MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013964	GAC	2	6	141197	141202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4002	NC_013964	CTC	2	6	141239	141244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494063
4003	NC_013964	TCG	2	6	141245	141250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4004	NC_013964	CCG	2	6	141323	141328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494063
4005	NC_013964	TCG	2	6	141363	141368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4006	NC_013964	CGG	2	6	141372	141377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494063
4007	NC_013964	GAC	2	6	141392	141397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4008	NC_013964	GAC	2	6	141461	141466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4009	NC_013964	CGA	2	6	141487	141492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4010	NC_013964	CCG	2	6	141498	141503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494063
4011	NC_013964	GC	4	8	141517	141524	0 %	0 %	50 %	50 %	292494063
4012	NC_013964	TCGC	2	8	141527	141534	0 %	25 %	25 %	50 %	292494063
4013	NC_013964	CGC	2	6	141556	141561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494063
4014	NC_013964	TCG	2	6	141582	141587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4015	NC_013964	CGA	2	6	141631	141636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494063
4016	NC_013964	CCA	2	6	141658	141663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494063
4017	NC_013964	GAC	2	6	141746	141751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494064
4018	NC_013964	CGA	2	6	141775	141780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494064
4019	NC_013964	GTC	2	6	141956	141961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494064
4020	NC_013964	CGA	2	6	141985	141990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494064
4021	NC_013964	CGG	2	6	142024	142029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494064
4022	NC_013964	GTCG	2	8	142067	142074	0 %	25 %	50 %	25 %	292494064
4023	NC_013964	CTGG	2	8	142079	142086	0 %	25 %	50 %	25 %	292494064
4024	NC_013964	TCG	2	6	142107	142112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494064
4025	NC_013964	GCC	2	6	142168	142173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494064
4026	NC_013964	TCG	2	6	142273	142278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_013964	CGG	2	6	142286	142291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_013964	GGC	2	6	142315	142320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_013964	TC	3	6	142327	142332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_013964	AAC	2	6	142374	142379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494065
4031	NC_013964	TCG	2	6	142387	142392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4032	NC_013964	CGA	2	6	142405	142410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4033	NC_013964	ACG	2	6	142416	142421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4034	NC_013964	TCG	2	6	142425	142430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4035	NC_013964	CGA	2	6	142441	142446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4036	NC_013964	TCGC	2	8	142457	142464	0 %	25 %	25 %	50 %	292494065
4037	NC_013964	CGA	2	6	142483	142488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4038	NC_013964	TCG	2	6	142539	142544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4039	NC_013964	AGG	2	6	142545	142550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494065
4040	NC_013964	CG	3	6	142587	142592	0 %	0 %	50 %	50 %	292494065
4041	NC_013964	CGG	2	6	142679	142684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494065
4042	NC_013964	CGC	4	12	142741	142752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494065
4043	NC_013964	GCGGGT	2	12	142765	142776	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	292494065
4044	NC_013964	TCG	2	6	142806	142811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4045	NC_013964	GTA	2	6	142817	142822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494065
4046	NC_013964	CTC	2	6	142880	142885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494065
4047	NC_013964	TTCC	2	8	142946	142953	0 %	50 %	0 %	50 %	292494065
4048	NC_013964	GAG	2	6	143021	143026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494065
4049	NC_013964	GTT	2	6	143045	143050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494065
4050	NC_013964	TCC	2	6	143076	143081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494065
4051	NC_013964	GGC	2	6	143096	143101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494065
4052	NC_013964	CGT	2	6	143120	143125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4053	NC_013964	TCG	2	6	143226	143231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494065
4054	NC_013964	CG	3	6	143309	143314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_013964	TC	3	6	143336	143341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_013964	TCTCAC	2	12	143346	143357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_013964	CTCA	2	8	143361	143368	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_013964	CGC	2	6	143399	143404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_013964	TAC	2	6	143417	143422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013964	ACC	2	6	143452	143457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494066
4061	NC_013964	GTC	2	6	143505	143510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494066
4062	NC_013964	GAC	2	6	143577	143582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494066
4063	NC_013964	GGC	2	6	143642	143647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494066
4064	NC_013964	GTCG	2	8	143654	143661	0 %	25 %	50 %	25 %	292494066
4065	NC_013964	GGC	2	6	143669	143674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494066
4066	NC_013964	AAC	2	6	143682	143687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494066
4067	NC_013964	CGT	2	6	143774	143779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494066
4068	NC_013964	GCG	2	6	143812	143817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494066
4069	NC_013964	CGG	2	6	143954	143959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494066
4070	NC_013964	GCC	2	6	143981	143986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_013964	ATA	2	6	144051	144056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013964	TC	3	6	144083	144088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_013964	GCT	2	6	144116	144121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_013964	CCAG	2	8	144140	144147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_013964	GC	3	6	144248	144253	0 %	0 %	50 %	50 %	292494067
4076	NC_013964	GC	3	6	144258	144263	0 %	0 %	50 %	50 %	292494067
4077	NC_013964	GTGC	2	8	144278	144285	0 %	25 %	50 %	25 %	292494067
4078	NC_013964	GTC	2	6	144392	144397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_013964	CCG	2	6	144517	144522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_013964	GTC	3	9	144575	144583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494068
4081	NC_013964	CGA	2	6	144631	144636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494068
4082	NC_013964	ACG	2	6	144702	144707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494068
4083	NC_013964	GAC	2	6	144710	144715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494068
4084	NC_013964	CGG	2	6	144835	144840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494068
4085	NC_013964	GC	4	8	144852	144859	0 %	0 %	50 %	50 %	292494068
4086	NC_013964	GGT	2	6	144877	144882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494068
4087	NC_013964	CGC	2	6	144900	144905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494068
4088	NC_013964	CAC	2	6	144911	144916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494068
4089	NC_013964	CGA	2	6	144919	144924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494068
4090	NC_013964	CCGAG	2	10	144967	144976	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4091	NC_013964	GCGTC	2	10	145062	145071	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4092	NC_013964	GAAA	2	8	145098	145105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013964	GGT	2	6	145131	145136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013964	G	6	6	145152	145157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013964	GAGGGC	2	12	145161	145172	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4096	NC_013964	GT	3	6	145173	145178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013964	CGG	2	6	145179	145184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_013964	CCG	2	6	145231	145236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_013964	CCG	2	6	145246	145251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_013964	CGC	2	6	145280	145285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_013964	CGG	2	6	145289	145294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013964	CCG	2	6	145302	145307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_013964	CGGC	2	8	145323	145330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_013964	TAC	2	6	145375	145380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_013964	TTAC	2	8	145383	145390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_013964	TC	3	6	145442	145447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_013964	G	6	6	145491	145496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013964	TCG	2	6	145571	145576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4109	NC_013964	GAC	2	6	145588	145593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4110	NC_013964	CCT	2	6	145611	145616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494069
4111	NC_013964	GTC	2	6	145663	145668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4112	NC_013964	CGA	2	6	145776	145781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4113	NC_013964	CCG	2	6	145802	145807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494069
4114	NC_013964	GC	3	6	145815	145820	0 %	0 %	50 %	50 %	292494069
4115	NC_013964	CGA	2	6	145832	145837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4116	NC_013964	AC	3	6	145854	145859	50 %	0 %	0 %	50 %	292494069
4117	NC_013964	CGT	2	6	145875	145880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4118	NC_013964	GAC	2	6	145950	145955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494069
4119	NC_013964	CGC	2	6	145989	145994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494069
4120	NC_013964	CAT	2	6	146001	146006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494069
4121	NC_013964	AGA	2	6	146042	146047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494069
4122	NC_013964	TCA	2	6	146051	146056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494069
4123	NC_013964	GGC	2	6	146061	146066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494069
4124	NC_013964	CGA	2	6	146112	146117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494069
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4242	NC_013964	GC	3	6	149805	149810	0 %	0 %	50 %	50 %	292494072
4243	NC_013964	CGG	2	6	149813	149818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494072
4244	NC_013964	CGA	2	6	149823	149828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494072
4245	NC_013964	GCT	2	6	149858	149863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494072
4246	NC_013964	TCG	2	6	149878	149883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494072
4247	NC_013964	GCG	3	9	149888	149896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494072
4248	NC_013964	GCG	2	6	149918	149923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494072
4249	NC_013964	TCGC	2	8	149938	149945	0 %	25 %	25 %	50 %	292494072
4250	NC_013964	GACC	2	8	149964	149971	25 %	0 %	25 %	50 %	292494072
4251	NC_013964	TCG	3	9	150008	150016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494072
4252	NC_013964	GGTC	2	8	150119	150126	0 %	25 %	50 %	25 %	292494072
4253	NC_013964	AC	3	6	150209	150214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4254	NC_013964	CGCC	2	8	150237	150244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4255	NC_013964	GTC	3	9	150255	150263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494073
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4259	NC_013964	CGA	2	6	150373	150378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494073
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4262	NC_013964	GAG	3	9	150473	150481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494073
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4265	NC_013964	GCC	2	6	150515	150520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494073
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4272	NC_013964	ACG	2	6	150675	150680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494073
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4283	NC_013964	CGA	3	9	151045	151053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494073
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4285	NC_013964	CGG	2	6	151081	151086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494073
4286	NC_013964	GTC	2	6	151159	151164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_013964	GGC	2	6	151214	151219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4288	NC_013964	GTC	2	6	151329	151334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494074
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4294	NC_013964	CGTCCA	2	12	151463	151474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292494074
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4320	NC_013964	TCGAA	2	10	152068	152077	40 %	20 %	20 %	20 %	292494074
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4323	NC_013964	CGG	3	9	152278	152286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494075
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4343	NC_013964	CCCA	2	8	152942	152949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4344	NC_013964	CGA	2	6	152970	152975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4345	NC_013964	ACG	2	6	152994	152999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494076
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4347	NC_013964	CGC	2	6	153022	153027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494076
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4350	NC_013964	CAGC	2	8	153232	153239	25 %	0 %	25 %	50 %	292494076
4351	NC_013964	GTCG	2	8	153253	153260	0 %	25 %	50 %	25 %	292494076
4352	NC_013964	GTCG	2	8	153287	153294	0 %	25 %	50 %	25 %	292494076
4353	NC_013964	TCGG	2	8	153313	153320	0 %	25 %	50 %	25 %	292494076
4354	NC_013964	CGC	2	6	153336	153341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494076
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4358	NC_013964	CG	3	6	153473	153478	0 %	0 %	50 %	50 %	292494076
4359	NC_013964	CCGTC	2	10	153487	153496	0 %	20 %	20 %	60 %	292494076
4360	NC_013964	GTC	2	6	153524	153529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494076
4361	NC_013964	CGG	2	6	153532	153537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494076
4362	NC_013964	GCGT	2	8	153630	153637	0 %	25 %	50 %	25 %	292494076
4363	NC_013964	CGA	2	6	153673	153678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494076
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4484	NC_013964	C	6	6	157002	157007	0 %	0 %	0 %	100 %	292494079
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