MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013964	GTC	2	6	86134	86139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494015
2502	NC_013964	GAG	2	6	86149	86154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494015
2503	NC_013964	GC	3	6	86178	86183	0 %	0 %	50 %	50 %	292494015
2504	NC_013964	GCCGC	2	10	86212	86221	0 %	0 %	40 %	60 %	292494015
2505	NC_013964	TCG	2	6	86235	86240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494015
2506	NC_013964	CGC	2	6	86286	86291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494015
2507	NC_013964	GTC	2	6	86293	86298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494015
2508	NC_013964	TCT	2	6	86339	86344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494015
2509	NC_013964	GTCTTC	2	12	86354	86365	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	292494015
2510	NC_013964	GAG	2	6	86368	86373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494015
2511	NC_013964	GTC	2	6	86377	86382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494015
2512	NC_013964	GAC	2	6	86392	86397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494015
2513	NC_013964	GCC	2	6	86413	86418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494015
2514	NC_013964	CGATTC	2	12	86424	86435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	292494015
2515	NC_013964	AGTC	2	8	86439	86446	25 %	25 %	25 %	25 %	292494015
2516	NC_013964	CGA	2	6	86512	86517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2517	NC_013964	CTC	2	6	86528	86533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494016
2518	NC_013964	GGT	2	6	86600	86605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494016
2519	NC_013964	ACG	2	6	86661	86666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2520	NC_013964	CGA	2	6	86686	86691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2521	NC_013964	GTC	2	6	86735	86740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2522	NC_013964	GCC	2	6	86774	86779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494016
2523	NC_013964	TCGCC	2	10	86890	86899	0 %	20 %	20 %	60 %	292494016
2524	NC_013964	TCGAG	2	10	86920	86929	20 %	20 %	40 %	20 %	292494016
2525	NC_013964	CGC	2	6	86986	86991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494016
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2529	NC_013964	GCCC	2	8	87220	87227	0 %	0 %	25 %	75 %	292494016
2530	NC_013964	TCG	2	6	87241	87246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2531	NC_013964	CCT	2	6	87253	87258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494016
2532	NC_013964	GGC	2	6	87287	87292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494016
2533	NC_013964	TCT	2	6	87316	87321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494016
2534	NC_013964	GC	3	6	87337	87342	0 %	0 %	50 %	50 %	292494016
2535	NC_013964	CGT	2	6	87370	87375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2536	NC_013964	CTG	2	6	87428	87433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2537	NC_013964	CGC	2	6	87466	87471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494016
2538	NC_013964	GTC	2	6	87503	87508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494016
2539	NC_013964	TGT	2	6	87511	87516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494016
2540	NC_013964	TCG	2	6	87557	87562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2541	NC_013964	CCG	2	6	87567	87572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494017
2542	NC_013964	CGT	2	6	87591	87596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2543	NC_013964	TCG	2	6	87617	87622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2544	NC_013964	CGA	2	6	87660	87665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494017
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2549	NC_013964	TCG	2	6	87920	87925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2550	NC_013964	AG	4	8	87941	87948	50 %	0 %	50 %	0 %	292494017
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2552	NC_013964	AGGT	2	8	87965	87972	25 %	25 %	50 %	0 %	292494017
2553	NC_013964	GAG	2	6	88000	88005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494017
2554	NC_013964	TCG	2	6	88044	88049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2555	NC_013964	TCG	2	6	88052	88057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2556	NC_013964	GC	3	6	88086	88091	0 %	0 %	50 %	50 %	292494017
2557	NC_013964	CCG	2	6	88118	88123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494017
2558	NC_013964	TCG	2	6	88154	88159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2559	NC_013964	CGC	2	6	88218	88223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494017
2560	NC_013964	CCG	2	6	88261	88266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494017
2561	NC_013964	CG	3	6	88308	88313	0 %	0 %	50 %	50 %	292494017
2562	NC_013964	TCG	2	6	88334	88339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
2563	NC_013964	CCG	2	6	88379	88384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494017
2564	NC_013964	GCCGGA	2	12	88429	88440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494017
2565	NC_013964	TGA	2	6	88524	88529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494017
2566	NC_013964	TCG	2	6	88562	88567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494017
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2568	NC_013964	C	6	6	88599	88604	0 %	0 %	0 %	100 %	292494018
2569	NC_013964	GAC	2	6	88673	88678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494018
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2571	NC_013964	CGGG	2	8	88733	88740	0 %	0 %	75 %	25 %	292494018
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2582	NC_013964	GC	4	8	89149	89156	0 %	0 %	50 %	50 %	292494018
2583	NC_013964	CCG	2	6	89166	89171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494018
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2592	NC_013964	CAG	2	6	89450	89455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494018
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2602	NC_013964	GACGCC	2	12	89872	89883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292494019
2603	NC_013964	TC	3	6	89973	89978	0 %	50 %	0 %	50 %	292494019
2604	NC_013964	GCG	2	6	89991	89996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494019
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2607	NC_013964	GGCG	2	8	90069	90076	0 %	0 %	75 %	25 %	292494019
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2611	NC_013964	GTCG	2	8	90187	90194	0 %	25 %	50 %	25 %	292494019
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2620	NC_013964	CGA	2	6	90438	90443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494019
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2624	NC_013964	GAC	2	6	90562	90567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494019
2625	NC_013964	TCG	2	6	90582	90587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494019
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2627	NC_013964	CGA	2	6	90656	90661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494020
2628	NC_013964	CGA	2	6	90707	90712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494020
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2697	NC_013964	TTA	2	6	93835	93840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2700	NC_013964	CTTA	2	8	93906	93913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2736	NC_013964	CCGCGG	2	12	95268	95279	0 %	0 %	50 %	50 %	292494023
2737	NC_013964	CGA	2	6	95310	95315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494023
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2742	NC_013964	CGG	2	6	95476	95481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2744	NC_013964	GTTCGC	2	12	95589	95600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2746	NC_013964	ACG	2	6	95671	95676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494024
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2872	NC_013964	CCG	2	6	99874	99879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494026
2873	NC_013964	CGA	2	6	99888	99893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494026
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2875	NC_013964	CGG	2	6	99985	99990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2876	NC_013964	CGA	2	6	100014	100019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2877	NC_013964	GA	4	8	100018	100025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2878	NC_013964	ACG	3	9	100026	100034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2879	NC_013964	CGG	2	6	100038	100043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2880	NC_013964	TCGC	2	8	100044	100051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2881	NC_013964	GTG	2	6	100076	100081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2882	NC_013964	CGGT	2	8	100098	100105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2883	NC_013964	GCC	2	6	100158	100163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494027
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2890	NC_013964	GCTC	2	8	100381	100388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2893	NC_013964	CGG	2	6	100478	100483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2993	NC_013964	GCC	2	6	104191	104196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494031
2994	NC_013964	AGT	2	6	104205	104210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494031
2995	NC_013964	ACG	2	6	104240	104245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494031
2996	NC_013964	CGA	2	6	104247	104252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494031
2997	NC_013964	GTA	2	6	104254	104259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494031
2998	NC_013964	GAT	2	6	104278	104283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494031
2999	NC_013964	TCA	2	6	104331	104336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494031
3000	NC_013964	AGCGCG	2	12	104366	104377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494031

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