MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013964	TCG	2	6	233282	233287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6502	NC_013964	CGA	2	6	233290	233295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6503	NC_013964	AGC	2	6	233309	233314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6504	NC_013964	TCG	2	6	233369	233374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6505	NC_013964	CGA	2	6	233385	233390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6506	NC_013964	TCG	2	6	233393	233398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6507	NC_013964	GC	3	6	233417	233422	0 %	0 %	50 %	50 %	292494138
6508	NC_013964	CGT	2	6	233568	233573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6509	NC_013964	GTC	2	6	233612	233617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494138
6510	NC_013964	ATT	2	6	233656	233661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_013964	ATG	2	6	233665	233670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_013964	TC	3	6	233739	233744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_013964	GTTCG	2	10	233795	233804	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6514	NC_013964	CGT	2	6	233809	233814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_013964	TCGG	2	8	233821	233828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_013964	GAG	2	6	233895	233900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494139
6517	NC_013964	CGA	2	6	233936	233941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494139
6518	NC_013964	GC	3	6	234002	234007	0 %	0 %	50 %	50 %	292494139
6519	NC_013964	GTC	2	6	234018	234023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494139
6520	NC_013964	CG	3	6	234076	234081	0 %	0 %	50 %	50 %	292494139
6521	NC_013964	AGT	2	6	234104	234109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494139
6522	NC_013964	CTC	2	6	234138	234143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494139
6523	NC_013964	TCG	2	6	234178	234183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494139
6524	NC_013964	TTC	2	6	234220	234225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292494139
6525	NC_013964	GAA	2	6	234296	234301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292494139
6526	NC_013964	TCGC	3	12	234423	234434	0 %	25 %	25 %	50 %	292494139
6527	NC_013964	CGA	2	6	234527	234532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494139
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6529	NC_013964	TCG	2	6	234586	234591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494139
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6531	NC_013964	TCG	2	6	234604	234609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494139
6532	NC_013964	CG	3	6	234608	234613	0 %	0 %	50 %	50 %	292494139
6533	NC_013964	CGT	2	6	234617	234622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494139
6534	NC_013964	GC	4	8	234703	234710	0 %	0 %	50 %	50 %	292494139
6535	NC_013964	TGACC	2	10	234735	234744	20 %	20 %	20 %	40 %	292494139
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6537	NC_013964	GTCG	2	8	234788	234795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_013964	TGA	2	6	234865	234870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494140
6539	NC_013964	GAG	2	6	234904	234909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494140
6540	NC_013964	CGA	2	6	234919	234924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
6541	NC_013964	CGA	2	6	235010	235015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
6542	NC_013964	CGAC	2	8	235036	235043	25 %	0 %	25 %	50 %	292494140
6543	NC_013964	GCA	2	6	235045	235050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
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6545	NC_013964	CGA	2	6	235094	235099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
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6548	NC_013964	CGT	2	6	235199	235204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494140
6549	NC_013964	TCG	2	6	235234	235239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494140
6550	NC_013964	AGGCG	2	10	235252	235261	20 %	0 %	60 %	20 %	292494140
6551	NC_013964	ACC	2	6	235291	235296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494140
6552	NC_013964	CGC	2	6	235301	235306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494140
6553	NC_013964	CCT	2	6	235345	235350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494140
6554	NC_013964	GCG	2	6	235369	235374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494140
6555	NC_013964	CAA	2	6	235382	235387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292494140
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6557	NC_013964	GAG	2	6	235437	235442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494140
6558	NC_013964	GTC	2	6	235488	235493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494140
6559	NC_013964	CGA	2	6	235502	235507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
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6572	NC_013964	CGGCG	2	10	236033	236042	0 %	0 %	60 %	40 %	292494140
6573	NC_013964	GAG	2	6	236067	236072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494140
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6575	NC_013964	TGA	2	6	236119	236124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292494140
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6577	NC_013964	CGA	2	6	236339	236344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494140
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6582	NC_013964	GACC	2	8	236624	236631	25 %	0 %	25 %	50 %	292494140
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6588	NC_013964	GCC	2	6	236787	236792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494140
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6602	NC_013964	TCG	2	6	237418	237423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494140
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6604	NC_013964	GACGG	2	10	237471	237480	20 %	0 %	60 %	20 %	292494140
6605	NC_013964	CGC	2	6	237530	237535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494140
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6616	NC_013964	CCCCA	2	10	237855	237864	20 %	0 %	0 %	80 %	292494140
6617	NC_013964	C	6	6	237934	237939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6618	NC_013964	CCAG	2	8	237943	237950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_013964	CGC	2	6	237982	237987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6621	NC_013964	TTA	2	6	238058	238063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6741	NC_013964	TCG	2	6	241605	241610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494143
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6771	NC_013964	TCG	2	6	242614	242619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6772	NC_013964	CGC	2	6	242658	242663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6852	NC_013964	CCG	2	6	244693	244698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494147
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6857	NC_013964	CGA	2	6	244960	244965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494147
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6859	NC_013964	CCGC	2	8	245092	245099	0 %	0 %	25 %	75 %	292494147
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6861	NC_013964	CGG	2	6	245126	245131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494147
6862	NC_013964	CGA	2	6	245224	245229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494147
6863	NC_013964	GTG	2	6	245237	245242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494147
6864	NC_013964	CGC	2	6	245270	245275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494147
6865	NC_013964	CGC	2	6	245282	245287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494147
6866	NC_013964	GTC	2	6	245345	245350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494147
6867	NC_013964	TCG	2	6	245376	245381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494147
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6869	NC_013964	CGT	2	6	245434	245439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494147
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6874	NC_013964	GTC	2	6	245727	245732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494148
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6881	NC_013964	CTC	2	6	245969	245974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494148
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6891	NC_013964	GCA	2	6	246236	246241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494148
6892	NC_013964	GC	3	6	246261	246266	0 %	0 %	50 %	50 %	292494148
6893	NC_013964	TCG	2	6	246277	246282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494148
6894	NC_013964	CATGTG	2	12	246293	246304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292494148
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6896	NC_013964	CT	3	6	246338	246343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6897	NC_013964	G	6	6	246385	246390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6898	NC_013964	CGG	2	6	246439	246444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6899	NC_013964	GCG	2	6	246505	246510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494149
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6902	NC_013964	GAG	2	6	246603	246608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494149
6903	NC_013964	TC	3	6	246624	246629	0 %	50 %	0 %	50 %	292494149
6904	NC_013964	AGCA	2	8	246636	246643	50 %	0 %	25 %	25 %	292494149
6905	NC_013964	CGCC	2	8	246698	246705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6906	NC_013964	GC	5	10	246835	246844	0 %	0 %	50 %	50 %	292494150
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6932	NC_013964	GAC	2	6	247629	247634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494150
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6938	NC_013964	GAC	2	6	247969	247974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494150
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6967	NC_013964	ACG	3	9	248808	248816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494151
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6972	NC_013964	ACC	2	6	248979	248984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494151
6973	NC_013964	TCG	4	12	249000	249011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6974	NC_013964	CGGACG	2	12	249012	249023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494151
6975	NC_013964	TAC	2	6	249035	249040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494151
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6977	NC_013964	CGA	2	6	249049	249054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6978	NC_013964	CGT	2	6	249066	249071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6979	NC_013964	CGA	2	6	249133	249138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6980	NC_013964	CGA	2	6	249159	249164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6981	NC_013964	CG	3	6	249201	249206	0 %	0 %	50 %	50 %	292494151
6982	NC_013964	CGG	2	6	249220	249225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494151
6983	NC_013964	CGG	2	6	249228	249233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494151
6984	NC_013964	CCGA	2	8	249249	249256	25 %	0 %	25 %	50 %	292494151
6985	NC_013964	TCG	2	6	249258	249263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494151
6986	NC_013964	GCG	2	6	249268	249273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494151
6987	NC_013964	CCT	2	6	249295	249300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494151
6988	NC_013964	TCGC	2	8	249320	249327	0 %	25 %	25 %	50 %	292494151
6989	NC_013964	CCG	2	6	249376	249381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6990	NC_013964	TCCGC	2	10	249404	249413	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6991	NC_013964	CGA	2	6	249415	249420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6992	NC_013964	GATA	2	8	249433	249440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6993	NC_013964	AAAAG	2	10	249442	249451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6994	NC_013964	CCG	2	6	249452	249457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6995	NC_013964	CCCG	2	8	249494	249501	0 %	0 %	25 %	75 %	292494152
6996	NC_013964	TGG	2	6	249537	249542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494152
6997	NC_013964	CGGTGA	2	12	249571	249582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292494152
6998	NC_013964	ACG	2	6	249619	249624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494152
6999	NC_013964	GTC	2	6	249647	249652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494152
7000	NC_013964	GC	3	6	249679	249684	0 %	0 %	50 %	50 %	292494152

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