MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013422	GTG	2	6	400331	400336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855007
8002	NC_013422	CTG	2	6	400338	400343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855007
8003	NC_013422	TCA	2	6	400371	400376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855007
8004	NC_013422	CTG	2	6	400430	400435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855007
8005	NC_013422	TTGCC	2	10	400461	400470	0 %	40 %	20 %	40 %	261855007
8006	NC_013422	TGA	2	6	400482	400487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855007
8007	NC_013422	GAA	2	6	400544	400549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855007
8008	NC_013422	TTGA	2	8	400676	400683	25 %	50 %	25 %	0 %	261855007
8009	NC_013422	CG	3	6	400700	400705	0 %	0 %	50 %	50 %	261855007
8010	NC_013422	TCA	2	6	400747	400752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_013422	CGA	2	6	400873	400878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8012	NC_013422	GT	3	6	400879	400884	0 %	50 %	50 %	0 %	261855008
8013	NC_013422	TCC	2	6	400902	400907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855008
8014	NC_013422	GAA	2	6	400910	400915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855008
8015	NC_013422	CCG	2	6	400920	400925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855008
8016	NC_013422	GTTCG	2	10	401062	401071	0 %	40 %	40 %	20 %	261855008
8017	NC_013422	CTG	2	6	401141	401146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8018	NC_013422	CCA	2	6	401229	401234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855008
8019	NC_013422	ACG	2	6	401307	401312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8020	NC_013422	CAG	2	6	401417	401422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8021	NC_013422	GCC	2	6	401461	401466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855008
8022	NC_013422	GCA	2	6	401488	401493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8023	NC_013422	GCG	2	6	401535	401540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855008
8024	NC_013422	CAT	2	6	401563	401568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855008
8025	NC_013422	GGT	2	6	401588	401593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855008
8026	NC_013422	CTG	2	6	401648	401653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8027	NC_013422	TGAA	2	8	401733	401740	50 %	25 %	25 %	0 %	261855008
8028	NC_013422	GCG	2	6	401750	401755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855008
8029	NC_013422	GAA	2	6	401779	401784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855008
8030	NC_013422	GC	4	8	401895	401902	0 %	0 %	50 %	50 %	261855008
8031	NC_013422	TCG	2	6	401916	401921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8032	NC_013422	TGC	2	6	401928	401933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8033	NC_013422	GTC	2	6	401978	401983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855008
8034	NC_013422	T	7	7	402124	402130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_013422	GCC	2	6	402280	402285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_013422	GC	3	6	402291	402296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_013422	CA	3	6	402297	402302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_013422	CA	3	6	402317	402322	50 %	0 %	0 %	50 %	261855010
8039	NC_013422	ACA	2	6	402328	402333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855010
8040	NC_013422	CGTAC	2	10	402358	402367	20 %	20 %	20 %	40 %	261855010
8041	NC_013422	TGG	2	6	402389	402394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855010
8042	NC_013422	GTCT	2	8	402438	402445	0 %	50 %	25 %	25 %	261855010
8043	NC_013422	GGA	2	6	402453	402458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855010
8044	NC_013422	GCA	2	6	402470	402475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855010
8045	NC_013422	CAA	2	6	402768	402773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855010
8046	NC_013422	GAT	2	6	402814	402819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855010
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8049	NC_013422	AGC	2	6	402989	402994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855010
8050	NC_013422	CGA	2	6	403089	403094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855010
8051	NC_013422	CGG	2	6	403115	403120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855010
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8053	NC_013422	CAA	2	6	403161	403166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855010
8054	NC_013422	GAT	2	6	403173	403178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855010
8055	NC_013422	CCG	2	6	403190	403195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855010
8056	NC_013422	CGTA	2	8	403206	403213	25 %	25 %	25 %	25 %	261855010
8057	NC_013422	TGGAT	2	10	403220	403229	20 %	40 %	40 %	0 %	261855010
8058	NC_013422	GAA	2	6	403245	403250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855010
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8061	NC_013422	CTCG	2	8	403425	403432	0 %	25 %	25 %	50 %	261855010
8062	NC_013422	GCGT	2	8	403487	403494	0 %	25 %	50 %	25 %	261855010
8063	NC_013422	ACATGG	2	12	403703	403714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261855010
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8065	NC_013422	TTA	2	6	403935	403940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855010
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8070	NC_013422	GGC	2	6	404178	404183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855010
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8072	NC_013422	GATC	2	8	404295	404302	25 %	25 %	25 %	25 %	261855010
8073	NC_013422	CACGTG	2	12	404329	404340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261855010
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8080	NC_013422	TGA	2	6	404625	404630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855010
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8083	NC_013422	TTG	2	6	404936	404941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_013422	AGA	2	6	405005	405010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_013422	T	7	7	405397	405403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_013422	CGG	2	6	405467	405472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_013422	T	6	6	405482	405487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013422	ATC	2	6	405550	405555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855012
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8095	NC_013422	AGCA	2	8	405656	405663	50 %	0 %	25 %	25 %	261855012
8096	NC_013422	GTCA	2	8	405676	405683	25 %	25 %	25 %	25 %	261855012
8097	NC_013422	ATT	2	6	405697	405702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855012
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8102	NC_013422	GC	3	6	405922	405927	0 %	0 %	50 %	50 %	261855012
8103	NC_013422	ACG	2	6	405931	405936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855012
8104	NC_013422	ACCG	2	8	406119	406126	25 %	0 %	25 %	50 %	261855012
8105	NC_013422	GAA	2	6	406281	406286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855012
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8112	NC_013422	TGG	2	6	406655	406660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855012
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8116	NC_013422	CGCAA	2	10	406950	406959	40 %	0 %	20 %	40 %	261855012
8117	NC_013422	CGA	2	6	406991	406996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855012
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8122	NC_013422	AGG	2	6	407312	407317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855012
8123	NC_013422	CAG	2	6	407335	407340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855012
8124	NC_013422	GCA	2	6	407349	407354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855012
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8131	NC_013422	G	6	6	407612	407617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_013422	TGA	2	6	407645	407650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855013
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8144	NC_013422	CGTC	2	8	408465	408472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8145	NC_013422	TC	3	6	408502	408507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8232	NC_013422	GCAA	2	8	412677	412684	50 %	0 %	25 %	25 %	261855017
8233	NC_013422	CCGC	2	8	412695	412702	0 %	0 %	25 %	75 %	261855017
8234	NC_013422	CGG	2	6	412721	412726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855017
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8236	NC_013422	T	6	6	412802	412807	0 %	100 %	0 %	0 %	261855017
8237	NC_013422	GGGCTG	2	12	412847	412858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	261855017
8238	NC_013422	TG	3	6	412966	412971	0 %	50 %	50 %	0 %	261855017
8239	NC_013422	GAGC	2	8	413010	413017	25 %	0 %	50 %	25 %	261855017
8240	NC_013422	GGC	2	6	413048	413053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855018
8241	NC_013422	ATT	2	6	413142	413147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855018
8242	NC_013422	AAT	2	6	413152	413157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855018
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8244	NC_013422	ACC	2	6	413221	413226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855018
8245	NC_013422	CGG	2	6	413229	413234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855018
8246	NC_013422	GGCT	2	8	413296	413303	0 %	25 %	50 %	25 %	261855018
8247	NC_013422	GC	4	8	413307	413314	0 %	0 %	50 %	50 %	261855018
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8364	NC_013422	GTC	2	6	419615	419620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855023
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8488	NC_013422	TCA	2	6	426253	426258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855028
8489	NC_013422	TGA	2	6	426325	426330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855028
8490	NC_013422	GCC	3	9	426344	426352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855028
8491	NC_013422	TGG	2	6	426403	426408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855028
8492	NC_013422	GCC	2	6	426419	426424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855028
8493	NC_013422	GCG	2	6	426600	426605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855028
8494	NC_013422	T	6	6	426608	426613	0 %	100 %	0 %	0 %	261855028
8495	NC_013422	CTTTT	2	10	426630	426639	0 %	80 %	0 %	20 %	261855028
8496	NC_013422	CAG	2	6	426665	426670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855028
8497	NC_013422	GCC	2	6	426698	426703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855028
8498	NC_013422	TTC	2	6	426782	426787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855028
8499	NC_013422	CTT	2	6	426799	426804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855028
8500	NC_013422	GAAT	2	8	426940	426947	50 %	25 %	25 %	0 %	261855028

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