MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013422	CCT	2	6	794267	794272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855344
15503	NC_013422	CAG	2	6	794359	794364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_013422	CTC	2	6	794646	794651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855345
15505	NC_013422	CCG	2	6	794696	794701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855345
15506	NC_013422	TCT	2	6	794705	794710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855345
15507	NC_013422	GCG	2	6	794728	794733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855345
15508	NC_013422	AGT	2	6	794779	794784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855345
15509	NC_013422	TCG	2	6	794848	794853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855345
15510	NC_013422	CGT	2	6	794860	794865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855345
15511	NC_013422	AGT	2	6	794899	794904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855345
15512	NC_013422	TCA	2	6	794989	794994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855345
15513	NC_013422	A	6	6	794998	795003	100 %	0 %	0 %	0 %	261855345
15514	NC_013422	CAG	2	6	795033	795038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855345
15515	NC_013422	TCCAG	2	10	795065	795074	20 %	20 %	20 %	40 %	261855345
15516	NC_013422	AAT	2	6	795154	795159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855345
15517	NC_013422	ATAA	2	8	795172	795179	75 %	25 %	0 %	0 %	261855345
15518	NC_013422	CTTG	2	8	795231	795238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15519	NC_013422	T	6	6	795244	795249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_013422	ACA	2	6	795263	795268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_013422	TGC	2	6	795379	795384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855346
15522	NC_013422	TGT	2	6	795397	795402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855346
15523	NC_013422	GAT	2	6	795422	795427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855346
15524	NC_013422	GCG	2	6	795488	795493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855346
15525	NC_013422	GCGA	2	8	795534	795541	25 %	0 %	50 %	25 %	261855346
15526	NC_013422	GCT	2	6	795602	795607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855346
15527	NC_013422	TTGG	2	8	795608	795615	0 %	50 %	50 %	0 %	261855346
15528	NC_013422	GTT	2	6	795644	795649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855346
15529	NC_013422	ATCC	2	8	795712	795719	25 %	25 %	0 %	50 %	261855346
15530	NC_013422	AGC	2	6	795730	795735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855346
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15532	NC_013422	GCCGT	2	10	795837	795846	0 %	20 %	40 %	40 %	261855346
15533	NC_013422	TGC	2	6	795853	795858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855346
15534	NC_013422	GTTC	2	8	795947	795954	0 %	50 %	25 %	25 %	261855346
15535	NC_013422	CTG	2	6	795996	796001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855346
15536	NC_013422	GT	3	6	796021	796026	0 %	50 %	50 %	0 %	261855346
15537	NC_013422	CAGG	2	8	796079	796086	25 %	0 %	50 %	25 %	261855346
15538	NC_013422	CGAT	2	8	796142	796149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15539	NC_013422	A	6	6	796191	796196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_013422	T	6	6	796216	796221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_013422	GTG	4	12	796256	796267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855347
15542	NC_013422	TCCG	2	8	796268	796275	0 %	25 %	25 %	50 %	261855347
15543	NC_013422	TTC	2	6	796301	796306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855347
15544	NC_013422	CGCC	2	8	796357	796364	0 %	0 %	25 %	75 %	261855347
15545	NC_013422	TTCGGC	2	12	796436	796447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855347
15546	NC_013422	TCA	2	6	796473	796478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855347
15547	NC_013422	TCG	2	6	796521	796526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855347
15548	NC_013422	CTT	2	6	796540	796545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855347
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15550	NC_013422	ATG	2	6	796614	796619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855347
15551	NC_013422	TGG	2	6	796623	796628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855347
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15553	NC_013422	TCGA	2	8	796704	796711	25 %	25 %	25 %	25 %	261855347
15554	NC_013422	ACG	2	6	796772	796777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855348
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15556	NC_013422	CCG	2	6	796917	796922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855348
15557	NC_013422	GAT	2	6	796982	796987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855348
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15559	NC_013422	CTT	2	6	797110	797115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855348
15560	NC_013422	AT	3	6	797147	797152	50 %	50 %	0 %	0 %	261855348
15561	NC_013422	CCGG	2	8	797420	797427	0 %	0 %	50 %	50 %	261855348
15562	NC_013422	CGG	3	9	797560	797568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855348
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15564	NC_013422	GT	3	6	797613	797618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_013422	CTG	2	6	797625	797630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_013422	GAT	2	6	797654	797659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15589	NC_013422	GT	3	6	798498	798503	0 %	50 %	50 %	0 %	261855350
15590	NC_013422	TGG	2	6	798584	798589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855350
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15592	NC_013422	ATA	2	6	798755	798760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_013422	ACA	2	6	798873	798878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_013422	CA	3	6	798877	798882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15595	NC_013422	GA	3	6	798888	798893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15600	NC_013422	GGC	2	6	799198	799203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855351
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15602	NC_013422	CGA	2	6	799311	799316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855351
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15605	NC_013422	GAG	2	6	799453	799458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_013422	CAAT	2	8	799500	799507	50 %	25 %	0 %	25 %	261855352
15607	NC_013422	GTC	2	6	799533	799538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855352
15608	NC_013422	GGC	2	6	799546	799551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855352
15609	NC_013422	GAC	2	6	799622	799627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855352
15610	NC_013422	CCG	2	6	799644	799649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855352
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15617	NC_013422	ACAA	2	8	800007	800014	75 %	0 %	0 %	25 %	261855352
15618	NC_013422	CTT	2	6	800026	800031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855352
15619	NC_013422	TGA	2	6	800171	800176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855353
15620	NC_013422	GCC	2	6	800230	800235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855353
15621	NC_013422	GCA	3	9	800250	800258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855353
15622	NC_013422	CAA	2	6	800308	800313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855353
15623	NC_013422	CGACC	2	10	800331	800340	20 %	0 %	20 %	60 %	261855353
15624	NC_013422	GTC	2	6	800456	800461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855353
15625	NC_013422	TTC	2	6	800560	800565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855353
15626	NC_013422	TCC	2	6	800714	800719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855353
15627	NC_013422	CG	4	8	800721	800728	0 %	0 %	50 %	50 %	261855353
15628	NC_013422	CGC	2	6	800786	800791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855353
15629	NC_013422	TGG	2	6	800810	800815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855353
15630	NC_013422	C	6	6	800848	800853	0 %	0 %	0 %	100 %	261855353
15631	NC_013422	GAT	2	6	800887	800892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855353
15632	NC_013422	TGC	2	6	800925	800930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855353
15633	NC_013422	CACC	2	8	800966	800973	25 %	0 %	0 %	75 %	261855353
15634	NC_013422	TAC	2	6	800998	801003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855353
15635	NC_013422	CG	3	6	801020	801025	0 %	0 %	50 %	50 %	261855353
15636	NC_013422	ACG	2	6	801065	801070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855353
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15638	NC_013422	CAAA	2	8	801261	801268	75 %	0 %	0 %	25 %	261855353
15639	NC_013422	GCGAT	2	10	801302	801311	20 %	20 %	40 %	20 %	261855353
15640	NC_013422	GAA	2	6	801316	801321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855353
15641	NC_013422	AAC	2	6	801348	801353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855353
15642	NC_013422	TCGAT	2	10	801407	801416	20 %	40 %	20 %	20 %	261855353
15643	NC_013422	TCG	2	6	801424	801429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855353
15644	NC_013422	A	7	7	801450	801456	100 %	0 %	0 %	0 %	261855353
15645	NC_013422	ACG	2	6	801471	801476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855354
15646	NC_013422	CG	3	6	801475	801480	0 %	0 %	50 %	50 %	261855354
15647	NC_013422	AAC	2	6	801482	801487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855354
15648	NC_013422	TGC	2	6	801572	801577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855354
15649	NC_013422	TGGA	2	8	801595	801602	25 %	25 %	50 %	0 %	261855354
15650	NC_013422	GCC	3	9	801744	801752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855354
15651	NC_013422	GC	3	6	801776	801781	0 %	0 %	50 %	50 %	261855354
15652	NC_013422	TGAA	2	8	801898	801905	50 %	25 %	25 %	0 %	261855354
15653	NC_013422	CGG	2	6	801994	801999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855354
15654	NC_013422	CTG	2	6	802038	802043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855354
15655	NC_013422	AATG	2	8	802124	802131	50 %	25 %	25 %	0 %	261855354
15656	NC_013422	TGA	2	6	802264	802269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855354
15657	NC_013422	GCCA	2	8	802301	802308	25 %	0 %	25 %	50 %	261855354
15658	NC_013422	CTG	2	6	802356	802361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855355
15659	NC_013422	GGCA	2	8	802545	802552	25 %	0 %	50 %	25 %	261855355
15660	NC_013422	GTCG	2	8	802571	802578	0 %	25 %	50 %	25 %	261855355
15661	NC_013422	CG	3	6	802603	802608	0 %	0 %	50 %	50 %	261855355
15662	NC_013422	TGC	2	6	802650	802655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855355
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15687	NC_013422	GC	3	6	803942	803947	0 %	0 %	50 %	50 %	261855355
15688	NC_013422	GCG	2	6	803976	803981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855355
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15700	NC_013422	GAC	2	6	804500	804505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855356
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15724	NC_013422	GATTG	2	10	805713	805722	20 %	40 %	40 %	0 %	261855356
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15738	NC_013422	TGCA	2	8	806393	806400	25 %	25 %	25 %	25 %	261855357
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15742	NC_013422	CG	3	6	806530	806535	0 %	0 %	50 %	50 %	261855358
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15744	NC_013422	CATA	2	8	806622	806629	50 %	25 %	0 %	25 %	261855358
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15981	NC_013422	CGG	2	6	819005	819010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855374
15982	NC_013422	GACC	2	8	819014	819021	25 %	0 %	25 %	50 %	261855374
15983	NC_013422	CGGG	2	8	819053	819060	0 %	0 %	75 %	25 %	261855374
15984	NC_013422	GATC	2	8	819074	819081	25 %	25 %	25 %	25 %	261855374
15985	NC_013422	GTG	2	6	819099	819104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855374
15986	NC_013422	TCA	2	6	819112	819117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855374
15987	NC_013422	CTG	2	6	819166	819171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855374
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15989	NC_013422	GCA	2	6	819306	819311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855374
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15992	NC_013422	GCT	2	6	819455	819460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855375
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15997	NC_013422	ATC	2	6	819662	819667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855375
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15999	NC_013422	ACA	2	6	819720	819725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855375
16000	NC_013422	TAT	2	6	819791	819796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855375

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