MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_013964	CAG	2	6	304806	304811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8502	NC_013964	CCGA	2	8	305005	305012	25 %	0 %	25 %	50 %	292494190
8503	NC_013964	AAC	2	6	305071	305076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494190
8504	NC_013964	CGT	2	6	305079	305084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8505	NC_013964	CGG	2	6	305088	305093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8506	NC_013964	ACA	2	6	305141	305146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494190
8507	NC_013964	TCG	2	6	305162	305167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8508	NC_013964	CGA	2	6	305192	305197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8509	NC_013964	GCG	2	6	305198	305203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8510	NC_013964	CAA	2	6	305220	305225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494190
8511	NC_013964	ACT	2	6	305240	305245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494190
8512	NC_013964	CGC	2	6	305246	305251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494190
8513	NC_013964	TCC	2	6	305252	305257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494190
8514	NC_013964	AGG	2	6	305312	305317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494190
8515	NC_013964	CGG	2	6	305367	305372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8516	NC_013964	CGG	2	6	305384	305389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8517	NC_013964	TCG	2	6	305396	305401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8518	NC_013964	GGC	2	6	305419	305424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8519	NC_013964	GTC	2	6	305425	305430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8520	NC_013964	CCG	2	6	305434	305439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494190
8521	NC_013964	CGA	2	6	305472	305477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8522	NC_013964	ACG	2	6	305480	305485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8523	NC_013964	CGA	2	6	305499	305504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8524	NC_013964	GTG	2	6	305535	305540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494190
8525	NC_013964	GCGA	2	8	305542	305549	25 %	0 %	50 %	25 %	292494190
8526	NC_013964	TGA	2	6	305573	305578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494190
8527	NC_013964	CGG	2	6	305595	305600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8528	NC_013964	CGT	2	6	305688	305693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8529	NC_013964	GC	3	6	305700	305705	0 %	0 %	50 %	50 %	292494190
8530	NC_013964	CCT	2	6	305742	305747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494190
8531	NC_013964	CGGC	2	8	305781	305788	0 %	0 %	50 %	50 %	292494190
8532	NC_013964	GGA	2	6	305802	305807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494190
8533	NC_013964	TCG	2	6	305861	305866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8534	NC_013964	GGC	2	6	305892	305897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8535	NC_013964	CAG	2	6	305908	305913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494190
8536	NC_013964	GCG	2	6	305927	305932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494190
8537	NC_013964	GGCC	2	8	305946	305953	0 %	0 %	50 %	50 %	292494190
8538	NC_013964	CGC	2	6	305981	305986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494190
8539	NC_013964	TCA	2	6	306026	306031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494190
8540	NC_013964	TCA	2	6	306110	306115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494191
8541	NC_013964	GAC	2	6	306118	306123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8542	NC_013964	CGT	2	6	306156	306161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8543	NC_013964	GAG	2	6	306217	306222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494191
8544	NC_013964	GACC	2	8	306246	306253	25 %	0 %	25 %	50 %	292494191
8545	NC_013964	ACA	2	6	306263	306268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494191
8546	NC_013964	CGT	2	6	306276	306281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8547	NC_013964	CGG	2	6	306291	306296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494191
8548	NC_013964	CGA	2	6	306306	306311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8549	NC_013964	CGA	2	6	306345	306350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8550	NC_013964	GC	3	6	306377	306382	0 %	0 %	50 %	50 %	292494191
8551	NC_013964	CGA	2	6	306387	306392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494191
8552	NC_013964	GCC	2	6	306396	306401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494191
8553	NC_013964	CG	3	6	306516	306521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8554	NC_013964	CCG	2	6	306523	306528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8555	NC_013964	CCG	2	6	306549	306554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8556	NC_013964	GTC	2	6	306568	306573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8557	NC_013964	CGG	2	6	306578	306583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494192
8558	NC_013964	CGC	2	6	306587	306592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494192
8559	NC_013964	CGA	2	6	306615	306620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8560	NC_013964	GC	3	6	306647	306652	0 %	0 %	50 %	50 %	292494192
8561	NC_013964	GGTC	2	8	306654	306661	0 %	25 %	50 %	25 %	292494192
8562	NC_013964	GTC	2	6	306670	306675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8563	NC_013964	GAG	2	6	306685	306690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494192
8564	NC_013964	CTC	2	6	306709	306714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494192
8565	NC_013964	CGC	2	6	306735	306740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494192
8566	NC_013964	CGTCGA	2	12	306762	306773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8567	NC_013964	TTG	2	6	306848	306853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494192
8568	NC_013964	GTA	2	6	306886	306891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494192
8569	NC_013964	GGA	2	6	306909	306914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494192
8570	NC_013964	CGG	2	6	306957	306962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494192
8571	NC_013964	TCGCGG	2	12	306983	306994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292494192
8572	NC_013964	CGT	2	6	307046	307051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8573	NC_013964	T	6	6	307072	307077	0 %	100 %	0 %	0 %	292494192
8574	NC_013964	GCCGCG	2	12	307141	307152	0 %	0 %	50 %	50 %	292494192
8575	NC_013964	CGG	2	6	307155	307160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494192
8576	NC_013964	GTC	2	6	307171	307176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8577	NC_013964	CCGT	2	8	307181	307188	0 %	25 %	25 %	50 %	292494192
8578	NC_013964	CGT	2	6	307197	307202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494192
8579	NC_013964	ACGA	2	8	307244	307251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8580	NC_013964	GC	3	6	307330	307335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8581	NC_013964	GGC	2	6	307342	307347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_013964	CGA	2	6	307379	307384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_013964	ACC	2	6	307403	307408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8584	NC_013964	CAGT	2	8	307606	307613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8585	NC_013964	CGGA	2	8	307634	307641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8586	NC_013964	TCAC	2	8	307656	307663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_013964	G	6	6	307664	307669	0 %	0 %	100 %	0 %	292494193
8588	NC_013964	CGG	2	6	307673	307678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
8589	NC_013964	TCC	2	6	307684	307689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494193
8590	NC_013964	CGA	2	6	307713	307718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8591	NC_013964	CGGCG	2	10	307743	307752	0 %	0 %	60 %	40 %	292494193
8592	NC_013964	GCT	2	6	307758	307763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8593	NC_013964	TCG	2	6	307766	307771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8594	NC_013964	TTC	2	6	307852	307857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494193
8595	NC_013964	GAT	2	6	307971	307976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494193
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8597	NC_013964	CGG	2	6	307994	307999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
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8601	NC_013964	CGG	2	6	308081	308086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
8602	NC_013964	ACG	2	6	308189	308194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8603	NC_013964	CGC	2	6	308195	308200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494193
8604	NC_013964	CGG	2	6	308210	308215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
8605	NC_013964	CGG	2	6	308298	308303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
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8608	NC_013964	GTC	2	6	308413	308418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8609	NC_013964	CGG	2	6	308565	308570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
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8611	NC_013964	CTT	2	6	308583	308588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494193
8612	NC_013964	TCT	2	6	308654	308659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494193
8613	NC_013964	CG	3	6	308717	308722	0 %	0 %	50 %	50 %	292494193
8614	NC_013964	CTCG	2	8	308766	308773	0 %	25 %	25 %	50 %	292494193
8615	NC_013964	TCG	2	6	308795	308800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8616	NC_013964	GCG	2	6	308801	308806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
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8618	NC_013964	GCA	2	6	308820	308825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8619	NC_013964	GCG	2	6	308833	308838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494193
8620	NC_013964	CGGTC	2	10	308847	308856	0 %	20 %	40 %	40 %	292494193
8621	NC_013964	CTC	2	6	308920	308925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494193
8622	NC_013964	CTCGTG	2	12	308938	308949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
8623	NC_013964	ACG	2	6	308950	308955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494193
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8625	NC_013964	CTC	2	6	308976	308981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494193
8626	NC_013964	GAT	2	6	308997	309002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494193
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8631	NC_013964	GTC	2	6	309088	309093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494193
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8634	NC_013964	CCT	3	9	309207	309215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494193
8635	NC_013964	AGACG	2	10	309219	309228	40 %	0 %	40 %	20 %	292494193
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8638	NC_013964	ACG	3	9	309290	309298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494193
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8640	NC_013964	GCC	2	6	309381	309386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8641	NC_013964	GTC	2	6	309425	309430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8642	NC_013964	GCA	2	6	309503	309508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494194
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8738	NC_013964	TCG	2	6	313315	313320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494196
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8984	NC_013964	CGA	2	6	321388	321393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494201
8985	NC_013964	CG	3	6	321400	321405	0 %	0 %	50 %	50 %	292494201
8986	NC_013964	CG	3	6	321410	321415	0 %	0 %	50 %	50 %	292494201
8987	NC_013964	CGT	2	6	321426	321431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494201
8988	NC_013964	CGAC	2	8	321464	321471	25 %	0 %	25 %	50 %	292494201
8989	NC_013964	GAG	2	6	321476	321481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494201
8990	NC_013964	CGG	2	6	321496	321501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494201
8991	NC_013964	CG	4	8	321546	321553	0 %	0 %	50 %	50 %	292494201
8992	NC_013964	CGA	2	6	321616	321621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494201
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8998	NC_013964	GCT	2	6	321831	321836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494202
8999	NC_013964	ACG	2	6	321880	321885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494202
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