MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_013964	ACC	2	6	338825	338830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9502	NC_013964	CCG	2	6	338834	338839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9503	NC_013964	ACC	2	6	338841	338846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9504	NC_013964	CCG	2	6	338850	338855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9505	NC_013964	ACC	2	6	338857	338862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9506	NC_013964	CCG	2	6	338866	338871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9507	NC_013964	GC	3	6	338896	338901	0 %	0 %	50 %	50 %	292494223
9508	NC_013964	CGA	2	6	338953	338958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9509	NC_013964	CGT	2	6	338974	338979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9510	NC_013964	CGC	2	6	339004	339009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494223
9511	NC_013964	CGGC	2	8	339084	339091	0 %	0 %	50 %	50 %	292494223
9512	NC_013964	CGA	2	6	339094	339099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9513	NC_013964	CGG	2	6	339112	339117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494223
9514	NC_013964	CGCCGT	2	12	339172	339183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494223
9515	NC_013964	ACG	2	6	339213	339218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9516	NC_013964	CGG	2	6	339235	339240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494223
9517	NC_013964	CCCG	2	8	339259	339266	0 %	0 %	25 %	75 %	292494223
9518	NC_013964	CCG	2	6	339310	339315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494223
9519	NC_013964	GAC	2	6	339326	339331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9520	NC_013964	CGA	2	6	339424	339429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9521	NC_013964	CTC	2	6	339464	339469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494223
9522	NC_013964	GAC	2	6	339473	339478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9523	NC_013964	GTC	2	6	339482	339487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9524	NC_013964	GGC	3	9	339494	339502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494223
9525	NC_013964	CGG	2	6	339526	339531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494223
9526	NC_013964	CCG	2	6	339538	339543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494223
9527	NC_013964	CG	3	6	339562	339567	0 %	0 %	50 %	50 %	292494223
9528	NC_013964	ACTCG	2	10	339569	339578	20 %	20 %	20 %	40 %	292494223
9529	NC_013964	TCG	2	6	339594	339599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494223
9530	NC_013964	GCC	2	6	339612	339617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494223
9531	NC_013964	TGT	2	6	339691	339696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_013964	CAT	2	6	339725	339730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9533	NC_013964	AGT	2	6	339744	339749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_013964	CGTAT	2	10	339759	339768	20 %	40 %	20 %	20 %	292494224
9535	NC_013964	TCG	2	6	339855	339860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9536	NC_013964	TGG	2	6	339894	339899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494224
9537	NC_013964	ACG	3	9	339906	339914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9538	NC_013964	GAC	2	6	339928	339933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9539	NC_013964	TCGAC	2	10	339943	339952	20 %	20 %	20 %	40 %	292494224
9540	NC_013964	CCG	2	6	339957	339962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494224
9541	NC_013964	CGA	2	6	339964	339969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9542	NC_013964	CGA	2	6	340002	340007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9543	NC_013964	GGT	2	6	340024	340029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494224
9544	NC_013964	TCG	2	6	340083	340088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9545	NC_013964	CGA	2	6	340117	340122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9546	NC_013964	GTC	2	6	340127	340132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9547	NC_013964	TCG	2	6	340136	340141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9548	NC_013964	CG	3	6	340146	340151	0 %	0 %	50 %	50 %	292494224
9549	NC_013964	GACGCC	2	12	340174	340185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292494224
9550	NC_013964	CGA	2	6	340210	340215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9551	NC_013964	GGC	2	6	340237	340242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494224
9552	NC_013964	CCT	2	6	340287	340292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494224
9553	NC_013964	GC	4	8	340306	340313	0 %	0 %	50 %	50 %	292494224
9554	NC_013964	ACG	2	6	340314	340319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9555	NC_013964	TCG	2	6	340329	340334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9556	NC_013964	CGA	3	9	340348	340356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9557	NC_013964	CGA	2	6	340365	340370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9558	NC_013964	GTC	2	6	340418	340423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494224
9559	NC_013964	AAC	2	6	340517	340522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_013964	ATA	2	6	340544	340549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_013964	GCGA	2	8	340610	340617	25 %	0 %	50 %	25 %	292494225
9562	NC_013964	ACG	2	6	340624	340629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494225
9563	NC_013964	CGG	2	6	340676	340681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494225
9564	NC_013964	CGG	3	9	340716	340724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494225
9565	NC_013964	ACCG	2	8	340734	340741	25 %	0 %	25 %	50 %	292494225
9566	NC_013964	ACG	2	6	340780	340785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494225
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9568	NC_013964	CGG	2	6	340836	340841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494225
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9570	NC_013964	CAG	2	6	340885	340890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494225
9571	NC_013964	ACG	2	6	340892	340897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494225
9572	NC_013964	CAA	2	6	340917	340922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494225
9573	NC_013964	CGG	2	6	340923	340928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494225
9574	NC_013964	CCG	2	6	340978	340983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494225
9575	NC_013964	GAG	2	6	341050	341055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494225
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9582	NC_013964	GAG	2	6	341191	341196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494225
9583	NC_013964	CGC	2	6	341219	341224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494225
9584	NC_013964	TCG	2	6	341261	341266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494225
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9586	NC_013964	CGACC	2	10	341383	341392	20 %	0 %	20 %	60 %	292494225
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9589	NC_013964	CGT	2	6	341640	341645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494225
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9591	NC_013964	G	6	6	341653	341658	0 %	0 %	100 %	0 %	292494225
9592	NC_013964	CGA	2	6	341685	341690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494225
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9594	NC_013964	GC	3	6	341746	341751	0 %	0 %	50 %	50 %	292494225
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9597	NC_013964	CGCGG	2	10	341890	341899	0 %	0 %	60 %	40 %	292494225
9598	NC_013964	GAG	2	6	341935	341940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494225
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9600	NC_013964	GAG	2	6	341977	341982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494225
9601	NC_013964	GGC	2	6	342118	342123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494226
9602	NC_013964	TGT	2	6	342126	342131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494226
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9605	NC_013964	CTT	2	6	342292	342297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494226
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9608	NC_013964	GCT	2	6	342349	342354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494226
9609	NC_013964	GTC	2	6	342388	342393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494226
9610	NC_013964	TCG	2	6	342402	342407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494226
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9615	NC_013964	GTC	2	6	342569	342574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494226
9616	NC_013964	ACA	2	6	342597	342602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494226
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9986	NC_013964	CGA	2	6	354904	354909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
9987	NC_013964	CCGA	2	8	354914	354921	25 %	0 %	25 %	50 %	292494242
9988	NC_013964	CGC	2	6	354931	354936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494242
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9990	NC_013964	CCCGGC	2	12	355078	355089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494242
9991	NC_013964	CGA	2	6	355096	355101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494242
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