MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

< Previous12...2829303132333435363738...101102Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013422	GCGT	2	8	819837	819844	0 %	25 %	50 %	25 %	261855375
16002	NC_013422	A	6	6	819878	819883	100 %	0 %	0 %	0 %	261855375
16003	NC_013422	CGAT	2	8	820020	820027	25 %	25 %	25 %	25 %	261855375
16004	NC_013422	GC	3	6	820175	820180	0 %	0 %	50 %	50 %	261855375
16005	NC_013422	GTC	2	6	820450	820455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855375
16006	NC_013422	GAT	2	6	820510	820515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855375
16007	NC_013422	CAG	2	6	820516	820521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855375
16008	NC_013422	TGGTT	2	10	820540	820549	0 %	60 %	40 %	0 %	261855375
16009	NC_013422	TGGCCG	2	12	820569	820580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	261855375
16010	NC_013422	CA	3	6	820591	820596	50 %	0 %	0 %	50 %	261855375
16011	NC_013422	CGT	2	6	820693	820698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855376
16012	NC_013422	T	7	7	820703	820709	0 %	100 %	0 %	0 %	261855376
16013	NC_013422	TGG	2	6	820725	820730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855376
16014	NC_013422	A	6	6	820842	820847	100 %	0 %	0 %	0 %	261855376
16015	NC_013422	TGC	2	6	820904	820909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855376
16016	NC_013422	GCCA	2	8	820972	820979	25 %	0 %	25 %	50 %	261855376
16017	NC_013422	GTT	2	6	821119	821124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855376
16018	NC_013422	GCA	2	6	821237	821242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855376
16019	NC_013422	GCA	2	6	821259	821264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855376
16020	NC_013422	CGTG	2	8	821365	821372	0 %	25 %	50 %	25 %	261855377
16021	NC_013422	CGGG	2	8	821377	821384	0 %	0 %	75 %	25 %	261855377
16022	NC_013422	TCC	2	6	821411	821416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855377
16023	NC_013422	AGGCCG	2	12	821544	821555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	261855377
16024	NC_013422	ATG	2	6	821609	821614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855377
16025	NC_013422	GTC	2	6	821642	821647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855377
16026	NC_013422	CGCC	2	8	821671	821678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16027	NC_013422	TTAA	2	8	821719	821726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_013422	GCG	2	6	821749	821754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855378
16029	NC_013422	CAT	2	6	821807	821812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855378
16030	NC_013422	GCC	2	6	821814	821819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855378
16031	NC_013422	TGT	2	6	821824	821829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855378
16032	NC_013422	GAT	2	6	821882	821887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
16033	NC_013422	CGG	2	6	821897	821902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855378
16034	NC_013422	CCA	2	6	821956	821961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855378
16035	NC_013422	TGG	2	6	821971	821976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855378
16036	NC_013422	CGG	2	6	822068	822073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855378
16037	NC_013422	TGA	2	6	822235	822240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
16038	NC_013422	CG	3	6	822284	822289	0 %	0 %	50 %	50 %	261855378
16039	NC_013422	GATC	2	8	822302	822309	25 %	25 %	25 %	25 %	261855378
16040	NC_013422	TCA	2	6	822364	822369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855378
16041	NC_013422	GCGT	2	8	822397	822404	0 %	25 %	50 %	25 %	261855378
16042	NC_013422	TGC	2	6	822449	822454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
16043	NC_013422	CGT	2	6	822588	822593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
16044	NC_013422	CATG	2	8	822725	822732	25 %	25 %	25 %	25 %	261855378
16045	NC_013422	TGC	2	6	822742	822747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
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16047	NC_013422	GC	3	6	822814	822819	0 %	0 %	50 %	50 %	261855378
16048	NC_013422	GAT	2	6	822821	822826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
16049	NC_013422	ATCG	2	8	822929	822936	25 %	25 %	25 %	25 %	261855378
16050	NC_013422	ATC	2	6	823036	823041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855379
16051	NC_013422	ACCA	2	8	823147	823154	50 %	0 %	0 %	50 %	261855379
16052	NC_013422	CCTA	2	8	823195	823202	25 %	25 %	0 %	50 %	261855379
16053	NC_013422	GCG	2	6	823216	823221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855379
16054	NC_013422	GTT	2	6	823272	823277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855379
16055	NC_013422	TGG	2	6	823316	823321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855379
16056	NC_013422	CCAG	2	8	823344	823351	25 %	0 %	25 %	50 %	261855379
16057	NC_013422	CGG	2	6	823385	823390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855379
16058	NC_013422	GGC	2	6	823412	823417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855379
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16060	NC_013422	TCG	2	6	823484	823489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855379
16061	NC_013422	TGC	2	6	823538	823543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855379
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16063	NC_013422	GGC	2	6	823653	823658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855379
16064	NC_013422	ATG	2	6	823665	823670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855379
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16066	NC_013422	ATC	2	6	823773	823778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855380
16067	NC_013422	TGA	2	6	823790	823795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855380
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16073	NC_013422	CGG	2	6	824063	824068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855380
16074	NC_013422	GGC	2	6	824072	824077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855380
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16078	NC_013422	CGCTG	2	10	824246	824255	0 %	20 %	40 %	40 %	261855380
16079	NC_013422	GC	3	6	824330	824335	0 %	0 %	50 %	50 %	261855380
16080	NC_013422	ACG	2	6	824452	824457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855380
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16082	NC_013422	CAT	2	6	824555	824560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855380
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16085	NC_013422	TGC	2	6	824773	824778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855380
16086	NC_013422	TAT	2	6	824843	824848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855380
16087	NC_013422	TGA	2	6	824977	824982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_013422	TAC	2	6	825272	825277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855381
16089	NC_013422	TCG	2	6	825300	825305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855381
16090	NC_013422	GC	3	6	825411	825416	0 %	0 %	50 %	50 %	261855381
16091	NC_013422	GATT	2	8	825435	825442	25 %	50 %	25 %	0 %	261855381
16092	NC_013422	TGA	2	6	825448	825453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855381
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16094	NC_013422	CTTT	2	8	825551	825558	0 %	75 %	0 %	25 %	261855381
16095	NC_013422	TTG	2	6	825576	825581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855381
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16098	NC_013422	AT	3	6	825619	825624	50 %	50 %	0 %	0 %	261855381
16099	NC_013422	TGG	2	6	825631	825636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855381
16100	NC_013422	CGG	2	6	825642	825647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855381
16101	NC_013422	GATC	2	8	825655	825662	25 %	25 %	25 %	25 %	261855381
16102	NC_013422	CG	3	6	825915	825920	0 %	0 %	50 %	50 %	261855381
16103	NC_013422	TGC	2	6	825930	825935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855381
16104	NC_013422	CAAG	2	8	825970	825977	50 %	0 %	25 %	25 %	261855381
16105	NC_013422	GTG	2	6	825978	825983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855381
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16109	NC_013422	TCT	2	6	826096	826101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855381
16110	NC_013422	CGC	2	6	826102	826107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855381
16111	NC_013422	TG	3	6	826161	826166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_013422	AGA	2	6	826220	826225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_013422	AACGGT	2	12	826299	826310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16114	NC_013422	CGG	2	6	826330	826335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_013422	TTCAT	2	10	826360	826369	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16116	NC_013422	GC	3	6	826407	826412	0 %	0 %	50 %	50 %	261855382
16117	NC_013422	ACC	2	6	826542	826547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855382
16118	NC_013422	CG	3	6	826550	826555	0 %	0 %	50 %	50 %	261855382
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16120	NC_013422	CGA	2	6	826691	826696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855382
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16234	NC_013422	CTT	2	6	831596	831601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855386
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16361	NC_013422	TCT	2	6	838937	838942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855391
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16389	NC_013422	GCCA	2	8	840295	840302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16415	NC_013422	AAGA	2	8	841623	841630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16416	NC_013422	ACG	2	6	841661	841666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16420	NC_013422	AT	4	8	841878	841885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16421	NC_013422	TTG	2	6	841983	841988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16423	NC_013422	ATC	2	6	842066	842071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16477	NC_013422	CATCGA	2	12	844543	844554	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855395
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16482	NC_013422	CGAG	2	8	844854	844861	25 %	0 %	50 %	25 %	261855395
16483	NC_013422	GC	4	8	844908	844915	0 %	0 %	50 %	50 %	261855395
16484	NC_013422	GCG	2	6	844926	844931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855395
16485	NC_013422	GGTCG	2	10	844961	844970	0 %	20 %	60 %	20 %	261855395
16486	NC_013422	GACC	2	8	844987	844994	25 %	0 %	25 %	50 %	261855395
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