MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013744	CGAT	2	8	510845	510852	25 %	25 %	25 %	25 %	284167455
12003	NC_013744	CGA	2	6	510872	510877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167455
12004	NC_013744	TCG	2	6	510911	510916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
12005	NC_013744	CCG	2	6	510952	510957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167455
12006	NC_013744	GAA	2	6	511029	511034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167455
12007	NC_013744	TCG	2	6	511060	511065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
12008	NC_013744	CTC	2	6	511176	511181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167455
12009	NC_013744	CGGT	2	8	511222	511229	0 %	25 %	50 %	25 %	284167455
12010	NC_013744	CCG	2	6	511252	511257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167455
12011	NC_013744	TCG	2	6	511321	511326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
12012	NC_013744	TCG	2	6	511372	511377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
12013	NC_013744	GCG	2	6	511393	511398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167455
12014	NC_013744	CGA	2	6	511418	511423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167455
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12019	NC_013744	CGG	2	6	511638	511643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167456
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12021	NC_013744	AGA	2	6	511864	511869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_013744	CTA	2	6	511870	511875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_013744	GTA	2	6	511912	511917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_013744	CAG	2	6	511957	511962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12029	NC_013744	TGA	2	6	512118	512123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167457
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12056	NC_013744	TGG	2	6	513284	513289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167457
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12060	NC_013744	CGAG	2	8	513427	513434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12091	NC_013744	GAAC	2	8	514617	514624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12092	NC_013744	GAC	3	9	514717	514725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167460
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12102	NC_013744	ATCG	2	8	515014	515021	25 %	25 %	25 %	25 %	284167460
12103	NC_013744	TCG	2	6	515024	515029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167460
12104	NC_013744	GAC	2	6	515080	515085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167460
12105	NC_013744	CCT	2	6	515175	515180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167460
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12108	NC_013744	CGT	2	6	515284	515289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167460
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12111	NC_013744	GGC	2	6	515321	515326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167460
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12113	NC_013744	AGC	2	6	515682	515687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12115	NC_013744	CGC	2	6	515773	515778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167461
12116	NC_013744	GATC	2	8	515815	515822	25 %	25 %	25 %	25 %	284167461
12117	NC_013744	CGA	2	6	515837	515842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167461
12118	NC_013744	GC	3	6	515845	515850	0 %	0 %	50 %	50 %	284167461
12119	NC_013744	CGCC	2	8	515851	515858	0 %	0 %	25 %	75 %	284167461
12120	NC_013744	CGC	2	6	515881	515886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167461
12121	NC_013744	CCG	2	6	515922	515927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167461
12122	NC_013744	CGA	2	6	515938	515943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167461
12123	NC_013744	GGC	2	6	515963	515968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167461
12124	NC_013744	CCGTCG	2	12	515983	515994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284167461
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12127	NC_013744	CGAC	2	8	516070	516077	25 %	0 %	25 %	50 %	284167461
12128	NC_013744	GTC	2	6	516078	516083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167461
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12150	NC_013744	TCG	2	6	516775	516780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167461
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12154	NC_013744	CGCT	2	8	516892	516899	0 %	25 %	25 %	50 %	284167462
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12198	NC_013744	ATGT	2	8	518766	518773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12208	NC_013744	TCCG	2	8	519224	519231	0 %	25 %	25 %	50 %	284167464
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12220	NC_013744	TCT	2	6	519772	519777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12221	NC_013744	TCG	2	6	519826	519831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167465
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12225	NC_013744	GCG	2	6	520027	520032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167465
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12229	NC_013744	TCG	2	6	520099	520104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167465
12230	NC_013744	GA	3	6	520216	520221	50 %	0 %	50 %	0 %	284167465
12231	NC_013744	CTC	2	6	520369	520374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167465
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12234	NC_013744	CGA	2	6	520448	520453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167465
12235	NC_013744	GCC	2	6	520481	520486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12236	NC_013744	CGT	2	6	520527	520532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12237	NC_013744	GAC	2	6	520554	520559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
12238	NC_013744	GAC	2	6	520573	520578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
12239	NC_013744	CCG	2	6	520624	520629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167466
12240	NC_013744	CGA	2	6	520646	520651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167466
12241	NC_013744	CG	3	6	520694	520699	0 %	0 %	50 %	50 %	284167466
12242	NC_013744	G	6	6	520701	520706	0 %	0 %	100 %	0 %	284167466
12243	NC_013744	GTC	2	6	520717	520722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
12244	NC_013744	TCGT	2	8	520797	520804	0 %	50 %	25 %	25 %	284167466
12245	NC_013744	CTC	2	6	520830	520835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167466
12246	NC_013744	CGC	2	6	520850	520855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167466
12247	NC_013744	CGTA	2	8	520897	520904	25 %	25 %	25 %	25 %	284167466
12248	NC_013744	TGT	2	6	520945	520950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167466
12249	NC_013744	GAT	2	6	520969	520974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167466
12250	NC_013744	TCCG	2	8	521012	521019	0 %	25 %	25 %	50 %	284167466
12251	NC_013744	TCG	2	6	521020	521025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
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12253	NC_013744	ATC	2	6	521097	521102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167466
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12255	NC_013744	TCG	3	9	521213	521221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
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12260	NC_013744	CGT	2	6	521405	521410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167466
12261	NC_013744	GTC	2	6	521501	521506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12262	NC_013744	GAC	2	6	521519	521524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12263	NC_013744	TAT	2	6	521525	521530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_013744	GAC	2	6	521620	521625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12265	NC_013744	GTC	2	6	521728	521733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12266	NC_013744	CAT	2	6	521736	521741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12267	NC_013744	CTT	2	6	521748	521753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12268	NC_013744	GAAT	2	8	521789	521796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12269	NC_013744	TCA	2	6	521832	521837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12270	NC_013744	TTC	2	6	521875	521880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12271	NC_013744	ATATT	2	10	521887	521896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12272	NC_013744	TACG	2	8	521943	521950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12273	NC_013744	GTCTG	2	10	522001	522010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12274	NC_013744	GAGT	2	8	522046	522053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12275	NC_013744	CGA	2	6	522104	522109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12276	NC_013744	TCG	2	6	522185	522190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12280	NC_013744	GACC	2	8	522337	522344	25 %	0 %	25 %	50 %	284167467
12281	NC_013744	CGA	2	6	522373	522378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167467
12282	NC_013744	ACG	2	6	522467	522472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12283	NC_013744	GAG	2	6	522483	522488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12284	NC_013744	GTC	2	6	522584	522589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12285	NC_013744	GTCG	2	8	522591	522598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12286	NC_013744	TCG	2	6	522612	522617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12287	NC_013744	CGT	2	6	522626	522631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12288	NC_013744	TCGA	2	8	522635	522642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12289	NC_013744	AGCCG	2	10	522649	522658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12290	NC_013744	CCG	2	6	522674	522679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12291	NC_013744	GGA	2	6	522683	522688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12292	NC_013744	CG	3	6	522758	522763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12293	NC_013744	ACT	2	6	522831	522836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167468
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12312	NC_013744	CGGC	2	8	523303	523310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12313	NC_013744	GTG	2	6	523380	523385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167469
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12338	NC_013744	ATCG	2	8	523946	523953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12339	NC_013744	GTAC	2	8	523979	523986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12340	NC_013744	TTC	2	6	524043	524048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167470
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12345	NC_013744	AG	3	6	524466	524471	50 %	0 %	50 %	0 %	284167470
12346	NC_013744	GCG	2	6	524540	524545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167470
12347	NC_013744	GACG	2	8	524574	524581	25 %	0 %	50 %	25 %	284167470
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12353	NC_013744	GA	3	6	524810	524815	50 %	0 %	50 %	0 %	284167470
12354	NC_013744	CGG	2	6	524864	524869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167470
12355	NC_013744	CGAGAA	2	12	524885	524896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284167470
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12357	NC_013744	ACG	2	6	524968	524973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167470
12358	NC_013744	GAC	2	6	524979	524984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167470
12359	NC_013744	CACG	2	8	525020	525027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12360	NC_013744	GTT	2	6	525043	525048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12361	NC_013744	TC	3	6	525049	525054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12362	NC_013744	TG	3	6	525075	525080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12363	NC_013744	CGAG	2	8	525136	525143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12364	NC_013744	ACG	2	6	525153	525158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12366	NC_013744	AG	3	6	525168	525173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12367	NC_013744	GAT	2	6	525222	525227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167471
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12474	NC_013744	TCG	2	6	528786	528791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167474
12475	NC_013744	TGAT	2	8	528870	528877	25 %	50 %	25 %	0 %	284167474
12476	NC_013744	TCCAGC	2	12	528904	528915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167474
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12478	NC_013744	AGCC	2	8	528957	528964	25 %	0 %	25 %	50 %	284167474
12479	NC_013744	GAGCAC	2	12	528965	528976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167474
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12481	NC_013744	AGC	2	6	529023	529028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167474
12482	NC_013744	GAC	2	6	529049	529054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167474
12483	NC_013744	GAC	2	6	529112	529117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167474
12484	NC_013744	CAG	2	6	529157	529162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167474
12485	NC_013744	TCAGT	2	10	529207	529216	20 %	40 %	20 %	20 %	284167474
12486	NC_013744	GCA	2	6	529239	529244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167475
12487	NC_013744	AGTTCG	2	12	529260	529271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284167475
12488	NC_013744	TCC	2	6	529293	529298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167475
12489	NC_013744	CG	3	6	529310	529315	0 %	0 %	50 %	50 %	284167475
12490	NC_013744	CGG	2	6	529334	529339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167475
12491	NC_013744	CGTTC	2	10	529402	529411	0 %	40 %	20 %	40 %	284167475
12492	NC_013744	CGC	2	6	529430	529435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167475
12493	NC_013744	CGG	2	6	529439	529444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167475
12494	NC_013744	GAC	2	6	529475	529480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167475
12495	NC_013744	CGT	2	6	529483	529488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167475
12496	NC_013744	CGAC	2	8	529696	529703	25 %	0 %	25 %	50 %	284167475
12497	NC_013744	CGATCG	2	12	529705	529716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284167475
12498	NC_013744	GGAG	2	8	529768	529775	25 %	0 %	75 %	0 %	284167475
12499	NC_013744	CCG	2	6	529809	529814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167475
12500	NC_013744	GGCGTG	2	12	529826	529837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	284167475

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