MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 50512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013422	GAT	2	6	350104	350109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854974
7002	NC_013422	CGTT	2	8	350121	350128	0 %	50 %	25 %	25 %	261854974
7003	NC_013422	TTA	2	6	350157	350162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854974
7004	NC_013422	A	6	6	350221	350226	100 %	0 %	0 %	0 %	261854974
7005	NC_013422	CTGA	2	8	350230	350237	25 %	25 %	25 %	25 %	261854974
7006	NC_013422	T	6	6	350349	350354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013422	TTGA	2	8	350448	350455	25 %	50 %	25 %	0 %	261854975
7008	NC_013422	AAC	2	6	350471	350476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854975
7009	NC_013422	CGT	2	6	350553	350558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854975
7010	NC_013422	AAG	2	6	350584	350589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854975
7011	NC_013422	GTT	2	6	350600	350605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854975
7012	NC_013422	GTG	2	6	350719	350724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854975
7013	NC_013422	GAA	2	6	350767	350772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013422	T	8	8	350791	350798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013422	GTT	2	6	350808	350813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_013422	GTTTG	2	10	350839	350848	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_013422	ATT	2	6	350850	350855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013422	ATT	2	6	350862	350867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013422	GTT	2	6	350935	350940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854976
7020	NC_013422	GTCG	2	8	350952	350959	0 %	25 %	50 %	25 %	261854976
7021	NC_013422	AGA	2	6	350970	350975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854976
7022	NC_013422	CTG	2	6	350990	350995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854976
7023	NC_013422	TGA	2	6	351038	351043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854976
7024	NC_013422	GC	3	6	351074	351079	0 %	0 %	50 %	50 %	261854976
7025	NC_013422	AAG	2	6	351118	351123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854976
7026	NC_013422	AGC	2	6	351140	351145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854976
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7028	NC_013422	ATG	2	6	351380	351385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854976
7029	NC_013422	CGAAGG	2	12	351413	351424	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	261854976
7030	NC_013422	TGAA	2	8	351546	351553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013422	T	6	6	351572	351577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_013422	TTCT	2	8	351588	351595	0 %	75 %	0 %	25 %	261854977
7033	NC_013422	CGG	2	6	351605	351610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854977
7034	NC_013422	GTT	2	6	351617	351622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854977
7035	NC_013422	TCGC	2	8	351757	351764	0 %	25 %	25 %	50 %	261854977
7036	NC_013422	CTA	2	6	351773	351778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854977
7037	NC_013422	ATCG	2	8	351936	351943	25 %	25 %	25 %	25 %	261854977
7038	NC_013422	GAAG	2	8	352046	352053	50 %	0 %	50 %	0 %	261854977
7039	NC_013422	CTT	2	6	352055	352060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854977
7040	NC_013422	GCA	2	6	352115	352120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7041	NC_013422	GAT	2	6	352167	352172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854977
7042	NC_013422	CAT	2	6	352223	352228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854977
7043	NC_013422	TCT	2	6	352252	352257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854977
7044	NC_013422	ACG	2	6	352296	352301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7045	NC_013422	TCG	2	6	352333	352338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7046	NC_013422	CAT	2	6	352473	352478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854977
7047	NC_013422	TCG	2	6	352615	352620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
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7049	NC_013422	AGT	2	6	352703	352708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854977
7050	NC_013422	CAT	2	6	352740	352745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854977
7051	NC_013422	TGC	2	6	352822	352827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7052	NC_013422	AAC	2	6	352951	352956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854977
7053	NC_013422	TCG	2	6	352972	352977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7054	NC_013422	TCG	3	9	353002	353010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7055	NC_013422	CGGA	2	8	353015	353022	25 %	0 %	50 %	25 %	261854977
7056	NC_013422	CGA	2	6	353062	353067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7057	NC_013422	ATC	2	6	353158	353163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854977
7058	NC_013422	GGA	2	6	353199	353204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854977
7059	NC_013422	GAT	2	6	353217	353222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854977
7060	NC_013422	AGT	2	6	353239	353244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854977
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7062	NC_013422	GTA	2	6	353352	353357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854977
7063	NC_013422	GGC	2	6	353418	353423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854977
7064	NC_013422	CTG	2	6	353526	353531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854977
7065	NC_013422	CGA	2	6	353555	353560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854977
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7069	NC_013422	GCC	2	6	353965	353970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854978
7070	NC_013422	TGCG	2	8	353974	353981	0 %	25 %	50 %	25 %	261854978
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7087	NC_013422	TGA	2	6	354916	354921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854978
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7125	NC_013422	GTCG	2	8	356803	356810	0 %	25 %	50 %	25 %	261854979
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7158	NC_013422	AATA	2	8	358344	358351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7229	NC_013422	CGG	2	6	362110	362115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
7230	NC_013422	GTCA	2	8	362285	362292	25 %	25 %	25 %	25 %	261854984
7231	NC_013422	CGAG	2	8	362317	362324	25 %	0 %	50 %	25 %	261854984
7232	NC_013422	G	6	6	362362	362367	0 %	0 %	100 %	0 %	261854984
7233	NC_013422	ACC	2	6	362378	362383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854984
7234	NC_013422	CTGATG	2	12	362427	362438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261854984
7235	NC_013422	CCG	2	6	362490	362495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854984
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7237	NC_013422	CGG	2	6	362673	362678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
7238	NC_013422	GCT	2	6	362687	362692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984
7239	NC_013422	GAA	2	6	362704	362709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854984
7240	NC_013422	ATT	2	6	362740	362745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7241	NC_013422	CCG	2	6	362823	362828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7242	NC_013422	TGG	2	6	362945	362950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854985
7243	NC_013422	ATG	2	6	363022	363027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854985
7244	NC_013422	GTT	3	9	363033	363041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854985
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7250	NC_013422	GC	3	6	363211	363216	0 %	0 %	50 %	50 %	261854985
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7277	NC_013422	TGA	2	6	364277	364282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854986
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7319	NC_013422	AATA	2	8	366395	366402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7322	NC_013422	AAT	2	6	366447	366452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7323	NC_013422	AAAAG	2	10	366478	366487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7324	NC_013422	GGT	2	6	366538	366543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7350	NC_013422	GCGTT	2	10	368031	368040	0 %	40 %	40 %	20 %	261854988
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7354	NC_013422	TCGAT	2	10	368268	368277	20 %	40 %	20 %	20 %	261854988
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7361	NC_013422	T	7	7	368678	368684	0 %	100 %	0 %	0 %	261854988
7362	NC_013422	T	6	6	368773	368778	0 %	100 %	0 %	0 %	261854988
7363	NC_013422	CACC	2	8	368794	368801	25 %	0 %	0 %	75 %	261854988
7364	NC_013422	GCCT	2	8	368842	368849	0 %	25 %	25 %	50 %	261854988
7365	NC_013422	GCT	2	6	368853	368858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
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7369	NC_013422	GAT	2	6	369080	369085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854988
7370	NC_013422	CAA	2	6	369328	369333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854988
7371	NC_013422	TCA	2	6	369421	369426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854988
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7381	NC_013422	ATT	2	6	370004	370009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7382	NC_013422	A	6	6	370095	370100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7383	NC_013422	ATT	3	9	370187	370195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261854990
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7430	NC_013422	CCT	2	6	371876	371881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7431	NC_013422	GA	3	6	371888	371893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7432	NC_013422	ATT	2	6	371931	371936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7433	NC_013422	TTC	2	6	371956	371961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7435	NC_013422	TCT	2	6	372038	372043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7491	NC_013422	GGC	2	6	374607	374612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7492	NC_013422	CACG	2	8	374618	374625	25 %	0 %	25 %	50 %	261854993
7493	NC_013422	CGG	2	6	374633	374638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7494	NC_013422	TGC	2	6	374642	374647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7495	NC_013422	CGG	2	6	374672	374677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
7496	NC_013422	GTTG	2	8	374681	374688	0 %	50 %	50 %	0 %	261854993
7497	NC_013422	CTTTAT	2	12	374738	374749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261854993
7498	NC_013422	TCCG	2	8	374856	374863	0 %	25 %	25 %	50 %	261854993
7499	NC_013422	TGGCCT	2	12	374882	374893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
7500	NC_013422	TTGG	2	8	374919	374926	0 %	50 %	50 %	0 %	261854993

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