MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 16847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013744	TCGA	2	8	331915	331922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_013744	CGG	2	6	331959	331964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_013744	CGA	2	6	331993	331998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_013744	TCC	2	6	332066	332071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_013744	TCG	2	6	332165	332170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_013744	GCA	2	6	332178	332183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_013744	CAGA	2	8	332188	332195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_013744	C	6	6	332354	332359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8009	NC_013744	ACG	2	6	332511	332516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8010	NC_013744	CGC	2	6	332525	332530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8011	NC_013744	CCGA	2	8	332545	332552	25 %	0 %	25 %	50 %	284167310
8012	NC_013744	TCGAC	2	10	332564	332573	20 %	20 %	20 %	40 %	284167310
8013	NC_013744	TCG	2	6	332578	332583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8014	NC_013744	GAA	2	6	332603	332608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167310
8015	NC_013744	GTG	2	6	332630	332635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167310
8016	NC_013744	CGG	2	6	332666	332671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167310
8017	NC_013744	AACG	2	8	332679	332686	50 %	0 %	25 %	25 %	284167310
8018	NC_013744	TC	3	6	332726	332731	0 %	50 %	0 %	50 %	284167310
8019	NC_013744	CGC	2	6	332779	332784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8020	NC_013744	CAT	2	6	332831	332836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167310
8021	NC_013744	CTG	2	6	332886	332891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8022	NC_013744	GGC	2	6	332944	332949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284167310
8023	NC_013744	CGAA	2	8	333151	333158	50 %	0 %	25 %	25 %	284167310
8024	NC_013744	GA	3	6	333165	333170	50 %	0 %	50 %	0 %	284167310
8025	NC_013744	CAA	2	6	333180	333185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167310
8026	NC_013744	AG	3	6	333198	333203	50 %	0 %	50 %	0 %	284167310
8027	NC_013744	TAC	2	6	333276	333281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167310
8028	NC_013744	GGA	2	6	333311	333316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167310
8029	NC_013744	GCC	2	6	333375	333380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8030	NC_013744	GAG	2	6	333384	333389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167310
8031	NC_013744	GAC	3	9	333486	333494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8032	NC_013744	TCG	2	6	333502	333507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8033	NC_013744	GC	3	6	333545	333550	0 %	0 %	50 %	50 %	284167310
8034	NC_013744	TCA	2	6	333631	333636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167310
8035	NC_013744	GGCGAG	2	12	333651	333662	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	284167310
8036	NC_013744	GAC	2	6	333678	333683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8037	NC_013744	GGT	2	6	333815	333820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167310
8038	NC_013744	TCGAGA	2	12	333844	333855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284167310
8039	NC_013744	TGG	2	6	333860	333865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167310
8040	NC_013744	GCGGA	2	10	333910	333919	20 %	0 %	60 %	20 %	284167310
8041	NC_013744	CGA	2	6	333944	333949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8042	NC_013744	GAT	2	6	334182	334187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167310
8043	NC_013744	CGA	2	6	334217	334222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8044	NC_013744	CCG	2	6	334228	334233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8045	NC_013744	AAC	2	6	334239	334244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167310
8046	NC_013744	CGA	2	6	334253	334258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8047	NC_013744	GCC	2	6	334288	334293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8048	NC_013744	GAA	2	6	334452	334457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167310
8049	NC_013744	GA	3	6	334492	334497	50 %	0 %	50 %	0 %	284167310
8050	NC_013744	GAG	2	6	334530	334535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167310
8051	NC_013744	CGTG	2	8	334632	334639	0 %	25 %	50 %	25 %	284167310
8052	NC_013744	AC	3	6	334690	334695	50 %	0 %	0 %	50 %	284167310
8053	NC_013744	GGT	2	6	334745	334750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284167310
8054	NC_013744	ACG	3	9	334843	334851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8055	NC_013744	CGA	2	6	334895	334900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8056	NC_013744	CGT	2	6	334997	335002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8057	NC_013744	CGC	2	6	335035	335040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8058	NC_013744	TC	3	6	335048	335053	0 %	50 %	0 %	50 %	284167310
8059	NC_013744	GTTC	2	8	335087	335094	0 %	50 %	25 %	25 %	284167310
8060	NC_013744	TCT	2	6	335119	335124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167310
8061	NC_013744	TCGT	2	8	335128	335135	0 %	50 %	25 %	25 %	284167310
8062	NC_013744	CAG	2	6	335164	335169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167310
8063	NC_013744	CGCT	2	8	335172	335179	0 %	25 %	25 %	50 %	284167310
8064	NC_013744	CGC	2	6	335258	335263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167310
8065	NC_013744	GTT	2	6	335325	335330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167310
8066	NC_013744	CGCC	2	8	335408	335415	0 %	0 %	25 %	75 %	284167310
8067	NC_013744	CG	3	6	335419	335424	0 %	0 %	50 %	50 %	284167310
8068	NC_013744	CTT	2	6	335522	335527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167310
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8070	NC_013744	CA	3	6	335561	335566	50 %	0 %	0 %	50 %	284167310
8071	NC_013744	TG	3	6	335626	335631	0 %	50 %	50 %	0 %	284167310
8072	NC_013744	CAC	2	6	335682	335687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_013744	AAT	2	6	335725	335730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_013744	TAT	2	6	335768	335773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_013744	TGG	2	6	335792	335797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_013744	AGG	2	6	335922	335927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167311
8077	NC_013744	TCT	2	6	335966	335971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167312
8078	NC_013744	ACA	3	9	335977	335985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284167312
8079	NC_013744	CGCT	2	8	335997	336004	0 %	25 %	25 %	50 %	284167312
8080	NC_013744	GATC	2	8	336102	336109	25 %	25 %	25 %	25 %	284167312
8081	NC_013744	GA	3	6	336262	336267	50 %	0 %	50 %	0 %	284167312
8082	NC_013744	GAATG	2	10	336326	336335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_013744	TA	3	6	336538	336543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_013744	TAT	2	6	336554	336559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_013744	GTC	2	6	336563	336568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_013744	GTA	2	6	336576	336581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_013744	CGCT	2	8	336611	336618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_013744	ACCC	2	8	336624	336631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8089	NC_013744	CTT	2	6	336678	336683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_013744	TGC	2	6	336777	336782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_013744	CGGC	2	8	336843	336850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_013744	AGA	2	6	336901	336906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013744	CTG	2	6	336933	336938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8094	NC_013744	GTT	2	6	336939	336944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284167313
8095	NC_013744	GCC	2	6	336945	336950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167313
8096	NC_013744	CCA	2	6	336951	336956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167313
8097	NC_013744	CG	3	6	336983	336988	0 %	0 %	50 %	50 %	284167313
8098	NC_013744	GTA	2	6	337041	337046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167313
8099	NC_013744	CTG	2	6	337074	337079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8100	NC_013744	CGC	2	6	337085	337090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167313
8101	NC_013744	CAC	2	6	337093	337098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167313
8102	NC_013744	CGT	2	6	337121	337126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8103	NC_013744	CAC	2	6	337234	337239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284167313
8104	NC_013744	CTG	2	6	337245	337250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8105	NC_013744	TCC	2	6	337272	337277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167313
8106	NC_013744	AGT	2	6	337352	337357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167313
8107	NC_013744	CCG	2	6	337390	337395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167313
8108	NC_013744	TCG	2	6	337406	337411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8109	NC_013744	TCT	2	6	337454	337459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284167313
8110	NC_013744	CGT	2	6	337463	337468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8111	NC_013744	GAT	2	6	337482	337487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167313
8112	NC_013744	CGA	2	6	337496	337501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8113	NC_013744	CGT	2	6	337523	337528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8114	NC_013744	GAA	2	6	337575	337580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167313
8115	NC_013744	TCGA	2	8	337596	337603	25 %	25 %	25 %	25 %	284167313
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8118	NC_013744	CGT	2	6	337625	337630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
8119	NC_013744	CG	3	6	337637	337642	0 %	0 %	50 %	50 %	284167313
8120	NC_013744	CTGA	2	8	337647	337654	25 %	25 %	25 %	25 %	284167313
8121	NC_013744	CAG	2	6	337685	337690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167313
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8123	NC_013744	TCG	2	6	337777	337782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
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8127	NC_013744	CGA	2	6	338048	338053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167313
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8132	NC_013744	TCG	2	6	338131	338136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
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8155	NC_013744	TCG	2	6	339049	339054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167313
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8206	NC_013744	CCG	2	6	341250	341255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8207	NC_013744	ATC	2	6	341340	341345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167314
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8230	NC_013744	TGC	2	6	342143	342148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167314
8231	NC_013744	GCC	2	6	342164	342169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167314
8232	NC_013744	GCA	2	6	342220	342225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167314
8233	NC_013744	TCC	2	6	342279	342284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167315
8234	NC_013744	GTCC	2	8	342338	342345	0 %	25 %	25 %	50 %	284167315
8235	NC_013744	CGA	2	6	342355	342360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167315
8236	NC_013744	CCTC	2	8	342384	342391	0 %	25 %	0 %	75 %	284167315
8237	NC_013744	TCG	2	6	342421	342426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167315
8238	NC_013744	GTC	2	6	342443	342448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167315
8239	NC_013744	GAC	2	6	342449	342454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284167315
8240	NC_013744	CGAC	2	8	342472	342479	25 %	0 %	25 %	50 %	284167315
8241	NC_013744	TCG	2	6	342510	342515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284167315
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8484	NC_013744	ATG	2	6	352732	352737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167322
8485	NC_013744	CAT	2	6	352749	352754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167322
8486	NC_013744	CG	3	6	352766	352771	0 %	0 %	50 %	50 %	284167322
8487	NC_013744	GAA	2	6	352785	352790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284167322
8488	NC_013744	GTA	2	6	352791	352796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167322
8489	NC_013744	GAT	2	6	352830	352835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284167322
8490	NC_013744	GGA	2	6	352886	352891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167322
8491	NC_013744	CTA	2	6	353072	353077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167322
8492	NC_013744	CGC	2	6	353175	353180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167322
8493	NC_013744	TCA	2	6	353201	353206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284167322
8494	NC_013744	CCT	2	6	353246	353251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284167322
8495	NC_013744	GAG	2	6	353259	353264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284167322
8496	NC_013744	CGAG	2	8	353270	353277	25 %	0 %	50 %	25 %	284167322
8497	NC_013744	TTGC	2	8	353511	353518	0 %	50 %	25 %	25 %	284167322
8498	NC_013744	TCGC	2	8	353525	353532	0 %	25 %	25 %	50 %	284167322
8499	NC_013744	GCC	2	6	353547	353552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284167322
8500	NC_013744	CGTGAT	2	12	353577	353588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284167322

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