MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_013422	GGC	2	6	845722	845727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855396
16503	NC_013422	CCG	2	6	845757	845762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855396
16504	NC_013422	AAG	2	6	845784	845789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855396
16505	NC_013422	AG	3	6	845810	845815	50 %	0 %	50 %	0 %	261855396
16506	NC_013422	CGA	2	6	845900	845905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855396
16507	NC_013422	TCA	2	6	845934	845939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855396
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16509	NC_013422	GC	3	6	846206	846211	0 %	0 %	50 %	50 %	261855396
16510	NC_013422	CGG	2	6	846258	846263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855396
16511	NC_013422	CGT	2	6	846314	846319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855396
16512	NC_013422	CGG	2	6	846360	846365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855396
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16517	NC_013422	CCA	2	6	846580	846585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855396
16518	NC_013422	AGCC	2	8	846589	846596	25 %	0 %	25 %	50 %	261855396
16519	NC_013422	TCA	2	6	846602	846607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855396
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16522	NC_013422	CGG	2	6	846827	846832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_013422	TG	3	6	846839	846844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_013422	A	6	6	846855	846860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_013422	CT	3	6	846874	846879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16526	NC_013422	TGG	3	9	847142	847150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_013422	GGT	2	6	847153	847158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_013422	T	6	6	847268	847273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_013422	T	6	6	847305	847310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16534	NC_013422	ATCG	2	8	847588	847595	25 %	25 %	25 %	25 %	261855397
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16544	NC_013422	TTGA	2	8	848117	848124	25 %	50 %	25 %	0 %	261855397
16545	NC_013422	GA	3	6	848133	848138	50 %	0 %	50 %	0 %	261855397
16546	NC_013422	CGG	2	6	848175	848180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855397
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16552	NC_013422	GACC	2	8	848356	848363	25 %	0 %	25 %	50 %	261855397
16553	NC_013422	GCAG	2	8	848365	848372	25 %	0 %	50 %	25 %	261855397
16554	NC_013422	GC	3	6	848400	848405	0 %	0 %	50 %	50 %	261855397
16555	NC_013422	T	6	6	848435	848440	0 %	100 %	0 %	0 %	261855397
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16606	NC_013422	CGCCA	2	10	850642	850651	20 %	0 %	20 %	60 %	261855399
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16624	NC_013422	GCA	2	6	851520	851525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855400
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16732	NC_013422	GC	3	6	856013	856018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16733	NC_013422	AAAG	2	8	856074	856081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16734	NC_013422	ATT	2	6	856095	856100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16735	NC_013422	AG	5	10	856192	856201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16736	NC_013422	TGCG	2	8	856222	856229	0 %	25 %	50 %	25 %	261855403
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16742	NC_013422	TCG	2	6	856543	856548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855403
16743	NC_013422	AAG	2	6	856587	856592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855403
16744	NC_013422	ATC	2	6	856618	856623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855403
16745	NC_013422	TGC	3	9	856624	856632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855403
16746	NC_013422	ATG	2	6	856666	856671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855403
16747	NC_013422	CGGCG	2	10	856760	856769	0 %	0 %	60 %	40 %	261855403
16748	NC_013422	ACG	2	6	856831	856836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855403
16749	NC_013422	AGT	2	6	856910	856915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855403
16750	NC_013422	AC	3	6	856938	856943	50 %	0 %	0 %	50 %	261855403
16751	NC_013422	CAT	2	6	856958	856963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855403
16752	NC_013422	CCA	2	6	856983	856988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855403
16753	NC_013422	CGAAG	2	10	857036	857045	40 %	0 %	40 %	20 %	261855403
16754	NC_013422	GCCA	2	8	857263	857270	25 %	0 %	25 %	50 %	261855404
16755	NC_013422	TGA	2	6	857302	857307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855404
16756	NC_013422	GCT	2	6	857321	857326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855404
16757	NC_013422	GAT	2	6	857369	857374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855404
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16762	NC_013422	TTC	2	6	857645	857650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855404
16763	NC_013422	CAT	2	6	857807	857812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855404
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16766	NC_013422	GTG	2	6	857934	857939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855404
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16768	NC_013422	ACGT	2	8	857971	857978	25 %	25 %	25 %	25 %	261855404
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16770	NC_013422	GAT	2	6	858020	858025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855404
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16772	NC_013422	GCC	2	6	858096	858101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855404
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16783	NC_013422	GATC	2	8	858696	858703	25 %	25 %	25 %	25 %	261855405
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16864	NC_013422	CTG	2	6	863174	863179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855410
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16979	NC_013422	GAGC	2	8	868880	868887	25 %	0 %	50 %	25 %	261855412
16980	NC_013422	GGC	2	6	868894	868899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
16981	NC_013422	GCG	2	6	868944	868949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
16982	NC_013422	GAT	2	6	868958	868963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855412
16983	NC_013422	TGC	2	6	868969	868974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
16984	NC_013422	CGGG	2	8	868995	869002	0 %	0 %	75 %	25 %	261855412
16985	NC_013422	TGT	2	6	869046	869051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855412
16986	NC_013422	GC	3	6	869079	869084	0 %	0 %	50 %	50 %	261855412
16987	NC_013422	TCA	2	6	869134	869139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855412
16988	NC_013422	CGC	2	6	869196	869201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855412
16989	NC_013422	AGC	2	6	869217	869222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855412
16990	NC_013422	TCCAG	2	10	869325	869334	20 %	20 %	20 %	40 %	261855412
16991	NC_013422	GC	3	6	869339	869344	0 %	0 %	50 %	50 %	261855412
16992	NC_013422	TCG	2	6	869349	869354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
16993	NC_013422	CGT	2	6	869407	869412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
16994	NC_013422	GCA	2	6	869467	869472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855412
16995	NC_013422	CGGG	2	8	869488	869495	0 %	0 %	75 %	25 %	261855412
16996	NC_013422	GGGC	2	8	869498	869505	0 %	0 %	75 %	25 %	261855412
16997	NC_013422	GAGC	2	8	869612	869619	25 %	0 %	50 %	25 %	261855412
16998	NC_013422	GCC	2	6	869632	869637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855412
16999	NC_013422	GTGC	2	8	869639	869646	0 %	25 %	50 %	25 %	261855412
17000	NC_013422	GGC	2	6	869647	869652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412

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