MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013964	GAG	2	6	285254	285259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494174
8002	NC_013964	CGAG	2	8	285277	285284	25 %	0 %	50 %	25 %	292494174
8003	NC_013964	CGA	2	6	285309	285314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_013964	TCG	2	6	285345	285350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_013964	GCG	2	6	285413	285418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_013964	CGG	2	6	285503	285508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494175
8007	NC_013964	TCG	2	6	285513	285518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8008	NC_013964	CTC	2	6	285545	285550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494175
8009	NC_013964	GTC	2	6	285554	285559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8010	NC_013964	GTC	2	6	285563	285568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8011	NC_013964	CGT	2	6	285592	285597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8012	NC_013964	CGG	2	6	285613	285618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494175
8013	NC_013964	CGC	2	6	285626	285631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494175
8014	NC_013964	ACCG	2	8	285662	285669	25 %	0 %	25 %	50 %	292494175
8015	NC_013964	CGT	2	6	285673	285678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8016	NC_013964	AGT	2	6	285726	285731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494175
8017	NC_013964	TCG	3	9	285739	285747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494175
8018	NC_013964	GCC	2	6	285768	285773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494175
8019	NC_013964	GCC	2	6	285854	285859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_013964	CGT	2	6	285863	285868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_013964	CG	3	6	285906	285911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_013964	GAC	3	9	285916	285924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_013964	CGG	2	6	285929	285934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_013964	GTG	2	6	285942	285947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_013964	GT	3	6	286024	286029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_013964	AG	3	6	286035	286040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_013964	ACG	2	6	286042	286047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_013964	GA	3	6	286049	286054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_013964	CA	3	6	286189	286194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_013964	GTC	2	6	286210	286215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8031	NC_013964	ACG	2	6	286277	286282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8032	NC_013964	ACG	2	6	286297	286302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8033	NC_013964	TCG	2	6	286391	286396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8034	NC_013964	CAG	2	6	286416	286421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8035	NC_013964	CGT	2	6	286440	286445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8036	NC_013964	GGA	2	6	286573	286578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494176
8037	NC_013964	CGGA	2	8	286631	286638	25 %	0 %	50 %	25 %	292494176
8038	NC_013964	GCT	2	6	286662	286667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8039	NC_013964	GGCAC	2	10	286691	286700	20 %	0 %	40 %	40 %	292494176
8040	NC_013964	TGA	2	6	286763	286768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494176
8041	NC_013964	CGT	2	6	286809	286814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8042	NC_013964	ACGCC	2	10	286859	286868	20 %	0 %	20 %	60 %	292494176
8043	NC_013964	GAG	2	6	286879	286884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494176
8044	NC_013964	CGG	3	9	286917	286925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494176
8045	NC_013964	GAAG	2	8	286974	286981	50 %	0 %	50 %	0 %	292494176
8046	NC_013964	CCCG	2	8	286999	287006	0 %	0 %	25 %	75 %	292494176
8047	NC_013964	CGT	2	6	287019	287024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8048	NC_013964	CAA	2	6	287028	287033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494176
8049	NC_013964	CCGA	2	8	287049	287056	25 %	0 %	25 %	50 %	292494176
8050	NC_013964	CGA	2	6	287091	287096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8051	NC_013964	GC	3	6	287102	287107	0 %	0 %	50 %	50 %	292494176
8052	NC_013964	CGA	2	6	287109	287114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8053	NC_013964	CCT	2	6	287151	287156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494176
8054	NC_013964	GTC	2	6	287260	287265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8055	NC_013964	CTG	2	6	287344	287349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494176
8056	NC_013964	ACG	2	6	287467	287472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494177
8057	NC_013964	GTT	2	6	287483	287488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292494177
8058	NC_013964	ACG	2	6	287494	287499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494177
8059	NC_013964	CGG	2	6	287519	287524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494177
8060	NC_013964	GAGTCG	2	12	287526	287537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494177
8061	NC_013964	ACC	2	6	287603	287608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494177
8062	NC_013964	GTC	2	6	287622	287627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_013964	CCA	2	6	287691	287696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_013964	GT	3	6	287835	287840	0 %	50 %	50 %	0 %	292494178
8065	NC_013964	CT	3	6	287853	287858	0 %	50 %	0 %	50 %	292494178
8066	NC_013964	GCG	2	6	287889	287894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494178
8067	NC_013964	TCGG	2	8	288179	288186	0 %	25 %	50 %	25 %	292494178
8068	NC_013964	GAC	2	6	288194	288199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494178
8069	NC_013964	TCG	2	6	288246	288251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
8070	NC_013964	TCG	2	6	288345	288350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
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8072	NC_013964	TC	3	6	288457	288462	0 %	50 %	0 %	50 %	292494178
8073	NC_013964	TCC	2	6	288465	288470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494178
8074	NC_013964	CGA	2	6	288484	288489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494178
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8076	NC_013964	GTC	2	6	288617	288622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
8077	NC_013964	GTG	2	6	288623	288628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494178
8078	NC_013964	TTCG	2	8	288686	288693	0 %	50 %	25 %	25 %	292494178
8079	NC_013964	GTC	2	6	288710	288715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
8080	NC_013964	CGT	2	6	288730	288735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
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8082	NC_013964	CGT	2	6	288814	288819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494178
8083	NC_013964	CGC	2	6	288821	288826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494178
8084	NC_013964	TG	3	6	288831	288836	0 %	50 %	50 %	0 %	292494178
8085	NC_013964	TCC	2	6	288971	288976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494179
8086	NC_013964	CTG	2	6	289023	289028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494179
8087	NC_013964	GTA	2	6	289036	289041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494179
8088	NC_013964	GGT	2	6	289086	289091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494179
8089	NC_013964	CGG	2	6	289150	289155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494179
8090	NC_013964	GGA	2	6	289236	289241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494179
8091	NC_013964	CGA	2	6	289269	289274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494179
8092	NC_013964	ACCG	2	8	289277	289284	25 %	0 %	25 %	50 %	292494179
8093	NC_013964	TAC	2	6	289354	289359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_013964	AC	3	6	289358	289363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_013964	GT	3	6	289374	289379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_013964	ACC	2	6	289386	289391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_013964	TAC	2	6	289415	289420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_013964	GGT	2	6	289425	289430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_013964	GTC	2	6	289517	289522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8100	NC_013964	CGC	2	6	289529	289534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494180
8101	NC_013964	CTCG	2	8	289537	289544	0 %	25 %	25 %	50 %	292494180
8102	NC_013964	CGT	2	6	289547	289552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8103	NC_013964	TCG	2	6	289563	289568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8104	NC_013964	TCG	2	6	289590	289595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8105	NC_013964	G	6	6	289627	289632	0 %	0 %	100 %	0 %	292494180
8106	NC_013964	ACCG	2	8	289645	289652	25 %	0 %	25 %	50 %	292494180
8107	NC_013964	GAC	2	6	289708	289713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8108	NC_013964	CG	3	6	289736	289741	0 %	0 %	50 %	50 %	292494180
8109	NC_013964	GAC	2	6	289742	289747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8110	NC_013964	GTC	2	6	289760	289765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8111	NC_013964	ACGG	2	8	289795	289802	25 %	0 %	50 %	25 %	292494180
8112	NC_013964	TCG	2	6	289857	289862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8113	NC_013964	TGGTCG	2	12	289869	289880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	292494180
8114	NC_013964	TCGC	2	8	289905	289912	0 %	25 %	25 %	50 %	292494180
8115	NC_013964	CGC	2	6	289943	289948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494180
8116	NC_013964	CGT	2	6	290003	290008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
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8118	NC_013964	CG	4	8	290021	290028	0 %	0 %	50 %	50 %	292494180
8119	NC_013964	CGT	2	6	290068	290073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494180
8120	NC_013964	CGA	2	6	290128	290133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494180
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8122	NC_013964	CCG	2	6	290185	290190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494180
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8249	NC_013964	GAG	2	6	294765	294770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8250	NC_013964	GTCG	2	8	294875	294882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8251	NC_013964	GTT	2	6	294914	294919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8252	NC_013964	GGT	2	6	294924	294929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8361	NC_013964	CGA	2	6	299293	299298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8362	NC_013964	CCGG	2	8	299316	299323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8363	NC_013964	GACC	2	8	299359	299366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8364	NC_013964	CCCGA	2	10	299380	299389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8365	NC_013964	CCCGA	2	10	299395	299404	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8366	NC_013964	TCGG	2	8	299412	299419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8367	NC_013964	CCGC	2	8	299467	299474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8368	NC_013964	CGC	3	9	299527	299535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8369	NC_013964	GGCTG	2	10	299545	299554	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8370	NC_013964	GATT	2	8	299590	299597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8371	NC_013964	CGCTC	2	10	299642	299651	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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