MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013964	CGT	2	6	374242	374247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494256
10502	NC_013964	CGA	2	6	374251	374256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494256
10503	NC_013964	CCG	2	6	374277	374282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494256
10504	NC_013964	TCC	2	6	374321	374326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494256
10505	NC_013964	GAG	2	6	374327	374332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494256
10506	NC_013964	CGC	2	6	374336	374341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494256
10507	NC_013964	GTC	2	6	374342	374347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494256
10508	NC_013964	CGA	2	6	374350	374355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494256
10509	NC_013964	C	6	6	374374	374379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10510	NC_013964	CA	3	6	374423	374428	50 %	0 %	0 %	50 %	292494257
10511	NC_013964	CGA	2	6	374434	374439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10512	NC_013964	ATC	2	6	374519	374524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494257
10513	NC_013964	CGG	2	6	374553	374558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494257
10514	NC_013964	GGC	2	6	374572	374577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494257
10515	NC_013964	CGC	2	6	374590	374595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494257
10516	NC_013964	TCG	2	6	374676	374681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10517	NC_013964	CGT	2	6	374686	374691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10518	NC_013964	CGG	2	6	374749	374754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494257
10519	NC_013964	GAAC	2	8	374785	374792	50 %	0 %	25 %	25 %	292494257
10520	NC_013964	GAG	2	6	374804	374809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494257
10521	NC_013964	CGT	2	6	374881	374886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10522	NC_013964	CGC	2	6	374899	374904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494257
10523	NC_013964	CAT	2	6	374917	374922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494257
10524	NC_013964	CA	3	6	374945	374950	50 %	0 %	0 %	50 %	292494257
10525	NC_013964	GCGCG	2	10	375013	375022	0 %	0 %	60 %	40 %	292494257
10526	NC_013964	GAT	2	6	375064	375069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494257
10527	NC_013964	CTG	2	6	375089	375094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10528	NC_013964	GCG	2	6	375114	375119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494257
10529	NC_013964	ACG	2	6	375141	375146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10530	NC_013964	C	6	6	375169	375174	0 %	0 %	0 %	100 %	292494257
10531	NC_013964	GAG	2	6	375245	375250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494257
10532	NC_013964	CGAC	2	8	375268	375275	25 %	0 %	25 %	50 %	292494257
10533	NC_013964	GCC	2	6	375321	375326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494257
10534	NC_013964	GTCGG	2	10	375425	375434	0 %	20 %	60 %	20 %	292494257
10535	NC_013964	TCG	2	6	375456	375461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10536	NC_013964	GAC	2	6	375478	375483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10537	NC_013964	TCA	2	6	375486	375491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494257
10538	NC_013964	CCCG	2	8	375529	375536	0 %	0 %	25 %	75 %	292494257
10539	NC_013964	TCG	2	6	375537	375542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10540	NC_013964	GACC	2	8	375544	375551	25 %	0 %	25 %	50 %	292494257
10541	NC_013964	CGC	2	6	375565	375570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494257
10542	NC_013964	CGT	2	6	375586	375591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10543	NC_013964	GTC	2	6	375611	375616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10544	NC_013964	CG	3	6	375617	375622	0 %	0 %	50 %	50 %	292494257
10545	NC_013964	TCG	2	6	375666	375671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494257
10546	NC_013964	AGG	2	6	375672	375677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494257
10547	NC_013964	CGAG	2	8	375682	375689	25 %	0 %	50 %	25 %	292494257
10548	NC_013964	CGC	2	6	375745	375750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494257
10549	NC_013964	GAA	2	6	375768	375773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494257
10550	NC_013964	GAC	2	6	375848	375853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10551	NC_013964	GAG	2	6	375884	375889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494258
10552	NC_013964	CGC	2	6	375913	375918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10553	NC_013964	CGT	2	6	375940	375945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10554	NC_013964	GCC	2	6	375959	375964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10555	NC_013964	GCCTCG	2	12	376014	376025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494258
10556	NC_013964	GAC	2	6	376037	376042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10557	NC_013964	AGA	2	6	376135	376140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494258
10558	NC_013964	CGGG	2	8	376199	376206	0 %	0 %	75 %	25 %	292494258
10559	NC_013964	CGC	2	6	376274	376279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10560	NC_013964	CCT	2	6	376288	376293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494258
10561	NC_013964	CGG	2	6	376294	376299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494258
10562	NC_013964	TGG	2	6	376305	376310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494258
10563	NC_013964	GTA	2	6	376379	376384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494258
10564	NC_013964	TGA	2	6	376390	376395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494258
10565	NC_013964	ATG	3	9	376419	376427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494258
10566	NC_013964	CGC	2	6	376456	376461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10567	NC_013964	CGGT	2	8	376491	376498	0 %	25 %	50 %	25 %	292494258
10568	NC_013964	GTGACG	2	12	376518	376529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494258
10569	NC_013964	GAC	2	6	376562	376567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10570	NC_013964	GCC	2	6	376568	376573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10571	NC_013964	ACG	3	9	376602	376610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10572	NC_013964	TCGG	2	8	376614	376621	0 %	25 %	50 %	25 %	292494258
10573	NC_013964	CGT	2	6	376672	376677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10574	NC_013964	GAG	2	6	376719	376724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494258
10575	NC_013964	TCGATG	2	12	376725	376736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292494258
10576	NC_013964	CGG	2	6	376757	376762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494258
10577	NC_013964	CGT	2	6	376777	376782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10578	NC_013964	CGT	2	6	376792	376797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10579	NC_013964	AGC	2	6	376884	376889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
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10581	NC_013964	CTG	2	6	376922	376927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
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10583	NC_013964	CCA	2	6	377003	377008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494258
10584	NC_013964	GCC	3	9	377015	377023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10585	NC_013964	GTCGT	2	10	377187	377196	0 %	40 %	40 %	20 %	292494258
10586	NC_013964	CGGG	2	8	377230	377237	0 %	0 %	75 %	25 %	292494258
10587	NC_013964	CGC	2	6	377248	377253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
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10589	NC_013964	GCC	2	6	377277	377282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10590	NC_013964	CGC	2	6	377288	377293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494258
10591	NC_013964	TCG	2	6	377307	377312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494258
10592	NC_013964	ACG	2	6	377404	377409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494258
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10594	NC_013964	CGAGA	2	10	377432	377441	40 %	0 %	40 %	20 %	292494258
10595	NC_013964	GA	3	6	377458	377463	50 %	0 %	50 %	0 %	292494258
10596	NC_013964	GTCG	2	8	377479	377486	0 %	25 %	50 %	25 %	292494259
10597	NC_013964	GAA	2	6	377513	377518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494259
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10601	NC_013964	CGA	2	6	377647	377652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494259
10602	NC_013964	CGA	2	6	377671	377676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494259
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10605	NC_013964	CGA	2	6	377830	377835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494259
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10610	NC_013964	CGAGTC	2	12	377939	377950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292494259
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10612	NC_013964	CGA	2	6	377998	378003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494259
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10616	NC_013964	CGGC	2	8	378063	378070	0 %	0 %	50 %	50 %	292494259
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10739	NC_013964	GCG	3	9	382709	382717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494262
10740	NC_013964	CGA	2	6	382737	382742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494262
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10742	NC_013964	CG	3	6	382811	382816	0 %	0 %	50 %	50 %	292494262
10743	NC_013964	AG	3	6	382828	382833	50 %	0 %	50 %	0 %	292494262
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