MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_013744	CGT	2	6	548748	548753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13003	NC_013744	TCG	2	6	548756	548761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13004	NC_013744	ACG	2	6	548780	548785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13005	NC_013744	CAG	2	6	548788	548793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13006	NC_013744	TGGCG	2	10	548814	548823	0 %	20 %	60 %	20 %	284167495
13007	NC_013744	TCGG	2	8	548876	548883	0 %	25 %	50 %	25 %	284167495
13008	NC_013744	GTC	2	6	548894	548899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13009	NC_013744	CGTC	2	8	548966	548973	0 %	25 %	25 %	50 %	284167495
13010	NC_013744	GAAC	2	8	548976	548983	50 %	0 %	25 %	25 %	284167495
13011	NC_013744	CTCG	2	8	549010	549017	0 %	25 %	25 %	50 %	284167495
13012	NC_013744	CGG	2	6	549060	549065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167495
13013	NC_013744	TCG	2	6	549140	549145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
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13015	NC_013744	CGT	2	6	549234	549239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
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13017	NC_013744	GGC	2	6	549286	549291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167495
13018	NC_013744	CGG	2	6	549302	549307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167495
13019	NC_013744	TCG	2	6	549311	549316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
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13021	NC_013744	CTG	2	6	549406	549411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
13022	NC_013744	CGT	2	6	549438	549443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167495
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13031	NC_013744	CAGC	2	8	549827	549834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13032	NC_013744	AGT	2	6	549838	549843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_013744	CGC	2	6	549872	549877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_013744	TC	3	6	549942	549947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_013744	TCAG	2	8	550004	550011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13036	NC_013744	AGAT	2	8	550026	550033	50 %	25 %	25 %	0 %	284167496
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13040	NC_013744	CGT	3	9	550223	550231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167496
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13052	NC_013744	CGGG	2	8	550530	550537	0 %	0 %	75 %	25 %	284167496
13053	NC_013744	GA	3	6	550566	550571	50 %	0 %	50 %	0 %	284167496
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13055	NC_013744	GATC	2	8	550599	550606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_013744	GCC	2	6	550640	550645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167497
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13060	NC_013744	CGG	2	6	550876	550881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167497
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13065	NC_013744	CGA	2	6	551174	551179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167498
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13069	NC_013744	GACG	2	8	551425	551432	25 %	0 %	50 %	25 %	284167498
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13102	NC_013744	AC	3	6	552808	552813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_013744	TCG	2	6	552904	552909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_013744	ACCG	2	8	552910	552917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13105	NC_013744	TCG	2	6	552922	552927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_013744	AGT	2	6	552936	552941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_013744	AC	3	6	552952	552957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13108	NC_013744	CGA	2	6	553023	553028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167502
13109	NC_013744	CGGC	3	12	553029	553040	0 %	0 %	50 %	50 %	284167502
13110	NC_013744	ACG	2	6	553061	553066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167502
13111	NC_013744	CGCA	2	8	553173	553180	25 %	0 %	25 %	50 %	284167502
13112	NC_013744	GC	3	6	553181	553186	0 %	0 %	50 %	50 %	284167502
13113	NC_013744	CCG	2	6	553232	553237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167502
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13117	NC_013744	CGA	2	6	553302	553307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167502
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13119	NC_013744	ACGC	2	8	553348	553355	25 %	0 %	25 %	50 %	284167502
13120	NC_013744	GAG	2	6	553385	553390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_013744	CTC	2	6	553432	553437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167503
13122	NC_013744	GCTGGT	2	12	553650	553661	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284167503
13123	NC_013744	GTC	2	6	553690	553695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167503
13124	NC_013744	GTC	2	6	553720	553725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167503
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13193	NC_013744	TGGC	2	8	556491	556498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13194	NC_013744	TCGA	2	8	556555	556562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13195	NC_013744	CGAAC	2	10	556603	556612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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13235	NC_013744	CGA	2	6	557942	557947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13236	NC_013744	TTCCGA	2	12	557957	557968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13240	NC_013744	CGA	3	9	558156	558164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167506
13241	NC_013744	TCG	2	6	558176	558181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167506
13242	NC_013744	CGA	2	6	558315	558320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167506
13243	NC_013744	CGA	2	6	558354	558359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167506
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13344	NC_013744	GA	3	6	561760	561765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13345	NC_013744	CG	4	8	561888	561895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13346	NC_013744	CG	3	6	561912	561917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13347	NC_013744	CCG	2	6	562086	562091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167510
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13354	NC_013744	CG	3	6	562423	562428	0 %	0 %	50 %	50 %	284167510
13355	NC_013744	GAC	2	6	562429	562434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167510
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13358	NC_013744	CGCGG	2	10	562466	562475	0 %	0 %	60 %	40 %	284167510
13359	NC_013744	TCC	2	6	562488	562493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167510
13360	NC_013744	ACGCG	2	10	562581	562590	20 %	0 %	40 %	40 %	284167510
13361	NC_013744	GGA	2	6	562639	562644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167510
13362	NC_013744	GGC	2	6	562675	562680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167510
13363	NC_013744	GAG	2	6	562688	562693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167510
13364	NC_013744	CGA	2	6	562738	562743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167510
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13366	NC_013744	CGA	3	9	562773	562781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167510
13367	NC_013744	TCG	2	6	562785	562790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167510
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13369	NC_013744	CCG	2	6	562813	562818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167510
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13373	NC_013744	TCA	2	6	562953	562958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167511
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13375	NC_013744	CGT	2	6	563099	563104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167511
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13377	NC_013744	CGC	2	6	563213	563218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167511
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13381	NC_013744	CGCC	2	8	563321	563328	0 %	0 %	25 %	75 %	284167511
13382	NC_013744	CAA	2	6	563346	563351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167511
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13384	NC_013744	TCG	2	6	563431	563436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167511
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13387	NC_013744	CGT	2	6	563529	563534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167511
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13390	NC_013744	GCC	2	6	563695	563700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13391	NC_013744	CGAA	2	8	563704	563711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13392	NC_013744	GACT	2	8	563749	563756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13393	NC_013744	ACCG	2	8	563773	563780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13394	NC_013744	GACG	2	8	563809	563816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13395	NC_013744	CCG	2	6	563819	563824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13396	NC_013744	TCG	2	6	563868	563873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167512
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13420	NC_013744	CGA	2	6	565232	565237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13422	NC_013744	TAT	2	6	565388	565393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13423	NC_013744	CCG	2	6	565394	565399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13424	NC_013744	CGA	2	6	565433	565438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13453	NC_013744	CTG	2	6	566221	566226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13457	NC_013744	CCTC	2	8	566368	566375	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13458	NC_013744	GAC	2	6	566475	566480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
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13462	NC_013744	CAT	2	6	566679	566684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167514
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13464	NC_013744	GAG	2	6	566932	566937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167514
13465	NC_013744	GAG	2	6	566962	566967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167514
13466	NC_013744	CGTCG	2	10	566997	567006	0 %	20 %	40 %	40 %	284167514
13467	NC_013744	TCC	2	6	567047	567052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167514
13468	NC_013744	CCGG	2	8	567069	567076	0 %	0 %	50 %	50 %	284167514
13469	NC_013744	TCG	2	6	567089	567094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
13470	NC_013744	TCG	2	6	567098	567103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
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13472	NC_013744	TCG	2	6	567227	567232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
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13475	NC_013744	GAC	2	6	567304	567309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167514
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13477	NC_013744	CTG	2	6	567352	567357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
13478	NC_013744	TCG	2	6	567365	567370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167514
13479	NC_013744	CAGA	2	8	567423	567430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13480	NC_013744	CCA	2	6	567455	567460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13481	NC_013744	AAG	2	6	567485	567490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13482	NC_013744	GAT	2	6	567505	567510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
13483	NC_013744	CGC	2	6	567540	567545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167515
13484	NC_013744	ATG	2	6	567568	567573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
13485	NC_013744	ATG	2	6	567589	567594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
13486	NC_013744	CGG	2	6	567624	567629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167515
13487	NC_013744	CTC	2	6	567664	567669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167515
13488	NC_013744	ATT	2	6	567676	567681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284167515
13489	NC_013744	ACGG	2	8	567747	567754	25 %	0 %	50 %	25 %	284167515
13490	NC_013744	GTG	2	6	567791	567796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167515
13491	NC_013744	GAG	2	6	567808	567813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167515
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13494	NC_013744	GTA	2	6	567849	567854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167515
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13498	NC_013744	AGCG	2	8	568151	568158	25 %	0 %	50 %	25 %	284167516
13499	NC_013744	TGC	2	6	568193	568198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167516
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