MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013743	CGT	2	6	419543	419548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11502	NC_013743	GCG	2	6	419571	419576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163685
11503	NC_013743	CGAC	2	8	419582	419589	25 %	0 %	25 %	50 %	284163685
11504	NC_013743	ACA	2	6	419593	419598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163685
11505	NC_013743	ACG	2	6	419614	419619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11506	NC_013743	GA	3	6	419704	419709	50 %	0 %	50 %	0 %	284163685
11507	NC_013743	GCAC	2	8	419755	419762	25 %	0 %	25 %	50 %	284163685
11508	NC_013743	CGA	2	6	419771	419776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11509	NC_013743	CGA	2	6	419851	419856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11510	NC_013743	CGG	3	9	419903	419911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163685
11511	NC_013743	ACC	2	6	419955	419960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163685
11512	NC_013743	CCT	2	6	419990	419995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163685
11513	NC_013743	TCG	2	6	420046	420051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11514	NC_013743	GGTCG	2	10	420068	420077	0 %	20 %	60 %	20 %	284163685
11515	NC_013743	TAC	2	6	420114	420119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163685
11516	NC_013743	GGCGA	2	10	420144	420153	20 %	0 %	60 %	20 %	284163685
11517	NC_013743	GTC	2	6	420165	420170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11518	NC_013743	CGA	3	9	420182	420190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11519	NC_013743	GGA	2	6	420224	420229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163685
11520	NC_013743	CGA	2	6	420233	420238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11521	NC_013743	CGG	2	6	420275	420280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163685
11522	NC_013743	CTA	2	6	420311	420316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163685
11523	NC_013743	CGA	2	6	420317	420322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163685
11524	NC_013743	GTTCGG	2	12	420353	420364	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284163685
11525	NC_013743	CGG	2	6	420377	420382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_013743	CGA	2	6	420410	420415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_013743	TCG	2	6	420466	420471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11528	NC_013743	TCG	3	9	420499	420507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11529	NC_013743	CGGC	2	8	420527	420534	0 %	0 %	50 %	50 %	284163686
11530	NC_013743	GAAC	2	8	420542	420549	50 %	0 %	25 %	25 %	284163686
11531	NC_013743	GCC	2	6	420568	420573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163686
11532	NC_013743	TCG	2	6	420646	420651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11533	NC_013743	CGA	3	9	420656	420664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11534	NC_013743	TCG	2	6	420679	420684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11535	NC_013743	CGGG	2	8	420692	420699	0 %	0 %	75 %	25 %	284163686
11536	NC_013743	GTA	2	6	420702	420707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163686
11537	NC_013743	CGA	2	6	420755	420760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11538	NC_013743	CTC	2	6	420768	420773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163686
11539	NC_013743	GGCC	2	8	420794	420801	0 %	0 %	50 %	50 %	284163686
11540	NC_013743	CGA	2	6	420824	420829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11541	NC_013743	ACG	2	6	420844	420849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11542	NC_013743	CTC	2	6	420873	420878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163686
11543	NC_013743	GCC	2	6	420886	420891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163686
11544	NC_013743	GAG	2	6	420900	420905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163686
11545	NC_013743	CGT	2	6	420923	420928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11546	NC_013743	GTC	2	6	420931	420936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163686
11547	NC_013743	TCCG	2	8	420948	420955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_013743	CG	3	6	420954	420959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_013743	GTCG	2	8	420983	420990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_013743	A	6	6	421001	421006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_013743	CTCG	2	8	421022	421029	0 %	25 %	25 %	50 %	284163687
11552	NC_013743	CGAC	2	8	421033	421040	25 %	0 %	25 %	50 %	284163687
11553	NC_013743	GACGGT	2	12	421043	421054	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284163687
11554	NC_013743	CG	3	6	421088	421093	0 %	0 %	50 %	50 %	284163687
11555	NC_013743	GAC	2	6	421094	421099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163687
11556	NC_013743	CGG	2	6	421109	421114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163687
11557	NC_013743	GC	3	6	421168	421173	0 %	0 %	50 %	50 %	284163687
11558	NC_013743	CGA	2	6	421216	421221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163687
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11560	NC_013743	CGG	2	6	421240	421245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163687
11561	NC_013743	CGA	2	6	421273	421278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163687
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11564	NC_013743	GCCG	2	8	421316	421323	0 %	0 %	50 %	50 %	284163687
11565	NC_013743	AGTG	2	8	421332	421339	25 %	25 %	50 %	0 %	284163687
11566	NC_013743	GTC	2	6	421358	421363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163687
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11568	NC_013743	CCGC	2	8	421389	421396	0 %	0 %	25 %	75 %	284163687
11569	NC_013743	GCC	2	6	421422	421427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163687
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11571	NC_013743	TCG	2	6	421446	421451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163687
11572	NC_013743	CG	3	6	421481	421486	0 %	0 %	50 %	50 %	284163687
11573	NC_013743	CGT	2	6	421499	421504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163687
11574	NC_013743	GCC	2	6	421529	421534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163687
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11578	NC_013743	CGGT	2	8	421707	421714	0 %	25 %	50 %	25 %	284163687
11579	NC_013743	TCG	2	6	421720	421725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163687
11580	NC_013743	CG	3	6	421727	421732	0 %	0 %	50 %	50 %	284163687
11581	NC_013743	GT	3	6	421752	421757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_013743	CGC	2	6	421794	421799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11583	NC_013743	ACT	2	6	421839	421844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163688
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11585	NC_013743	GACG	3	12	421936	421947	25 %	0 %	50 %	25 %	284163688
11586	NC_013743	GCC	2	6	421951	421956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163688
11587	NC_013743	GCC	2	6	422004	422009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163688
11588	NC_013743	TCC	2	6	422093	422098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163688
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11590	NC_013743	CG	3	6	422164	422169	0 %	0 %	50 %	50 %	284163688
11591	NC_013743	ACC	2	6	422195	422200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163688
11592	NC_013743	GATC	2	8	422249	422256	25 %	25 %	25 %	25 %	284163688
11593	NC_013743	TCCG	2	8	422279	422286	0 %	25 %	25 %	50 %	284163688
11594	NC_013743	CGT	2	6	422310	422315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163688
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11596	NC_013743	TCG	2	6	422378	422383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163688
11597	NC_013743	TCGA	2	8	422420	422427	25 %	25 %	25 %	25 %	284163688
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11600	NC_013743	CT	3	6	422467	422472	0 %	50 %	0 %	50 %	284163688
11601	NC_013743	TCG	2	6	422491	422496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163688
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11604	NC_013743	GCT	2	6	422556	422561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163688
11605	NC_013743	ACGG	2	8	422572	422579	25 %	0 %	50 %	25 %	284163688
11606	NC_013743	CGT	2	6	422586	422591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163688
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11609	NC_013743	TC	3	6	422685	422690	0 %	50 %	0 %	50 %	284163688
11610	NC_013743	CGA	2	6	422807	422812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_013743	GTCGA	2	10	422817	422826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11612	NC_013743	AGG	2	6	422851	422856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_013743	TTCG	2	8	422923	422930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11614	NC_013743	TCC	2	6	422943	422948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_013743	CGCT	2	8	422950	422957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11616	NC_013743	ACG	2	6	422972	422977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_013743	ACG	2	6	422982	422987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_013743	CGG	2	6	423002	423007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_013743	CGA	2	6	423085	423090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163689
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11621	NC_013743	GCG	2	6	423106	423111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163689
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11977	NC_013743	CCGC	2	8	435429	435436	0 %	0 %	25 %	75 %	284163700
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