MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013422	TGGATG	2	12	374929	374940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261854993
7502	NC_013422	GGT	2	6	374970	374975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854993
7503	NC_013422	TG	3	6	375071	375076	0 %	50 %	50 %	0 %	261854993
7504	NC_013422	GCT	3	9	375084	375092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7505	NC_013422	TTG	2	6	375096	375101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854993
7506	NC_013422	CAC	2	6	375131	375136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854993
7507	NC_013422	GATGTC	2	12	375138	375149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261854993
7508	NC_013422	CTGG	2	8	375153	375160	0 %	25 %	50 %	25 %	261854993
7509	NC_013422	GCG	2	6	375172	375177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7510	NC_013422	CCA	2	6	375185	375190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854993
7511	NC_013422	CACC	2	8	375206	375213	25 %	0 %	0 %	75 %	261854993
7512	NC_013422	TGC	2	6	375233	375238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7513	NC_013422	TTGT	2	8	375251	375258	0 %	75 %	25 %	0 %	261854993
7514	NC_013422	CAGG	2	8	375290	375297	25 %	0 %	50 %	25 %	261854993
7515	NC_013422	TGGCTG	2	12	375334	375345	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	261854993
7516	NC_013422	TGG	2	6	375365	375370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854993
7517	NC_013422	CCGT	2	8	375402	375409	0 %	25 %	25 %	50 %	261854993
7518	NC_013422	GCT	2	6	375481	375486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7519	NC_013422	AGG	2	6	375532	375537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854993
7520	NC_013422	TG	3	6	375561	375566	0 %	50 %	50 %	0 %	261854993
7521	NC_013422	TGG	2	6	375584	375589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854993
7522	NC_013422	TTC	2	6	375606	375611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854993
7523	NC_013422	TGT	2	6	375659	375664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854993
7524	NC_013422	TGG	2	6	375764	375769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854993
7525	NC_013422	TGC	2	6	375812	375817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7526	NC_013422	CTG	3	9	375832	375840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7527	NC_013422	TGC	2	6	375866	375871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7528	NC_013422	CGG	2	6	375941	375946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7529	NC_013422	TTG	2	6	376017	376022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854993
7530	NC_013422	ACG	2	6	376057	376062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854993
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7532	NC_013422	GTACCG	2	12	376147	376158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7533	NC_013422	GGC	2	6	376173	376178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7534	NC_013422	CTGG	2	8	376275	376282	0 %	25 %	50 %	25 %	261854993
7535	NC_013422	GCC	2	6	376374	376379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854993
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7538	NC_013422	TAC	2	6	376559	376564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854993
7539	NC_013422	CCAG	2	8	376652	376659	25 %	0 %	25 %	50 %	261854993
7540	NC_013422	GCG	2	6	376690	376695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7541	NC_013422	TCA	2	6	376751	376756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854993
7542	NC_013422	TCA	2	6	376774	376779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854993
7543	NC_013422	CTG	2	6	376780	376785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
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7545	NC_013422	GCA	2	6	376885	376890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854993
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7547	NC_013422	ACCAG	2	10	376930	376939	40 %	0 %	20 %	40 %	261854993
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7550	NC_013422	CGG	2	6	377170	377175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
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7552	NC_013422	ACA	2	6	377362	377367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854993
7553	NC_013422	AGCG	2	8	377430	377437	25 %	0 %	50 %	25 %	261854993
7554	NC_013422	GGCA	2	8	377438	377445	25 %	0 %	50 %	25 %	261854993
7555	NC_013422	GCG	2	6	377451	377456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7556	NC_013422	CGA	2	6	377561	377566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_013422	AAC	2	6	377594	377599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_013422	GGC	2	6	377617	377622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_013422	GCT	2	6	377642	377647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_013422	AGGC	2	8	377684	377691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7561	NC_013422	AGG	2	6	377708	377713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013422	GAA	2	6	377746	377751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_013422	AAG	2	6	377998	378003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_013422	GCGG	2	8	378027	378034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7565	NC_013422	GCG	3	9	378043	378051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_013422	CGG	2	6	378095	378100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_013422	TGA	2	6	378153	378158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_013422	ACT	2	6	378159	378164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_013422	GGC	2	6	378209	378214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7570	NC_013422	C	6	6	378262	378267	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7571	NC_013422	CCT	2	6	378374	378379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_013422	CCTG	2	8	378434	378441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_013422	CTAT	2	8	378521	378528	25 %	50 %	0 %	25 %	261854994
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7581	NC_013422	TGGT	2	8	379190	379197	0 %	50 %	50 %	0 %	261854995
7582	NC_013422	TAG	2	6	379224	379229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854995
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7585	NC_013422	TCG	2	6	379374	379379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854995
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7589	NC_013422	CTG	2	6	379594	379599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854995
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7595	NC_013422	CAT	2	6	379732	379737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854995
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7601	NC_013422	GCCA	2	8	380017	380024	25 %	0 %	25 %	50 %	261854995
7602	NC_013422	CGG	2	6	380214	380219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854995
7603	NC_013422	GCT	2	6	380254	380259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854995
7604	NC_013422	CAC	2	6	380289	380294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854995
7605	NC_013422	TGA	2	6	380301	380306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854995
7606	NC_013422	TGGC	2	8	380321	380328	0 %	25 %	50 %	25 %	261854995
7607	NC_013422	TGCC	2	8	380355	380362	0 %	25 %	25 %	50 %	261854995
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7622	NC_013422	TTGG	2	8	380929	380936	0 %	50 %	50 %	0 %	261854995
7623	NC_013422	TGGATG	2	12	380939	380950	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261854995
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7991	NC_013422	GC	3	6	399797	399802	0 %	0 %	50 %	50 %	261855006
7992	NC_013422	AGC	2	6	399816	399821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855006
7993	NC_013422	TGA	2	6	399885	399890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855006
7994	NC_013422	AGC	2	6	399921	399926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7995	NC_013422	CAGA	2	8	399947	399954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7996	NC_013422	TG	3	6	399985	399990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7997	NC_013422	ACC	2	6	400018	400023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7998	NC_013422	GTC	2	6	400108	400113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855007
7999	NC_013422	GC	3	6	400168	400173	0 %	0 %	50 %	50 %	261855007
8000	NC_013422	GTT	3	9	400264	400272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855007

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