MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013744	ACGA	2	8	488304	488311	50 %	0 %	25 %	25 %	284167431
11502	NC_013744	CGG	2	6	488333	488338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167431
11503	NC_013744	GACG	2	8	488354	488361	25 %	0 %	50 %	25 %	284167431
11504	NC_013744	CGAGGC	2	12	488374	488385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284167431
11505	NC_013744	CGA	2	6	488386	488391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11506	NC_013744	CAG	2	6	488465	488470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11507	NC_013744	GAC	2	6	488501	488506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11508	NC_013744	GC	3	6	488581	488586	0 %	0 %	50 %	50 %	284167431
11509	NC_013744	GTAC	2	8	488653	488660	25 %	25 %	25 %	25 %	284167431
11510	NC_013744	CGA	2	6	488662	488667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11511	NC_013744	ACG	2	6	488688	488693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11512	NC_013744	TCG	2	6	488718	488723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11513	NC_013744	TCG	2	6	488773	488778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11514	NC_013744	CGA	2	6	488806	488811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11515	NC_013744	GCT	2	6	488826	488831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167431
11516	NC_013744	TCCGAA	2	12	488976	488987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284167432
11517	NC_013744	CGGT	2	8	489029	489036	0 %	25 %	50 %	25 %	284167432
11518	NC_013744	GTC	2	6	489060	489065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11519	NC_013744	TCG	2	6	489086	489091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11520	NC_013744	GAC	2	6	489097	489102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11521	NC_013744	GCC	2	6	489127	489132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167432
11522	NC_013744	TGG	2	6	489176	489181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167432
11523	NC_013744	TCTG	2	8	489218	489225	0 %	50 %	25 %	25 %	284167432
11524	NC_013744	CGT	2	6	489304	489309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11525	NC_013744	GTC	2	6	489323	489328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11526	NC_013744	GCG	2	6	489344	489349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167432
11527	NC_013744	GCC	2	6	489391	489396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167432
11528	NC_013744	ACGC	2	8	489399	489406	25 %	0 %	25 %	50 %	284167432
11529	NC_013744	CTC	2	6	489412	489417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167432
11530	NC_013744	CGGT	2	8	489421	489428	0 %	25 %	50 %	25 %	284167432
11531	NC_013744	TTCG	2	8	489680	489687	0 %	50 %	25 %	25 %	284167432
11532	NC_013744	ACG	2	6	489707	489712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167432
11533	NC_013744	GATCG	2	10	489790	489799	20 %	20 %	40 %	20 %	284167432
11534	NC_013744	CTC	2	6	489816	489821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_013744	CGGT	2	8	489835	489842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11536	NC_013744	TTC	2	6	489857	489862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_013744	TCCC	2	8	489874	489881	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11538	NC_013744	CGA	2	6	489896	489901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_013744	CCA	2	6	489971	489976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_013744	TA	3	6	490003	490008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_013744	AGT	2	6	490148	490153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_013744	GAT	2	6	490198	490203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_013744	AAG	2	6	490257	490262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_013744	AT	3	6	490311	490316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_013744	GCA	2	6	490334	490339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_013744	GATC	2	8	490378	490385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_013744	GTA	2	6	490423	490428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_013744	ACA	2	6	490549	490554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_013744	CGA	2	6	490603	490608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_013744	CT	3	6	490769	490774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_013744	AGA	2	6	490835	490840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_013744	GA	3	6	490839	490844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_013744	TTC	2	6	490854	490859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_013744	TG	3	6	490909	490914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_013744	GGC	2	6	490935	490940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_013744	CAG	2	6	491036	491041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167433
11557	NC_013744	GTT	2	6	491135	491140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167433
11558	NC_013744	CGAATC	2	12	491184	491195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284167433
11559	NC_013744	ACGTT	2	10	491196	491205	20 %	40 %	20 %	20 %	284167433
11560	NC_013744	AATC	2	8	491340	491347	50 %	25 %	0 %	25 %	284167433
11561	NC_013744	TCG	2	6	491379	491384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167433
11562	NC_013744	GA	3	6	491481	491486	50 %	0 %	50 %	0 %	284167433
11563	NC_013744	TCCG	2	8	491687	491694	0 %	25 %	25 %	50 %	284167434
11564	NC_013744	CGG	2	6	491793	491798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167434
11565	NC_013744	CGG	2	6	491841	491846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167434
11566	NC_013744	TCG	2	6	491870	491875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167434
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11570	NC_013744	GC	3	6	492134	492139	0 %	0 %	50 %	50 %	284167434
11571	NC_013744	CGG	2	6	492149	492154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167434
11572	NC_013744	CTT	2	6	492198	492203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167434
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11575	NC_013744	CGC	2	6	492243	492248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167434
11576	NC_013744	AGCG	2	8	492327	492334	25 %	0 %	50 %	25 %	284167434
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11581	NC_013744	CGTG	2	8	492438	492445	0 %	25 %	50 %	25 %	284167434
11582	NC_013744	GTC	2	6	492542	492547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167434
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11585	NC_013744	GCC	2	6	492620	492625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167434
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11590	NC_013744	CGC	2	6	492800	492805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167435
11591	NC_013744	CGAA	2	8	492812	492819	50 %	0 %	25 %	25 %	284167435
11592	NC_013744	TCG	2	6	492838	492843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167435
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11595	NC_013744	CGT	2	6	492963	492968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167435
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11600	NC_013744	TG	3	6	493092	493097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_013744	GAGG	2	8	493171	493178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_013744	CTC	2	6	493221	493226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_013744	AAC	2	6	493263	493268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_013744	GTC	2	6	493284	493289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167436
11605	NC_013744	CG	4	8	493346	493353	0 %	0 %	50 %	50 %	284167436
11606	NC_013744	CGA	3	9	493433	493441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167436
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11608	NC_013744	CGC	2	6	493571	493576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167436
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11610	NC_013744	GTA	2	6	493704	493709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167436
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11614	NC_013744	GCG	2	6	493900	493905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167436
11615	NC_013744	GTACG	2	10	493913	493922	20 %	20 %	40 %	20 %	284167436
11616	NC_013744	CGGA	2	8	493951	493958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_013744	CGA	2	6	494083	494088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167437
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11621	NC_013744	CGT	3	9	494284	494292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167437
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11745	NC_013744	GGT	2	6	499680	499685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167444
11746	NC_013744	CGG	2	6	499733	499738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167444
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11777	NC_013744	CCGG	2	8	500977	500984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11833	NC_013744	CGTC	2	8	503667	503674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11844	NC_013744	AT	3	6	503889	503894	50 %	50 %	0 %	0 %	284167447
11845	NC_013744	GC	3	6	503934	503939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11846	NC_013744	GAA	3	9	504052	504060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11847	NC_013744	GAC	2	6	504139	504144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167448
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11850	NC_013744	GGTC	2	8	504231	504238	0 %	25 %	50 %	25 %	284167448
11851	NC_013744	T	6	6	504251	504256	0 %	100 %	0 %	0 %	284167448
11852	NC_013744	ACG	2	6	504272	504277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167448
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11855	NC_013744	GAG	2	6	504402	504407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167449
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11859	NC_013744	GAG	2	6	504615	504620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167449
11860	NC_013744	GTCG	2	8	504695	504702	0 %	25 %	50 %	25 %	284167449
11861	NC_013744	TAC	2	6	504762	504767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11862	NC_013744	GTA	2	6	504785	504790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11864	NC_013744	TCG	2	6	504925	504930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167450
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11866	NC_013744	CGT	2	6	504986	504991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167450
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11984	NC_013744	GAG	2	6	510139	510144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167453
11985	NC_013744	ACC	2	6	510302	510307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167454
11986	NC_013744	GACA	2	8	510344	510351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11987	NC_013744	CATT	2	8	510355	510362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11988	NC_013744	TCG	2	6	510364	510369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11989	NC_013744	GACC	2	8	510372	510379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11990	NC_013744	GCTTC	2	10	510419	510428	0 %	40 %	20 %	40 %	284167455
11991	NC_013744	CGG	2	6	510460	510465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167455
11992	NC_013744	TCC	2	6	510508	510513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167455
11993	NC_013744	CTGA	2	8	510546	510553	25 %	25 %	25 %	25 %	284167455
11994	NC_013744	TCC	2	6	510631	510636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167455
11995	NC_013744	ATC	2	6	510652	510657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167455
11996	NC_013744	CGT	2	6	510665	510670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
11997	NC_013744	TC	3	6	510680	510685	0 %	50 %	0 %	50 %	284167455
11998	NC_013744	CGT	2	6	510764	510769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167455
11999	NC_013744	CGCC	2	8	510812	510819	0 %	0 %	25 %	75 %	284167455
12000	NC_013744	CCGC	2	8	510824	510831	0 %	0 %	25 %	75 %	284167455

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