MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013744	CGA	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167053
502	NC_013744	CGT	2	6	17749	17754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167053
503	NC_013744	ACT	2	6	17766	17771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167053
504	NC_013744	CGACCT	2	12	17773	17784	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284167053
505	NC_013744	TCGAG	2	10	17810	17819	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_013744	CGC	2	6	17862	17867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
507	NC_013744	TCG	2	6	17884	17889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
508	NC_013744	GTC	2	6	17890	17895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
509	NC_013744	CGGC	2	8	17950	17957	0 %	0 %	50 %	50 %	284167054
510	NC_013744	C	7	7	17997	18003	0 %	0 %	0 %	100 %	284167054
511	NC_013744	CG	3	6	18015	18020	0 %	0 %	50 %	50 %	284167054
512	NC_013744	TCG	2	6	18043	18048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
513	NC_013744	CGA	2	6	18053	18058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
514	NC_013744	CGT	2	6	18095	18100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
515	NC_013744	CGG	2	6	18107	18112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
516	NC_013744	GAT	2	6	18117	18122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167054
517	NC_013744	GCTC	2	8	18224	18231	0 %	25 %	25 %	50 %	284167054
518	NC_013744	GCC	3	9	18267	18275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
519	NC_013744	CGA	2	6	18299	18304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
520	NC_013744	TCGA	2	8	18361	18368	25 %	25 %	25 %	25 %	284167054
521	NC_013744	CGA	2	6	18389	18394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
522	NC_013744	CG	3	6	18423	18428	0 %	0 %	50 %	50 %	284167054
523	NC_013744	CAG	2	6	18447	18452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
524	NC_013744	CTC	2	6	18465	18470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167054
525	NC_013744	CGAG	2	8	18473	18480	25 %	0 %	50 %	25 %	284167054
526	NC_013744	CGG	2	6	18485	18490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
527	NC_013744	TCGA	2	8	18540	18547	25 %	25 %	25 %	25 %	284167054
528	NC_013744	CCGA	2	8	18555	18562	25 %	0 %	25 %	50 %	284167054
529	NC_013744	CGG	2	6	18569	18574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
530	NC_013744	GGT	2	6	18575	18580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167054
531	NC_013744	CGT	3	9	18602	18610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
532	NC_013744	ACG	2	6	18650	18655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
533	NC_013744	CG	4	8	18686	18693	0 %	0 %	50 %	50 %	284167054
534	NC_013744	GCC	3	9	18762	18770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
535	NC_013744	TCG	2	6	18784	18789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
536	NC_013744	CGT	2	6	18809	18814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
537	NC_013744	CGC	2	6	18828	18833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
538	NC_013744	GCC	2	6	18857	18862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
539	NC_013744	TCG	2	6	18874	18879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
540	NC_013744	CGG	2	6	18888	18893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
541	NC_013744	CTCGTA	2	12	18912	18923	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284167054
542	NC_013744	TTC	2	6	18940	18945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167054
543	NC_013744	CGA	2	6	18971	18976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
544	NC_013744	CGA	2	6	19025	19030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
545	NC_013744	TCG	2	6	19127	19132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
546	NC_013744	CGT	2	6	19139	19144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
547	NC_013744	CGA	2	6	19145	19150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
548	NC_013744	GGC	2	6	19155	19160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
549	NC_013744	CAG	2	6	19167	19172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
550	NC_013744	TCT	2	6	19232	19237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167054
551	NC_013744	CGAA	2	8	19246	19253	50 %	0 %	25 %	25 %	284167054
552	NC_013744	CCG	2	6	19259	19264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
553	NC_013744	CGTC	2	8	19280	19287	0 %	25 %	25 %	50 %	284167054
554	NC_013744	GAC	2	6	19299	19304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
555	NC_013744	CGG	2	6	19326	19331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167054
556	NC_013744	GAA	2	6	19335	19340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167054
557	NC_013744	CGT	2	6	19427	19432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
558	NC_013744	CCT	2	6	19466	19471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167054
559	NC_013744	CG	3	6	19524	19529	0 %	0 %	50 %	50 %	284167054
560	NC_013744	CGA	2	6	19538	19543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
561	NC_013744	GAC	2	6	19548	19553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167054
562	NC_013744	TCC	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167054
563	NC_013744	CGT	2	6	19679	19684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167054
564	NC_013744	CGC	2	6	19695	19700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167054
565	NC_013744	TCGA	2	8	19869	19876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_013744	CGA	3	9	19874	19882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013744	TCG	2	6	19986	19991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
568	NC_013744	CGAC	2	8	20004	20011	25 %	0 %	25 %	50 %	284167055
569	NC_013744	CGA	2	6	20062	20067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
570	NC_013744	CTC	2	6	20150	20155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167055
571	NC_013744	CTCG	2	8	20201	20208	0 %	25 %	25 %	50 %	284167055
572	NC_013744	TTC	2	6	20219	20224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167055
573	NC_013744	GAC	2	6	20269	20274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
574	NC_013744	CGA	2	6	20323	20328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
575	NC_013744	CGA	2	6	20362	20367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167055
576	NC_013744	TCG	2	6	20415	20420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
577	NC_013744	GCT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
578	NC_013744	CGTCGG	2	12	20578	20589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284167055
579	NC_013744	CGT	2	6	20620	20625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
580	NC_013744	TCG	2	6	20643	20648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
581	NC_013744	ACC	3	9	20649	20657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167055
582	NC_013744	AGG	2	6	20667	20672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167055
583	NC_013744	CTG	2	6	20798	20803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167055
584	NC_013744	CCG	2	6	20845	20850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167055
585	NC_013744	GTCA	2	8	20910	20917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_013744	TCCGA	2	10	20937	20946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
587	NC_013744	CGAG	2	8	20959	20966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_013744	GAC	2	6	20990	20995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013744	GCG	3	9	21018	21026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
590	NC_013744	CGTC	2	8	21033	21040	0 %	25 %	25 %	50 %	284167056
591	NC_013744	CGC	2	6	21048	21053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167056
592	NC_013744	TCG	2	6	21072	21077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
593	NC_013744	ACG	2	6	21177	21182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
594	NC_013744	CGG	2	6	21220	21225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
595	NC_013744	TCG	2	6	21228	21233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
596	NC_013744	GGC	2	6	21271	21276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
597	NC_013744	GGTC	2	8	21301	21308	0 %	25 %	50 %	25 %	284167056
598	NC_013744	CGA	2	6	21346	21351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
599	NC_013744	CTC	2	6	21388	21393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167056
600	NC_013744	CGG	2	6	21396	21401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167056
601	NC_013744	TCG	2	6	21402	21407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167056
602	NC_013744	CCGA	2	8	21432	21439	25 %	0 %	25 %	50 %	284167056
603	NC_013744	ACG	2	6	21474	21479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167056
604	NC_013744	GCCG	2	8	21497	21504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_013744	CT	3	6	21505	21510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_013744	CGG	2	6	21536	21541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013744	GACT	2	8	21565	21572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_013744	ATG	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013744	TG	3	6	21596	21601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013744	GGAT	2	8	21630	21637	25 %	25 %	50 %	0 %	284167057
611	NC_013744	TGA	2	6	21681	21686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167057
612	NC_013744	ACT	2	6	21726	21731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167057
613	NC_013744	GAG	2	6	21764	21769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167057
614	NC_013744	GGC	2	6	21791	21796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
615	NC_013744	CGG	2	6	21826	21831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
616	NC_013744	CTC	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167057
617	NC_013744	GAA	2	6	21881	21886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167057
618	NC_013744	CTG	2	6	21889	21894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167057
619	NC_013744	GAC	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
620	NC_013744	CGG	2	6	21931	21936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
621	NC_013744	CGG	2	6	22000	22005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167057
622	NC_013744	CG	3	6	22054	22059	0 %	0 %	50 %	50 %	284167057
623	NC_013744	GCC	2	6	22070	22075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167057
624	NC_013744	CGA	2	6	22087	22092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167057
625	NC_013744	ACC	2	6	22143	22148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167057
626	NC_013744	TGA	2	6	22155	22160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167057
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