MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 3788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013746	CGG	3	9	24105	24113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172875
502	NC_013746	ATC	2	6	24137	24142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172875
503	NC_013746	ATTA	2	8	24309	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013746	AAC	2	6	24317	24322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013746	AGA	2	6	24326	24331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013746	TA	3	6	24335	24340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013746	TGGGG	2	10	24403	24412	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013746	G	6	6	24409	24414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013746	TAA	2	6	24445	24450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013746	GT	3	6	24497	24502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013746	GCA	2	6	24577	24582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013746	GGT	2	6	24612	24617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013746	AGGA	2	8	24667	24674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013746	ACA	2	6	24790	24795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013746	TGAC	2	8	24911	24918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_013746	ATT	2	6	24956	24961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013746	CTA	2	6	24975	24980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013746	AGT	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013746	GTG	2	6	25110	25115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013746	AC	3	6	25210	25215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_013746	TC	3	6	25276	25281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_013746	TCAC	2	8	25321	25328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_013746	GTCT	2	8	25330	25337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_013746	TCA	2	6	25412	25417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013746	GTC	2	6	25528	25533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013746	CAC	2	6	25536	25541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_013746	TGAC	2	8	25603	25610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_013746	CGAT	2	8	25627	25634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_013746	GAC	2	6	25635	25640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013746	GTC	2	6	25644	25649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013746	GAC	2	6	25650	25655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013746	TCG	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013746	TCG	2	6	25732	25737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_013746	GCC	2	6	25743	25748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_013746	ACG	2	6	25786	25791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013746	CCGA	2	8	25792	25799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
537	NC_013746	AT	3	6	25816	25821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013746	ACA	2	6	25906	25911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013746	AAC	2	6	25932	25937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013746	GAA	2	6	25955	25960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013746	CTGT	2	8	26053	26060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_013746	TGTCC	2	10	26106	26115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
543	NC_013746	GC	3	6	26177	26182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_013746	TCG	2	6	26189	26194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013746	CAG	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013746	G	6	6	26289	26294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013746	GCCA	2	8	26296	26303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013746	AC	3	6	26337	26342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_013746	TCG	2	6	26353	26358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013746	CACG	2	8	26388	26395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_013746	TGA	2	6	26411	26416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013746	G	6	6	26420	26425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013746	CAG	2	6	26545	26550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013746	TTCA	2	8	26567	26574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_013746	CAG	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013746	G	8	8	26670	26677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013746	GCT	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013746	AAC	2	6	26774	26779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013746	CGTG	2	8	26794	26801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_013746	ATG	2	6	26830	26835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013746	AAC	2	6	26975	26980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013746	C	6	6	26989	26994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
563	NC_013746	AC	3	6	27001	27006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_013746	TCCA	2	8	27031	27038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_013746	AGA	2	6	27086	27091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013746	AATAGA	2	12	27142	27153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013746	AT	3	6	27178	27183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013746	TA	3	6	27217	27222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013746	CGT	2	6	27237	27242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013746	AG	3	6	27290	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013746	CAA	3	9	27350	27358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172876
572	NC_013746	AC	3	6	27466	27471	50 %	0 %	0 %	50 %	284172876
573	NC_013746	ATT	2	6	27542	27547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172876
574	NC_013746	AAC	2	6	27637	27642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172876
575	NC_013746	A	6	6	27699	27704	100 %	0 %	0 %	0 %	284172876
576	NC_013746	AAT	2	6	27778	27783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284172876
577	NC_013746	GAG	2	6	27797	27802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172876
578	NC_013746	TGC	2	6	27850	27855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172876
579	NC_013746	GAT	2	6	27881	27886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172876
580	NC_013746	GTA	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172876
581	NC_013746	TGA	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013746	TGG	2	6	27942	27947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013746	TGT	2	6	27966	27971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172877
584	NC_013746	CGA	2	6	27972	27977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172877
585	NC_013746	ATT	2	6	28016	28021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172877
586	NC_013746	CGA	2	6	28023	28028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172877
587	NC_013746	GC	3	6	28047	28052	0 %	0 %	50 %	50 %	284172877
588	NC_013746	CGG	2	6	28083	28088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172877
589	NC_013746	CGGG	2	8	28103	28110	0 %	0 %	75 %	25 %	284172877
590	NC_013746	TCG	2	6	28190	28195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172877
591	NC_013746	GAT	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172877
592	NC_013746	GAG	2	6	28234	28239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172877
593	NC_013746	AGG	2	6	28253	28258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172877
594	NC_013746	CAG	2	6	28268	28273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172877
595	NC_013746	GACT	2	8	28276	28283	25 %	25 %	25 %	25 %	284172877
596	NC_013746	GT	3	6	28285	28290	0 %	50 %	50 %	0 %	284172878
597	NC_013746	TGG	2	6	28305	28310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172878
598	NC_013746	AAT	3	9	28375	28383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284172878
599	NC_013746	GAC	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172878
600	NC_013746	TTC	2	6	28420	28425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172878
601	NC_013746	AG	3	6	28477	28482	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
602	NC_013746	CTG	2	6	28519	28524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172878
603	NC_013746	GAA	2	6	28551	28556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172878
604	NC_013746	TTC	2	6	28558	28563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172878
605	NC_013746	GGT	2	6	28642	28647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172878
606	NC_013746	CAC	2	6	28732	28737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172878
607	NC_013746	CCCA	2	8	28747	28754	25 %	0 %	0 %	75 %	284172878
608	NC_013746	AG	3	6	28772	28777	50 %	0 %	50 %	0 %	284172878
609	NC_013746	CGAA	2	8	28879	28886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_013746	GCCG	2	8	28950	28957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_013746	TGT	2	6	28965	28970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013746	CTAAA	2	10	29052	29061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_013746	CCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_013746	TA	3	6	29108	29113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013746	GGCGA	2	10	29117	29126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_013746	ACG	2	6	29229	29234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013746	CAC	2	6	29241	29246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_013746	GAG	2	6	29259	29264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013746	GAT	2	6	29301	29306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013746	CTCCG	2	10	29408	29417	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
621	NC_013746	GT	3	6	29452	29457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013746	ATG	2	6	29513	29518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013746	CAA	2	6	29567	29572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013746	ATCTT	2	10	29581	29590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
625	NC_013746	CCA	2	6	29599	29604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_013746	TAC	2	6	29652	29657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013746	ATG	2	6	29704	29709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013746	AG	3	6	29770	29775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013746	TCG	2	6	29829	29834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013746	TCTGGT	2	12	29903	29914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
631	NC_013746	GCT	2	6	29930	29935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013746	AGC	2	6	29959	29964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013746	GGC	2	6	29981	29986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013746	TAC	3	9	29987	29995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013746	TCA	2	6	30016	30021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013746	ATG	2	6	30060	30065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013746	CCG	2	6	30145	30150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_013746	GAC	2	6	30161	30166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013746	CGA	2	6	30233	30238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013746	GAC	2	6	30254	30259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013746	CGCT	2	8	30318	30325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
642	NC_013746	GA	3	6	30437	30442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
643	NC_013746	CGA	2	6	30531	30536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172879
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647	NC_013746	ACT	2	6	30700	30705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_013746	TCA	2	6	30776	30781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_013746	AACC	2	8	30839	30846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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655	NC_013746	GAT	2	6	31245	31250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_013746	TTC	2	6	31309	31314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_013746	AGC	2	6	31335	31340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_013746	AT	3	6	31368	31373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
661	NC_013746	ATA	2	6	31388	31393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_013746	TAC	2	6	31471	31476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_013746	ATC	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_013746	TA	3	6	31579	31584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_013746	GTC	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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668	NC_013746	GAG	2	6	31710	31715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_013746	CGT	2	6	31802	31807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_013746	GA	4	8	32159	32166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_013746	AT	3	6	32209	32214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_013746	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_013746	GTC	2	6	35853	35858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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