MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_013967	GGC	2	6	2650625	2650630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78002	NC_013967	GTC	2	6	2650659	2650664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78003	NC_013967	GCT	2	6	2650742	2650747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78004	NC_013967	GAA	2	6	2650757	2650762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292656933
78005	NC_013967	GGA	2	6	2650844	2650849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656933
78006	NC_013967	CA	3	6	2650933	2650938	50 %	0 %	0 %	50 %	292656933
78007	NC_013967	GGC	2	6	2650978	2650983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656933
78008	NC_013967	AGCACG	2	12	2650984	2650995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78009	NC_013967	CGC	2	6	2651027	2651032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656933
78010	NC_013967	ACT	2	6	2651056	2651061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292656933
78011	NC_013967	CG	3	6	2651065	2651070	0 %	0 %	50 %	50 %	292656933
78012	NC_013967	CG	3	6	2651076	2651081	0 %	0 %	50 %	50 %	292656933
78013	NC_013967	CGAG	2	8	2651144	2651151	25 %	0 %	50 %	25 %	292656933
78014	NC_013967	GAC	2	6	2651211	2651216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78015	NC_013967	CGGT	2	8	2651305	2651312	0 %	25 %	50 %	25 %	292656933
78016	NC_013967	TCC	2	6	2651335	2651340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292656933
78017	NC_013967	AGG	2	6	2651350	2651355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656933
78018	NC_013967	GAA	2	6	2651363	2651368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292656933
78019	NC_013967	GTC	2	6	2651382	2651387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78020	NC_013967	ACG	2	6	2651455	2651460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78021	NC_013967	ACGGC	2	10	2651500	2651509	20 %	0 %	40 %	40 %	292656933
78022	NC_013967	CTG	2	6	2651523	2651528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78023	NC_013967	TG	3	6	2651536	2651541	0 %	50 %	50 %	0 %	292656933
78024	NC_013967	ACG	2	6	2651559	2651564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78025	NC_013967	GAG	2	6	2651622	2651627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292656933
78026	NC_013967	GAC	2	6	2651672	2651677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656933
78027	NC_013967	C	7	7	2651853	2651859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78028	NC_013967	TGCT	2	8	2651912	2651919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78029	NC_013967	AGCA	2	8	2651942	2651949	50 %	0 %	25 %	25 %	292656934
78030	NC_013967	CT	3	6	2651994	2651999	0 %	50 %	0 %	50 %	292656934
78031	NC_013967	CT	3	6	2652014	2652019	0 %	50 %	0 %	50 %	292656934
78032	NC_013967	TCG	2	6	2652068	2652073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78033	NC_013967	GA	3	6	2652112	2652117	50 %	0 %	50 %	0 %	292656934
78034	NC_013967	CTC	2	6	2652205	2652210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292656934
78035	NC_013967	CAG	2	6	2652238	2652243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78036	NC_013967	CTA	2	6	2652276	2652281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292656934
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78039	NC_013967	TCAC	2	8	2652312	2652319	25 %	25 %	0 %	50 %	292656934
78040	NC_013967	AAGCG	2	10	2652320	2652329	40 %	0 %	40 %	20 %	292656934
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78042	NC_013967	ACGC	2	8	2652365	2652372	25 %	0 %	25 %	50 %	292656934
78043	NC_013967	GAA	2	6	2652375	2652380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292656934
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78047	NC_013967	TACC	2	8	2652696	2652703	25 %	25 %	0 %	50 %	292656934
78048	NC_013967	ACGG	2	8	2652707	2652714	25 %	0 %	50 %	25 %	292656934
78049	NC_013967	ACG	2	6	2652716	2652721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78050	NC_013967	TGGCG	2	10	2652726	2652735	0 %	20 %	60 %	20 %	292656934
78051	NC_013967	CGC	2	6	2652747	2652752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656934
78052	NC_013967	CAC	2	6	2652773	2652778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292656934
78053	NC_013967	CT	3	6	2652832	2652837	0 %	50 %	0 %	50 %	292656934
78054	NC_013967	CGA	2	6	2652851	2652856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78055	NC_013967	GCT	2	6	2652882	2652887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78056	NC_013967	CGT	2	6	2652891	2652896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78057	NC_013967	GGCG	2	8	2652964	2652971	0 %	0 %	75 %	25 %	292656934
78058	NC_013967	TCA	2	6	2653001	2653006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292656934
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78060	NC_013967	GAC	2	6	2653075	2653080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656934
78061	NC_013967	CGG	2	6	2653142	2653147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78062	NC_013967	GCC	3	9	2653150	2653158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78063	NC_013967	CCG	2	6	2653174	2653179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78064	NC_013967	TC	3	6	2653193	2653198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78065	NC_013967	TGC	2	6	2653281	2653286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78066	NC_013967	CGG	2	6	2653303	2653308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78067	NC_013967	AATC	2	8	2653311	2653318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78068	NC_013967	CGT	2	6	2653413	2653418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78069	NC_013967	TC	3	6	2653429	2653434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78070	NC_013967	CTG	2	6	2653453	2653458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78074	NC_013967	GTG	2	6	2653543	2653548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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78098	NC_013967	GCC	2	6	2654732	2654737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78099	NC_013967	CTT	2	6	2654774	2654779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78100	NC_013967	CAC	2	6	2654799	2654804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78101	NC_013967	ACC	2	6	2654929	2654934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78102	NC_013967	CGA	2	6	2654956	2654961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78103	NC_013967	CACT	2	8	2655007	2655014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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78105	NC_013967	TGC	2	6	2655100	2655105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78113	NC_013967	GC	3	6	2655522	2655527	0 %	0 %	50 %	50 %	292656937
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78119	NC_013967	ACG	2	6	2655675	2655680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656937
78120	NC_013967	CCGA	2	8	2655701	2655708	25 %	0 %	25 %	50 %	292656937
78121	NC_013967	CCG	2	6	2655736	2655741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292656937
78122	NC_013967	ACG	2	6	2655746	2655751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656937
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78149	NC_013967	ACG	3	9	2656610	2656618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78337	NC_013967	CAG	2	6	2664028	2664033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656943
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78340	NC_013967	CGG	3	9	2664067	2664075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292656943
78341	NC_013967	TCGG	2	8	2664107	2664114	0 %	25 %	50 %	25 %	292656943
78342	NC_013967	TCGACG	2	12	2664149	2664160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292656943
78343	NC_013967	CGTTG	2	10	2664216	2664225	0 %	40 %	40 %	20 %	292656943
78344	NC_013967	GAGCG	2	10	2664260	2664269	20 %	0 %	60 %	20 %	292656943
78345	NC_013967	AAG	2	6	2664394	2664399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78346	NC_013967	AAGA	2	8	2664430	2664437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78347	NC_013967	CAC	2	6	2664536	2664541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78348	NC_013967	ACAG	2	8	2664561	2664568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78349	NC_013967	CGA	2	6	2664572	2664577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78350	NC_013967	CCT	2	6	2664717	2664722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292656944
78351	NC_013967	TCGT	2	8	2664738	2664745	0 %	50 %	25 %	25 %	292656944
78352	NC_013967	GGCG	2	8	2664773	2664780	0 %	0 %	75 %	25 %	292656944
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78384	NC_013967	CT	3	6	2666155	2666160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78385	NC_013967	AT	3	6	2666202	2666207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78386	NC_013967	TG	3	6	2666300	2666305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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78469	NC_013967	TCG	2	6	2669906	2669911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78470	NC_013967	TGG	2	6	2669940	2669945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78471	NC_013967	GAT	2	6	2669994	2669999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78472	NC_013967	CGA	2	6	2670030	2670035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78473	NC_013967	TCGAA	2	10	2670057	2670066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78474	NC_013967	GT	3	6	2670112	2670117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78475	NC_013967	CAGT	2	8	2670119	2670126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78476	NC_013967	CGAA	2	8	2670187	2670194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78477	NC_013967	AAC	2	6	2670253	2670258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78478	NC_013967	AG	4	8	2670266	2670273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78479	NC_013967	AGCG	2	8	2670309	2670316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78480	NC_013967	CTT	2	6	2670344	2670349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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78482	NC_013967	GCTC	2	8	2670606	2670613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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78484	NC_013967	G	6	6	2670758	2670763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78485	NC_013967	CGA	2	6	2670854	2670859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78486	NC_013967	GACG	2	8	2670862	2670869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78487	NC_013967	CG	3	6	2670951	2670956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78488	NC_013967	GAAG	2	8	2670967	2670974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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78490	NC_013967	TGC	2	6	2671105	2671110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78491	NC_013967	CGGG	2	8	2671193	2671200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78492	NC_013967	CAAC	2	8	2671271	2671278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78493	NC_013967	TCGG	2	8	2671284	2671291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78494	NC_013967	CGA	2	6	2671365	2671370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656949
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78499	NC_013967	AGC	2	6	2671767	2671772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292656949
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