MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013964	CGC	2	6	249715	249720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7002	NC_013964	TCG	2	6	249745	249750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7003	NC_013964	CGT	3	9	249844	249852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7004	NC_013964	GCC	2	6	249857	249862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7005	NC_013964	GTC	2	6	249863	249868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7006	NC_013964	GCC	3	9	249869	249877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7007	NC_013964	TCG	2	6	249880	249885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7008	NC_013964	GCC	2	6	249938	249943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7009	NC_013964	TCG	2	6	249963	249968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7010	NC_013964	GCC	2	6	249998	250003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7011	NC_013964	CAG	2	6	250007	250012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7012	NC_013964	CGT	2	6	250052	250057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7013	NC_013964	GTA	2	6	250091	250096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494152
7014	NC_013964	GAGT	2	8	250118	250125	25 %	25 %	50 %	0 %	292494152
7015	NC_013964	GTC	2	6	250190	250195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7016	NC_013964	GTTCG	2	10	250232	250241	0 %	40 %	40 %	20 %	292494152
7017	NC_013964	GTC	2	6	250244	250249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7018	NC_013964	ACG	2	6	250264	250269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7019	NC_013964	GCC	2	6	250352	250357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7020	NC_013964	GTAG	2	8	250358	250365	25 %	25 %	50 %	0 %	292494152
7021	NC_013964	CTCC	2	8	250417	250424	0 %	25 %	0 %	75 %	292494152
7022	NC_013964	ACG	2	6	250429	250434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7023	NC_013964	AGG	2	6	250443	250448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7024	NC_013964	GGTC	2	8	250462	250469	0 %	25 %	50 %	25 %	292494152
7025	NC_013964	GCCGT	2	10	250503	250512	0 %	20 %	40 %	40 %	292494152
7026	NC_013964	GCC	2	6	250514	250519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7027	NC_013964	CGT	2	6	250541	250546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7028	NC_013964	GTG	2	6	250560	250565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494152
7029	NC_013964	TCGT	2	8	250590	250597	0 %	50 %	25 %	25 %	292494152
7030	NC_013964	GC	3	6	250645	250650	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7031	NC_013964	CGA	2	6	250738	250743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7032	NC_013964	CCGCGT	2	12	250804	250815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494152
7033	NC_013964	CGG	2	6	250825	250830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494152
7034	NC_013964	TCG	2	6	250846	250851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7035	NC_013964	CGG	2	6	250858	250863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494152
7036	NC_013964	GCT	2	6	250877	250882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7037	NC_013964	CT	3	6	250890	250895	0 %	50 %	0 %	50 %	292494152
7038	NC_013964	GGTC	2	8	250933	250940	0 %	25 %	50 %	25 %	292494152
7039	NC_013964	TCGCC	2	10	250972	250981	0 %	20 %	20 %	60 %	292494152
7040	NC_013964	GCC	2	6	250985	250990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7041	NC_013964	CGC	2	6	251023	251028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7042	NC_013964	TGG	2	6	251035	251040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494152
7043	NC_013964	CGA	2	6	251176	251181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7044	NC_013964	GGA	2	6	251276	251281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7045	NC_013964	AGT	2	6	251347	251352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494152
7046	NC_013964	CGC	2	6	251398	251403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7047	NC_013964	CGG	2	6	251404	251409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494152
7048	NC_013964	GAG	2	6	251432	251437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7049	NC_013964	GTC	2	6	251447	251452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7050	NC_013964	GCC	2	6	251453	251458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7051	NC_013964	CGC	2	6	251461	251466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7052	NC_013964	GCGA	2	8	251529	251536	25 %	0 %	50 %	25 %	292494152
7053	NC_013964	CGC	2	6	251537	251542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7054	NC_013964	CGA	2	6	251545	251550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7055	NC_013964	TCG	2	6	251574	251579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7056	NC_013964	ATC	2	6	251583	251588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494152
7057	NC_013964	CGT	2	6	251611	251616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7058	NC_013964	CGGC	2	8	251617	251624	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7059	NC_013964	GCGCGA	2	12	251629	251640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494152
7060	NC_013964	TCG	3	9	251670	251678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7061	NC_013964	AGG	2	6	251679	251684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7062	NC_013964	C	6	6	251701	251706	0 %	0 %	0 %	100 %	292494152
7063	NC_013964	CCG	2	6	251713	251718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7064	NC_013964	GGA	2	6	251725	251730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7065	NC_013964	CGCC	2	8	251752	251759	0 %	0 %	25 %	75 %	292494152
7066	NC_013964	GAG	2	6	251760	251765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494152
7067	NC_013964	GC	3	6	251773	251778	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7068	NC_013964	GC	3	6	251824	251829	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7069	NC_013964	CGC	2	6	251861	251866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7070	NC_013964	TCG	2	6	251883	251888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7071	NC_013964	CGA	2	6	251902	251907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7072	NC_013964	CGA	2	6	251911	251916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7073	NC_013964	GC	3	6	251926	251931	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7074	NC_013964	CGTTC	2	10	251938	251947	0 %	40 %	20 %	40 %	292494152
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7079	NC_013964	CGT	3	9	252052	252060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
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7085	NC_013964	GAA	2	6	252308	252313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494152
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7090	NC_013964	CGC	2	6	252485	252490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494152
7091	NC_013964	GTA	2	6	252527	252532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494152
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7096	NC_013964	CGA	2	6	252643	252648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
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7107	NC_013964	TCG	2	6	252996	253001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
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7111	NC_013964	GACA	2	8	253082	253089	50 %	0 %	25 %	25 %	292494152
7112	NC_013964	CG	3	6	253104	253109	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
7113	NC_013964	CG	3	6	253137	253142	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152
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7121	NC_013964	GTCG	2	8	253436	253443	0 %	25 %	50 %	25 %	292494152
7122	NC_013964	AGA	2	6	253477	253482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494152
7123	NC_013964	TGCG	2	8	253497	253504	0 %	25 %	50 %	25 %	292494152
7124	NC_013964	TCG	2	6	253539	253544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7125	NC_013964	TCG	2	6	253599	253604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
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7162	NC_013964	GTC	2	6	254717	254722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7165	NC_013964	GC	3	6	254818	254823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7171	NC_013964	CGG	2	6	255067	255072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7172	NC_013964	GACC	2	8	255112	255119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7217	NC_013964	GTCG	2	8	256480	256487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7218	NC_013964	GAA	2	6	256560	256565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7219	NC_013964	CCG	2	6	256641	256646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494154
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7226	NC_013964	GAC	2	6	256745	256750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494154
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7229	NC_013964	CCCG	2	8	256792	256799	0 %	0 %	25 %	75 %	292494154
7230	NC_013964	GCG	2	6	256911	256916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494154
7231	NC_013964	TCG	2	6	256920	256925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494154
7232	NC_013964	ACT	2	6	256926	256931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494154
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7234	NC_013964	CAT	2	6	256954	256959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494154
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7237	NC_013964	ACA	2	6	257019	257024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494154
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7239	NC_013964	ACA	2	6	257046	257051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494154
7240	NC_013964	GGC	2	6	257066	257071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494154
7241	NC_013964	GA	3	6	257115	257120	50 %	0 %	50 %	0 %	292494154
7242	NC_013964	TGGG	2	8	257133	257140	0 %	25 %	75 %	0 %	292494154
7243	NC_013964	CCG	2	6	257151	257156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494154
7244	NC_013964	TAC	2	6	257183	257188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494154
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7364	NC_013964	ACA	2	6	261351	261356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494158
7365	NC_013964	GGC	2	6	261365	261370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494158
7366	NC_013964	CGT	2	6	261376	261381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494158
7367	NC_013964	GCG	2	6	261391	261396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494158
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7378	NC_013964	CTG	2	6	261635	261640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494158
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7380	NC_013964	CGA	2	6	261850	261855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494158
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7382	NC_013964	CTC	2	6	261888	261893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7383	NC_013964	CGAC	2	8	261898	261905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7384	NC_013964	ACCT	2	8	261959	261966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7385	NC_013964	AACCC	2	10	261995	262004	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7386	NC_013964	GCC	2	6	262008	262013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7387	NC_013964	ATCA	2	8	262014	262021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7388	NC_013964	ATT	2	6	262031	262036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7389	NC_013964	AC	3	6	262050	262055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7390	NC_013964	CGA	2	6	262076	262081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494159
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7427	NC_013964	ACG	2	6	263344	263349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7455	NC_013964	CGA	2	6	264301	264306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7468	NC_013964	TGG	2	6	264787	264792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7469	NC_013964	AGC	2	6	264867	264872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7471	NC_013964	ATT	2	6	264984	264989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7472	NC_013964	TGAC	2	8	265035	265042	25 %	25 %	25 %	25 %	292494162
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7480	NC_013964	CGT	2	6	265264	265269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7481	NC_013964	TCGG	2	8	265290	265297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7482	NC_013964	ACGT	2	8	265306	265313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7483	NC_013964	CA	3	6	265318	265323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7484	NC_013964	TAC	2	6	265349	265354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7485	NC_013964	ACGAG	2	10	265372	265381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7486	NC_013964	GGT	2	6	265458	265463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7487	NC_013964	AGC	2	6	265592	265597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7488	NC_013964	CAC	2	6	265599	265604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7489	NC_013964	CGACGG	2	12	265639	265650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7490	NC_013964	GGA	2	6	265697	265702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494163
7491	NC_013964	GGT	3	9	265740	265748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494163
7492	NC_013964	GTC	2	6	265795	265800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494163
7493	NC_013964	TCG	2	6	265801	265806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494163
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