MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 1832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013968	ACG	2	6	70779	70784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657187
1502	NC_013968	TCA	3	9	70834	70842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657187
1503	NC_013968	GCC	2	6	70856	70861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657187
1504	NC_013968	GAT	3	9	70928	70936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657187
1505	NC_013968	CAG	2	6	70967	70972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657187
1506	NC_013968	GTC	2	6	70985	70990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657187
1507	NC_013968	GAG	2	6	70997	71002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657187
1508	NC_013968	CAAT	2	8	71065	71072	50 %	25 %	0 %	25 %	292657187
1509	NC_013968	TGA	2	6	71119	71124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657187
1510	NC_013968	ACG	2	6	71154	71159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657187
1511	NC_013968	AGT	2	6	71204	71209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657187
1512	NC_013968	ATT	2	6	71226	71231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292657187
1513	NC_013968	ATTCG	2	10	71244	71253	20 %	40 %	20 %	20 %	292657188
1514	NC_013968	GAG	2	6	71371	71376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657188
1515	NC_013968	ACG	3	9	71411	71419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1516	NC_013968	AAG	2	6	71428	71433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657188
1517	NC_013968	TCG	2	6	71463	71468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1518	NC_013968	GCA	2	6	71469	71474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1519	NC_013968	GTGC	2	8	71487	71494	0 %	25 %	50 %	25 %	292657188
1520	NC_013968	CCGA	2	8	71574	71581	25 %	0 %	25 %	50 %	292657188
1521	NC_013968	TGC	2	6	71875	71880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1522	NC_013968	CCT	2	6	71925	71930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657188
1523	NC_013968	ACCA	2	8	71975	71982	50 %	0 %	0 %	50 %	292657188
1524	NC_013968	CG	3	6	72004	72009	0 %	0 %	50 %	50 %	292657188
1525	NC_013968	TGC	2	6	72023	72028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1526	NC_013968	GGC	2	6	72034	72039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657188
1527	NC_013968	TCT	2	6	72047	72052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657188
1528	NC_013968	GCA	2	6	72093	72098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657188
1529	NC_013968	AGG	2	6	72134	72139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657188
1530	NC_013968	GTT	2	6	72318	72323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292657189
1531	NC_013968	GAT	2	6	72369	72374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657189
1532	NC_013968	CGA	2	6	72395	72400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1533	NC_013968	CTCGCA	2	12	72495	72506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292657189
1534	NC_013968	ACG	2	6	72559	72564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1535	NC_013968	TC	3	6	72581	72586	0 %	50 %	0 %	50 %	292657189
1536	NC_013968	CGG	2	6	72815	72820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657189
1537	NC_013968	CAG	2	6	72825	72830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1538	NC_013968	CGA	2	6	72881	72886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1539	NC_013968	CGA	2	6	72889	72894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1540	NC_013968	TAC	2	6	72908	72913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657189
1541	NC_013968	CGA	2	6	72938	72943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1542	NC_013968	TCA	2	6	72976	72981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657189
1543	NC_013968	CAT	2	6	73025	73030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657189
1544	NC_013968	GACG	2	8	73061	73068	25 %	0 %	50 %	25 %	292657189
1545	NC_013968	CGA	2	6	73084	73089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1546	NC_013968	CCG	2	6	73136	73141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657189
1547	NC_013968	CGG	2	6	73296	73301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657189
1548	NC_013968	TCA	2	6	73381	73386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657189
1549	NC_013968	GTTC	2	8	73420	73427	0 %	50 %	25 %	25 %	292657189
1550	NC_013968	GTC	2	6	73512	73517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1551	NC_013968	TAC	2	6	73555	73560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657189
1552	NC_013968	CCT	2	6	73565	73570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657189
1553	NC_013968	GAC	2	6	73604	73609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1554	NC_013968	GGTC	2	8	73796	73803	0 %	25 %	50 %	25 %	292657189
1555	NC_013968	GA	3	6	73849	73854	50 %	0 %	50 %	0 %	292657189
1556	NC_013968	AGC	2	6	73855	73860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1557	NC_013968	TCGT	2	8	73896	73903	0 %	50 %	25 %	25 %	292657189
1558	NC_013968	CAAG	2	8	73944	73951	50 %	0 %	25 %	25 %	292657189
1559	NC_013968	CCT	2	6	73993	73998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657189
1560	NC_013968	TCT	2	6	74000	74005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657189
1561	NC_013968	CGT	2	6	74024	74029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1562	NC_013968	C	7	7	74108	74114	0 %	0 %	0 %	100 %	292657189
1563	NC_013968	CG	4	8	74128	74135	0 %	0 %	50 %	50 %	292657189
1564	NC_013968	CTG	2	6	74136	74141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1565	NC_013968	GC	3	6	74209	74214	0 %	0 %	50 %	50 %	292657189
1566	NC_013968	AGA	2	6	74257	74262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657189
1567	NC_013968	GAC	2	6	74313	74318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1568	NC_013968	CTG	2	6	74376	74381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657189
1569	NC_013968	TCG	2	6	74406	74411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013968	ATC	2	6	74432	74437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_013968	ACA	2	6	74469	74474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013968	TG	3	6	74496	74501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013968	GAA	2	6	74553	74558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013968	GT	3	6	74608	74613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013968	CGCA	2	8	74662	74669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_013968	CCGAG	2	10	74751	74760	20 %	0 %	40 %	40 %	292657190
1577	NC_013968	TTC	2	6	74822	74827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657190
1578	NC_013968	TCG	2	6	74873	74878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1579	NC_013968	CTG	2	6	74908	74913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1580	NC_013968	TCG	2	6	74957	74962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1581	NC_013968	TTCG	2	8	74968	74975	0 %	50 %	25 %	25 %	292657190
1582	NC_013968	GCA	2	6	75012	75017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1583	NC_013968	CTT	2	6	75079	75084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657190
1584	NC_013968	CTT	2	6	75144	75149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657190
1585	NC_013968	AGT	2	6	75318	75323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657190
1586	NC_013968	AGC	2	6	75341	75346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1587	NC_013968	TCA	2	6	75465	75470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657190
1588	NC_013968	CGC	2	6	75486	75491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657190
1589	NC_013968	GAT	2	6	75562	75567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657190
1590	NC_013968	GTA	2	6	75676	75681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657190
1591	NC_013968	TCG	2	6	75683	75688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1592	NC_013968	CAA	2	6	75699	75704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292657190
1593	NC_013968	TTC	2	6	75754	75759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657190
1594	NC_013968	CTT	2	6	75778	75783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657190
1595	NC_013968	TCC	2	6	75800	75805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657190
1596	NC_013968	CTG	2	6	75904	75909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1597	NC_013968	TCG	2	6	75950	75955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1598	NC_013968	CGG	3	9	75984	75992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657190
1599	NC_013968	CGT	2	6	76005	76010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1600	NC_013968	TCG	2	6	76043	76048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1601	NC_013968	CGA	2	6	76060	76065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1602	NC_013968	CAT	2	6	76168	76173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657190
1603	NC_013968	GTC	3	9	76187	76195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1604	NC_013968	GAC	2	6	76253	76258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657190
1605	NC_013968	TCCGAA	2	12	76280	76291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292657190
1606	NC_013968	CCG	2	6	76378	76383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657190
1607	NC_013968	ATTGC	2	10	76422	76431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_013968	TAA	2	6	76455	76460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013968	TGG	2	6	76467	76472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013968	CAC	2	6	76531	76536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_013968	GC	3	6	76565	76570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_013968	TGA	2	6	76829	76834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657191
1613	NC_013968	GCTC	2	8	76856	76863	0 %	25 %	25 %	50 %	292657191
1614	NC_013968	TCG	2	6	76867	76872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657191
1615	NC_013968	AG	3	6	76928	76933	50 %	0 %	50 %	0 %	292657191
1616	NC_013968	GC	3	6	76952	76957	0 %	0 %	50 %	50 %	292657191
1617	NC_013968	GC	3	6	76963	76968	0 %	0 %	50 %	50 %	292657191
1618	NC_013968	GAT	2	6	76974	76979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657191
1619	NC_013968	CTC	2	6	76980	76985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657191
1620	NC_013968	TCA	2	6	77029	77034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657191
1621	NC_013968	TTC	2	6	77088	77093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657191
1622	NC_013968	GAC	2	6	77094	77099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657191
1623	NC_013968	CCG	2	6	77100	77105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292657191
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1832	NC_013968	AC	3	6	85072	85077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.