MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_013744	ACGA	2	8	353605	353612	50 %	0 %	25 %	25 %	284167322
8502	NC_013744	GTA	2	6	353631	353636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167322
8503	NC_013744	CGT	2	6	353657	353662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_013744	TA	3	6	353720	353725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_013744	ATCA	2	8	353741	353748	50 %	25 %	0 %	25 %	284167323
8506	NC_013744	GCC	2	6	353770	353775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167323
8507	NC_013744	AGAGT	2	10	353826	353835	40 %	20 %	40 %	0 %	284167323
8508	NC_013744	CCG	2	6	353845	353850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167323
8509	NC_013744	CGAG	2	8	353858	353865	25 %	0 %	50 %	25 %	284167323
8510	NC_013744	GCT	2	6	353901	353906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8511	NC_013744	CGT	2	6	353978	353983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8512	NC_013744	TCG	2	6	353998	354003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8513	NC_013744	GCG	2	6	354025	354030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167323
8514	NC_013744	CGA	2	6	354056	354061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8515	NC_013744	CCGT	2	8	354073	354080	0 %	25 %	25 %	50 %	284167323
8516	NC_013744	GTTC	2	8	354094	354101	0 %	50 %	25 %	25 %	284167323
8517	NC_013744	CGA	3	9	354122	354130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8518	NC_013744	GAGT	2	8	354266	354273	25 %	25 %	50 %	0 %	284167323
8519	NC_013744	CGGC	2	8	354278	354285	0 %	0 %	50 %	50 %	284167323
8520	NC_013744	GACA	2	8	354330	354337	50 %	0 %	25 %	25 %	284167323
8521	NC_013744	ACC	2	6	354347	354352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167323
8522	NC_013744	CCGTCG	2	12	354415	354426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284167323
8523	NC_013744	GCG	2	6	354439	354444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167323
8524	NC_013744	TAG	2	6	354445	354450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167323
8525	NC_013744	GCA	2	6	354545	354550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8526	NC_013744	AGT	2	6	354571	354576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167323
8527	NC_013744	TCG	2	6	354604	354609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8528	NC_013744	GTC	2	6	354654	354659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8529	NC_013744	ACA	2	6	354668	354673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167323
8530	NC_013744	TCC	2	6	354730	354735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167323
8531	NC_013744	CGT	2	6	354743	354748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8532	NC_013744	GTC	2	6	354771	354776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8533	NC_013744	TGA	2	6	354812	354817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167323
8534	NC_013744	GTC	2	6	354852	354857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8535	NC_013744	CG	3	6	354864	354869	0 %	0 %	50 %	50 %	284167323
8536	NC_013744	CGC	2	6	354899	354904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167323
8537	NC_013744	CGT	2	6	354926	354931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8538	NC_013744	CCGGT	2	10	354966	354975	0 %	20 %	40 %	40 %	284167323
8539	NC_013744	TCC	2	6	355009	355014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167323
8540	NC_013744	GTC	2	6	355026	355031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8541	NC_013744	GATC	2	8	355053	355060	25 %	25 %	25 %	25 %	284167323
8542	NC_013744	CCGG	2	8	355072	355079	0 %	0 %	50 %	50 %	284167323
8543	NC_013744	CGG	2	6	355152	355157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167323
8544	NC_013744	TCG	3	9	355186	355194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8545	NC_013744	GAA	2	6	355286	355291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167323
8546	NC_013744	GTC	2	6	355303	355308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8547	NC_013744	CGA	2	6	355355	355360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167323
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8549	NC_013744	CGTC	2	8	355409	355416	0 %	25 %	25 %	50 %	284167323
8550	NC_013744	GCG	2	6	355426	355431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167323
8551	NC_013744	GTCGGC	2	12	355545	355556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284167323
8552	NC_013744	CCG	2	6	355580	355585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167323
8553	NC_013744	TCG	2	6	355621	355626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8554	NC_013744	CGG	2	6	355635	355640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167323
8555	NC_013744	GATC	2	8	355646	355653	25 %	25 %	25 %	25 %	284167323
8556	NC_013744	CCG	2	6	355699	355704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167323
8557	NC_013744	AG	3	6	355767	355772	50 %	0 %	50 %	0 %	284167323
8558	NC_013744	CCA	2	6	355782	355787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167323
8559	NC_013744	ACG	2	6	355799	355804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167323
8560	NC_013744	CGTC	2	8	355892	355899	0 %	25 %	25 %	50 %	284167323
8561	NC_013744	GGC	2	6	356001	356006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_013744	GCA	2	6	356093	356098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_013744	CCAGTT	2	12	356261	356272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284167324
8564	NC_013744	GTA	2	6	356282	356287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167324
8565	NC_013744	TCCA	2	8	356328	356335	25 %	25 %	0 %	50 %	284167324
8566	NC_013744	GCT	2	6	356353	356358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167324
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8569	NC_013744	TC	3	6	356428	356433	0 %	50 %	0 %	50 %	284167324
8570	NC_013744	CGG	2	6	356459	356464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167324
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8581	NC_013744	GTC	2	6	357242	357247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167324
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8584	NC_013744	GGA	2	6	357391	357396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167324
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8587	NC_013744	TCG	2	6	357582	357587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167324
8588	NC_013744	GTT	2	6	357608	357613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167324
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8591	NC_013744	CGA	2	6	357748	357753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167324
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8593	NC_013744	TCG	2	6	357774	357779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167324
8594	NC_013744	CG	3	6	357789	357794	0 %	0 %	50 %	50 %	284167324
8595	NC_013744	GAT	2	6	357806	357811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167324
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8597	NC_013744	TGATC	2	10	357856	357865	20 %	40 %	20 %	20 %	284167324
8598	NC_013744	CAGC	2	8	357927	357934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8599	NC_013744	CGA	3	9	357978	357986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_013744	CTCC	2	8	357998	358005	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8601	NC_013744	CAA	2	6	358142	358147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_013744	TCCT	2	8	358192	358199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8603	NC_013744	GTGA	2	8	358203	358210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_013744	TCA	2	6	358269	358274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_013744	CTC	2	6	358331	358336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8606	NC_013744	ACCA	2	8	358461	358468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_013744	ATT	2	6	358486	358491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284167325
8608	NC_013744	CT	3	6	358541	358546	0 %	50 %	0 %	50 %	284167325
8609	NC_013744	ATC	2	6	358577	358582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167325
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8611	NC_013744	ACT	2	6	358651	358656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_013744	GGAC	2	8	358731	358738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_013744	CT	3	6	358750	358755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8614	NC_013744	TCAC	2	8	358762	358769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8615	NC_013744	ATCT	2	8	358786	358793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8616	NC_013744	GTC	2	6	358848	358853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_013744	GGT	2	6	358983	358988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_013744	GATC	2	8	359026	359033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8619	NC_013744	CAC	2	6	359035	359040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8620	NC_013744	CTGC	2	8	359056	359063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8621	NC_013744	AGGT	2	8	359162	359169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8999	NC_013744	GCTG	2	8	375940	375947	0 %	25 %	50 %	25 %	284167335
9000	NC_013744	TCT	2	6	376031	376036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167335

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