MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_013422	A	6	6	743971	743976	100 %	0 %	0 %	0 %	261855296
14503	NC_013422	TGG	2	6	744263	744268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855296
14504	NC_013422	T	8	8	744300	744307	0 %	100 %	0 %	0 %	261855296
14505	NC_013422	A	7	7	744329	744335	100 %	0 %	0 %	0 %	261855296
14506	NC_013422	GTT	3	9	744389	744397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855296
14507	NC_013422	AC	3	6	744466	744471	50 %	0 %	0 %	50 %	261855296
14508	NC_013422	CGA	2	6	744472	744477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855296
14509	NC_013422	TCA	2	6	744674	744679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855296
14510	NC_013422	ATC	2	6	744683	744688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855296
14511	NC_013422	GCCA	2	8	744746	744753	25 %	0 %	25 %	50 %	261855296
14512	NC_013422	CTT	2	6	744783	744788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855296
14513	NC_013422	AAAAG	2	10	744828	744837	80 %	0 %	20 %	0 %	261855296
14514	NC_013422	GATT	2	8	744843	744850	25 %	50 %	25 %	0 %	261855296
14515	NC_013422	TCA	2	6	744879	744884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855296
14516	NC_013422	GTT	2	6	744917	744922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855296
14517	NC_013422	T	6	6	744937	744942	0 %	100 %	0 %	0 %	261855296
14518	NC_013422	GCC	2	6	744955	744960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855296
14519	NC_013422	GAGT	2	8	745104	745111	25 %	25 %	50 %	0 %	261855296
14520	NC_013422	CTG	2	6	745157	745162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855296
14521	NC_013422	ATG	2	6	745164	745169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855296
14522	NC_013422	AGC	2	6	745174	745179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855296
14523	NC_013422	CGG	2	6	745184	745189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855296
14524	NC_013422	GGT	2	6	745213	745218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855296
14525	NC_013422	TC	3	6	745224	745229	0 %	50 %	0 %	50 %	261855296
14526	NC_013422	TGA	2	6	745231	745236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855296
14527	NC_013422	TGCCGC	2	12	745335	745346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	261855296
14528	NC_013422	GTTGCG	2	12	745390	745401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	261855296
14529	NC_013422	ATCG	2	8	745475	745482	25 %	25 %	25 %	25 %	261855296
14530	NC_013422	TC	3	6	745552	745557	0 %	50 %	0 %	50 %	261855296
14531	NC_013422	CGT	2	6	745775	745780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855296
14532	NC_013422	CAG	2	6	745868	745873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855296
14533	NC_013422	TTA	2	6	745972	745977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855296
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14537	NC_013422	GCA	2	6	746139	746144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855297
14538	NC_013422	CGGT	2	8	746186	746193	0 %	25 %	50 %	25 %	261855297
14539	NC_013422	GCT	2	6	746218	746223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855297
14540	NC_013422	GCA	2	6	746277	746282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855297
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14542	NC_013422	GCCT	2	8	746419	746426	0 %	25 %	25 %	50 %	261855297
14543	NC_013422	CGA	2	6	746481	746486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855297
14544	NC_013422	GGA	2	6	746747	746752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855297
14545	NC_013422	T	7	7	746784	746790	0 %	100 %	0 %	0 %	261855297
14546	NC_013422	GCG	2	6	746871	746876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855297
14547	NC_013422	GCAG	2	8	746910	746917	25 %	0 %	50 %	25 %	261855297
14548	NC_013422	ATGG	2	8	746935	746942	25 %	25 %	50 %	0 %	261855297
14549	NC_013422	ATC	2	6	747029	747034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14551	NC_013422	TGG	2	6	747113	747118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855298
14552	NC_013422	GC	3	6	747120	747125	0 %	0 %	50 %	50 %	261855298
14553	NC_013422	GC	3	6	747150	747155	0 %	0 %	50 %	50 %	261855298
14554	NC_013422	CGG	2	6	747161	747166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855298
14555	NC_013422	ACG	2	6	747265	747270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855298
14556	NC_013422	CGT	2	6	747429	747434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855298
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14571	NC_013422	CCAG	2	8	748250	748257	25 %	0 %	25 %	50 %	261855298
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14587	NC_013422	CGAA	2	8	748909	748916	50 %	0 %	25 %	25 %	261855299
14588	NC_013422	TCG	2	6	748923	748928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855299
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14593	NC_013422	TG	3	6	749174	749179	0 %	50 %	50 %	0 %	261855299
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14601	NC_013422	CA	3	6	749620	749625	50 %	0 %	0 %	50 %	261855299
14602	NC_013422	CAT	2	6	749770	749775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855299
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14604	NC_013422	GATG	2	8	749913	749920	25 %	25 %	50 %	0 %	261855299
14605	NC_013422	CTG	2	6	750032	750037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855299
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14608	NC_013422	GGC	2	6	750175	750180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855299
14609	NC_013422	AGCA	2	8	750204	750211	50 %	0 %	25 %	25 %	261855299
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14614	NC_013422	AGTC	2	8	750358	750365	25 %	25 %	25 %	25 %	261855299
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14987	NC_013422	TGG	2	6	769202	769207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855319
14988	NC_013422	A	7	7	769254	769260	100 %	0 %	0 %	0 %	261855319
14989	NC_013422	ACGT	3	12	769327	769338	25 %	25 %	25 %	25 %	261855319
14990	NC_013422	A	7	7	769360	769366	100 %	0 %	0 %	0 %	261855319
14991	NC_013422	TCG	2	6	769388	769393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855319
14992	NC_013422	CG	3	6	769392	769397	0 %	0 %	50 %	50 %	261855319
14993	NC_013422	AACA	2	8	769416	769423	75 %	0 %	0 %	25 %	261855319
14994	NC_013422	A	6	6	769472	769477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_013422	ATTT	2	8	769506	769513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14996	NC_013422	GAA	2	6	769548	769553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855320
14997	NC_013422	GGC	2	6	769581	769586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855320
14998	NC_013422	GCTGAT	2	12	769592	769603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261855320
14999	NC_013422	TGA	2	6	769606	769611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855320
15000	NC_013422	ATC	2	6	769617	769622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855320

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