MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013744	TTC	2	6	665281	665286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167602
16002	NC_013744	TCG	2	6	665302	665307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167602
16003	NC_013744	CTG	2	6	665319	665324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167602
16004	NC_013744	CGT	2	6	665333	665338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167602
16005	NC_013744	TCA	2	6	665339	665344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167602
16006	NC_013744	CCT	3	9	665372	665380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167602
16007	NC_013744	GTG	2	6	665401	665406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167602
16008	NC_013744	TCAGCT	2	12	665450	665461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284167602
16009	NC_013744	GAT	2	6	665514	665519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167602
16010	NC_013744	GCC	2	6	665550	665555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167602
16011	NC_013744	CCT	2	6	665612	665617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167602
16012	NC_013744	CGGA	2	8	665683	665690	25 %	0 %	50 %	25 %	284167602
16013	NC_013744	TTC	2	6	665740	665745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167602
16014	NC_013744	CGT	2	6	665762	665767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167602
16015	NC_013744	TCGGT	2	10	665795	665804	0 %	40 %	40 %	20 %	284167602
16016	NC_013744	CAGCG	2	10	665818	665827	20 %	0 %	40 %	40 %	284167602
16017	NC_013744	TCG	2	6	665828	665833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167602
16018	NC_013744	GAG	2	6	665856	665861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167602
16019	NC_013744	CGTA	2	8	665942	665949	25 %	25 %	25 %	25 %	284167602
16020	NC_013744	TCC	2	6	665969	665974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_013744	CGC	2	6	665981	665986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_013744	CG	3	6	666064	666069	0 %	0 %	50 %	50 %	284167603
16023	NC_013744	ACGA	2	8	666151	666158	50 %	0 %	25 %	25 %	284167603
16024	NC_013744	CGC	2	6	666183	666188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167603
16025	NC_013744	GAT	2	6	666204	666209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167603
16026	NC_013744	TCG	2	6	666239	666244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167603
16027	NC_013744	GAA	2	6	666297	666302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167603
16028	NC_013744	CCT	2	6	666359	666364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167603
16029	NC_013744	GAA	2	6	666366	666371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167603
16030	NC_013744	TCA	2	6	666377	666382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167603
16031	NC_013744	CGG	2	6	666495	666500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167603
16032	NC_013744	GCC	3	9	666583	666591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167603
16033	NC_013744	GTC	2	6	666598	666603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167603
16034	NC_013744	GAT	2	6	666606	666611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167603
16035	NC_013744	GTC	2	6	666613	666618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167603
16036	NC_013744	CCG	2	6	666707	666712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167603
16037	NC_013744	CGG	2	6	666723	666728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167603
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16039	NC_013744	GAA	2	6	666804	666809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167603
16040	NC_013744	GAACG	2	10	666894	666903	40 %	0 %	40 %	20 %	284167603
16041	NC_013744	GTT	3	9	666908	666916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167603
16042	NC_013744	ACG	3	9	666978	666986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167604
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16044	NC_013744	ATCGCC	2	12	666996	667007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167604
16045	NC_013744	TCG	2	6	667069	667074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16046	NC_013744	GCC	2	6	667085	667090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167604
16047	NC_013744	CGA	2	6	667132	667137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167604
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16049	NC_013744	AGCACG	2	12	667149	667160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16050	NC_013744	CGA	2	6	667192	667197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16051	NC_013744	CGC	2	6	667229	667234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167604
16052	NC_013744	GTC	2	6	667244	667249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16053	NC_013744	GCG	2	6	667291	667296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167604
16054	NC_013744	GTCG	2	8	667310	667317	0 %	25 %	50 %	25 %	284167604
16055	NC_013744	CGA	2	6	667318	667323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16056	NC_013744	GCC	2	6	667423	667428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167604
16057	NC_013744	ATC	2	6	667458	667463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167604
16058	NC_013744	TCT	2	6	667504	667509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167604
16059	NC_013744	CAC	2	6	667583	667588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167604
16060	NC_013744	GTC	2	6	667650	667655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16061	NC_013744	CGCC	2	8	667656	667663	0 %	0 %	25 %	75 %	284167604
16062	NC_013744	CTG	2	6	667673	667678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16063	NC_013744	CG	3	6	667694	667699	0 %	0 %	50 %	50 %	284167604
16064	NC_013744	AGG	2	6	667728	667733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167604
16065	NC_013744	TCG	2	6	667770	667775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16066	NC_013744	GCT	2	6	667819	667824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167604
16067	NC_013744	CGTC	2	8	667849	667856	0 %	25 %	25 %	50 %	284167604
16068	NC_013744	TAG	2	6	667897	667902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167605
16069	NC_013744	TCGAC	2	10	667922	667931	20 %	20 %	20 %	40 %	284167605
16070	NC_013744	CCGCGG	2	12	668037	668048	0 %	0 %	50 %	50 %	284167605
16071	NC_013744	TGT	2	6	668102	668107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167605
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16075	NC_013744	CTTC	2	8	668204	668211	0 %	50 %	0 %	50 %	284167605
16076	NC_013744	GTC	2	6	668214	668219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
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16083	NC_013744	GGC	2	6	668373	668378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167605
16084	NC_013744	CCGAT	2	10	668389	668398	20 %	20 %	20 %	40 %	284167605
16085	NC_013744	GATC	2	8	668442	668449	25 %	25 %	25 %	25 %	284167605
16086	NC_013744	TCG	2	6	668455	668460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
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16089	NC_013744	TCG	2	6	668518	668523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
16090	NC_013744	ACC	2	6	668543	668548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167605
16091	NC_013744	TCG	2	6	668626	668631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
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16094	NC_013744	GTA	2	6	668694	668699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167605
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16101	NC_013744	GTC	2	6	668913	668918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
16102	NC_013744	CGT	2	6	668930	668935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
16103	NC_013744	CCG	2	6	668944	668949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167605
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16105	NC_013744	GA	3	6	669013	669018	50 %	0 %	50 %	0 %	284167605
16106	NC_013744	GTC	2	6	669039	669044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167605
16107	NC_013744	GAT	2	6	669084	669089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167605
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16111	NC_013744	TG	3	6	669323	669328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_013744	CCG	2	6	669349	669354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_013744	CGT	2	6	669374	669379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_013744	CGG	2	6	669381	669386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_013744	ACG	2	6	669398	669403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_013744	CGAGC	2	10	669416	669425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16117	NC_013744	CGGA	2	8	669440	669447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16119	NC_013744	GAGT	2	8	669490	669497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16480	NC_013744	CGA	3	9	683789	683797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167615
16481	NC_013744	ATC	2	6	683829	683834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167615
16482	NC_013744	GC	3	6	683852	683857	0 %	0 %	50 %	50 %	284167616
16483	NC_013744	GAC	2	6	683973	683978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167616
16484	NC_013744	TAC	2	6	684050	684055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167617
16485	NC_013744	CGG	2	6	684092	684097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167617
16486	NC_013744	GCT	2	6	684116	684121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167617
16487	NC_013744	TG	3	6	684129	684134	0 %	50 %	50 %	0 %	284167617
16488	NC_013744	GGA	2	6	684143	684148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167617
16489	NC_013744	ACGG	2	8	684162	684169	25 %	0 %	50 %	25 %	284167617
16490	NC_013744	CGA	2	6	684212	684217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167617
16491	NC_013744	CGA	2	6	684491	684496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167617
16492	NC_013744	TCT	2	6	684535	684540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167617
16493	NC_013744	ACG	2	6	684652	684657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167617
16494	NC_013744	GC	3	6	684678	684683	0 %	0 %	50 %	50 %	284167617
16495	NC_013744	CCG	2	6	684732	684737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167617
16496	NC_013744	CGT	2	6	684827	684832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167617
16497	NC_013744	CGG	2	6	684845	684850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167617
16498	NC_013744	G	6	6	684849	684854	0 %	0 %	100 %	0 %	284167617
16499	NC_013744	GATC	2	8	684881	684888	25 %	25 %	25 %	25 %	284167617
16500	NC_013744	CGAG	2	8	684979	684986	25 %	0 %	50 %	25 %	284167617

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