014303	GGTC	2	8	2814	2821	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
68	NC_014303	TCGGG	2	10	2826	2835	0 %	20 %	60 %	20 %	299883500
69	NC_014303	GGC	2	6	2847	2852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
70	NC_014303	ACGG	2	8	2884	2891	25 %	0 %	50 %	25 %	299883500
71	NC_014303	CCG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
72	NC_014303	ACT	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883501
73	NC_014303	TCG	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
74	NC_014303	GACG	2	8	3023	3030	25 %	0 %	50 %	25 %	299883501
75	NC_014303	GCT	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
76	NC_014303	GA	3	6	3138	3143	50 %	0 %	50 %	0 %	299883501
77	NC_014303	GGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883501
78	NC_014303	CGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883501
79	NC_014303	CTCA	2	8	3245	3252	25 %	25 %	0 %	50 %	299883501
80	NC_014303	G	6	6	3295	3300	0 %	0 %	100 %	0 %	299883501
81	NC_014303	CTG	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
82	NC_014303	GTG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883501
83	NC_014303	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
84	NC_014303	TCCA	2	8	3433	3440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014303	CCG	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014303	CCT	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014303	C	6	6	3523	3528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_014303	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014303	ACA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883502
90	NC_014303	CGGC	2	8	3848	3855	0 %	0 %	50 %	50 %	299883502
91	NC_014303	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883503
92	NC_014303	GGA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
93	NC_014303	CGG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
94	NC_014303	GAG	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
95	NC_014303	GCGG	2	8	3955	3962	0 %	0 %	75 %	25 %	299883503
96	NC_014303	GTG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
97	NC_014303	GTC	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883503
98	NC_014303	GGC	2	6	4016	4021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
99	NC_014303	GAG	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
100	NC_014303	GTG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
101	NC_014303	GAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
102	NC_014303	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014303	TG	3	6	4186	4191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014303	G	6	6	4291	4296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014303	CGA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014303	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014303	GGTC	2	8	4348	4355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014303	AGT	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014303	ACG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014303	GAC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014303	GCC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014303	GT	3	6	4722	4727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014303	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014303	GCC	3	9	4786	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014303	TGGA	2	8	4807	4814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014303	CAG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014303	CTT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014303	ACA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014303	TCT	2	6	5037	5042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014303	ACCC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_014303	GGCG	2	8	5110	5117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014303	GT	3	6	5154	5159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014303	TA	4	8	5187	5194	50 %	50 %	0 %	0 %	299883504
124	NC_014303	AG	3	6	5197	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	299883504
125	NC_014303	CATC	2	8	5208	5215	25 %	25 %	0 %	50 %	299883504
126	NC_014303	CGAG	2	8	5225	5232	25 %	0 %	50 %	25 %	299883504
127	NC_014303	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883504
128	NC_014303	GAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014303	TGAG	2	8	5469	5476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014303	TCAG	2	8	5485	5492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014303	GGCT	2	8	5537	5544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014303	TAC	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014303	AC	3	6	5573	5578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014303	ACTC	2	8	5624	5631	25 %	25 %	0 %	50 %	299883505
135	NC_014303	ACG	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
136	NC_014303	AGG	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
137	NC_014303	CAG	3	9	5740	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
138	NC_014303	AGG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
139	NC_014303	TTG	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883505
140	NC_014303	CAG	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
141	NC_014303	GTG	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883505
142	NC_014303	TTC	2	6	5899	5904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014303	TGC	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883506
144	NC_014303	C	6	6	6002	6007	0 %	0 %	0 %	100 %	299883506
145	NC_014303	GAC	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883506
146	NC_014303	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883506
147	NC_014303	GTT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014303	CT	3	6	6264	6269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014303	TAT	2	6	6270	6275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014303	TTG	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014303	GGT	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014303	CTCC	2	8	6548	6555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_014303	CA	3	6	6563	6568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014303	GT	3	6	6579	6584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014303	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014303	AACG	2	8	6710	6717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_014303	GAC	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014303	CGAA	2	8	6748	6755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014303	TCG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014303	GC	3	6	6903	6908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_014303	GC	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.