MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013743	CGA	2	6	380075	380080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_013743	AAT	2	6	380201	380206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_013743	GC	3	6	380214	380219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_013743	ACG	2	6	380250	380255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_013743	CAT	2	6	380267	380272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_013743	AAG	2	6	380336	380341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_013743	GA	4	8	380350	380357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_013743	ATG	2	6	380366	380371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163651
10509	NC_013743	GCC	2	6	380387	380392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163651
10510	NC_013743	GAC	2	6	380518	380523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10511	NC_013743	GAC	2	6	380527	380532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10512	NC_013743	GAC	2	6	380552	380557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10513	NC_013743	CGA	2	6	380560	380565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10514	NC_013743	GGA	2	6	380581	380586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163651
10515	NC_013743	CTG	2	6	380654	380659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10516	NC_013743	CGA	2	6	380671	380676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10517	NC_013743	GGC	2	6	380705	380710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163651
10518	NC_013743	CGG	2	6	380788	380793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163651
10519	NC_013743	CCGG	2	8	380846	380853	0 %	0 %	50 %	50 %	284163651
10520	NC_013743	CGT	2	6	380854	380859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10521	NC_013743	GTC	2	6	380906	380911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10522	NC_013743	GTG	2	6	380939	380944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163651
10523	NC_013743	CGC	2	6	380964	380969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163651
10524	NC_013743	GGCC	2	8	381007	381014	0 %	0 %	50 %	50 %	284163651
10525	NC_013743	CGT	2	6	381034	381039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10526	NC_013743	CTC	2	6	381112	381117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163651
10527	NC_013743	AAC	2	6	381188	381193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163651
10528	NC_013743	CGT	2	6	381199	381204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10529	NC_013743	GAG	2	6	381320	381325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163651
10530	NC_013743	AAC	2	6	381354	381359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163651
10531	NC_013743	AGGA	2	8	381381	381388	50 %	0 %	50 %	0 %	284163651
10532	NC_013743	TCG	2	6	381393	381398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10533	NC_013743	TCA	2	6	381405	381410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163651
10534	NC_013743	TCG	2	6	381432	381437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10535	NC_013743	GAG	2	6	381446	381451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163651
10536	NC_013743	ACG	2	6	381492	381497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10537	NC_013743	TCG	2	6	381504	381509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10538	NC_013743	CGG	2	6	381546	381551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163651
10539	NC_013743	CGA	2	6	381601	381606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10540	NC_013743	GACG	2	8	381664	381671	25 %	0 %	50 %	25 %	284163651
10541	NC_013743	GC	3	6	381680	381685	0 %	0 %	50 %	50 %	284163651
10542	NC_013743	ACG	2	6	381741	381746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10543	NC_013743	CGG	2	6	381763	381768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163651
10544	NC_013743	ACG	2	6	381798	381803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163651
10545	NC_013743	TCCG	2	8	381980	381987	0 %	25 %	25 %	50 %	284163652
10546	NC_013743	TCC	2	6	382008	382013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163652
10547	NC_013743	TTG	2	6	382026	382031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163652
10548	NC_013743	CTT	2	6	382037	382042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163652
10549	NC_013743	TGA	2	6	382054	382059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163652
10550	NC_013743	TCCT	2	8	382118	382125	0 %	50 %	0 %	50 %	284163652
10551	NC_013743	GGT	2	6	382159	382164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163652
10552	NC_013743	TGG	2	6	382167	382172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284163652
10553	NC_013743	TCG	2	6	382284	382289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163652
10554	NC_013743	ACGA	2	8	382395	382402	50 %	0 %	25 %	25 %	284163652
10555	NC_013743	TCA	2	6	382509	382514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163652
10556	NC_013743	CTC	2	6	382526	382531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163652
10557	NC_013743	CGA	2	6	382543	382548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163652
10558	NC_013743	CTAA	2	8	382621	382628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10559	NC_013743	TAGT	2	8	382636	382643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_013743	ATA	2	6	382655	382660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_013743	TCG	2	6	382734	382739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_013743	TCG	2	6	382887	382892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_013743	TCG	2	6	382952	382957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_013743	CGC	2	6	382988	382993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163653
10565	NC_013743	GC	3	6	382992	382997	0 %	0 %	50 %	50 %	284163653
10566	NC_013743	AAG	2	6	383004	383009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163653
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10568	NC_013743	CG	3	6	383045	383050	0 %	0 %	50 %	50 %	284163653
10569	NC_013743	CGA	2	6	383246	383251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163653
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10573	NC_013743	CGA	2	6	383485	383490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163654
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10575	NC_013743	CCG	2	6	383550	383555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163654
10576	NC_013743	GTC	2	6	383556	383561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163654
10577	NC_013743	AGCA	2	8	383567	383574	50 %	0 %	25 %	25 %	284163654
10578	NC_013743	AAG	2	6	383579	383584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163654
10579	NC_013743	TCG	2	6	383598	383603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163654
10580	NC_013743	TCA	2	6	383610	383615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163654
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10582	NC_013743	AGA	2	6	383655	383660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163654
10583	NC_013743	CGA	2	6	383707	383712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163654
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10585	NC_013743	CG	3	6	383757	383762	0 %	0 %	50 %	50 %	284163654
10586	NC_013743	GCGTC	2	10	383827	383836	0 %	20 %	40 %	40 %	284163654
10587	NC_013743	ACGCCC	2	12	383888	383899	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	284163654
10588	NC_013743	TCG	2	6	383925	383930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163654
10589	NC_013743	ACG	2	6	383943	383948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163654
10590	NC_013743	CAGT	2	8	383961	383968	25 %	25 %	25 %	25 %	284163654
10591	NC_013743	AGAA	2	8	383970	383977	75 %	0 %	25 %	0 %	284163654
10592	NC_013743	TCT	2	6	384026	384031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_013743	TC	3	6	384036	384041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10594	NC_013743	ACCG	2	8	384042	384049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_013743	CAG	2	6	384055	384060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_013743	CTC	2	6	384140	384145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_013743	ATA	2	6	384212	384217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_013743	TAT	2	6	384272	384277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_013743	GT	3	6	384308	384313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_013743	ATTTG	2	10	384442	384451	20 %	60 %	20 %	0 %	284163655
10601	NC_013743	GA	3	6	384452	384457	50 %	0 %	50 %	0 %	284163655
10602	NC_013743	TTC	2	6	384613	384618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163655
10603	NC_013743	TTA	2	6	384745	384750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284163655
10604	NC_013743	TCT	2	6	384857	384862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163655
10605	NC_013743	GCA	2	6	384871	384876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163655
10606	NC_013743	GAAG	2	8	384932	384939	50 %	0 %	50 %	0 %	284163655
10607	NC_013743	AG	3	6	384951	384956	50 %	0 %	50 %	0 %	284163655
10608	NC_013743	TCA	2	6	385015	385020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163655
10609	NC_013743	TCA	2	6	385054	385059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163655
10610	NC_013743	ACT	2	6	385084	385089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163655
10611	NC_013743	GTA	2	6	385219	385224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163655
10612	NC_013743	GTT	2	6	385507	385512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163655
10613	NC_013743	ACAAT	2	10	385525	385534	60 %	20 %	0 %	20 %	284163655
10614	NC_013743	GAG	2	6	385536	385541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163655
10615	NC_013743	ATCC	2	8	385580	385587	25 %	25 %	0 %	50 %	284163655
10616	NC_013743	TTCGA	2	10	385588	385597	20 %	40 %	20 %	20 %	284163655
10617	NC_013743	TGC	2	6	385656	385661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163655
10618	NC_013743	ACG	2	6	385684	385689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163655
10619	NC_013743	CAG	2	6	385886	385891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163655
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10621	NC_013743	TCG	2	6	385901	385906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163655
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10978	NC_013743	CGG	2	6	399745	399750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10979	NC_013743	CCG	2	6	399761	399766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10980	NC_013743	GGAA	2	8	399772	399779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10981	NC_013743	GCG	2	6	399859	399864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163668
10982	NC_013743	TCG	3	9	399896	399904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163668
10983	NC_013743	CTG	2	6	399940	399945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163668
10984	NC_013743	TCG	2	6	399986	399991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163668
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