MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013422	GATC	2	8	967905	967912	25 %	25 %	25 %	25 %	261855504
19003	NC_013422	AAT	2	6	968037	968042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855505
19004	NC_013422	AGG	2	6	968151	968156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855505
19005	NC_013422	GAT	2	6	968252	968257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855505
19006	NC_013422	AGC	3	9	968340	968348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855505
19007	NC_013422	A	7	7	968360	968366	100 %	0 %	0 %	0 %	261855505
19008	NC_013422	CCA	2	6	968367	968372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855505
19009	NC_013422	ATGA	2	8	968382	968389	50 %	25 %	25 %	0 %	261855505
19010	NC_013422	ATC	2	6	968468	968473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855505
19011	NC_013422	CTTT	2	8	968503	968510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19012	NC_013422	GCT	2	6	968519	968524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_013422	ATA	2	6	968543	968548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_013422	ATTGA	2	10	968573	968582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_013422	A	6	6	968597	968602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_013422	CGG	2	6	968618	968623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19017	NC_013422	ACG	2	6	968667	968672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_013422	GATT	2	8	968730	968737	25 %	50 %	25 %	0 %	261855506
19019	NC_013422	GAT	2	6	968803	968808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855506
19020	NC_013422	TTC	2	6	968810	968815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855506
19021	NC_013422	CAT	2	6	968866	968871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855506
19022	NC_013422	GT	3	6	968880	968885	0 %	50 %	50 %	0 %	261855506
19023	NC_013422	TAA	2	6	968928	968933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855506
19024	NC_013422	CAC	2	6	968941	968946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855506
19025	NC_013422	ATGACC	2	12	968949	968960	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855506
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19028	NC_013422	TGA	2	6	969279	969284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855507
19029	NC_013422	AAAT	2	8	969434	969441	75 %	25 %	0 %	0 %	261855507
19030	NC_013422	ATC	2	6	969446	969451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855507
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19033	NC_013422	GTC	2	6	969487	969492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855507
19034	NC_013422	GA	3	6	969493	969498	50 %	0 %	50 %	0 %	261855507
19035	NC_013422	CGA	2	6	969522	969527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855507
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19038	NC_013422	TGA	2	6	969634	969639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855507
19039	NC_013422	ATC	2	6	969738	969743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855508
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19041	NC_013422	TG	3	6	969854	969859	0 %	50 %	50 %	0 %	261855508
19042	NC_013422	GAAC	2	8	969875	969882	50 %	0 %	25 %	25 %	261855508
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19044	NC_013422	GGC	2	6	970042	970047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855508
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19046	NC_013422	ACGC	2	8	970242	970249	25 %	0 %	25 %	50 %	261855508
19047	NC_013422	T	6	6	970329	970334	0 %	100 %	0 %	0 %	261855508
19048	NC_013422	GGT	2	6	970335	970340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855508
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19051	NC_013422	ATCTG	2	10	970505	970514	20 %	40 %	20 %	20 %	261855509
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19053	NC_013422	TTGA	2	8	970719	970726	25 %	50 %	25 %	0 %	261855509
19054	NC_013422	AGA	2	6	970729	970734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855509
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19057	NC_013422	TGA	2	6	970867	970872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855509
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19059	NC_013422	CAAT	2	8	970990	970997	50 %	25 %	0 %	25 %	261855509
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19063	NC_013422	CCCA	2	8	971096	971103	25 %	0 %	0 %	75 %	261855509
19064	NC_013422	A	6	6	971125	971130	100 %	0 %	0 %	0 %	261855509
19065	NC_013422	GTC	2	6	971135	971140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855509
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19068	NC_013422	G	7	7	971328	971334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_013422	ATT	2	6	971389	971394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_013422	ACG	2	6	971480	971485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19088	NC_013422	CGTTTC	2	12	972594	972605	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261855511
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19096	NC_013422	CAAT	2	8	972849	972856	50 %	25 %	0 %	25 %	261855512
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19100	NC_013422	ATGG	2	8	973179	973186	25 %	25 %	50 %	0 %	261855512
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19106	NC_013422	TATT	2	8	973592	973599	25 %	75 %	0 %	0 %	261855513
19107	NC_013422	GAC	2	6	973624	973629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855513
19108	NC_013422	TAC	2	6	973652	973657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855513
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19110	NC_013422	TGA	2	6	973729	973734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855513
19111	NC_013422	TGAT	2	8	973865	973872	25 %	50 %	25 %	0 %	261855513
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19117	NC_013422	A	6	6	974016	974021	100 %	0 %	0 %	0 %	261855514
19118	NC_013422	ACA	3	9	974048	974056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855514
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19123	NC_013422	GGC	2	6	974376	974381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855514
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19222	NC_013422	CAA	2	6	979367	979372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855516
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19224	NC_013422	AAATTA	2	12	979554	979565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19227	NC_013422	TTCG	2	8	979748	979755	0 %	50 %	25 %	25 %	261855517
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19231	NC_013422	GTAA	2	8	979894	979901	50 %	25 %	25 %	0 %	261855517
19232	NC_013422	TCT	2	6	979913	979918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
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19237	NC_013422	T	6	6	980171	980176	0 %	100 %	0 %	0 %	261855517
19238	NC_013422	CTT	2	6	980177	980182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
19239	NC_013422	GA	3	6	980215	980220	50 %	0 %	50 %	0 %	261855517
19240	NC_013422	CGA	2	6	980263	980268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19241	NC_013422	ATTC	2	8	980295	980302	25 %	50 %	0 %	25 %	261855517
19242	NC_013422	TCA	2	6	980344	980349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19243	NC_013422	T	7	7	980360	980366	0 %	100 %	0 %	0 %	261855517
19244	NC_013422	ACC	2	6	980455	980460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855517
19245	NC_013422	TCT	2	6	980483	980488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
19246	NC_013422	GTC	2	6	980497	980502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19247	NC_013422	ATA	2	6	980544	980549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855517
19248	NC_013422	CGT	2	6	980592	980597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19249	NC_013422	TCA	2	6	980605	980610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19250	NC_013422	CCG	2	6	980651	980656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855517
19251	NC_013422	GCA	2	6	980681	980686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19252	NC_013422	TCA	2	6	980785	980790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19253	NC_013422	TGC	2	6	980839	980844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19254	NC_013422	TGC	2	6	980910	980915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19255	NC_013422	GGGT	2	8	980947	980954	0 %	25 %	75 %	0 %	261855517
19256	NC_013422	TC	3	6	981020	981025	0 %	50 %	0 %	50 %	261855517
19257	NC_013422	GCA	2	6	981049	981054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19258	NC_013422	GTTG	2	8	981062	981069	0 %	50 %	50 %	0 %	261855517
19259	NC_013422	TCC	2	6	981074	981079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855517
19260	NC_013422	CG	3	6	981127	981132	0 %	0 %	50 %	50 %	261855517
19261	NC_013422	CG	3	6	981153	981158	0 %	0 %	50 %	50 %	261855517
19262	NC_013422	TTC	2	6	981175	981180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
19263	NC_013422	TGC	2	6	981213	981218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
19264	NC_013422	TGTT	2	8	981261	981268	0 %	75 %	25 %	0 %	261855517
19265	NC_013422	ATC	2	6	981285	981290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19266	NC_013422	TCA	2	6	981319	981324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19267	NC_013422	ACGG	2	8	981329	981336	25 %	0 %	50 %	25 %	261855517
19268	NC_013422	A	7	7	981378	981384	100 %	0 %	0 %	0 %	261855517
19269	NC_013422	GCG	2	6	981420	981425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855517
19270	NC_013422	CAA	2	6	981434	981439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855517
19271	NC_013422	TCGC	2	8	981453	981460	0 %	25 %	25 %	50 %	261855517
19272	NC_013422	GGC	2	6	981513	981518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855517
19273	NC_013422	TCGGT	2	10	981523	981532	0 %	40 %	40 %	20 %	261855517
19274	NC_013422	CGC	2	6	981559	981564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855517
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19276	NC_013422	G	6	6	981629	981634	0 %	0 %	100 %	0 %	261855517
19277	NC_013422	AAAG	2	8	981658	981665	75 %	0 %	25 %	0 %	261855517
19278	NC_013422	TAA	2	6	981767	981772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855517
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19281	NC_013422	TAAC	2	8	981848	981855	50 %	25 %	0 %	25 %	261855517
19282	NC_013422	TCA	2	6	981856	981861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
19283	NC_013422	TTC	2	6	982005	982010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
19284	NC_013422	AATC	2	8	982058	982065	50 %	25 %	0 %	25 %	261855518
19285	NC_013422	ATC	2	6	982117	982122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855518
19286	NC_013422	CAG	2	6	982149	982154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855518
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19289	NC_013422	TGG	2	6	982233	982238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855518
19290	NC_013422	GC	3	6	982255	982260	0 %	0 %	50 %	50 %	261855518
19291	NC_013422	TGGC	2	8	982269	982276	0 %	25 %	50 %	25 %	261855518
19292	NC_013422	TCT	2	6	982334	982339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855518
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19298	NC_013422	TGCG	2	8	982592	982599	0 %	25 %	50 %	25 %	261855519
19299	NC_013422	ATC	2	6	982606	982611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855519
19300	NC_013422	ATC	2	6	982684	982689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855519
19301	NC_013422	ACG	2	6	982732	982737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855519
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19304	NC_013422	GTC	2	6	982933	982938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855519
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19307	NC_013422	CGT	2	6	983070	983075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855520
19308	NC_013422	GCA	2	6	983078	983083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855520
19309	NC_013422	GCG	2	6	983206	983211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855520
19310	NC_013422	GGT	2	6	983222	983227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855520
19311	NC_013422	ATTCA	2	10	983450	983459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19312	NC_013422	AAT	2	6	983465	983470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19313	NC_013422	A	6	6	983476	983481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19314	NC_013422	TCAG	2	8	983581	983588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19315	NC_013422	GAT	2	6	983654	983659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855521
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19317	NC_013422	ATG	2	6	983685	983690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855521
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19319	NC_013422	GCA	2	6	983748	983753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855521
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19322	NC_013422	CAA	2	6	983803	983808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855521
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19324	NC_013422	ATG	2	6	984093	984098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855522
19325	NC_013422	GCA	2	6	984102	984107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855522
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19328	NC_013422	GAC	2	6	984220	984225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855522
19329	NC_013422	GCT	2	6	984264	984269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855522
19330	NC_013422	TAAA	2	8	984336	984343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19331	NC_013422	GACCA	2	10	984478	984487	40 %	0 %	20 %	40 %	261855523
19332	NC_013422	CTG	2	6	984525	984530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855523
19333	NC_013422	CAC	2	6	984549	984554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855523
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19336	NC_013422	CGG	2	6	984612	984617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855523
19337	NC_013422	CTG	2	6	984696	984701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855523
19338	NC_013422	TCT	2	6	984707	984712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19339	NC_013422	CTC	2	6	984713	984718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19340	NC_013422	GAT	2	6	984775	984780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855524
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19342	NC_013422	TCC	2	6	984917	984922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855524
19343	NC_013422	GAAC	2	8	984980	984987	50 %	0 %	25 %	25 %	261855524
19344	NC_013422	AAT	2	6	985023	985028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855525
19345	NC_013422	TGC	2	6	985080	985085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855525
19346	NC_013422	CCTG	2	8	985145	985152	0 %	25 %	25 %	50 %	261855525
19347	NC_013422	GC	3	6	985154	985159	0 %	0 %	50 %	50 %	261855525
19348	NC_013422	TTG	2	6	985214	985219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855525
19349	NC_013422	TTCT	2	8	985390	985397	0 %	75 %	0 %	25 %	261855526
19350	NC_013422	AATCGG	2	12	985439	985450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261855526
19351	NC_013422	CACATC	2	12	985493	985504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	261855526
19352	NC_013422	TTC	2	6	985514	985519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855526
19353	NC_013422	GTA	2	6	985538	985543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855526
19354	NC_013422	TCA	2	6	985566	985571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
19355	NC_013422	AT	3	6	985590	985595	50 %	50 %	0 %	0 %	261855526
19356	NC_013422	ACC	2	6	985631	985636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855526
19357	NC_013422	TAC	2	6	985646	985651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
19358	NC_013422	GTT	2	6	985670	985675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855526
19359	NC_013422	ACG	2	6	985697	985702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855526
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19361	NC_013422	TGT	2	6	985831	985836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855526
19362	NC_013422	A	6	6	985857	985862	100 %	0 %	0 %	0 %	261855526
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19481	NC_013422	GAT	2	6	992565	992570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855530
19482	NC_013422	GAT	2	6	992668	992673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855530
19483	NC_013422	CAG	2	6	992680	992685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855530
19484	NC_013422	CGTGA	2	10	992707	992716	20 %	20 %	40 %	20 %	261855530
19485	NC_013422	TC	3	6	992732	992737	0 %	50 %	0 %	50 %	261855530
19486	NC_013422	TAT	2	6	992742	992747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855530
19487	NC_013422	GATG	2	8	992793	992800	25 %	25 %	50 %	0 %	261855530
19488	NC_013422	T	6	6	992880	992885	0 %	100 %	0 %	0 %	261855530
19489	NC_013422	GCTTAC	2	12	992959	992970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261855530
19490	NC_013422	GT	3	6	992972	992977	0 %	50 %	50 %	0 %	261855530
19491	NC_013422	CTT	2	6	992994	992999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855530
19492	NC_013422	TGGC	2	8	993062	993069	0 %	25 %	50 %	25 %	261855530
19493	NC_013422	TGAT	2	8	993122	993129	25 %	50 %	25 %	0 %	261855530
19494	NC_013422	TGA	2	6	993156	993161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855530
19495	NC_013422	AGGGC	2	10	993321	993330	20 %	0 %	60 %	20 %	261855530
19496	NC_013422	GTC	2	6	993337	993342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855530
19497	NC_013422	ATC	2	6	993418	993423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855530
19498	NC_013422	GTT	2	6	993481	993486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855530
19499	NC_013422	GCT	2	6	993577	993582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855530
19500	NC_013422	TGG	2	6	993593	993598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855530

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