MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_013422	GGT	2	6	530730	530735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855116
10503	NC_013422	GAT	2	6	530808	530813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855116
10504	NC_013422	TGA	2	6	530820	530825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855116
10505	NC_013422	CGC	2	6	530842	530847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855116
10506	NC_013422	TGA	2	6	530864	530869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855116
10507	NC_013422	GGC	2	6	530983	530988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855116
10508	NC_013422	CGC	2	6	531053	531058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855117
10509	NC_013422	GTG	2	6	531124	531129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855117
10510	NC_013422	CGC	2	6	531344	531349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855117
10511	NC_013422	CGC	2	6	531415	531420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855117
10512	NC_013422	CTG	2	6	531482	531487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10513	NC_013422	CCG	2	6	531528	531533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855117
10514	NC_013422	GCA	2	6	531570	531575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10515	NC_013422	CTGG	2	8	531602	531609	0 %	25 %	50 %	25 %	261855117
10516	NC_013422	TGT	2	6	531616	531621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855117
10517	NC_013422	TGC	2	6	531659	531664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10518	NC_013422	TCG	2	6	531807	531812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10519	NC_013422	TGA	2	6	531883	531888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855117
10520	NC_013422	GCA	2	6	532039	532044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10521	NC_013422	GGC	2	6	532088	532093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855117
10522	NC_013422	GCTT	2	8	532110	532117	0 %	50 %	25 %	25 %	261855117
10523	NC_013422	TTTGA	2	10	532239	532248	20 %	60 %	20 %	0 %	261855117
10524	NC_013422	CTG	2	6	532346	532351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10525	NC_013422	GGC	2	6	532352	532357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855117
10526	NC_013422	AGC	2	6	532359	532364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10527	NC_013422	CGA	2	6	532438	532443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855117
10528	NC_013422	GTTT	2	8	532464	532471	0 %	75 %	25 %	0 %	261855117
10529	NC_013422	ATT	2	6	532519	532524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_013422	GGTA	2	8	532565	532572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_013422	CAT	2	6	532596	532601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_013422	C	6	6	532634	532639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10533	NC_013422	T	7	7	532640	532646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_013422	GT	5	10	532809	532818	0 %	50 %	50 %	0 %	261855118
10535	NC_013422	ATG	2	6	532868	532873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855118
10536	NC_013422	TGTTC	2	10	532881	532890	0 %	60 %	20 %	20 %	261855118
10537	NC_013422	CGA	2	6	532896	532901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855118
10538	NC_013422	AAC	2	6	532907	532912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855118
10539	NC_013422	CGTT	2	8	532991	532998	0 %	50 %	25 %	25 %	261855118
10540	NC_013422	CAC	2	6	533035	533040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855118
10541	NC_013422	CAGG	2	8	533134	533141	25 %	0 %	50 %	25 %	261855118
10542	NC_013422	CGTT	2	8	533180	533187	0 %	50 %	25 %	25 %	261855118
10543	NC_013422	CGA	2	6	533223	533228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855118
10544	NC_013422	CAG	2	6	533298	533303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855118
10545	NC_013422	TTG	2	6	533377	533382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855118
10546	NC_013422	CAT	2	6	533422	533427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855118
10547	NC_013422	ATT	2	6	533445	533450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_013422	AAT	2	6	533459	533464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_013422	ATCA	2	8	533505	533512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10550	NC_013422	GT	3	6	533751	533756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_013422	GA	3	6	533761	533766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_013422	CGG	2	6	533795	533800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_013422	TCAT	2	8	533847	533854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_013422	T	6	6	533891	533896	0 %	100 %	0 %	0 %	261855119
10555	NC_013422	CCG	2	6	534048	534053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855119
10556	NC_013422	CGT	2	6	534181	534186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855119
10557	NC_013422	CGCC	2	8	534299	534306	0 %	0 %	25 %	75 %	261855119
10558	NC_013422	CAT	2	6	534311	534316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855119
10559	NC_013422	AAC	2	6	534351	534356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855119
10560	NC_013422	GCT	2	6	534395	534400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855119
10561	NC_013422	TCA	2	6	534445	534450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855119
10562	NC_013422	CGA	2	6	534467	534472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855119
10563	NC_013422	ATCA	2	8	534507	534514	50 %	25 %	0 %	25 %	261855119
10564	NC_013422	GAT	2	6	534530	534535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855119
10565	NC_013422	CCA	2	6	534586	534591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855119
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10568	NC_013422	TGC	3	9	534862	534870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855119
10569	NC_013422	GTG	2	6	534916	534921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855119
10570	NC_013422	CAT	2	6	534951	534956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855119
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10572	NC_013422	GCG	2	6	535074	535079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855119
10573	NC_013422	GAT	2	6	535178	535183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855119
10574	NC_013422	CGGCG	2	10	535295	535304	0 %	0 %	60 %	40 %	261855119
10575	NC_013422	GGTAC	2	10	535315	535324	20 %	20 %	40 %	20 %	261855119
10576	NC_013422	GAC	2	6	535377	535382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855119
10577	NC_013422	TTAC	2	8	535399	535406	25 %	50 %	0 %	25 %	261855119
10578	NC_013422	CGC	2	6	535412	535417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855119
10579	NC_013422	GC	3	6	535450	535455	0 %	0 %	50 %	50 %	261855119
10580	NC_013422	GC	4	8	535535	535542	0 %	0 %	50 %	50 %	261855119
10581	NC_013422	CGA	2	6	535673	535678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855119
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10583	NC_013422	GAA	2	6	535704	535709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855119
10584	NC_013422	A	6	6	535728	535733	100 %	0 %	0 %	0 %	261855119
10585	NC_013422	T	6	6	535808	535813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_013422	ATC	2	6	535886	535891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855120
10587	NC_013422	GTT	2	6	535913	535918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855120
10588	NC_013422	TGCCG	2	10	535959	535968	0 %	20 %	40 %	40 %	261855120
10589	NC_013422	ATA	2	6	536051	536056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855120
10590	NC_013422	T	6	6	536057	536062	0 %	100 %	0 %	0 %	261855120
10591	NC_013422	CG	3	6	536162	536167	0 %	0 %	50 %	50 %	261855120
10592	NC_013422	GAT	2	6	536229	536234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855120
10593	NC_013422	CCG	2	6	536294	536299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855120
10594	NC_013422	GC	3	6	536312	536317	0 %	0 %	50 %	50 %	261855120
10595	NC_013422	CCAG	2	8	536362	536369	25 %	0 %	25 %	50 %	261855121
10596	NC_013422	TGT	2	6	536482	536487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855121
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10598	NC_013422	GC	3	6	536539	536544	0 %	0 %	50 %	50 %	261855121
10599	NC_013422	GAT	2	6	536687	536692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855121
10600	NC_013422	TCGC	2	8	536721	536728	0 %	25 %	25 %	50 %	261855121
10601	NC_013422	GGC	2	6	536899	536904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855121
10602	NC_013422	GTA	2	6	536945	536950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855121
10603	NC_013422	TC	3	6	537025	537030	0 %	50 %	0 %	50 %	261855121
10604	NC_013422	TTC	2	6	537096	537101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855121
10605	NC_013422	TTAAGA	2	12	537129	537140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_013422	ATTC	2	8	537162	537169	25 %	50 %	0 %	25 %	261855122
10607	NC_013422	TGT	2	6	537174	537179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855122
10608	NC_013422	TGA	2	6	537197	537202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855122
10609	NC_013422	CTT	2	6	537212	537217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855122
10610	NC_013422	CTG	2	6	537274	537279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855122
10611	NC_013422	AAGAC	2	10	537365	537374	60 %	0 %	20 %	20 %	261855122
10612	NC_013422	CG	3	6	537436	537441	0 %	0 %	50 %	50 %	261855122
10613	NC_013422	AGG	2	6	537443	537448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855122
10614	NC_013422	ACG	2	6	537455	537460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855122
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10616	NC_013422	GTC	3	9	537631	537639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855122
10617	NC_013422	CGG	2	6	537669	537674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855122
10618	NC_013422	GGC	2	6	537714	537719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855122
10619	NC_013422	GCC	2	6	537781	537786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855122
10620	NC_013422	CCA	2	6	537805	537810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855122
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10622	NC_013422	CGCC	2	8	537923	537930	0 %	0 %	25 %	75 %	261855122
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10644	NC_013422	ATCC	2	8	539319	539326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10645	NC_013422	GATG	2	8	539328	539335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10742	NC_013422	GTTC	2	8	544340	544347	0 %	50 %	25 %	25 %	261855131
10743	NC_013422	GCAT	2	8	544411	544418	25 %	25 %	25 %	25 %	261855131
10744	NC_013422	AGA	2	6	544469	544474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855131
10745	NC_013422	GGC	2	6	544494	544499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855131
10746	NC_013422	CGCC	2	8	544582	544589	0 %	0 %	25 %	75 %	261855132
10747	NC_013422	GGC	2	6	544601	544606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855132
10748	NC_013422	ATC	2	6	544620	544625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855132
10749	NC_013422	AGGC	2	8	544721	544728	25 %	0 %	50 %	25 %	261855132
10750	NC_013422	CTA	2	6	544825	544830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855132
10751	NC_013422	TGA	2	6	544884	544889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855132
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10753	NC_013422	GCT	2	6	544978	544983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855132
10754	NC_013422	CGT	2	6	545002	545007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855132
10755	NC_013422	CGG	2	6	545008	545013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855132
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10757	NC_013422	TGA	2	6	545059	545064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855132
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10774	NC_013422	ATTTTT	2	12	545919	545930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261855132
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10776	NC_013422	TGT	2	6	545956	545961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10777	NC_013422	ATG	2	6	545994	545999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10779	NC_013422	GCA	2	6	546043	546048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10781	NC_013422	CCG	2	6	546122	546127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10783	NC_013422	ACTA	2	8	546213	546220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10784	NC_013422	CGAA	2	8	546245	546252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10785	NC_013422	TCA	2	6	546425	546430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10788	NC_013422	CTG	2	6	546515	546520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10802	NC_013422	GTC	2	6	547427	547432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855134
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10807	NC_013422	ATCG	2	8	547663	547670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10851	NC_013422	GTT	2	6	549795	549800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10852	NC_013422	TC	3	6	549845	549850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10853	NC_013422	GTA	2	6	549867	549872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10856	NC_013422	AAGG	2	8	549975	549982	50 %	0 %	50 %	0 %	261855136
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10859	NC_013422	CACT	2	8	550153	550160	25 %	25 %	0 %	50 %	261855136
10860	NC_013422	AGC	2	6	550184	550189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855136
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10863	NC_013422	GAT	2	6	550289	550294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855136
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10980	NC_013422	GCGCA	2	10	556688	556697	20 %	0 %	40 %	40 %	261855137
10981	NC_013422	GAAC	2	8	556726	556733	50 %	0 %	25 %	25 %	261855137
10982	NC_013422	CGA	2	6	556740	556745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855137
10983	NC_013422	TTGCC	2	10	556794	556803	0 %	40 %	20 %	40 %	261855137
10984	NC_013422	TAC	2	6	556805	556810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855137
10985	NC_013422	GGA	2	6	556840	556845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855137
10986	NC_013422	GAA	2	6	556868	556873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855137
10987	NC_013422	GGGC	2	8	556915	556922	0 %	0 %	75 %	25 %	261855137
10988	NC_013422	ACT	2	6	557000	557005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855137
10989	NC_013422	AATC	2	8	557025	557032	50 %	25 %	0 %	25 %	261855137
10990	NC_013422	T	8	8	557070	557077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10991	NC_013422	TCTG	2	8	557086	557093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10992	NC_013422	TCAA	2	8	557122	557129	50 %	25 %	0 %	25 %	261855138
10993	NC_013422	CAA	2	6	557173	557178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855138
10994	NC_013422	TCA	2	6	557179	557184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855138
10995	NC_013422	TGG	2	6	557212	557217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855138
10996	NC_013422	CGA	2	6	557278	557283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855138
10997	NC_013422	GCG	2	6	557328	557333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855138
10998	NC_013422	ACC	2	6	557350	557355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855138
10999	NC_013422	TCG	2	6	557371	557376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855138
11000	NC_013422	CAG	2	6	557447	557452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855138

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