MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 1

Total Repeats: 8561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014298	CAC	2	6	404121	404126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8502	NC_014298	GCC	2	6	404127	404132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8503	NC_014298	GAC	2	6	404157	404162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8504	NC_014298	CGC	2	6	404163	404168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8505	NC_014298	CGG	2	6	404213	404218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712766
8506	NC_014298	ACC	2	6	404252	404257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8507	NC_014298	GCG	2	6	404288	404293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712766
8508	NC_014298	ACC	2	6	404308	404313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8509	NC_014298	GCG	2	6	404323	404328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712766
8510	NC_014298	CGA	2	6	404387	404392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8511	NC_014298	AGG	2	6	404410	404415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712766
8512	NC_014298	AGC	2	6	404431	404436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8513	NC_014298	GAAC	2	8	404457	404464	50 %	0 %	25 %	25 %	300712766
8514	NC_014298	CGC	3	9	404471	404479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8515	NC_014298	CCCGTA	2	12	404485	404496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300712766
8516	NC_014298	TCGA	2	8	404527	404534	25 %	25 %	25 %	25 %	300712766
8517	NC_014298	CAC	2	6	404544	404549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8518	NC_014298	GCC	2	6	404694	404699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8519	NC_014298	GCGA	2	8	404719	404726	25 %	0 %	50 %	25 %	300712766
8520	NC_014298	CGA	2	6	404732	404737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8521	NC_014298	ATG	2	6	404749	404754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712766
8522	NC_014298	CAG	2	6	404802	404807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8523	NC_014298	CGG	2	6	404816	404821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712766
8524	NC_014298	ACC	2	6	404875	404880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8525	NC_014298	TCG	2	6	404891	404896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8526	NC_014298	GACCA	2	10	404911	404920	40 %	0 %	20 %	40 %	300712766
8527	NC_014298	CGA	2	6	404921	404926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8528	NC_014298	GCC	2	6	404944	404949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8529	NC_014298	CGA	2	6	404975	404980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8530	NC_014298	ACG	2	6	405025	405030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8531	NC_014298	GTC	2	6	405079	405084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8532	NC_014298	CGGCG	2	10	405108	405117	0 %	0 %	60 %	40 %	300712766
8533	NC_014298	CGTC	2	8	405126	405133	0 %	25 %	25 %	50 %	300712766
8534	NC_014298	CCG	2	6	405215	405220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712766
8535	NC_014298	CAC	2	6	405243	405248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712766
8536	NC_014298	CAG	3	9	405273	405281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8537	NC_014298	CGCC	2	8	405373	405380	0 %	0 %	25 %	75 %	300712766
8538	NC_014298	GAT	2	6	405396	405401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712766
8539	NC_014298	GAC	2	6	405423	405428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8540	NC_014298	CGAT	2	8	405472	405479	25 %	25 %	25 %	25 %	300712766
8541	NC_014298	CGA	2	6	405480	405485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8542	NC_014298	GGC	2	6	405532	405537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712766
8543	NC_014298	CCGT	2	8	405539	405546	0 %	25 %	25 %	50 %	300712766
8544	NC_014298	CAG	2	6	405582	405587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8545	NC_014298	CAG	2	6	405594	405599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712766
8546	NC_014298	ACCCG	2	10	405629	405638	20 %	0 %	20 %	60 %	300712766
8547	NC_014298	GA	3	6	405652	405657	50 %	0 %	50 %	0 %	300712766
8548	NC_014298	ACC	2	6	405856	405861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8549	NC_014298	GAA	2	6	405864	405869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_014298	GTTC	2	8	405900	405907	0 %	50 %	25 %	25 %	300712767
8551	NC_014298	ATCA	2	8	405911	405918	50 %	25 %	0 %	25 %	300712767
8552	NC_014298	CG	3	6	405985	405990	0 %	0 %	50 %	50 %	300712767
8553	NC_014298	TTGA	2	8	406017	406024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_014298	CGT	2	6	406045	406050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_014298	GTG	2	6	406053	406058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014298	TC	3	6	406061	406066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8557	NC_014298	GTA	2	6	406091	406096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_014298	CGT	2	6	406100	406105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_014298	TTC	2	6	406147	406152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712768
8560	NC_014298	TCT	2	6	406157	406162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712768
8561	NC_014298	CGTTC	2	10	406197	406206	0 %	40 %	20 %	40 %	300712768

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.