MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013964	GCC	2	6	392114	392119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494271
11002	NC_013964	CGG	2	6	392173	392178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11003	NC_013964	CGG	3	9	392211	392219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11004	NC_013964	TCG	2	6	392226	392231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494271
11005	NC_013964	CGA	2	6	392308	392313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494271
11006	NC_013964	CGG	2	6	392335	392340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11007	NC_013964	GGC	2	6	392345	392350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11008	NC_013964	CGC	2	6	392374	392379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494271
11009	NC_013964	CGA	3	9	392389	392397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494271
11010	NC_013964	TCGC	2	8	392400	392407	0 %	25 %	25 %	50 %	292494271
11011	NC_013964	GGCG	2	8	392422	392429	0 %	0 %	75 %	25 %	292494271
11012	NC_013964	GCC	2	6	392436	392441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494271
11013	NC_013964	CCG	2	6	392493	392498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494271
11014	NC_013964	CGG	2	6	392560	392565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11015	NC_013964	CGA	3	9	392590	392598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494271
11016	NC_013964	GCGCC	2	10	392599	392608	0 %	0 %	40 %	60 %	292494271
11017	NC_013964	GGTT	2	8	392670	392677	0 %	50 %	50 %	0 %	292494271
11018	NC_013964	GCG	2	6	392692	392697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11019	NC_013964	CG	4	8	392699	392706	0 %	0 %	50 %	50 %	292494271
11020	NC_013964	GAC	2	6	392748	392753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494271
11021	NC_013964	CGG	2	6	392811	392816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494271
11022	NC_013964	TCG	2	6	392874	392879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_013964	GCGG	2	8	392883	392890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_013964	GCGG	2	8	392900	392907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_013964	GAGT	2	8	392911	392918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_013964	GGT	2	6	392964	392969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494272
11027	NC_013964	GACGG	2	10	392989	392998	20 %	0 %	60 %	20 %	292494272
11028	NC_013964	CGA	2	6	393045	393050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11029	NC_013964	CCCGG	2	10	393052	393061	0 %	0 %	40 %	60 %	292494272
11030	NC_013964	GAC	2	6	393063	393068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11031	NC_013964	GAC	2	6	393121	393126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11032	NC_013964	CCG	2	6	393134	393139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494272
11033	NC_013964	CGA	2	6	393210	393215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11034	NC_013964	CTG	2	6	393252	393257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11035	NC_013964	GCGCGA	2	12	393294	393305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494272
11036	NC_013964	CGAC	2	8	393329	393336	25 %	0 %	25 %	50 %	292494272
11037	NC_013964	GCG	2	6	393337	393342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494272
11038	NC_013964	CGTC	2	8	393359	393366	0 %	25 %	25 %	50 %	292494272
11039	NC_013964	GAC	3	9	393394	393402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494272
11040	NC_013964	GTG	2	6	393405	393410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494272
11041	NC_013964	CGCGG	2	10	393414	393423	0 %	0 %	60 %	40 %	292494272
11042	NC_013964	ACTCG	2	10	393468	393477	20 %	20 %	20 %	40 %	292494272
11043	NC_013964	TCGAGT	2	12	393596	393607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292494272
11044	NC_013964	CGGG	2	8	393620	393627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11045	NC_013964	GTG	2	6	393656	393661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_013964	CG	3	6	393679	393684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_013964	GCA	2	6	393705	393710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11048	NC_013964	GA	3	6	393731	393736	50 %	0 %	50 %	0 %	292494273
11049	NC_013964	GAG	2	6	393760	393765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494273
11050	NC_013964	CGC	2	6	393798	393803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494273
11051	NC_013964	CGA	2	6	393815	393820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11052	NC_013964	TCG	2	6	393860	393865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11053	NC_013964	GACG	2	8	393876	393883	25 %	0 %	50 %	25 %	292494273
11054	NC_013964	CGG	2	6	393933	393938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494273
11055	NC_013964	GCC	2	6	393961	393966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494273
11056	NC_013964	TCA	2	6	393971	393976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494273
11057	NC_013964	ACG	2	6	393983	393988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11058	NC_013964	CGG	2	6	393993	393998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494273
11059	NC_013964	CGA	2	6	394011	394016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11060	NC_013964	CCT	2	6	394038	394043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494273
11061	NC_013964	CGG	2	6	394044	394049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494273
11062	NC_013964	CTCA	2	8	394057	394064	25 %	25 %	0 %	50 %	292494273
11063	NC_013964	CGG	2	6	394125	394130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494273
11064	NC_013964	CGA	2	6	394143	394148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
11065	NC_013964	GAC	2	6	394168	394173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494273
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11067	NC_013964	CCG	2	6	394283	394288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494273
11068	NC_013964	GGCT	2	8	394336	394343	0 %	25 %	50 %	25 %	292494273
11069	NC_013964	GAGCG	2	10	394355	394364	20 %	0 %	60 %	20 %	292494273
11070	NC_013964	CG	3	6	394367	394372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_013964	CGGT	2	8	394394	394401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_013964	GCC	2	6	394429	394434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494274
11073	NC_013964	CGTGTT	2	12	394443	394454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	292494274
11074	NC_013964	CAG	2	6	394492	394497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494274
11075	NC_013964	TCG	2	6	394532	394537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494274
11076	NC_013964	CGT	2	6	394539	394544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494274
11077	NC_013964	TAC	2	6	394564	394569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494274
11078	NC_013964	GAC	4	12	394609	394620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494274
11079	NC_013964	CAG	2	6	394624	394629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494274
11080	NC_013964	CGAC	2	8	394690	394697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11081	NC_013964	CGC	2	6	394712	394717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_013964	CGCT	2	8	394723	394730	0 %	25 %	25 %	50 %	292494275
11083	NC_013964	AAT	2	6	394740	394745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292494275
11084	NC_013964	TCG	2	6	394876	394881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
11085	NC_013964	GCC	3	9	394906	394914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494275
11086	NC_013964	TCG	2	6	394936	394941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
11087	NC_013964	ATG	2	6	394957	394962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494275
11088	NC_013964	GAG	2	6	395001	395006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494275
11089	NC_013964	CGG	2	6	395007	395012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494275
11090	NC_013964	GCCG	2	8	395046	395053	0 %	0 %	50 %	50 %	292494275
11091	NC_013964	CG	3	6	395052	395057	0 %	0 %	50 %	50 %	292494275
11092	NC_013964	TCG	2	6	395062	395067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
11093	NC_013964	CG	3	6	395100	395105	0 %	0 %	50 %	50 %	292494275
11094	NC_013964	TCG	2	6	395176	395181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
11095	NC_013964	GCG	2	6	395264	395269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494275
11096	NC_013964	TG	3	6	395300	395305	0 %	50 %	50 %	0 %	292494275
11097	NC_013964	TCG	2	6	395308	395313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
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11100	NC_013964	AC	3	6	395386	395391	50 %	0 %	0 %	50 %	292494275
11101	NC_013964	GTC	2	6	395412	395417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494275
11102	NC_013964	CCGT	2	8	395485	395492	0 %	25 %	25 %	50 %	292494275
11103	NC_013964	TCGG	2	8	395527	395534	0 %	25 %	50 %	25 %	292494275
11104	NC_013964	GGC	2	6	395537	395542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494275
11105	NC_013964	CCT	2	6	395576	395581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494275
11106	NC_013964	CGG	2	6	395625	395630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494275
11107	NC_013964	CCA	2	6	395633	395638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494275
11108	NC_013964	CTC	2	6	395643	395648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494275
11109	NC_013964	GGT	2	6	395669	395674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494275
11110	NC_013964	ACGGTG	2	12	395680	395691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494275
11111	NC_013964	CGCT	2	8	395718	395725	0 %	25 %	25 %	50 %	292494275
11112	NC_013964	CGG	2	6	395819	395824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_013964	G	6	6	395865	395870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_013964	CGA	2	6	395943	395948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494276
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11116	NC_013964	TCG	2	6	395972	395977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494276
11117	NC_013964	CG	3	6	395976	395981	0 %	0 %	50 %	50 %	292494276
11118	NC_013964	CGAGGT	2	12	396021	396032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494276
11119	NC_013964	CG	3	6	396046	396051	0 %	0 %	50 %	50 %	292494276
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11483	NC_013964	TTC	2	6	408562	408567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494287
11484	NC_013964	GTA	3	9	408576	408584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494287
11485	NC_013964	GAACTC	2	12	408591	408602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292494287
11486	NC_013964	GAT	2	6	408666	408671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494287
11487	NC_013964	CGA	2	6	408716	408721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494287
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11490	NC_013964	CG	3	6	408867	408872	0 %	0 %	50 %	50 %	292494287
11491	NC_013964	GCC	2	6	408918	408923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494287
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