MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013964	CGA	2	6	321915	321920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494202
9002	NC_013964	CTC	2	6	321931	321936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494202
9003	NC_013964	TCC	2	6	321974	321979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494202
9004	NC_013964	TCC	2	6	321995	322000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494202
9005	NC_013964	TAC	2	6	322051	322056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494202
9006	NC_013964	GCC	2	6	322059	322064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494202
9007	NC_013964	TCG	2	6	322118	322123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494202
9008	NC_013964	GCG	2	6	322129	322134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_013964	ACG	2	6	322136	322141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_013964	TGCC	2	8	322228	322235	0 %	25 %	25 %	50 %	292494203
9011	NC_013964	CGA	3	9	322255	322263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9012	NC_013964	CGAG	2	8	322294	322301	25 %	0 %	50 %	25 %	292494203
9013	NC_013964	CGT	2	6	322337	322342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9014	NC_013964	TCG	2	6	322425	322430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9015	NC_013964	CCG	2	6	322434	322439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494203
9016	NC_013964	CGG	2	6	322480	322485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9017	NC_013964	CGAC	2	8	322576	322583	25 %	0 %	25 %	50 %	292494203
9018	NC_013964	CGCC	2	8	322603	322610	0 %	0 %	25 %	75 %	292494203
9019	NC_013964	CCG	2	6	322611	322616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494203
9020	NC_013964	CGCC	2	8	322636	322643	0 %	0 %	25 %	75 %	292494203
9021	NC_013964	CGG	2	6	322654	322659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9022	NC_013964	ACG	2	6	322681	322686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9023	NC_013964	GAA	2	6	322724	322729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494203
9024	NC_013964	CGT	2	6	322754	322759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9025	NC_013964	GTC	2	6	322764	322769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9026	NC_013964	CGT	2	6	322774	322779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9027	NC_013964	GGC	2	6	322784	322789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9028	NC_013964	CGG	2	6	322795	322800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9029	NC_013964	ACGTC	2	10	322819	322828	20 %	20 %	20 %	40 %	292494203
9030	NC_013964	GACTC	2	10	322858	322867	20 %	20 %	20 %	40 %	292494203
9031	NC_013964	CGC	2	6	322881	322886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494203
9032	NC_013964	CGT	2	6	322900	322905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9033	NC_013964	CAC	2	6	322922	322927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494203
9034	NC_013964	ACG	2	6	322932	322937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9035	NC_013964	CCGTC	2	10	322996	323005	0 %	20 %	20 %	60 %	292494203
9036	NC_013964	GTCGG	2	10	323049	323058	0 %	20 %	60 %	20 %	292494203
9037	NC_013964	CGA	2	6	323066	323071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9038	NC_013964	CGT	4	12	323078	323089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9039	NC_013964	CCA	2	6	323106	323111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494203
9040	NC_013964	CCACCG	2	12	323115	323126	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	292494203
9041	NC_013964	GCCACC	2	12	323132	323143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	292494203
9042	NC_013964	ACCGCC	2	12	323147	323158	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	292494203
9043	NC_013964	GTG	2	6	323193	323198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494203
9044	NC_013964	TCG	2	6	323215	323220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9045	NC_013964	CGA	2	6	323240	323245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9046	NC_013964	TCC	2	6	323325	323330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494203
9047	NC_013964	CGG	4	12	323348	323359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9048	NC_013964	CGG	2	6	323378	323383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9049	NC_013964	GTC	2	6	323396	323401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9050	NC_013964	GTC	2	6	323438	323443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9051	NC_013964	GAC	2	6	323504	323509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9052	NC_013964	CGA	2	6	323530	323535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494203
9053	NC_013964	GCG	2	6	323548	323553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9054	NC_013964	GCGAG	2	10	323584	323593	20 %	0 %	60 %	20 %	292494203
9055	NC_013964	CGG	2	6	323624	323629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494203
9056	NC_013964	ACC	2	6	323640	323645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494203
9057	NC_013964	TCGG	2	8	323655	323662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9058	NC_013964	TCG	2	6	323682	323687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_013964	TCG	2	6	323730	323735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_013964	CGCTCG	2	12	323745	323756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_013964	CGA	2	6	323761	323766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_013964	CGA	2	6	323788	323793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9063	NC_013964	ACG	2	6	323794	323799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9064	NC_013964	CGA	2	6	323801	323806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9065	NC_013964	GAC	2	6	323831	323836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9066	NC_013964	GA	3	6	323889	323894	50 %	0 %	50 %	0 %	292494204
9067	NC_013964	CCT	2	6	323908	323913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494204
9068	NC_013964	CGT	3	9	323926	323934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9069	NC_013964	GCC	2	6	323943	323948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494204
9070	NC_013964	CGA	2	6	323956	323961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9071	NC_013964	GGC	2	6	323962	323967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494204
9072	NC_013964	CGC	2	6	323985	323990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494204
9073	NC_013964	GCC	2	6	324015	324020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494204
9074	NC_013964	GTC	2	6	324027	324032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9075	NC_013964	CGT	2	6	324060	324065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9076	NC_013964	CGT	2	6	324113	324118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9077	NC_013964	GCCG	2	8	324120	324127	0 %	0 %	50 %	50 %	292494204
9078	NC_013964	CGT	2	6	324188	324193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9079	NC_013964	TCG	2	6	324223	324228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494204
9080	NC_013964	CGG	3	9	324355	324363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494204
9081	NC_013964	GAG	2	6	324383	324388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494204
9082	NC_013964	C	6	6	324389	324394	0 %	0 %	0 %	100 %	292494204
9083	NC_013964	GCG	2	6	324401	324406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494204
9084	NC_013964	CCGT	2	8	324471	324478	0 %	25 %	25 %	50 %	292494204
9085	NC_013964	TGGG	2	8	324486	324493	0 %	25 %	75 %	0 %	292494204
9086	NC_013964	CTCGA	2	10	324509	324518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9087	NC_013964	AAT	2	6	324528	324533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_013964	ACC	2	6	324539	324544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_013964	GCG	2	6	324571	324576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_013964	GGA	2	6	324601	324606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_013964	CGA	2	6	324609	324614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_013964	CGGT	2	8	324628	324635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9093	NC_013964	ACCG	2	8	324638	324645	25 %	0 %	25 %	50 %	292494205
9094	NC_013964	GCC	2	6	324688	324693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494205
9095	NC_013964	CGG	2	6	324746	324751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494205
9096	NC_013964	GTCG	2	8	324815	324822	0 %	25 %	50 %	25 %	292494205
9097	NC_013964	GGCC	2	8	324827	324834	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9098	NC_013964	CG	3	6	324877	324882	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9099	NC_013964	CGT	2	6	324898	324903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9100	NC_013964	CGC	2	6	324904	324909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494205
9101	NC_013964	GAC	2	6	324922	324927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9102	NC_013964	GCC	2	6	324928	324933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494205
9103	NC_013964	CGA	2	6	324942	324947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9104	NC_013964	CGA	2	6	324969	324974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9105	NC_013964	GC	3	6	324985	324990	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9106	NC_013964	GC	4	8	325005	325012	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9107	NC_013964	GCCG	2	8	325104	325111	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9108	NC_013964	GC	3	6	325115	325120	0 %	0 %	50 %	50 %	292494205
9109	NC_013964	CGGT	2	8	325173	325180	0 %	25 %	50 %	25 %	292494205
9110	NC_013964	AGC	2	6	325198	325203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9111	NC_013964	GTA	2	6	325227	325232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494205
9112	NC_013964	GAC	2	6	325239	325244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9113	NC_013964	CGT	2	6	325253	325258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9114	NC_013964	CCT	2	6	325319	325324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494205
9115	NC_013964	ACG	2	6	325339	325344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9116	NC_013964	GCCA	2	8	325348	325355	25 %	0 %	25 %	50 %	292494205
9117	NC_013964	TCG	2	6	325366	325371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494205
9118	NC_013964	GAG	2	6	325374	325379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494205
9119	NC_013964	CTCGT	2	10	325399	325408	0 %	40 %	20 %	40 %	292494205
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9121	NC_013964	CGG	2	6	325424	325429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494205
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9238	NC_013964	GC	3	6	329561	329566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9239	NC_013964	CGC	2	6	329574	329579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9242	NC_013964	CGA	2	6	329813	329818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494210
9243	NC_013964	TCG	2	6	329821	329826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494210
9244	NC_013964	CCGG	2	8	329852	329859	0 %	0 %	50 %	50 %	292494210
9245	NC_013964	TCG	2	6	329860	329865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494210
9246	NC_013964	CGAC	2	8	329875	329882	25 %	0 %	25 %	50 %	292494210
9247	NC_013964	CGA	2	6	329917	329922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494210
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9249	NC_013964	CCT	2	6	329975	329980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494210
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9251	NC_013964	CCG	3	9	330055	330063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494210
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9253	NC_013964	CCT	2	6	330149	330154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494210
9254	NC_013964	CGACGC	2	12	330155	330166	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292494210
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9262	NC_013964	GGC	2	6	330335	330340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494210
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9264	NC_013964	CGAC	2	8	330381	330388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9265	NC_013964	CGT	2	6	330391	330396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9266	NC_013964	CGG	2	6	330426	330431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9267	NC_013964	CAG	2	6	330444	330449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9270	NC_013964	GTC	2	6	330519	330524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494211
9271	NC_013964	AG	3	6	330526	330531	50 %	0 %	50 %	0 %	292494211
9272	NC_013964	TCG	2	6	330577	330582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494211
9273	NC_013964	TGA	2	6	330592	330597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494211
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9275	NC_013964	GTC	2	6	330808	330813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494212
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9289	NC_013964	GTGC	2	8	331437	331444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9291	NC_013964	GT	3	6	331539	331544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9292	NC_013964	G	6	6	331548	331553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9293	NC_013964	GCC	2	6	331568	331573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9294	NC_013964	CGTGC	2	10	331606	331615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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9296	NC_013964	GTC	2	6	331642	331647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9351	NC_013964	CTC	2	6	333330	333335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494215
9352	NC_013964	GAC	2	6	333336	333341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494215
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9355	NC_013964	CGA	2	6	333428	333433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494215
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9357	NC_013964	CGCC	2	8	333476	333483	0 %	0 %	25 %	75 %	292494215
9358	NC_013964	CGA	2	6	333518	333523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494215
9359	NC_013964	CGG	2	6	333541	333546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9360	NC_013964	GAC	2	6	333551	333556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9361	NC_013964	CGGA	2	8	333585	333592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9362	NC_013964	ACCA	2	8	333603	333610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9363	NC_013964	CGA	2	6	333685	333690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494216
9364	NC_013964	CGAG	2	8	333753	333760	25 %	0 %	50 %	25 %	292494216
9365	NC_013964	CGA	2	6	333814	333819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494216
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