MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013743	CGC	2	6	161898	161903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4502	NC_013743	CGTT	2	8	161954	161961	0 %	50 %	25 %	25 %	284163445
4503	NC_013743	GAC	2	6	161965	161970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4504	NC_013743	CGAC	2	8	161997	162004	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4505	NC_013743	CCG	2	6	162083	162088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4506	NC_013743	TCG	2	6	162116	162121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4507	NC_013743	ACCG	2	8	162148	162155	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4508	NC_013743	GGAACG	2	12	162159	162170	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284163445
4509	NC_013743	CGA	2	6	162182	162187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4510	NC_013743	GC	4	8	162188	162195	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4511	NC_013743	GCT	2	6	162369	162374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4512	NC_013743	CGA	2	6	162375	162380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4513	NC_013743	GCGA	2	8	162392	162399	25 %	0 %	50 %	25 %	284163445
4514	NC_013743	ACG	2	6	162428	162433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4515	NC_013743	ACG	2	6	162436	162441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4516	NC_013743	GAG	2	6	162481	162486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4517	NC_013743	ACG	2	6	162558	162563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4518	NC_013743	GAG	2	6	162682	162687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4519	NC_013743	CGG	2	6	162740	162745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4520	NC_013743	GCGG	2	8	162753	162760	0 %	0 %	75 %	25 %	284163445
4521	NC_013743	CGA	2	6	162768	162773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4522	NC_013743	GAGG	2	8	162805	162812	25 %	0 %	75 %	0 %	284163445
4523	NC_013743	GGTCG	2	10	162838	162847	0 %	20 %	60 %	20 %	284163445
4524	NC_013743	CGA	3	9	162849	162857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4525	NC_013743	TCG	2	6	162872	162877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4526	NC_013743	ACCG	2	8	162895	162902	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4527	NC_013743	CGA	2	6	162945	162950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4528	NC_013743	CCT	2	6	162951	162956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163445
4529	NC_013743	CGA	2	6	162966	162971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4530	NC_013743	TTC	2	6	163081	163086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163445
4531	NC_013743	CG	3	6	163099	163104	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4532	NC_013743	TCG	2	6	163202	163207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4533	NC_013743	CGA	2	6	163208	163213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4534	NC_013743	CGT	2	6	163239	163244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4535	NC_013743	GAC	2	6	163302	163307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4536	NC_013743	GGC	2	6	163345	163350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4537	NC_013743	GAG	2	6	163369	163374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4538	NC_013743	CGA	2	6	163395	163400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4539	NC_013743	GAC	2	6	163431	163436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4540	NC_013743	GCCG	2	8	163443	163450	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4541	NC_013743	CGA	2	6	163473	163478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4542	NC_013743	CCGG	2	8	163479	163486	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4543	NC_013743	GAC	2	6	163558	163563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4544	NC_013743	GAG	2	6	163567	163572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4545	NC_013743	CGA	2	6	163614	163619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4546	NC_013743	TCG	2	6	163622	163627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4547	NC_013743	CGAA	2	8	163683	163690	50 %	0 %	25 %	25 %	284163445
4548	NC_013743	CGA	2	6	163782	163787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4549	NC_013743	GGA	2	6	163860	163865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4550	NC_013743	GGC	2	6	163881	163886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4551	NC_013743	GCG	2	6	163907	163912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4552	NC_013743	CGA	2	6	163947	163952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4553	NC_013743	GGAC	2	8	163998	164005	25 %	0 %	50 %	25 %	284163445
4554	NC_013743	GTC	2	6	164008	164013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4555	NC_013743	ACCG	2	8	164041	164048	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4556	NC_013743	CGA	2	6	164121	164126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4557	NC_013743	ACG	2	6	164150	164155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4558	NC_013743	GAC	2	6	164200	164205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4559	NC_013743	GCC	2	6	164220	164225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4560	NC_013743	GCT	2	6	164262	164267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4561	NC_013743	GGA	2	6	164271	164276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163445
4562	NC_013743	GAC	2	6	164365	164370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4563	NC_013743	CGG	2	6	164387	164392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4564	NC_013743	GTC	2	6	164395	164400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4565	NC_013743	ACG	2	6	164519	164524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4566	NC_013743	GGGA	2	8	164639	164646	25 %	0 %	75 %	0 %	284163445
4567	NC_013743	CCG	2	6	164681	164686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4568	NC_013743	CGG	2	6	164756	164761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4569	NC_013743	GTC	2	6	164764	164769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4570	NC_013743	GAC	2	6	164814	164819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4571	NC_013743	CGG	2	6	164856	164861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4572	NC_013743	GAC	2	6	164877	164882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4573	NC_013743	GCTGAC	2	12	164895	164906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4574	NC_013743	TCGG	2	8	164927	164934	0 %	25 %	50 %	25 %	284163445
4575	NC_013743	ACC	2	6	164981	164986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163445
4576	NC_013743	CGA	2	6	164988	164993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4577	NC_013743	CGA	3	9	165075	165083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4578	NC_013743	GAC	2	6	165121	165126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4579	NC_013743	GTC	2	6	165133	165138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4580	NC_013743	ACCG	2	8	165166	165173	25 %	0 %	25 %	50 %	284163445
4581	NC_013743	ACGCGA	2	12	165180	165191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4582	NC_013743	ACG	2	6	165202	165207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4583	NC_013743	CGG	2	6	165243	165248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4584	NC_013743	CGTCGA	2	12	165275	165286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4585	NC_013743	CGA	2	6	165294	165299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4586	NC_013743	CGA	2	6	165372	165377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4587	NC_013743	GGC	2	6	165405	165410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4588	NC_013743	GAGACG	2	12	165415	165426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284163445
4589	NC_013743	ACT	2	6	165609	165614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163445
4590	NC_013743	GTC	2	6	165649	165654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4591	NC_013743	GCC	2	6	165661	165666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4592	NC_013743	TCG	2	6	165742	165747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4593	NC_013743	CGG	2	6	165771	165776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4594	NC_013743	CCGT	2	8	165781	165788	0 %	25 %	25 %	50 %	284163445
4595	NC_013743	CGGT	2	8	165791	165798	0 %	25 %	50 %	25 %	284163445
4596	NC_013743	GAC	2	6	165819	165824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
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4598	NC_013743	CGA	2	6	165852	165857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4599	NC_013743	CGAT	2	8	165870	165877	25 %	25 %	25 %	25 %	284163445
4600	NC_013743	CGC	2	6	165878	165883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4601	NC_013743	CGG	2	6	165888	165893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4602	NC_013743	CGG	2	6	165903	165908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4603	NC_013743	CTG	2	6	165946	165951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4604	NC_013743	CGA	2	6	165962	165967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4605	NC_013743	CGA	3	9	165969	165977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4606	NC_013743	CCG	2	6	165981	165986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4607	NC_013743	TCG	2	6	166001	166006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4608	NC_013743	ACC	2	6	166009	166014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163445
4609	NC_013743	GGC	2	6	166074	166079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4610	NC_013743	CGG	2	6	166087	166092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163445
4611	NC_013743	CAGATC	2	12	166102	166113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284163445
4612	NC_013743	CGA	2	6	166164	166169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4613	NC_013743	TCG	2	6	166196	166201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4614	NC_013743	GC	3	6	166264	166269	0 %	0 %	50 %	50 %	284163445
4615	NC_013743	CGA	2	6	166281	166286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163445
4616	NC_013743	GCC	2	6	166351	166356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163445
4617	NC_013743	GTC	2	6	166375	166380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163445
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4619	NC_013743	CGAA	2	8	166417	166424	50 %	0 %	25 %	25 %	284163445
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4741	NC_013743	CCT	2	6	170485	170490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163449
4742	NC_013743	CGA	2	6	170531	170536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163449
4743	NC_013743	GCT	2	6	170543	170548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163449
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4801	NC_013743	GC	4	8	172828	172835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4802	NC_013743	CACG	2	8	172836	172843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4803	NC_013743	CGTC	2	8	172908	172915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4804	NC_013743	TCGAG	2	10	172939	172948	20 %	20 %	40 %	20 %	284163451
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4825	NC_013743	TCGATA	2	12	173590	173601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4828	NC_013743	AAG	2	6	173654	173659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4829	NC_013743	GCC	2	6	173727	173732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4834	NC_013743	TCG	2	6	173884	173889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163452
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4837	NC_013743	CGA	3	9	173978	173986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163452
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4840	NC_013743	AT	3	6	174058	174063	50 %	50 %	0 %	0 %	284163453
4841	NC_013743	CGC	2	6	174121	174126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163453
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4843	NC_013743	CCGTCG	2	12	174192	174203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284163453
4844	NC_013743	GCT	2	6	174223	174228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163453
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4848	NC_013743	CG	3	6	174363	174368	0 %	0 %	50 %	50 %	284163453
4849	NC_013743	GC	3	6	174381	174386	0 %	0 %	50 %	50 %	284163453
4850	NC_013743	CAA	2	6	174398	174403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163453
4851	NC_013743	CGA	2	6	174409	174414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163453
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4853	NC_013743	TCT	2	6	174466	174471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163454
4854	NC_013743	CT	3	6	174475	174480	0 %	50 %	0 %	50 %	284163454
4855	NC_013743	TCG	3	9	174505	174513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163454
4856	NC_013743	CGT	2	6	174515	174520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163454
4857	NC_013743	CTC	2	6	174528	174533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163454
4858	NC_013743	GTA	2	6	174534	174539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163454
4859	NC_013743	CA	3	6	174563	174568	50 %	0 %	0 %	50 %	284163454
4860	NC_013743	GTC	2	6	174570	174575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163454
4861	NC_013743	TCG	2	6	174605	174610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163454
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4893	NC_013743	GCG	2	6	175620	175625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4977	NC_013743	CGGC	2	8	179052	179059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4978	NC_013743	CGA	2	6	179139	179144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4979	NC_013743	CCG	2	6	179223	179228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4980	NC_013743	AAG	2	6	179268	179273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4981	NC_013743	GAC	2	6	179291	179296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163460
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4985	NC_013743	CGA	2	6	179359	179364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163460
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