MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 9749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013745	CGT	2	6	240363	240368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_013745	TCG	2	6	240410	240415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_013745	CGA	2	6	240542	240547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_013745	CTGA	2	8	240556	240563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_013745	GAA	2	6	240573	240578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_013745	AC	3	6	240655	240660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_013745	GACCG	2	10	240712	240721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5508	NC_013745	ACG	2	6	240724	240729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_013745	AGA	2	6	240734	240739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_013745	CGAGAC	2	12	240741	240752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_013745	CGA	2	6	240882	240887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_013745	CGA	2	6	240952	240957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_013745	GCC	2	6	241069	241074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172733
5514	NC_013745	CGAC	2	8	241093	241100	25 %	0 %	25 %	50 %	284172733
5515	NC_013745	TCG	2	6	241111	241116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5516	NC_013745	GTC	2	6	241161	241166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5517	NC_013745	GTC	2	6	241206	241211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5518	NC_013745	CACC	2	8	241260	241267	25 %	0 %	0 %	75 %	284172733
5519	NC_013745	TCG	2	6	241294	241299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5520	NC_013745	GCC	2	6	241302	241307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172733
5521	NC_013745	CGC	2	6	241322	241327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172733
5522	NC_013745	CTC	2	6	241329	241334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172733
5523	NC_013745	GAA	2	6	241374	241379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172733
5524	NC_013745	GAC	2	6	241464	241469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5525	NC_013745	CTC	2	6	241476	241481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172733
5526	NC_013745	TTC	2	6	241534	241539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172733
5527	NC_013745	TAG	2	6	241566	241571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172733
5528	NC_013745	GTA	2	6	241614	241619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172733
5529	NC_013745	GAGATG	2	12	241638	241649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284172733
5530	NC_013745	TCA	2	6	241655	241660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172733
5531	NC_013745	TGTC	2	8	241734	241741	0 %	50 %	25 %	25 %	284172733
5532	NC_013745	C	6	6	241785	241790	0 %	0 %	0 %	100 %	284172733
5533	NC_013745	GTC	2	6	241857	241862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5534	NC_013745	CG	3	6	241869	241874	0 %	0 %	50 %	50 %	284172733
5535	NC_013745	GTA	2	6	241875	241880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172733
5536	NC_013745	GTTT	2	8	241922	241929	0 %	75 %	25 %	0 %	284172733
5537	NC_013745	GCC	2	6	241971	241976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172733
5538	NC_013745	TCG	2	6	241996	242001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5539	NC_013745	TCG	2	6	242041	242046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5540	NC_013745	GC	3	6	242088	242093	0 %	0 %	50 %	50 %	284172733
5541	NC_013745	TG	3	6	242095	242100	0 %	50 %	50 %	0 %	284172733
5542	NC_013745	TGTT	2	8	242107	242114	0 %	75 %	25 %	0 %	284172733
5543	NC_013745	TCG	2	6	242140	242145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5544	NC_013745	TGA	2	6	242153	242158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172733
5545	NC_013745	TGC	2	6	242180	242185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5546	NC_013745	CGA	2	6	242232	242237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172733
5547	NC_013745	GA	3	6	242236	242241	50 %	0 %	50 %	0 %	284172733
5548	NC_013745	AGAT	2	8	242277	242284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_013745	ATA	3	9	242302	242310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013745	TCA	2	6	242361	242366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_013745	GA	3	6	242387	242392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_013745	ACA	2	6	242414	242419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_013745	GTC	2	6	242572	242577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5554	NC_013745	CGG	2	6	242618	242623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172734
5555	NC_013745	AG	3	6	242707	242712	50 %	0 %	50 %	0 %	284172734
5556	NC_013745	TCG	2	6	242714	242719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5557	NC_013745	GCG	2	6	242735	242740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172734
5558	NC_013745	TCG	2	6	242741	242746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5559	NC_013745	ACG	2	6	242822	242827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5560	NC_013745	GCTC	2	8	242909	242916	0 %	25 %	25 %	50 %	284172734
5561	NC_013745	CGA	2	6	242917	242922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5562	NC_013745	CTT	2	6	242943	242948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172734
5563	NC_013745	GC	3	6	242957	242962	0 %	0 %	50 %	50 %	284172734
5564	NC_013745	CGC	2	6	243000	243005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172734
5565	NC_013745	CGC	2	6	243150	243155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172734
5566	NC_013745	ACGG	2	8	243172	243179	25 %	0 %	50 %	25 %	284172734
5567	NC_013745	GACG	2	8	243198	243205	25 %	0 %	50 %	25 %	284172734
5568	NC_013745	CCG	2	6	243237	243242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172734
5569	NC_013745	ATCG	2	8	243243	243250	25 %	25 %	25 %	25 %	284172734
5570	NC_013745	ACGA	2	8	243277	243284	50 %	0 %	25 %	25 %	284172734
5571	NC_013745	GTC	2	6	243337	243342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5572	NC_013745	GC	3	6	243377	243382	0 %	0 %	50 %	50 %	284172734
5573	NC_013745	CGC	3	9	243433	243441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172734
5574	NC_013745	CTCG	2	8	243456	243463	0 %	25 %	25 %	50 %	284172734
5575	NC_013745	GTG	2	6	243466	243471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172734
5576	NC_013745	CGG	3	9	243521	243529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172734
5577	NC_013745	CGA	2	6	243531	243536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172734
5578	NC_013745	CGGT	2	8	243549	243556	0 %	25 %	50 %	25 %	284172734
5579	NC_013745	ACCG	2	8	243763	243770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_013745	GAC	2	6	243814	243819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_013745	CG	3	6	243821	243826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_013745	CGA	2	6	243847	243852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_013745	C	6	6	243934	243939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5584	NC_013745	GTC	2	6	244003	244008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_013745	GCC	2	6	244066	244071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_013745	CGG	2	6	244082	244087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013745	CGAC	2	8	244088	244095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_013745	CGTC	2	8	244124	244131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_013745	ATGG	2	8	244171	244178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_013745	TCG	3	9	244183	244191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_013745	CGA	2	6	244222	244227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_013745	GGA	2	6	244280	244285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013745	CGT	2	6	244384	244389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172735
5594	NC_013745	CGA	2	6	244421	244426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172735
5595	NC_013745	CGAG	2	8	244697	244704	25 %	0 %	50 %	25 %	284172735
5596	NC_013745	CGC	3	9	244712	244720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172735
5597	NC_013745	CGAC	2	8	244819	244826	25 %	0 %	25 %	50 %	284172735
5598	NC_013745	GGGT	2	8	244851	244858	0 %	25 %	75 %	0 %	284172735
5599	NC_013745	CGGCG	2	10	244859	244868	0 %	0 %	60 %	40 %	284172735
5600	NC_013745	ACG	2	6	244936	244941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172735
5601	NC_013745	GACC	2	8	245049	245056	25 %	0 %	25 %	50 %	284172735
5602	NC_013745	CGC	2	6	245081	245086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172735
5603	NC_013745	TCG	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172735
5604	NC_013745	CGAC	2	8	245123	245130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_013745	CGG	2	6	245168	245173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172736
5606	NC_013745	CGAT	2	8	245199	245206	25 %	25 %	25 %	25 %	284172736
5607	NC_013745	AGG	2	6	245276	245281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172736
5608	NC_013745	TTCC	2	8	245371	245378	0 %	50 %	0 %	50 %	284172736
5609	NC_013745	CGTC	2	8	245398	245405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_013745	GAC	2	6	245450	245455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_013745	CGA	2	6	245481	245486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_013745	CTGT	2	8	245568	245575	0 %	50 %	25 %	25 %	284172737
5613	NC_013745	GCG	2	6	245595	245600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172737
5614	NC_013745	CGG	2	6	245659	245664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172737
5615	NC_013745	GCA	2	6	245745	245750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172737
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5620	NC_013745	CAT	2	6	245938	245943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172737
5621	NC_013745	GC	3	6	245967	245972	0 %	0 %	50 %	50 %	284172737
5622	NC_013745	TCG	2	6	245981	245986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172737
5623	NC_013745	TCA	2	6	246006	246011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172737
5624	NC_013745	GC	3	6	246015	246020	0 %	0 %	50 %	50 %	284172737
5625	NC_013745	CGC	2	6	246045	246050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172737
5626	NC_013745	GAT	2	6	246193	246198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172737
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5628	NC_013745	TGG	2	6	246233	246238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172737
5629	NC_013745	TCC	2	6	246263	246268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172737
5630	NC_013745	GTGTCG	2	12	246275	246286	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284172737
5631	NC_013745	CGTCGC	2	12	246288	246299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172737
5632	NC_013745	CGT	2	6	246379	246384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172737
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5634	NC_013745	CGT	2	6	246420	246425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172737
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5643	NC_013745	CG	3	6	246860	246865	0 %	0 %	50 %	50 %	284172738
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5646	NC_013745	CGTG	2	8	246941	246948	0 %	25 %	50 %	25 %	284172738
5647	NC_013745	CAG	2	6	246990	246995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172738
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5650	NC_013745	CGT	2	6	247211	247216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172738
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5656	NC_013745	GGTCGA	2	12	247490	247501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284172738
5657	NC_013745	CGA	2	6	247565	247570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172738
5658	NC_013745	TCG	2	6	247576	247581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172738
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5661	NC_013745	CGC	3	9	247807	247815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172739
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5663	NC_013745	GGA	2	6	247879	247884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172739
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5666	NC_013745	GAC	2	6	247916	247921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172739
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5668	NC_013745	AGCCC	2	10	248082	248091	20 %	0 %	20 %	60 %	284172739
5669	NC_013745	AGT	2	6	248092	248097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172739
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5673	NC_013745	GAC	3	9	248141	248149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172739
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5677	NC_013745	C	7	7	248228	248234	0 %	0 %	0 %	100 %	284172739
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5682	NC_013745	TCC	2	6	248508	248513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172739
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5695	NC_013745	CGAT	2	8	249038	249045	25 %	25 %	25 %	25 %	284172740
5696	NC_013745	ACA	2	6	249068	249073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172740
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5699	NC_013745	GC	3	6	249269	249274	0 %	0 %	50 %	50 %	284172740
5700	NC_013745	GAC	2	6	249279	249284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172740
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5702	NC_013745	CT	3	6	249369	249374	0 %	50 %	0 %	50 %	284172740
5703	NC_013745	CGA	2	6	249411	249416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172740
5704	NC_013745	GTA	2	6	249426	249431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172740
5705	NC_013745	CTC	2	6	249453	249458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172740
5706	NC_013745	GAT	2	6	249471	249476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172740
5707	NC_013745	GC	3	6	249486	249491	0 %	0 %	50 %	50 %	284172740
5708	NC_013745	GCC	2	6	249540	249545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172740
5709	NC_013745	ATT	2	6	249630	249635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172740
5710	NC_013745	TAC	2	6	249655	249660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5711	NC_013745	CGT	2	6	249713	249718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5712	NC_013745	TCG	2	6	249802	249807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5713	NC_013745	TCGA	2	8	249883	249890	25 %	25 %	25 %	25 %	284172741
5714	NC_013745	TCG	2	6	249910	249915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5715	NC_013745	CGC	2	6	250010	250015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172741
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5718	NC_013745	ACG	2	6	250097	250102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172741
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5720	NC_013745	CCGTT	2	10	250163	250172	0 %	40 %	20 %	40 %	284172741
5721	NC_013745	GC	3	6	250175	250180	0 %	0 %	50 %	50 %	284172741
5722	NC_013745	CGA	2	6	250232	250237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5723	NC_013745	GACGG	2	10	250273	250282	20 %	0 %	60 %	20 %	284172741
5724	NC_013745	TAT	2	6	250310	250315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172741
5725	NC_013745	GGA	2	6	250355	250360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172741
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5727	NC_013745	TCGT	2	8	250383	250390	0 %	50 %	25 %	25 %	284172741
5728	NC_013745	CGT	2	6	250421	250426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5729	NC_013745	GTC	2	6	250443	250448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5730	NC_013745	AGC	2	6	250465	250470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5731	NC_013745	TGC	2	6	250579	250584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5732	NC_013745	AATC	2	8	250587	250594	50 %	25 %	0 %	25 %	284172741
5733	NC_013745	ACG	2	6	250651	250656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5734	NC_013745	CGG	2	6	250659	250664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172741
5735	NC_013745	GTTC	2	8	250688	250695	0 %	50 %	25 %	25 %	284172741
5736	NC_013745	TGA	2	6	250708	250713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172741
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5738	NC_013745	GAA	2	6	250799	250804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172741
5739	NC_013745	CTG	2	6	250806	250811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5740	NC_013745	CAT	2	6	250898	250903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172741
5741	NC_013745	CT	3	6	250936	250941	0 %	50 %	0 %	50 %	284172741
5742	NC_013745	GAATT	2	10	250969	250978	40 %	40 %	20 %	0 %	284172741
5743	NC_013745	ACG	2	6	251017	251022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172741
5744	NC_013745	GTC	2	6	251028	251033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172741
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5989	NC_013745	CGA	2	6	261431	261436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5990	NC_013745	CGTT	2	8	261478	261485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5991	NC_013745	AGG	2	6	261510	261515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5992	NC_013745	GA	3	6	261599	261604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5993	NC_013745	TCGA	2	8	261622	261629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5994	NC_013745	TCGT	2	8	261630	261637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5995	NC_013745	GAC	2	6	261687	261692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5998	NC_013745	GT	3	6	261904	261909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_013745	AG	3	6	261925	261930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_013745	GAAA	2	8	261945	261952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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