MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013964	GAC	2	6	266088	266093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7502	NC_013964	GC	3	6	266099	266104	0 %	0 %	50 %	50 %	292494163
7503	NC_013964	CGA	2	6	266108	266113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7504	NC_013964	CGA	2	6	266120	266125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7505	NC_013964	CAG	2	6	266133	266138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7506	NC_013964	ACG	2	6	266224	266229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7507	NC_013964	CGG	2	6	266252	266257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494163
7508	NC_013964	CGTC	2	8	266259	266266	0 %	25 %	25 %	50 %	292494163
7509	NC_013964	CGA	2	6	266303	266308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7510	NC_013964	CGC	3	9	266325	266333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494163
7511	NC_013964	GC	3	6	266342	266347	0 %	0 %	50 %	50 %	292494163
7512	NC_013964	GAG	2	6	266349	266354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494163
7513	NC_013964	CGA	2	6	266420	266425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7514	NC_013964	GCCGAG	2	12	266427	266438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494163
7515	NC_013964	CGC	2	6	266453	266458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494163
7516	NC_013964	GTC	2	6	266464	266469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7517	NC_013964	AACGCC	2	12	266485	266496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	292494163
7518	NC_013964	CGT	2	6	266547	266552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7519	NC_013964	CGA	2	6	266570	266575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7520	NC_013964	GGTC	2	8	266631	266638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7521	NC_013964	CGG	2	6	266657	266662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_013964	CGCTGT	2	12	266688	266699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_013964	CGA	2	6	266776	266781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_013964	CATG	2	8	266836	266843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7525	NC_013964	AG	3	6	266879	266884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_013964	CCA	2	6	266962	266967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_013964	AAC	2	6	266971	266976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_013964	ATT	2	6	266988	266993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_013964	AAT	2	6	266996	267001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_013964	ATT	2	6	267006	267011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_013964	TTC	2	6	267026	267031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_013964	GACCAT	2	12	267120	267131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_013964	GAC	2	6	267137	267142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_013964	CGT	2	6	267185	267190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_013964	CGA	2	6	267240	267245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_013964	G	6	6	267347	267352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_013964	TCG	2	6	267370	267375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_013964	GA	3	6	267432	267437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_013964	GAG	2	6	267553	267558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_013964	ACT	2	6	267580	267585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_013964	ACC	2	6	267679	267684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_013964	CCAC	2	8	267694	267701	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7543	NC_013964	GT	3	6	267714	267719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_013964	CTA	2	6	267801	267806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_013964	CCG	2	6	267824	267829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_013964	GTT	2	6	267870	267875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_013964	GGGC	2	8	267891	267898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7548	NC_013964	CGG	2	6	267929	267934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_013964	CGC	2	6	267959	267964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7550	NC_013964	CGA	2	6	268007	268012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_013964	TCGC	2	8	268026	268033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7552	NC_013964	GGT	2	6	268148	268153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494164
7553	NC_013964	TCT	2	6	268154	268159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494164
7554	NC_013964	CTC	2	6	268207	268212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494164
7555	NC_013964	GCGA	2	8	268220	268227	25 %	0 %	50 %	25 %	292494164
7556	NC_013964	CTC	2	6	268279	268284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494164
7557	NC_013964	TCG	2	6	268364	268369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7558	NC_013964	CTGT	2	8	268370	268377	0 %	50 %	25 %	25 %	292494164
7559	NC_013964	CTCG	2	8	268455	268462	0 %	25 %	25 %	50 %	292494164
7560	NC_013964	CGG	2	6	268531	268536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494164
7561	NC_013964	CGA	2	6	268542	268547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7562	NC_013964	TCC	2	6	268586	268591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494164
7563	NC_013964	CTG	2	6	268603	268608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7564	NC_013964	CGC	2	6	268614	268619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494164
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7566	NC_013964	CCT	2	6	268656	268661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494164
7567	NC_013964	GTGA	2	8	268669	268676	25 %	25 %	50 %	0 %	292494164
7568	NC_013964	CGT	3	9	268684	268692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7569	NC_013964	GCT	2	6	268710	268715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7570	NC_013964	TCCG	2	8	268721	268728	0 %	25 %	25 %	50 %	292494164
7571	NC_013964	TCG	2	6	268769	268774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7572	NC_013964	GACG	2	8	268783	268790	25 %	0 %	50 %	25 %	292494164
7573	NC_013964	TCC	2	6	268834	268839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494164
7574	NC_013964	AG	3	6	268840	268845	50 %	0 %	50 %	0 %	292494164
7575	NC_013964	CAT	2	6	268882	268887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494164
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7577	NC_013964	GGTC	2	8	268932	268939	0 %	25 %	50 %	25 %	292494164
7578	NC_013964	GC	3	6	268969	268974	0 %	0 %	50 %	50 %	292494164
7579	NC_013964	GAC	2	6	269047	269052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7580	NC_013964	CGA	2	6	269142	269147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7581	NC_013964	GTC	2	6	269185	269190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494164
7582	NC_013964	TAA	2	6	269280	269285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_013964	GCTC	2	8	269348	269355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7584	NC_013964	CGC	2	6	269360	269365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7585	NC_013964	GACA	2	8	269369	269376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7586	NC_013964	GCGA	2	8	269378	269385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7587	NC_013964	ACA	2	6	269567	269572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494165
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7590	NC_013964	CGG	2	6	269616	269621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494165
7591	NC_013964	GCG	3	9	269678	269686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494165
7592	NC_013964	CAA	2	6	269712	269717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494165
7593	NC_013964	TAC	2	6	269791	269796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494165
7594	NC_013964	CGG	2	6	269820	269825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494165
7595	NC_013964	CGC	2	6	269853	269858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494165
7596	NC_013964	CGG	2	6	269877	269882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494165
7597	NC_013964	TAC	2	6	270013	270018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494165
7598	NC_013964	CGA	2	6	270065	270070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7599	NC_013964	GAG	2	6	270076	270081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494165
7600	NC_013964	GTC	2	6	270103	270108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7601	NC_013964	ACG	2	6	270149	270154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7602	NC_013964	CAG	2	6	270193	270198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7603	NC_013964	ACG	3	9	270212	270220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7604	NC_013964	ATGGG	2	10	270292	270301	20 %	20 %	60 %	0 %	292494165
7605	NC_013964	CGAG	2	8	270311	270318	25 %	0 %	50 %	25 %	292494165
7606	NC_013964	AAC	2	6	270331	270336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494165
7607	NC_013964	GAACG	2	10	270345	270354	40 %	0 %	40 %	20 %	292494165
7608	NC_013964	GCGATG	2	12	270358	270369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494165
7609	NC_013964	CGC	2	6	270387	270392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494165
7610	NC_013964	CGA	2	6	270405	270410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494165
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7612	NC_013964	ACCG	2	8	270432	270439	25 %	0 %	25 %	50 %	292494165
7613	NC_013964	AACA	2	8	270448	270455	75 %	0 %	0 %	25 %	292494165
7614	NC_013964	TCC	2	6	270491	270496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494165
7615	NC_013964	GAA	2	6	270498	270503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494165
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7618	NC_013964	TAC	2	6	270649	270654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494165
7619	NC_013964	CAA	2	6	270666	270671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494165
7620	NC_013964	ACT	2	6	270698	270703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494165
7621	NC_013964	ACC	2	6	270707	270712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494165
7622	NC_013964	TCG	2	6	270761	270766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7623	NC_013964	GCT	2	6	270796	270801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494165
7624	NC_013964	CAT	2	6	270870	270875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494166
7625	NC_013964	GGCC	2	8	270989	270996	0 %	0 %	50 %	50 %	292494166
7626	NC_013964	CTC	2	6	271129	271134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494166
7627	NC_013964	TCG	2	6	271136	271141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494166
7628	NC_013964	ACT	2	6	271316	271321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494166
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7632	NC_013964	TGG	2	6	271405	271410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494166
7633	NC_013964	GGC	2	6	271440	271445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494166
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7637	NC_013964	TGA	2	6	271610	271615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494166
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7642	NC_013964	TCATCG	2	12	271733	271744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	292494166
7643	NC_013964	CT	3	6	271904	271909	0 %	50 %	0 %	50 %	292494167
7644	NC_013964	CCGA	2	8	271922	271929	25 %	0 %	25 %	50 %	292494167
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7652	NC_013964	TCG	2	6	272079	272084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494167
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7655	NC_013964	TCA	2	6	272229	272234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494167
7656	NC_013964	GCCG	2	8	272257	272264	0 %	0 %	50 %	50 %	292494167
7657	NC_013964	TCC	2	6	272286	272291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494167
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7660	NC_013964	GCG	2	6	272333	272338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494167
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7677	NC_013964	TCG	2	6	273161	273166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494168
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7692	NC_013964	CACGT	2	10	273700	273709	20 %	20 %	20 %	40 %	292494169
7693	NC_013964	TGA	2	6	273719	273724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494169
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7696	NC_013964	CCCG	2	8	273782	273789	0 %	0 %	25 %	75 %	292494169
7697	NC_013964	TCA	2	6	273851	273856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494169
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7706	NC_013964	CGT	2	6	274091	274096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494169
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7723	NC_013964	GGC	2	6	274775	274780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7724	NC_013964	CGA	2	6	274805	274810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494170
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7741	NC_013964	CCG	2	6	275452	275457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494170
7742	NC_013964	GC	4	8	275467	275474	0 %	0 %	50 %	50 %	292494170
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7870	NC_013964	TCGTAG	2	12	280495	280506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292494172
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7992	NC_013964	CGT	2	6	285018	285023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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