MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20123	NC_013422	CAT	2	6	1023471	1023476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20124	NC_013422	GGC	2	6	1023552	1023557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20125	NC_013422	ACG	2	6	1023579	1023584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20126	NC_013422	GCG	2	6	1023591	1023596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20127	NC_013422	CAGC	2	8	1023612	1023619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20128	NC_013422	C	6	6	1023707	1023712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20129	NC_013422	CAT	2	6	1023781	1023786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20130	NC_013422	CAT	2	6	1023855	1023860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20131	NC_013422	ATG	2	6	1023893	1023898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20132	NC_013422	GCA	2	6	1023935	1023940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20133	NC_013422	CGC	2	6	1023969	1023974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20134	NC_013422	CAGG	2	8	1024110	1024117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20135	NC_013422	CCGT	2	8	1024143	1024150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20136	NC_013422	GCA	2	6	1024180	1024185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20137	NC_013422	CA	3	6	1024207	1024212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20138	NC_013422	CTC	2	6	1024315	1024320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20139	NC_013422	TTC	2	6	1024333	1024338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20140	NC_013422	TCA	2	6	1024384	1024389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20141	NC_013422	CGG	2	6	1024400	1024405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20142	NC_013422	TTATC	2	10	1024447	1024456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20143	NC_013422	TAT	2	6	1024491	1024496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20144	NC_013422	TTTG	2	8	1024566	1024573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20145	NC_013422	TGGTTA	2	12	1024600	1024611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20146	NC_013422	TAAT	3	12	1024654	1024665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20147	NC_013422	A	7	7	1024679	1024685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20148	NC_013422	AAG	2	6	1024820	1024825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20149	NC_013422	GT	3	6	1024828	1024833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20150	NC_013422	CAAT	2	8	1024944	1024951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20151	NC_013422	T	6	6	1025003	1025008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20152	NC_013422	T	7	7	1025014	1025020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20153	NC_013422	AATT	2	8	1025065	1025072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20154	NC_013422	TGCT	2	8	1025181	1025188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20155	NC_013422	GTA	2	6	1025222	1025227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855557
20156	NC_013422	GAT	2	6	1025290	1025295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855557
20157	NC_013422	TTG	2	6	1025336	1025341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855557
20158	NC_013422	TTA	2	6	1025412	1025417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855557
20159	NC_013422	ATC	2	6	1025429	1025434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855557
20160	NC_013422	CAGA	2	8	1025473	1025480	50 %	0 %	25 %	25 %	261855557
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20162	NC_013422	TTATT	2	10	1025604	1025613	20 %	80 %	0 %	0 %	261855557
20163	NC_013422	AC	3	6	1025779	1025784	50 %	0 %	0 %	50 %	261855557
20164	NC_013422	TTG	2	6	1025789	1025794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855557
20165	NC_013422	ATC	2	6	1025798	1025803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855557
20166	NC_013422	GAT	2	6	1025866	1025871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855557
20167	NC_013422	TTG	2	6	1025906	1025911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855557
20168	NC_013422	T	7	7	1025981	1025987	0 %	100 %	0 %	0 %	261855557
20169	NC_013422	CGT	2	6	1025998	1026003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855557
20170	NC_013422	TCA	2	6	1026009	1026014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855557
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20180	NC_013422	CAA	2	6	1026920	1026925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855559
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20224	NC_013422	TGA	2	6	1028573	1028578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855560
20225	NC_013422	CAT	2	6	1028588	1028593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855560
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20228	NC_013422	ATG	2	6	1028656	1028661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855560
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20241	NC_013422	AT	3	6	1029490	1029495	50 %	50 %	0 %	0 %	261855560
20242	NC_013422	TGC	2	6	1029512	1029517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855560
20243	NC_013422	GAG	2	6	1029657	1029662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855560
20244	NC_013422	TGA	2	6	1029671	1029676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855560
20245	NC_013422	TC	3	6	1029683	1029688	0 %	50 %	0 %	50 %	261855560
20246	NC_013422	TA	3	6	1029691	1029696	50 %	50 %	0 %	0 %	261855560
20247	NC_013422	GT	3	6	1029736	1029741	0 %	50 %	50 %	0 %	261855560
20248	NC_013422	TG	3	6	1029751	1029756	0 %	50 %	50 %	0 %	261855560
20249	NC_013422	GAGTG	2	10	1029809	1029818	20 %	20 %	60 %	0 %	261855560
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20347	NC_013422	G	6	6	1035655	1035660	0 %	0 %	100 %	0 %	261855562
20348	NC_013422	GAT	2	6	1035663	1035668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855562
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20350	NC_013422	AAAT	2	8	1035726	1035733	75 %	25 %	0 %	0 %	261855562
20351	NC_013422	TGT	2	6	1035762	1035767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855562
20352	NC_013422	ATT	2	6	1035833	1035838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855562
20353	NC_013422	TA	3	6	1035899	1035904	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
20354	NC_013422	ATG	2	6	1035962	1035967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855562
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20356	NC_013422	CT	3	6	1035989	1035994	0 %	50 %	0 %	50 %	261855562
20357	NC_013422	AT	3	6	1035999	1036004	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
20358	NC_013422	AT	3	6	1036037	1036042	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
20359	NC_013422	C	6	6	1036050	1036055	0 %	0 %	0 %	100 %	261855562
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20362	NC_013422	GCA	2	6	1036206	1036211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855562
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20365	NC_013422	TGA	3	9	1036390	1036398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20482	NC_013422	TGCT	2	8	1041434	1041441	0 %	50 %	25 %	25 %	261855567
20483	NC_013422	CT	3	6	1041458	1041463	0 %	50 %	0 %	50 %	261855567
20484	NC_013422	CTG	2	6	1041499	1041504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20485	NC_013422	GTG	2	6	1041508	1041513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20486	NC_013422	GAC	2	6	1041557	1041562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20487	NC_013422	GTT	2	6	1041607	1041612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20488	NC_013422	AAC	2	6	1041634	1041639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20489	NC_013422	CTT	2	6	1041680	1041685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20490	NC_013422	GCATG	2	10	1041729	1041738	20 %	20 %	40 %	20 %	261855568
20491	NC_013422	ATC	2	6	1041748	1041753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855568
20492	NC_013422	AG	3	6	1041832	1041837	50 %	0 %	50 %	0 %	261855568
20493	NC_013422	CAG	2	6	1041838	1041843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855568
20494	NC_013422	A	7	7	1041896	1041902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20495	NC_013422	ACCG	2	8	1041939	1041946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20496	NC_013422	GTT	2	6	1042005	1042010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855569
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