MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_013422	CGA	2	6	502709	502714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855096
10003	NC_013422	TGA	2	6	502795	502800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855096
10004	NC_013422	TGCG	2	8	502848	502855	0 %	25 %	50 %	25 %	261855096
10005	NC_013422	GCC	2	6	502931	502936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855096
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10009	NC_013422	ACAG	2	8	503357	503364	50 %	0 %	25 %	25 %	261855096
10010	NC_013422	TGG	2	6	503457	503462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855096
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10017	NC_013422	A	6	6	503914	503919	100 %	0 %	0 %	0 %	261855096
10018	NC_013422	GC	3	6	503951	503956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10020	NC_013422	GAT	2	6	503990	503995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_013422	GCG	2	6	504098	504103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_013422	TCA	2	6	504138	504143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10024	NC_013422	AGC	2	6	504160	504165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10026	NC_013422	CTA	2	6	504294	504299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10030	NC_013422	GGC	2	6	504546	504551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855097
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10123	NC_013422	GGC	2	6	509907	509912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855100
10124	NC_013422	GGCC	2	8	509952	509959	0 %	0 %	50 %	50 %	261855100
10125	NC_013422	AAGC	2	8	510036	510043	50 %	0 %	25 %	25 %	261855100
10126	NC_013422	TGA	2	6	510101	510106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855100
10127	NC_013422	GAAA	2	8	510134	510141	75 %	0 %	25 %	0 %	261855100
10128	NC_013422	ACA	2	6	510215	510220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855100
10129	NC_013422	GCGG	2	8	510260	510267	0 %	0 %	75 %	25 %	261855100
10130	NC_013422	TTG	2	6	510352	510357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_013422	AGATG	2	10	510389	510398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_013422	ATC	2	6	510423	510428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855101
10133	NC_013422	GTT	2	6	510723	510728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_013422	AGC	2	6	510772	510777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_013422	AAACTC	2	12	510779	510790	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_013422	AGC	2	6	510818	510823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_013422	CTTT	2	8	510852	510859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10138	NC_013422	T	6	6	510857	510862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_013422	T	6	6	510936	510941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_013422	GTCT	2	8	511026	511033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10141	NC_013422	GC	3	6	511112	511117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_013422	T	8	8	511180	511187	0 %	100 %	0 %	0 %	261855102
10143	NC_013422	A	6	6	511210	511215	100 %	0 %	0 %	0 %	261855102
10144	NC_013422	TTA	2	6	511251	511256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855102
10145	NC_013422	GGC	2	6	511342	511347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10146	NC_013422	AACT	2	8	511365	511372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10147	NC_013422	GC	3	6	511531	511536	0 %	0 %	50 %	50 %	261855103
10148	NC_013422	GCTG	2	8	511557	511564	0 %	25 %	50 %	25 %	261855103
10149	NC_013422	T	6	6	511582	511587	0 %	100 %	0 %	0 %	261855103
10150	NC_013422	GGCG	2	8	511593	511600	0 %	0 %	75 %	25 %	261855103
10151	NC_013422	GATC	2	8	511620	511627	25 %	25 %	25 %	25 %	261855103
10152	NC_013422	GCC	2	6	511639	511644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855103
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10154	NC_013422	CGG	2	6	511664	511669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855103
10155	NC_013422	TGG	2	6	511676	511681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855103
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10162	NC_013422	ACG	2	6	512030	512035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855103
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10165	NC_013422	GATT	2	8	512103	512110	25 %	50 %	25 %	0 %	261855103
10166	NC_013422	TGA	2	6	512150	512155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855103
10167	NC_013422	CGACA	2	10	512162	512171	40 %	0 %	20 %	40 %	261855103
10168	NC_013422	GTTT	2	8	512191	512198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10169	NC_013422	T	6	6	512220	512225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10170	NC_013422	GAA	2	6	512231	512236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10171	NC_013422	ATG	3	9	512278	512286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10172	NC_013422	AGA	2	6	512325	512330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10173	NC_013422	TGGC	2	8	512448	512455	0 %	25 %	50 %	25 %	261855104
10174	NC_013422	TGC	2	6	512473	512478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10182	NC_013422	CTG	2	6	512843	512848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10196	NC_013422	TTG	2	6	513695	513700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855104
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10201	NC_013422	GGC	2	6	513971	513976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855104
10202	NC_013422	AGC	2	6	514044	514049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10205	NC_013422	GCT	2	6	514092	514097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10210	NC_013422	GCA	2	6	514372	514377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10215	NC_013422	TTG	2	6	514631	514636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855104
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10217	NC_013422	CGG	2	6	514717	514722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855104
10218	NC_013422	TG	3	6	514791	514796	0 %	50 %	50 %	0 %	261855104
10219	NC_013422	ACA	2	6	514839	514844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855104
10220	NC_013422	GAT	2	6	514993	514998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855104
10221	NC_013422	GAT	2	6	515006	515011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855104
10222	NC_013422	AG	3	6	515063	515068	50 %	0 %	50 %	0 %	261855104
10223	NC_013422	GC	4	8	515095	515102	0 %	0 %	50 %	50 %	261855104
10224	NC_013422	TGGG	2	8	515121	515128	0 %	25 %	75 %	0 %	261855104
10225	NC_013422	TCG	3	9	515136	515144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855104
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10228	NC_013422	CTG	2	6	515327	515332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855104
10229	NC_013422	CCA	2	6	515346	515351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855104
10230	NC_013422	GTG	2	6	515389	515394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855104
10231	NC_013422	GTT	2	6	515398	515403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855104
10232	NC_013422	TCG	2	6	515473	515478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_013422	TCG	2	6	515565	515570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10234	NC_013422	A	6	6	515594	515599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_013422	TCG	2	6	515657	515662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_013422	TCG	2	6	515749	515754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10237	NC_013422	CCGAT	2	10	515940	515949	20 %	20 %	20 %	40 %	261855105
10238	NC_013422	CG	3	6	515956	515961	0 %	0 %	50 %	50 %	261855105
10239	NC_013422	CGC	2	6	515976	515981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855105
10240	NC_013422	GTT	2	6	515982	515987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855105
10241	NC_013422	TCTT	2	8	515988	515995	0 %	75 %	0 %	25 %	261855105
10242	NC_013422	GCA	2	6	516023	516028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855105
10243	NC_013422	ATC	2	6	516175	516180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855105
10244	NC_013422	CCG	2	6	516331	516336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855105
10245	NC_013422	TGGC	2	8	516355	516362	0 %	25 %	50 %	25 %	261855105
10246	NC_013422	TGCC	2	8	516365	516372	0 %	25 %	25 %	50 %	261855105
10247	NC_013422	TTGT	2	8	516409	516416	0 %	75 %	25 %	0 %	261855105
10248	NC_013422	CGC	2	6	516426	516431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855105
10249	NC_013422	ATTTC	2	10	516560	516569	20 %	60 %	0 %	20 %	261855105
10250	NC_013422	GCT	2	6	516585	516590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855105
10251	NC_013422	GGCT	2	8	516646	516653	0 %	25 %	50 %	25 %	261855105
10252	NC_013422	CGC	2	6	516679	516684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855105
10253	NC_013422	CG	5	10	516762	516771	0 %	0 %	50 %	50 %	261855106
10254	NC_013422	CGC	2	6	516819	516824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855106
10255	NC_013422	GAT	2	6	516859	516864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855106
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10258	NC_013422	CTG	2	6	517234	517239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855106
10259	NC_013422	AAAGCC	2	12	517282	517293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261855106
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10264	NC_013422	GAT	2	6	517444	517449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855107
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10267	NC_013422	AACC	2	8	517689	517696	50 %	0 %	0 %	50 %	261855107
10268	NC_013422	GCA	3	9	517709	517717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855107
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10272	NC_013422	TA	3	6	517910	517915	50 %	50 %	0 %	0 %	261855107
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10275	NC_013422	GGC	2	6	518039	518044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855107
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10283	NC_013422	CAT	2	6	518654	518659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855107
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10285	NC_013422	CATT	2	8	518745	518752	25 %	50 %	0 %	25 %	261855107
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10290	NC_013422	GACTT	2	10	518886	518895	20 %	40 %	20 %	20 %	261855108
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10295	NC_013422	GGCG	2	8	519071	519078	0 %	0 %	75 %	25 %	261855108
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10300	NC_013422	C	6	6	519285	519290	0 %	0 %	0 %	100 %	261855108
10301	NC_013422	G	7	7	519308	519314	0 %	0 %	100 %	0 %	261855108
10302	NC_013422	TGA	2	6	519338	519343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855108
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10307	NC_013422	ACC	2	6	519493	519498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855108
10308	NC_013422	GCGAC	2	10	519664	519673	20 %	0 %	40 %	40 %	261855108
10309	NC_013422	TTTG	2	8	519743	519750	0 %	75 %	25 %	0 %	261855108
10310	NC_013422	TTA	2	6	519776	519781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855108
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10312	NC_013422	TCA	2	6	519925	519930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855108
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10353	NC_013422	TGGA	2	8	522254	522261	25 %	25 %	50 %	0 %	261855110
10354	NC_013422	CGATT	2	10	522361	522370	20 %	40 %	20 %	20 %	261855110
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10356	NC_013422	GC	3	6	522485	522490	0 %	0 %	50 %	50 %	261855110
10357	NC_013422	TGCT	2	8	522565	522572	0 %	50 %	25 %	25 %	261855110
10358	NC_013422	GAAG	2	8	522593	522600	50 %	0 %	50 %	0 %	261855110
10359	NC_013422	GTT	2	6	522688	522693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855110
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10362	NC_013422	CTG	2	6	522795	522800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855110
10363	NC_013422	GC	3	6	522845	522850	0 %	0 %	50 %	50 %	261855110
10364	NC_013422	CGGT	2	8	522861	522868	0 %	25 %	50 %	25 %	261855110
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10367	NC_013422	TCG	2	6	522946	522951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855110
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10473	NC_013422	GT	3	6	529048	529053	0 %	50 %	50 %	0 %	261855115
10474	NC_013422	GC	3	6	529064	529069	0 %	0 %	50 %	50 %	261855115
10475	NC_013422	GGCTT	2	10	529074	529083	0 %	40 %	40 %	20 %	261855115
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10487	NC_013422	AATC	2	8	529589	529596	50 %	25 %	0 %	25 %	261855115
10488	NC_013422	GAT	2	6	529625	529630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855115
10489	NC_013422	TGC	2	6	529711	529716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855115
10490	NC_013422	TCA	2	6	529717	529722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855115
10491	NC_013422	GTT	2	6	529727	529732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855115
10492	NC_013422	TGC	2	6	529966	529971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855115
10493	NC_013422	TTG	2	6	529987	529992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855115
10494	NC_013422	TAT	2	6	530163	530168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855115
10495	NC_013422	ATTTG	2	10	530189	530198	20 %	60 %	20 %	0 %	261855115
10496	NC_013422	T	6	6	530382	530387	0 %	100 %	0 %	0 %	261855116
10497	NC_013422	AGC	2	6	530393	530398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855116
10498	NC_013422	T	6	6	530443	530448	0 %	100 %	0 %	0 %	261855116
10499	NC_013422	GTT	2	6	530520	530525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855116
10500	NC_013422	TTC	2	6	530620	530625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855116

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