MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013422	AGAC	2	8	611445	611452	50 %	0 %	25 %	25 %	261855192
12003	NC_013422	GAT	2	6	611482	611487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855192
12004	NC_013422	TTG	2	6	611497	611502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855192
12005	NC_013422	GA	3	6	611564	611569	50 %	0 %	50 %	0 %	261855193
12006	NC_013422	AGT	2	6	611587	611592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855193
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12008	NC_013422	GCA	2	6	611775	611780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855193
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12015	NC_013422	T	7	7	611983	611989	0 %	100 %	0 %	0 %	261855193
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12018	NC_013422	CAAG	2	8	612289	612296	50 %	0 %	25 %	25 %	261855193
12019	NC_013422	TTG	2	6	612379	612384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12021	NC_013422	T	6	6	612437	612442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12025	NC_013422	TG	3	6	612604	612609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_013422	TTCA	2	8	612611	612618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12059	NC_013422	G	6	6	614095	614100	0 %	0 %	100 %	0 %	261855194
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12102	NC_013422	AGTC	2	8	616405	616412	25 %	25 %	25 %	25 %	261855196
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12115	NC_013422	GC	3	6	617601	617606	0 %	0 %	50 %	50 %	261855196
12116	NC_013422	CGCA	2	8	617715	617722	25 %	0 %	25 %	50 %	261855196
12117	NC_013422	GC	3	6	617852	617857	0 %	0 %	50 %	50 %	261855196
12118	NC_013422	CTGG	2	8	617920	617927	0 %	25 %	50 %	25 %	261855196
12119	NC_013422	GCA	2	6	618019	618024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855196
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12121	NC_013422	CGA	2	6	618188	618193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855196
12122	NC_013422	TGA	2	6	618226	618231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_013422	TTA	2	6	618239	618244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12124	NC_013422	CAT	2	6	618282	618287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855197
12125	NC_013422	TGA	2	6	618332	618337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855197
12126	NC_013422	CGA	2	6	618389	618394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855197
12127	NC_013422	CAGC	2	8	618411	618418	25 %	0 %	25 %	50 %	261855197
12128	NC_013422	CCA	2	6	618568	618573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855197
12129	NC_013422	GCC	2	6	618579	618584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855197
12130	NC_013422	GC	3	6	618592	618597	0 %	0 %	50 %	50 %	261855197
12131	NC_013422	CG	3	6	618623	618628	0 %	0 %	50 %	50 %	261855197
12132	NC_013422	A	6	6	618631	618636	100 %	0 %	0 %	0 %	261855197
12133	NC_013422	TCG	2	6	618739	618744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855197
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12135	NC_013422	CGA	2	6	618806	618811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855197
12136	NC_013422	GACG	3	12	618825	618836	25 %	0 %	50 %	25 %	261855197
12137	NC_013422	AACC	2	8	618845	618852	50 %	0 %	0 %	50 %	261855197
12138	NC_013422	GCA	2	6	618887	618892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855197
12139	NC_013422	TCG	2	6	618913	618918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855197
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12142	NC_013422	CAG	2	6	619200	619205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855197
12143	NC_013422	CG	3	6	619257	619262	0 %	0 %	50 %	50 %	261855197
12144	NC_013422	CTC	2	6	619275	619280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855197
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12150	NC_013422	TCG	2	6	620114	620119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855198
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12153	NC_013422	GGC	2	6	620182	620187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855198
12154	NC_013422	TTTC	2	8	620229	620236	0 %	75 %	0 %	25 %	261855198
12155	NC_013422	CGC	2	6	620257	620262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855198
12156	NC_013422	GCG	2	6	620288	620293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855198
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12164	NC_013422	GCCG	2	8	620793	620800	0 %	0 %	50 %	50 %	261855198
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12194	NC_013422	TTCAT	2	10	622462	622471	20 %	60 %	0 %	20 %	261855199
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12213	NC_013422	GGC	2	6	624123	624128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12214	NC_013422	GC	4	8	624161	624168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12215	NC_013422	T	7	7	624307	624313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12216	NC_013422	ATT	2	6	624314	624319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12217	NC_013422	A	8	8	624337	624344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12218	NC_013422	GC	3	6	624348	624353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12219	NC_013422	GTG	2	6	624409	624414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12220	NC_013422	CGCTG	2	10	624426	624435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12221	NC_013422	GTG	2	6	624454	624459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12222	NC_013422	AC	3	6	624492	624497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12223	NC_013422	TGC	2	6	624557	624562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12224	NC_013422	CACCTG	2	12	624575	624586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261855201
12225	NC_013422	GGC	2	6	624718	624723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855201
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12228	NC_013422	GCG	2	6	624898	624903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855201
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12230	NC_013422	GGC	2	6	625009	625014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855201
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12232	NC_013422	TGT	2	6	625138	625143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855201
12233	NC_013422	CCA	2	6	625146	625151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855201
12234	NC_013422	ACG	2	6	625152	625157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855201
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12239	NC_013422	T	6	6	625381	625386	0 %	100 %	0 %	0 %	261855201
12240	NC_013422	GAGC	2	8	625441	625448	25 %	0 %	50 %	25 %	261855201
12241	NC_013422	CCG	2	6	625479	625484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855201
12242	NC_013422	T	6	6	625558	625563	0 %	100 %	0 %	0 %	261855201
12243	NC_013422	TGG	2	6	625644	625649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855201
12244	NC_013422	GCT	2	6	625657	625662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855201
12245	NC_013422	CTG	2	6	625694	625699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855201
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12299	NC_013422	A	7	7	628695	628701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12300	NC_013422	CTG	2	6	628783	628788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12345	NC_013422	TTC	2	6	631057	631062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12346	NC_013422	TTC	2	6	631067	631072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12347	NC_013422	TCAA	2	8	631081	631088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12348	NC_013422	GC	4	8	631456	631463	0 %	0 %	50 %	50 %	261855205
12349	NC_013422	ATG	2	6	631616	631621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855205
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12352	NC_013422	GA	3	6	631698	631703	50 %	0 %	50 %	0 %	261855205
12353	NC_013422	CCGC	2	8	631745	631752	0 %	0 %	25 %	75 %	261855205
12354	NC_013422	ATTG	2	8	631862	631869	25 %	50 %	25 %	0 %	261855206
12355	NC_013422	GTC	2	6	632242	632247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855206
12356	NC_013422	TG	3	6	632263	632268	0 %	50 %	50 %	0 %	261855206
12357	NC_013422	ACG	2	6	632364	632369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855206
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12359	NC_013422	ATT	2	6	632433	632438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855206
12360	NC_013422	TTG	2	6	632473	632478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855206
12361	NC_013422	GGC	2	6	632528	632533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855206
12362	NC_013422	GGT	2	6	632603	632608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855206
12363	NC_013422	CGGAT	2	10	632676	632685	20 %	20 %	40 %	20 %	261855206
12364	NC_013422	GTTC	2	8	632744	632751	0 %	50 %	25 %	25 %	261855206
12365	NC_013422	TGCG	2	8	632761	632768	0 %	25 %	50 %	25 %	261855206
12366	NC_013422	GGC	2	6	632775	632780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855206
12367	NC_013422	GCC	2	6	632798	632803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855206
12368	NC_013422	GCG	2	6	632864	632869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855206
12369	NC_013422	CGAG	2	8	632870	632877	25 %	0 %	50 %	25 %	261855206
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12383	NC_013422	T	7	7	633571	633577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12384	NC_013422	ACG	2	6	633854	633859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12387	NC_013422	TGG	2	6	634053	634058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855208
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12414	NC_013422	GCAG	2	8	635961	635968	25 %	0 %	50 %	25 %	261855209
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12484	NC_013422	TTTC	2	8	639854	639861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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