MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 12335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013964	ACG	3	9	198935	198943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_013964	CGA	2	6	198954	198959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_013964	TGAT	2	8	198965	198972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_013964	TCG	2	6	198983	198988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013964	CGA	2	6	199011	199016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_013964	CCG	2	6	199028	199033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_013964	ACG	2	6	199043	199048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_013964	GCC	2	6	199069	199074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_013964	GAC	2	6	199075	199080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_013964	GGAA	2	8	199085	199092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_013964	GTG	2	6	199100	199105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_013964	CG	4	8	199245	199252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_013964	CGA	2	6	199274	199279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_013964	GAC	2	6	199308	199313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_013964	TCG	2	6	199318	199323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_013964	CTCC	2	8	199354	199361	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5517	NC_013964	GA	6	12	199377	199388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013964	ACG	2	6	199404	199409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_013964	CGG	2	6	199586	199591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_013964	AAT	2	6	199632	199637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_013964	AAT	2	6	199641	199646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013964	ATC	2	6	199664	199669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013964	TAC	2	6	199701	199706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_013964	AT	3	6	199729	199734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013964	GTTA	2	8	199764	199771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_013964	GTA	2	6	199801	199806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013964	TC	3	6	199823	199828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_013964	GC	3	6	199852	199857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_013964	ACG	2	6	199872	199877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_013964	ATC	2	6	199879	199884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_013964	TC	3	6	199883	199888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_013964	CGA	2	6	199896	199901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_013964	TAC	3	9	199934	199942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_013964	CGT	2	6	199966	199971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_013964	GTTCAG	2	12	200017	200028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5536	NC_013964	TGG	2	6	200076	200081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_013964	CGT	2	6	200148	200153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_013964	ACCC	2	8	200182	200189	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5539	NC_013964	GCT	2	6	200213	200218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_013964	TGTC	2	8	200260	200267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_013964	GTC	2	6	200315	200320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5542	NC_013964	CG	3	6	200341	200346	0 %	0 %	50 %	50 %	292494110
5543	NC_013964	ACG	2	6	200365	200370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5544	NC_013964	GCGG	2	8	200384	200391	0 %	0 %	75 %	25 %	292494110
5545	NC_013964	GAG	2	6	200400	200405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494110
5546	NC_013964	CGG	2	6	200407	200412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5547	NC_013964	GGAAC	2	10	200453	200462	40 %	0 %	40 %	20 %	292494110
5548	NC_013964	GTC	2	6	200463	200468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5549	NC_013964	CGGCGA	2	12	200492	200503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292494110
5550	NC_013964	CGA	2	6	200513	200518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5551	NC_013964	CTCCGA	2	12	200526	200537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292494110
5552	NC_013964	GGT	2	6	200540	200545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494110
5553	NC_013964	CGT	2	6	200570	200575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5554	NC_013964	GAAC	2	8	200597	200604	50 %	0 %	25 %	25 %	292494110
5555	NC_013964	CGT	2	6	200621	200626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5556	NC_013964	CGC	2	6	200627	200632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5557	NC_013964	CGT	2	6	200639	200644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5558	NC_013964	GTCG	2	8	200672	200679	0 %	25 %	50 %	25 %	292494110
5559	NC_013964	CG	3	6	200733	200738	0 %	0 %	50 %	50 %	292494110
5560	NC_013964	GTC	2	6	200778	200783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5561	NC_013964	GTCC	2	8	200808	200815	0 %	25 %	25 %	50 %	292494110
5562	NC_013964	GTCG	2	8	200816	200823	0 %	25 %	50 %	25 %	292494110
5563	NC_013964	TCG	2	6	200848	200853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5564	NC_013964	ACG	2	6	200854	200859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5565	NC_013964	CGC	2	6	200875	200880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5566	NC_013964	GAG	2	6	200925	200930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494110
5567	NC_013964	CGCGG	2	10	200931	200940	0 %	0 %	60 %	40 %	292494110
5568	NC_013964	TCGCCC	2	12	200941	200952	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	292494110
5569	NC_013964	CGA	2	6	200984	200989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5570	NC_013964	TCG	2	6	201004	201009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5571	NC_013964	GC	3	6	201049	201054	0 %	0 %	50 %	50 %	292494110
5572	NC_013964	CTC	2	6	201066	201071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494110
5573	NC_013964	CGT	2	6	201091	201096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5574	NC_013964	CTC	2	6	201168	201173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292494110
5575	NC_013964	GCG	2	6	201174	201179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5576	NC_013964	GTC	2	6	201180	201185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5577	NC_013964	TCGAT	2	10	201212	201221	20 %	40 %	20 %	20 %	292494110
5578	NC_013964	GAC	2	6	201258	201263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5579	NC_013964	CGT	2	6	201272	201277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5580	NC_013964	TCG	2	6	201295	201300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5581	NC_013964	TCTCGC	3	18	201302	201319	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	292494110
5582	NC_013964	CTCG	2	8	201327	201334	0 %	25 %	25 %	50 %	292494110
5583	NC_013964	CGG	2	6	201335	201340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5584	NC_013964	GTC	2	6	201419	201424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5585	NC_013964	CGG	2	6	201452	201457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5586	NC_013964	GTC	2	6	201462	201467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5587	NC_013964	CGG	2	6	201473	201478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5588	NC_013964	CGG	2	6	201485	201490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5589	NC_013964	GTC	2	6	201516	201521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5590	NC_013964	GTC	2	6	201579	201584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5591	NC_013964	CCG	2	6	201686	201691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5592	NC_013964	GATTC	2	10	201694	201703	20 %	40 %	20 %	20 %	292494110
5593	NC_013964	TCG	2	6	201766	201771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5594	NC_013964	CGG	2	6	201772	201777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5595	NC_013964	GTC	2	6	201828	201833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5596	NC_013964	ACG	2	6	201901	201906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5597	NC_013964	GAG	2	6	201960	201965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292494110
5598	NC_013964	CGG	2	6	201980	201985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494110
5599	NC_013964	CCG	2	6	201986	201991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5600	NC_013964	GTC	2	6	201993	201998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5601	NC_013964	CGA	2	6	202019	202024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5602	NC_013964	GTC	2	6	202092	202097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5603	NC_013964	TCG	2	6	202126	202131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5604	NC_013964	TCGG	2	8	202170	202177	0 %	25 %	50 %	25 %	292494110
5605	NC_013964	CGC	2	6	202205	202210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5606	NC_013964	GGT	2	6	202224	202229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292494110
5607	NC_013964	TCG	2	6	202231	202236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5608	NC_013964	GCC	2	6	202239	202244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494110
5609	NC_013964	TCG	2	6	202277	202282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494110
5610	NC_013964	AATC	2	8	202431	202438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_013964	GTC	2	6	202448	202453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_013964	CGG	2	6	202511	202516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_013964	CGG	2	6	202565	202570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_013964	GGA	2	6	202627	202632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_013964	GCG	2	6	202644	202649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_013964	AGTCGC	2	12	202652	202663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292494111
5617	NC_013964	CCG	2	6	202666	202671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494111
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5619	NC_013964	TCG	2	6	202771	202776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494111
5620	NC_013964	CGGTG	2	10	202847	202856	0 %	20 %	60 %	20 %	292494111
5621	NC_013964	CGT	2	6	202871	202876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494111
5622	NC_013964	CGGT	2	8	202879	202886	0 %	25 %	50 %	25 %	292494111
5623	NC_013964	GCG	2	6	202895	202900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494111
5624	NC_013964	CGC	2	6	202904	202909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494111
5625	NC_013964	TCGACG	2	12	202969	202980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292494111
5626	NC_013964	CGT	3	9	203030	203038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494111
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5739	NC_013964	CGA	2	6	206643	206648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494114
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5741	NC_013964	GC	3	6	206787	206792	0 %	0 %	50 %	50 %	292494114
5742	NC_013964	CGC	2	6	206823	206828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494114
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5744	NC_013964	TCG	2	6	206885	206890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494114
5745	NC_013964	GCG	2	6	206964	206969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494114
5746	NC_013964	GTC	2	6	206992	206997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494114
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5843	NC_013964	TAG	2	6	210432	210437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5845	NC_013964	CGC	2	6	210473	210478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5853	NC_013964	TTCG	2	8	210662	210669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5854	NC_013964	CGAGC	2	10	210672	210681	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5858	NC_013964	GACA	2	8	210949	210956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5863	NC_013964	CCG	2	6	211050	211055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5864	NC_013964	CCG	2	6	211097	211102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494118
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5867	NC_013964	CGG	2	6	211210	211215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494118
5868	NC_013964	CGCTCG	2	12	211216	211227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292494118
5869	NC_013964	CGT	2	6	211241	211246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494118
5870	NC_013964	TCGGCG	3	18	211258	211275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292494118
5871	NC_013964	CCG	2	6	211277	211282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494118
5872	NC_013964	CGC	2	6	211295	211300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494118
5873	NC_013964	CTG	2	6	211317	211322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494118
5874	NC_013964	CGA	2	6	211354	211359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494118
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5881	NC_013964	CAC	2	6	211544	211549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5882	NC_013964	GC	3	6	211591	211596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5883	NC_013964	CGT	2	6	211641	211646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494119
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5885	NC_013964	TTCGAC	2	12	211708	211719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	292494119
5886	NC_013964	CGA	2	6	211739	211744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494119
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5979	NC_013964	ACG	2	6	215084	215089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494121
5980	NC_013964	AC	3	6	215134	215139	50 %	0 %	0 %	50 %	292494121
5981	NC_013964	CGT	2	6	215148	215153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494121
5982	NC_013964	ACC	2	6	215207	215212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494121
5983	NC_013964	CCAC	2	8	215256	215263	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5984	NC_013964	CCG	2	6	215297	215302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5985	NC_013964	CTG	2	6	215339	215344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494122
5986	NC_013964	CGG	2	6	215353	215358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494122
5987	NC_013964	GGTGCT	2	12	215362	215373	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	292494122
5988	NC_013964	CGG	2	6	215427	215432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494122
5989	NC_013964	CGC	2	6	215434	215439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292494122
5990	NC_013964	CCA	2	6	215458	215463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292494122
5991	NC_013964	CGG	4	12	215469	215480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494122
5992	NC_013964	CCGC	2	8	215512	215519	0 %	0 %	25 %	75 %	292494122
5993	NC_013964	TCCGG	2	10	215521	215530	0 %	20 %	40 %	40 %	292494122
5994	NC_013964	CG	4	8	215554	215561	0 %	0 %	50 %	50 %	292494122
5995	NC_013964	GGC	2	6	215589	215594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292494122
5996	NC_013964	GTC	2	6	215657	215662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494122
5997	NC_013964	GCGGTC	2	12	215663	215674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292494122
5998	NC_013964	CGA	2	6	215722	215727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292494122
5999	NC_013964	TCG	2	6	215748	215753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292494122
6000	NC_013964	TCA	2	6	215790	215795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292494122

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