MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 1832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013968	TCC	2	6	47542	47547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657167
1002	NC_013968	CACC	2	8	47549	47556	25 %	0 %	0 %	75 %	292657167
1003	NC_013968	GTC	2	6	47611	47616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657167
1004	NC_013968	CAC	2	6	47660	47665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657167
1005	NC_013968	TCG	2	6	47668	47673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657167
1006	NC_013968	GCG	2	6	47779	47784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657168
1007	NC_013968	AACCA	2	10	47807	47816	60 %	0 %	0 %	40 %	292657168
1008	NC_013968	GCG	2	6	47823	47828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657168
1009	NC_013968	GCAG	2	8	47838	47845	25 %	0 %	50 %	25 %	292657168
1010	NC_013968	AG	3	6	47867	47872	50 %	0 %	50 %	0 %	292657168
1011	NC_013968	CGA	3	9	47877	47885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1012	NC_013968	TCACA	2	10	47899	47908	40 %	20 %	0 %	40 %	292657168
1013	NC_013968	AGA	2	6	47915	47920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292657168
1014	NC_013968	CGA	2	6	47933	47938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1015	NC_013968	G	6	6	47949	47954	0 %	0 %	100 %	0 %	292657168
1016	NC_013968	C	6	6	47966	47971	0 %	0 %	0 %	100 %	292657168
1017	NC_013968	CGA	2	6	48012	48017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1018	NC_013968	CAG	2	6	48046	48051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1019	NC_013968	GGC	2	6	48093	48098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657168
1020	NC_013968	GAC	2	6	48108	48113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1021	NC_013968	GCG	2	6	48127	48132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657168
1022	NC_013968	CGA	4	12	48205	48216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1023	NC_013968	CGA	3	9	48251	48259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657168
1024	NC_013968	ACG	2	6	48299	48304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_013968	CGG	2	6	48353	48358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657169
1026	NC_013968	GA	3	6	48365	48370	50 %	0 %	50 %	0 %	292657169
1027	NC_013968	GGT	3	9	48451	48459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657169
1028	NC_013968	GAGC	2	8	48460	48467	25 %	0 %	50 %	25 %	292657169
1029	NC_013968	CGA	2	6	48470	48475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657169
1030	NC_013968	GTCA	2	8	48495	48502	25 %	25 %	25 %	25 %	292657169
1031	NC_013968	AGACG	3	15	48748	48762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_013968	CTG	2	6	48796	48801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013968	GAGC	2	8	48834	48841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_013968	AGCG	2	8	48852	48859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_013968	GCGGT	2	10	48867	48876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_013968	GAC	2	6	48883	48888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013968	AGGCC	2	10	48890	48899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_013968	TGC	2	6	48906	48911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013968	TGG	2	6	48921	48926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013968	CGA	2	6	48965	48970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013968	GTG	2	6	49001	49006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013968	TGCG	2	8	49052	49059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_013968	AT	3	6	49176	49181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013968	CA	3	6	49276	49281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_013968	TAC	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013968	TCA	2	6	49353	49358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657171
1047	NC_013968	TTC	2	6	49361	49366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657171
1048	NC_013968	GTG	2	6	49378	49383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657171
1049	NC_013968	CAG	2	6	49405	49410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1050	NC_013968	TTC	2	6	49418	49423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657171
1051	NC_013968	TTG	2	6	49473	49478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292657171
1052	NC_013968	GCT	2	6	49497	49502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1053	NC_013968	GAG	2	6	49589	49594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292657171
1054	NC_013968	GCT	2	6	49611	49616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1055	NC_013968	TCC	2	6	49620	49625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657171
1056	NC_013968	GTG	2	6	49670	49675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657171
1057	NC_013968	AGT	2	6	49708	49713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657171
1058	NC_013968	CGA	2	6	49807	49812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1059	NC_013968	GTTC	2	8	49930	49937	0 %	50 %	25 %	25 %	292657171
1060	NC_013968	GCACG	2	10	49939	49948	20 %	0 %	40 %	40 %	292657171
1061	NC_013968	TC	3	6	50047	50052	0 %	50 %	0 %	50 %	292657171
1062	NC_013968	CTG	2	6	50059	50064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1063	NC_013968	ACC	2	6	50097	50102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292657171
1064	NC_013968	GCA	2	6	50115	50120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657171
1065	NC_013968	TCT	2	6	50178	50183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013968	AATA	2	8	50203	50210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013968	GCT	2	6	50243	50248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_013968	TCA	2	6	50353	50358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657172
1069	NC_013968	CTG	2	6	50367	50372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657172
1070	NC_013968	TCGC	2	8	50394	50401	0 %	25 %	25 %	50 %	292657172
1071	NC_013968	GGC	2	6	50432	50437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657172
1072	NC_013968	CTC	2	6	50475	50480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292657172
1073	NC_013968	CGAG	2	8	50500	50507	25 %	0 %	50 %	25 %	292657172
1074	NC_013968	GTG	2	6	50551	50556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292657172
1075	NC_013968	GTA	2	6	50734	50739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657172
1076	NC_013968	CCCT	2	8	50751	50758	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1077	NC_013968	GTT	2	6	50763	50768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013968	AGTC	2	8	50787	50794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_013968	GACC	2	8	50796	50803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013968	GTTC	2	8	50833	50840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_013968	TTG	2	6	50857	50862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013968	AG	3	6	50868	50873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013968	GCG	2	6	50985	50990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013968	GAC	2	6	51073	51078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013968	TCG	3	9	51095	51103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013968	TCC	2	6	51104	51109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_013968	CTC	3	9	51154	51162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_013968	GAC	2	6	51214	51219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_013968	GGT	2	6	51260	51265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013968	CCACGC	2	12	51284	51295	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_013968	TCG	2	6	51365	51370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013968	CGACG	2	10	51429	51438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_013968	AAC	2	6	51521	51526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013968	TGAG	2	8	51547	51554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013968	TAG	2	6	51700	51705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657173
1096	NC_013968	TG	3	6	51755	51760	0 %	50 %	50 %	0 %	292657173
1097	NC_013968	CGA	2	6	51903	51908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1098	NC_013968	GCG	2	6	51919	51924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657173
1099	NC_013968	TCA	3	9	51983	51991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657173
1100	NC_013968	ATG	2	6	52006	52011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657173
1101	NC_013968	GAT	2	6	52023	52028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657173
1102	NC_013968	GTCG	2	8	52035	52042	0 %	25 %	50 %	25 %	292657173
1103	NC_013968	CAG	2	6	52086	52091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1104	NC_013968	GC	3	6	52104	52109	0 %	0 %	50 %	50 %	292657173
1105	NC_013968	GC	3	6	52133	52138	0 %	0 %	50 %	50 %	292657173
1106	NC_013968	TC	3	6	52147	52152	0 %	50 %	0 %	50 %	292657173
1107	NC_013968	GAT	2	6	52172	52177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292657173
1108	NC_013968	TCG	2	6	52180	52185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1109	NC_013968	TCT	2	6	52187	52192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657173
1110	NC_013968	GTC	2	6	52299	52304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1111	NC_013968	TTC	2	6	52365	52370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657173
1112	NC_013968	CGT	2	6	52388	52393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1113	NC_013968	GA	3	6	52403	52408	50 %	0 %	50 %	0 %	292657173
1114	NC_013968	AACC	2	8	52411	52418	50 %	0 %	0 %	50 %	292657173
1115	NC_013968	GTC	2	6	52528	52533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1116	NC_013968	GA	4	8	52570	52577	50 %	0 %	50 %	0 %	292657173
1117	NC_013968	GGTGA	2	10	52581	52590	20 %	20 %	60 %	0 %	292657173
1118	NC_013968	GCG	2	6	52636	52641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292657173
1119	NC_013968	TCT	2	6	52714	52719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292657173
1120	NC_013968	TC	3	6	52757	52762	0 %	50 %	0 %	50 %	292657173
1121	NC_013968	GA	3	6	52863	52868	50 %	0 %	50 %	0 %	292657173
1122	NC_013968	CAG	2	6	52880	52885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292657173
1123	NC_013968	GT	3	6	52901	52906	0 %	50 %	50 %	0 %	292657173
1124	NC_013968	GC	3	6	52963	52968	0 %	0 %	50 %	50 %	292657173
1125	NC_013968	TCA	2	6	52978	52983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292657173
1126	NC_013968	CGA	2	6	53075	53080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013968	ATCAA	2	10	53082	53091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_013968	TTC	2	6	53107	53112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013968	CAG	2	6	53155	53160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013968	GCGA	2	8	53168	53175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1253	NC_013968	TCTCA	2	10	58998	59007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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