MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013964	GTC	2	6	355385	355390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10002	NC_013964	CCA	2	6	355417	355422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494242
10003	NC_013964	GTGG	2	8	355453	355460	0 %	25 %	75 %	0 %	292494242
10004	NC_013964	GGC	2	6	355470	355475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10005	NC_013964	GAC	3	9	355486	355494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10006	NC_013964	GTC	2	6	355562	355567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10007	NC_013964	CGG	3	9	355579	355587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10008	NC_013964	AGG	2	6	355683	355688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494242
10009	NC_013964	GGACG	2	10	355750	355759	20 %	0 %	60 %	20 %	292494242
10010	NC_013964	TGA	2	6	355827	355832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494242
10011	NC_013964	CGC	2	6	355834	355839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494242
10012	NC_013964	CTGT	2	8	355850	355857	0 %	50 %	25 %	25 %	292494242
10013	NC_013964	GC	3	6	355888	355893	0 %	0 %	50 %	50 %	292494242
10014	NC_013964	CGG	2	6	355915	355920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10015	NC_013964	CGA	2	6	355975	355980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10016	NC_013964	CGC	2	6	355984	355989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494242
10017	NC_013964	GCG	3	9	356017	356025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10018	NC_013964	GAG	2	6	356036	356041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494242
10019	NC_013964	CGA	2	6	356044	356049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10020	NC_013964	CGA	2	6	356167	356172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10021	NC_013964	TGGCGA	2	12	356202	356213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494242
10022	NC_013964	AGC	2	6	356228	356233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10023	NC_013964	GCG	2	6	356339	356344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10024	NC_013964	CGA	2	6	356386	356391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10025	NC_013964	GAC	2	6	356531	356536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10026	NC_013964	GCG	2	6	356635	356640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10027	NC_013964	CAC	2	6	356660	356665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494242
10028	NC_013964	CGG	2	6	356703	356708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10029	NC_013964	CGG	2	6	356812	356817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494242
10030	NC_013964	GAC	2	6	356864	356869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10031	NC_013964	GC	3	6	356874	356879	0 %	0 %	50 %	50 %	292494242
10032	NC_013964	CGA	2	6	356959	356964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10033	NC_013964	GCCC	2	8	357015	357022	0 %	0 %	25 %	75 %	292494242
10034	NC_013964	ACG	2	6	357045	357050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
10035	NC_013964	AGG	2	6	357111	357116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494242
10036	NC_013964	GTCG	2	8	357141	357148	0 %	25 %	50 %	25 %	292494243
10037	NC_013964	CGA	2	6	357201	357206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10038	NC_013964	GC	3	6	357208	357213	0 %	0 %	50 %	50 %	292494243
10039	NC_013964	CGG	2	6	357222	357227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494243
10040	NC_013964	CTG	2	6	357244	357249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10041	NC_013964	GC	3	6	357344	357349	0 %	0 %	50 %	50 %	292494243
10042	NC_013964	ACG	2	6	357359	357364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10043	NC_013964	GC	4	8	357393	357400	0 %	0 %	50 %	50 %	292494243
10044	NC_013964	TCGG	2	8	357424	357431	0 %	25 %	50 %	25 %	292494243
10045	NC_013964	ACG	2	6	357494	357499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10046	NC_013964	CGG	2	6	357503	357508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494243
10047	NC_013964	CGG	2	6	357522	357527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494243
10048	NC_013964	GTC	2	6	357532	357537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10049	NC_013964	GCCG	3	12	357546	357557	0 %	0 %	50 %	50 %	292494243
10050	NC_013964	GCG	2	6	357568	357573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494243
10051	NC_013964	GAC	2	6	357574	357579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10052	NC_013964	CGT	2	6	357696	357701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10053	NC_013964	CGA	2	6	357726	357731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10054	NC_013964	CG	3	6	357805	357810	0 %	0 %	50 %	50 %	292494243
10055	NC_013964	TCG	2	6	357812	357817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10056	NC_013964	GTC	2	6	357835	357840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10057	NC_013964	CCG	2	6	357869	357874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494243
10058	NC_013964	CGA	2	6	357879	357884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10059	NC_013964	ACG	2	6	357911	357916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494243
10060	NC_013964	GAG	2	6	357925	357930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494243
10061	NC_013964	CCG	2	6	357998	358003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_013964	GCG	2	6	358044	358049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_013964	ACCGA	2	10	358055	358064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10064	NC_013964	CTG	2	6	358079	358084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_013964	GAC	2	6	358124	358129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10066	NC_013964	AGC	2	6	358173	358178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10067	NC_013964	GTC	2	6	358199	358204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10068	NC_013964	CGT	2	6	358210	358215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10069	NC_013964	GAG	2	6	358223	358228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494244
10070	NC_013964	CCG	2	6	358237	358242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494244
10071	NC_013964	GTC	2	6	358259	358264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10072	NC_013964	GCGA	2	8	358275	358282	25 %	0 %	50 %	25 %	292494244
10073	NC_013964	CCG	2	6	358296	358301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494244
10074	NC_013964	CG	3	6	358330	358335	0 %	0 %	50 %	50 %	292494244
10075	NC_013964	CGC	2	6	358356	358361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494244
10076	NC_013964	CGACGC	2	12	358390	358401	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292494244
10077	NC_013964	TCG	2	6	358443	358448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10078	NC_013964	CG	3	6	358499	358504	0 %	0 %	50 %	50 %	292494244
10079	NC_013964	CCG	2	6	358518	358523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494244
10080	NC_013964	CGA	2	6	358531	358536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10081	NC_013964	TCGGCG	2	12	358545	358556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292494244
10082	NC_013964	GTC	2	6	358625	358630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10083	NC_013964	GCG	2	6	358658	358663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494244
10084	NC_013964	GCG	3	9	358670	358678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494244
10085	NC_013964	GCGACG	2	12	358698	358709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494244
10086	NC_013964	GCT	2	6	358747	358752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10087	NC_013964	CGG	2	6	358759	358764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494244
10088	NC_013964	CGTCG	2	10	358783	358792	0 %	20 %	40 %	40 %	292494244
10089	NC_013964	GC	3	6	358797	358802	0 %	0 %	50 %	50 %	292494244
10090	NC_013964	TCCGCG	2	12	358812	358823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494244
10091	NC_013964	CGA	2	6	358849	358854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10092	NC_013964	CGG	2	6	358866	358871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494244
10093	NC_013964	CCG	2	6	358896	358901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494244
10094	NC_013964	TCG	2	6	358914	358919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10095	NC_013964	CGT	2	6	358939	358944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10096	NC_013964	TCG	2	6	358962	358967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494244
10097	NC_013964	CGAC	2	8	358969	358976	25 %	0 %	25 %	50 %	292494244
10098	NC_013964	CGAC	2	8	359080	359087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_013964	CGG	2	6	359122	359127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494245
10100	NC_013964	CGT	2	6	359154	359159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494245
10101	NC_013964	GACC	2	8	359205	359212	25 %	0 %	25 %	50 %	292494245
10102	NC_013964	GGC	2	6	359231	359236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494245
10103	NC_013964	CGC	2	6	359270	359275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494246
10104	NC_013964	CCG	2	6	359342	359347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494246
10105	NC_013964	GGC	2	6	359348	359353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494246
10106	NC_013964	CGG	2	6	359355	359360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494246
10107	NC_013964	GTC	2	6	359391	359396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494246
10108	NC_013964	ACG	2	6	359404	359409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494246
10109	NC_013964	CGG	2	6	359421	359426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494246
10110	NC_013964	GTC	2	6	359457	359462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494246
10111	NC_013964	ACG	2	6	359476	359481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494246
10112	NC_013964	GGA	2	6	359513	359518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494246
10113	NC_013964	CG	3	6	359527	359532	0 %	0 %	50 %	50 %	292494246
10114	NC_013964	GTCG	2	8	359537	359544	0 %	25 %	50 %	25 %	292494246
10115	NC_013964	CCG	2	6	359569	359574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494246
10116	NC_013964	ACG	2	6	359590	359595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494246
10117	NC_013964	CTC	2	6	359598	359603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494246
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10119	NC_013964	CGA	2	6	359618	359623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494246
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10224	NC_013964	TCGG	2	8	363318	363325	0 %	25 %	50 %	25 %	292494249
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10226	NC_013964	GCGA	2	8	363522	363529	25 %	0 %	50 %	25 %	292494249
10227	NC_013964	CCGC	2	8	363570	363577	0 %	0 %	25 %	75 %	292494249
10228	NC_013964	GCTCGC	2	12	363607	363618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494249
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10234	NC_013964	ACCG	2	8	364086	364093	25 %	0 %	25 %	50 %	292494250
10235	NC_013964	CGA	2	6	364133	364138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494250
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10238	NC_013964	GAC	2	6	364215	364220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494250
10239	NC_013964	TCG	2	6	364228	364233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494250
10240	NC_013964	CGG	2	6	364249	364254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494250
10241	NC_013964	GTC	2	6	364316	364321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494250
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10253	NC_013964	AGGG	2	8	364800	364807	25 %	0 %	75 %	0 %	292494250
10254	NC_013964	GGTC	2	8	364835	364842	0 %	25 %	50 %	25 %	292494250
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10341	NC_013964	CA	3	6	368438	368443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10342	NC_013964	GT	3	6	368445	368450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10343	NC_013964	CGA	2	6	368534	368539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10345	NC_013964	GCTC	2	8	368651	368658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10346	NC_013964	CGCGAG	2	12	368671	368682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494253
10347	NC_013964	GT	3	6	368717	368722	0 %	50 %	50 %	0 %	292494253
10348	NC_013964	GGGCC	2	10	368760	368769	0 %	0 %	60 %	40 %	292494253
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10350	NC_013964	CGGT	2	8	368912	368919	0 %	25 %	50 %	25 %	292494253
10351	NC_013964	GGT	3	9	368917	368925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494253
10352	NC_013964	CGG	2	6	369012	369017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494253
10353	NC_013964	TGT	2	6	369018	369023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494253
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10355	NC_013964	ACC	2	6	369057	369062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494253
10356	NC_013964	CCCA	2	8	369103	369110	25 %	0 %	0 %	75 %	292494253
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10479	NC_013964	CGA	3	9	373459	373467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494256
10480	NC_013964	C	6	6	373491	373496	0 %	0 %	0 %	100 %	292494256
10481	NC_013964	GCC	2	6	373497	373502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494256
10482	NC_013964	GCGA	2	8	373562	373569	25 %	0 %	50 %	25 %	292494256
10483	NC_013964	AG	3	6	373606	373611	50 %	0 %	50 %	0 %	292494256
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