MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013744	AGC	2	6	135203	135208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3502	NC_013744	CGT	2	6	135225	135230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3503	NC_013744	GAG	2	6	135259	135264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167149
3504	NC_013744	GTC	2	6	135373	135378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3505	NC_013744	GCC	2	6	135397	135402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3506	NC_013744	CCG	2	6	135408	135413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3507	NC_013744	GC	3	6	135459	135464	0 %	0 %	50 %	50 %	284167149
3508	NC_013744	GCGA	2	8	135512	135519	25 %	0 %	50 %	25 %	284167149
3509	NC_013744	GGA	2	6	135549	135554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167149
3510	NC_013744	CGC	2	6	135555	135560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3511	NC_013744	TCG	2	6	135575	135580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3512	NC_013744	CGA	2	6	135618	135623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3513	NC_013744	CGG	2	6	135673	135678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167149
3514	NC_013744	TCGA	2	8	135715	135722	25 %	25 %	25 %	25 %	284167149
3515	NC_013744	GTC	2	6	135775	135780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3516	NC_013744	GTCG	2	8	135837	135844	0 %	25 %	50 %	25 %	284167149
3517	NC_013744	CTC	2	6	135883	135888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167149
3518	NC_013744	ACGA	2	8	135923	135930	50 %	0 %	25 %	25 %	284167149
3519	NC_013744	GTG	2	6	135934	135939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167149
3520	NC_013744	GTA	2	6	135976	135981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167149
3521	NC_013744	GTC	2	6	135988	135993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3522	NC_013744	GCGA	2	8	136001	136008	25 %	0 %	50 %	25 %	284167149
3523	NC_013744	GTT	2	6	136015	136020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167149
3524	NC_013744	GCC	2	6	136064	136069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3525	NC_013744	GCC	2	6	136076	136081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3526	NC_013744	CGG	2	6	136084	136089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167149
3527	NC_013744	CGT	2	6	136165	136170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3528	NC_013744	CGG	2	6	136171	136176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167149
3529	NC_013744	CAG	2	6	136199	136204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3530	NC_013744	TCCG	2	8	136205	136212	0 %	25 %	25 %	50 %	284167149
3531	NC_013744	TCG	2	6	136227	136232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3532	NC_013744	CGG	2	6	136305	136310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167149
3533	NC_013744	CGAG	2	8	136332	136339	25 %	0 %	50 %	25 %	284167149
3534	NC_013744	CCG	2	6	136356	136361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167149
3535	NC_013744	GGT	2	6	136498	136503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167149
3536	NC_013744	GAT	2	6	136660	136665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167149
3537	NC_013744	GT	3	6	136685	136690	0 %	50 %	50 %	0 %	284167149
3538	NC_013744	GTC	2	6	136735	136740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3539	NC_013744	TCGG	2	8	136862	136869	0 %	25 %	50 %	25 %	284167149
3540	NC_013744	GCCC	2	8	136903	136910	0 %	0 %	25 %	75 %	284167149
3541	NC_013744	GGT	2	6	136977	136982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167149
3542	NC_013744	TCG	2	6	136994	136999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3543	NC_013744	TCG	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3544	NC_013744	CGT	2	6	137061	137066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3545	NC_013744	ACG	2	6	137078	137083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167149
3546	NC_013744	GTCG	2	8	137085	137092	0 %	25 %	50 %	25 %	284167149
3547	NC_013744	GGA	2	6	137162	137167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167149
3548	NC_013744	TCGA	2	8	137204	137211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_013744	TA	3	6	137239	137244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013744	ATA	2	6	137281	137286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013744	GAC	2	6	137353	137358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3552	NC_013744	AC	3	6	137357	137362	50 %	0 %	0 %	50 %	284167150
3553	NC_013744	CCG	2	6	137390	137395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167150
3554	NC_013744	CGC	2	6	137425	137430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167150
3555	NC_013744	TCGC	2	8	137440	137447	0 %	25 %	25 %	50 %	284167150
3556	NC_013744	CGGT	2	8	137471	137478	0 %	25 %	50 %	25 %	284167150
3557	NC_013744	GCGA	2	8	137488	137495	25 %	0 %	50 %	25 %	284167150
3558	NC_013744	ACG	2	6	137498	137503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3559	NC_013744	CGC	2	6	137535	137540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167150
3560	NC_013744	CGG	2	6	137544	137549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167150
3561	NC_013744	GGC	2	6	137589	137594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167150
3562	NC_013744	CAC	2	6	137607	137612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167150
3563	NC_013744	TCGG	2	8	137656	137663	0 %	25 %	50 %	25 %	284167150
3564	NC_013744	ATCG	2	8	137796	137803	25 %	25 %	25 %	25 %	284167150
3565	NC_013744	CGA	2	6	137934	137939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167150
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3568	NC_013744	CGA	2	6	138027	138032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3569	NC_013744	CTG	2	6	138079	138084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3570	NC_013744	GCG	2	6	138143	138148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167150
3571	NC_013744	CCGGA	2	10	138179	138188	20 %	0 %	40 %	40 %	284167150
3572	NC_013744	TCG	2	6	138191	138196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3573	NC_013744	ACG	2	6	138269	138274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167150
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3577	NC_013744	TCG	2	6	138497	138502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167150
3578	NC_013744	AGCGG	2	10	138526	138535	20 %	0 %	60 %	20 %	284167150
3579	NC_013744	ATCG	2	8	138594	138601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_013744	CGG	2	6	138602	138607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_013744	CGG	2	6	138633	138638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_013744	ACC	2	6	138641	138646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013744	CTCG	2	8	138684	138691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_013744	GAAC	2	8	138708	138715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_013744	CCA	2	6	138732	138737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013744	ACG	2	6	138780	138785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3587	NC_013744	CTG	2	6	138842	138847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3588	NC_013744	ACG	2	6	138882	138887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3589	NC_013744	GC	3	6	138888	138893	0 %	0 %	50 %	50 %	284167151
3590	NC_013744	GCC	2	6	138906	138911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167151
3591	NC_013744	GAT	2	6	138967	138972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167151
3592	NC_013744	CGA	2	6	138976	138981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3593	NC_013744	TCT	2	6	139008	139013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167151
3594	NC_013744	CGT	2	6	139039	139044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3595	NC_013744	GCG	2	6	139280	139285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167151
3596	NC_013744	CCGAT	2	10	139338	139347	20 %	20 %	20 %	40 %	284167151
3597	NC_013744	CGC	2	6	139381	139386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167151
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3601	NC_013744	GTC	2	6	139634	139639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3602	NC_013744	CTG	2	6	139685	139690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3603	NC_013744	CGG	2	6	139699	139704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167151
3604	NC_013744	CAC	2	6	139708	139713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167151
3605	NC_013744	CGA	2	6	139732	139737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3606	NC_013744	GAT	2	6	139741	139746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167151
3607	NC_013744	CGC	2	6	139765	139770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167151
3608	NC_013744	GAC	2	6	139797	139802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167151
3609	NC_013744	GCG	2	6	139841	139846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013744	GGTA	2	8	139875	139882	25 %	25 %	50 %	0 %	284167152
3611	NC_013744	CGC	2	6	139948	139953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167152
3612	NC_013744	TCG	2	6	139958	139963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3613	NC_013744	CGA	2	6	139983	139988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3614	NC_013744	GAC	2	6	140020	140025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3615	NC_013744	TCG	2	6	140049	140054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3616	NC_013744	ACG	2	6	140067	140072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3617	NC_013744	CCGG	2	8	140143	140150	0 %	0 %	50 %	50 %	284167152
3618	NC_013744	CGGG	2	8	140172	140179	0 %	0 %	75 %	25 %	284167152
3619	NC_013744	GAG	2	6	140309	140314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167152
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3621	NC_013744	CGT	2	6	140376	140381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167152
3622	NC_013744	CAG	2	6	140395	140400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167152
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3862	NC_013744	CTG	2	6	149860	149865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167156
3863	NC_013744	CAC	2	6	149897	149902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167156
3864	NC_013744	CG	3	6	149922	149927	0 %	0 %	50 %	50 %	284167156
3865	NC_013744	ATC	2	6	149987	149992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167156
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3874	NC_013744	GTC	2	6	150338	150343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167156
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3877	NC_013744	GCTGCC	2	12	150469	150480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284167156
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3892	NC_013744	GCGA	2	8	151050	151057	25 %	0 %	50 %	25 %	284167156
3893	NC_013744	GCC	2	6	151089	151094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167156
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3972	NC_013744	TCG	2	6	154363	154368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167157
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3975	NC_013744	GCG	2	6	154533	154538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167157
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3979	NC_013744	CCGA	2	8	154611	154618	25 %	0 %	25 %	50 %	284167157
3980	NC_013744	GCGCC	2	10	154654	154663	0 %	0 %	40 %	60 %	284167157
3981	NC_013744	GTC	2	6	154668	154673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167157
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3983	NC_013744	CGA	2	6	154744	154749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167157
3984	NC_013744	CGCTGT	2	12	154783	154794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167157
3985	NC_013744	GTC	2	6	154815	154820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167157
3986	NC_013744	GTC	2	6	154830	154835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167157
3987	NC_013744	CGA	2	6	154847	154852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167157
3988	NC_013744	CCG	2	6	154853	154858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167157
3989	NC_013744	GA	3	6	154876	154881	50 %	0 %	50 %	0 %	284167157
3990	NC_013744	GA	3	6	154925	154930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_013744	CGG	2	6	154946	154951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_013744	CGAG	2	8	154954	154961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3993	NC_013744	CGGA	2	8	155038	155045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3994	NC_013744	CGGG	2	8	155137	155144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3995	NC_013744	TCG	2	6	155202	155207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_013744	CGA	2	6	155224	155229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_013744	CGT	2	6	155284	155289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_013744	CGAA	2	8	155358	155365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3999	NC_013744	TCCG	2	8	155367	155374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4000	NC_013744	GCT	2	6	155436	155441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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