MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_013422	GT	3	6	942854	942859	0 %	50 %	50 %	0 %	261855480
18502	NC_013422	CCAT	2	8	942924	942931	25 %	25 %	0 %	50 %	261855480
18503	NC_013422	TGC	2	6	942994	942999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18504	NC_013422	CTTG	2	8	943013	943020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18505	NC_013422	TGA	2	6	943021	943026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_013422	CA	3	6	943080	943085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18507	NC_013422	GATG	2	8	943089	943096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_013422	CTC	2	6	943283	943288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18509	NC_013422	TG	3	6	943393	943398	0 %	50 %	50 %	0 %	261855481
18510	NC_013422	TCA	2	6	943421	943426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855481
18511	NC_013422	CGT	2	6	943436	943441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855481
18512	NC_013422	CTGA	2	8	943443	943450	25 %	25 %	25 %	25 %	261855481
18513	NC_013422	CAA	2	6	943463	943468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855481
18514	NC_013422	GGC	2	6	943488	943493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855481
18515	NC_013422	TTC	2	6	943495	943500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855481
18516	NC_013422	GGAAGT	2	12	943571	943582	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	261855481
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18519	NC_013422	CGGG	2	8	943769	943776	0 %	0 %	75 %	25 %	261855481
18520	NC_013422	GATC	2	8	943964	943971	25 %	25 %	25 %	25 %	261855481
18521	NC_013422	GTTC	2	8	944037	944044	0 %	50 %	25 %	25 %	261855481
18522	NC_013422	GCA	2	6	944060	944065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855481
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18530	NC_013422	AGGA	2	8	944421	944428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_013422	AGCGA	2	10	944461	944470	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18532	NC_013422	TCA	2	6	944528	944533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855482
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18536	NC_013422	TCGA	2	8	944880	944887	25 %	25 %	25 %	25 %	261855482
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18539	NC_013422	CCGAT	2	10	945079	945088	20 %	20 %	20 %	40 %	261855482
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18543	NC_013422	CTG	2	6	945293	945298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_013422	CAA	2	6	945338	945343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_013422	AGTA	2	8	945447	945454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_013422	GC	3	6	945473	945478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18547	NC_013422	TCG	2	6	945483	945488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18549	NC_013422	AAG	2	6	945695	945700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18561	NC_013422	TTCG	2	8	946162	946169	0 %	50 %	25 %	25 %	261855484
18562	NC_013422	AT	3	6	946284	946289	50 %	50 %	0 %	0 %	261855484
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18574	NC_013422	CAGG	2	8	946829	946836	25 %	0 %	50 %	25 %	261855484
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18582	NC_013422	GGCT	2	8	947130	947137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18593	NC_013422	TGA	2	6	947748	947753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855485
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18598	NC_013422	CGA	2	6	947887	947892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855485
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18601	NC_013422	GTC	2	6	947986	947991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855485
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18604	NC_013422	AAATC	2	10	948237	948246	60 %	20 %	0 %	20 %	261855485
18605	NC_013422	GCGG	2	8	948274	948281	0 %	0 %	75 %	25 %	261855485
18606	NC_013422	CTT	2	6	948291	948296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855485
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18609	NC_013422	GTC	2	6	948480	948485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855485
18610	NC_013422	GGTG	2	8	948529	948536	0 %	25 %	75 %	0 %	261855485
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18612	NC_013422	CTTGC	2	10	948586	948595	0 %	40 %	20 %	40 %	261855485
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18620	NC_013422	CAA	2	6	948965	948970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18621	NC_013422	GCT	2	6	949092	949097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18622	NC_013422	AGC	2	6	949114	949119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18623	NC_013422	TGC	2	6	949166	949171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855486
18624	NC_013422	GC	3	6	949228	949233	0 %	0 %	50 %	50 %	261855486
18625	NC_013422	CGG	2	6	949284	949289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855486
18626	NC_013422	TG	3	6	949360	949365	0 %	50 %	50 %	0 %	261855486
18627	NC_013422	TCG	2	6	949404	949409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855486
18628	NC_013422	GTT	2	6	949422	949427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855486
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18650	NC_013422	AACC	2	8	950338	950345	50 %	0 %	0 %	50 %	261855487
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18659	NC_013422	GTG	2	6	950634	950639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855487
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18730	NC_013422	GGGGC	2	10	955219	955228	0 %	0 %	80 %	20 %	261855492
18731	NC_013422	TTCC	2	8	955529	955536	0 %	50 %	0 %	50 %	261855492
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18744	NC_013422	AAT	2	6	955949	955954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855493
18745	NC_013422	GTC	2	6	956137	956142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855493
18746	NC_013422	ATG	2	6	956177	956182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855493
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18758	NC_013422	CCTG	2	8	956622	956629	0 %	25 %	25 %	50 %	261855493
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18765	NC_013422	GC	3	6	956988	956993	0 %	0 %	50 %	50 %	261855493
18766	NC_013422	TCGAT	2	10	957054	957063	20 %	40 %	20 %	20 %	261855493
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18768	NC_013422	CAGG	2	8	957206	957213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18769	NC_013422	A	6	6	957227	957232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18770	NC_013422	GCA	2	6	957324	957329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855494
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