MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 84768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_013202	TAA	2	6	2872320	2872325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78002	NC_013202	AC	3	6	2872370	2872375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78003	NC_013202	CGT	2	6	2872388	2872393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78004	NC_013202	CTA	2	6	2872423	2872428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78005	NC_013202	GTC	2	6	2872443	2872448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78006	NC_013202	TCG	2	6	2872450	2872455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78007	NC_013202	CGA	2	6	2872529	2872534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78008	NC_013202	TCT	2	6	2872559	2872564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257389029
78009	NC_013202	CTG	2	6	2872569	2872574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78010	NC_013202	TCGACG	2	12	2872585	2872596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78011	NC_013202	TCT	2	6	2872625	2872630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257389029
78012	NC_013202	GTC	2	6	2872635	2872640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78013	NC_013202	CCT	2	6	2872661	2872666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257389029
78014	NC_013202	CCA	2	6	2872742	2872747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257389029
78015	NC_013202	GTC	2	6	2872777	2872782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78016	NC_013202	GCC	2	6	2872791	2872796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389029
78017	NC_013202	CG	3	6	2872833	2872838	0 %	0 %	50 %	50 %	257389029
78018	NC_013202	CGG	2	6	2872853	2872858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389029
78019	NC_013202	CG	3	6	2872863	2872868	0 %	0 %	50 %	50 %	257389029
78020	NC_013202	GAT	2	6	2872935	2872940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389029
78021	NC_013202	CCG	2	6	2872961	2872966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389029
78022	NC_013202	CGG	2	6	2872973	2872978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389029
78023	NC_013202	TCCGC	2	10	2873021	2873030	0 %	20 %	20 %	60 %	257389029
78024	NC_013202	TCG	2	6	2873116	2873121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78025	NC_013202	CGC	2	6	2873162	2873167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389029
78026	NC_013202	GTC	2	6	2873181	2873186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78027	NC_013202	CGT	2	6	2873217	2873222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78028	NC_013202	GCTC	2	8	2873242	2873249	0 %	25 %	25 %	50 %	257389029
78029	NC_013202	CTT	2	6	2873274	2873279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257389029
78030	NC_013202	GAC	2	6	2873301	2873306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78031	NC_013202	CGG	2	6	2873312	2873317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389029
78032	NC_013202	GAG	2	6	2873436	2873441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389029
78033	NC_013202	CTG	2	6	2873475	2873480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78034	NC_013202	GAT	2	6	2873490	2873495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389029
78035	NC_013202	AGG	2	6	2873530	2873535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389029
78036	NC_013202	CGA	2	6	2873546	2873551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389029
78037	NC_013202	GGA	2	6	2873570	2873575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389029
78038	NC_013202	AAAAG	2	10	2873615	2873624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78039	NC_013202	GTC	2	6	2873631	2873636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78040	NC_013202	GGC	2	6	2873682	2873687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389030
78041	NC_013202	ACTG	2	8	2873737	2873744	25 %	25 %	25 %	25 %	257389030
78042	NC_013202	CGGT	2	8	2873749	2873756	0 %	25 %	50 %	25 %	257389030
78043	NC_013202	GTCG	2	8	2873765	2873772	0 %	25 %	50 %	25 %	257389030
78044	NC_013202	GAC	2	6	2873805	2873810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78045	NC_013202	GCC	3	9	2873814	2873822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389030
78046	NC_013202	CGA	2	6	2873828	2873833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78047	NC_013202	GTA	2	6	2873883	2873888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389030
78048	NC_013202	CTCG	2	8	2873939	2873946	0 %	25 %	25 %	50 %	257389030
78049	NC_013202	TCGAG	2	10	2873978	2873987	20 %	20 %	40 %	20 %	257389030
78050	NC_013202	CGT	2	6	2874008	2874013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78051	NC_013202	CGG	3	9	2874065	2874073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389030
78052	NC_013202	C	7	7	2874095	2874101	0 %	0 %	0 %	100 %	257389030
78053	NC_013202	CGA	2	6	2874119	2874124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78054	NC_013202	CGCC	2	8	2874125	2874132	0 %	0 %	25 %	75 %	257389030
78055	NC_013202	GAA	2	6	2874156	2874161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257389030
78056	NC_013202	CGA	2	6	2874188	2874193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78057	NC_013202	CGA	2	6	2874209	2874214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389030
78058	NC_013202	CGG	2	6	2874269	2874274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78059	NC_013202	GAA	2	6	2874300	2874305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257389031
78060	NC_013202	CAG	2	6	2874315	2874320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389031
78061	NC_013202	GAG	2	6	2874330	2874335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389031
78062	NC_013202	CCG	3	9	2874337	2874345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389031
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78066	NC_013202	CGC	2	6	2874456	2874461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389031
78067	NC_013202	CGGCC	2	10	2874474	2874483	0 %	0 %	40 %	60 %	257389031
78068	NC_013202	CAG	2	6	2874486	2874491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389031
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78072	NC_013202	TCG	2	6	2874590	2874595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389031
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78077	NC_013202	GTC	2	6	2874747	2874752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389032
78078	NC_013202	CGT	2	6	2874763	2874768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389032
78079	NC_013202	GCCG	2	8	2874770	2874777	0 %	0 %	50 %	50 %	257389032
78080	NC_013202	ATC	2	6	2874783	2874788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257389032
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78082	NC_013202	GAC	2	6	2874839	2874844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389032
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78084	NC_013202	GGCC	2	8	2874886	2874893	0 %	0 %	50 %	50 %	257389032
78085	NC_013202	GAG	2	6	2874935	2874940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389032
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78087	NC_013202	CGA	2	6	2874970	2874975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389032
78088	NC_013202	GTTCGA	2	12	2875039	2875050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257389032
78089	NC_013202	TCG	2	6	2875056	2875061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389032
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78100	NC_013202	GCA	2	6	2875279	2875284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389032
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78116	NC_013202	TCG	2	6	2875902	2875907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389032
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78218	NC_013202	CGCGAG	2	12	2879507	2879518	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257389035
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78227	NC_013202	TCG	2	6	2879996	2880001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78228	NC_013202	GTT	2	6	2880022	2880027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257389036
78229	NC_013202	TCGT	2	8	2880059	2880066	0 %	50 %	25 %	25 %	257389036
78230	NC_013202	GC	3	6	2880117	2880122	0 %	0 %	50 %	50 %	257389036
78231	NC_013202	C	6	6	2880144	2880149	0 %	0 %	0 %	100 %	257389036
78232	NC_013202	CGC	2	6	2880175	2880180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78233	NC_013202	AGC	2	6	2880185	2880190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78234	NC_013202	CGT	2	6	2880216	2880221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78235	NC_013202	GCGA	2	8	2880271	2880278	25 %	0 %	50 %	25 %	257389036
78236	NC_013202	TCCAGC	2	12	2880284	2880295	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257389036
78237	NC_013202	CCGG	2	8	2880306	2880313	0 %	0 %	50 %	50 %	257389036
78238	NC_013202	CGG	2	6	2880323	2880328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389036
78239	NC_013202	CGG	2	6	2880360	2880365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389036
78240	NC_013202	CGC	2	6	2880375	2880380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78241	NC_013202	TCG	2	6	2880398	2880403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78242	NC_013202	CGGACC	2	12	2880422	2880433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257389036
78243	NC_013202	CGA	2	6	2880474	2880479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78244	NC_013202	TCG	2	6	2880482	2880487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78245	NC_013202	TCG	2	6	2880537	2880542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
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78248	NC_013202	GGCTCG	2	12	2880701	2880712	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257389036
78249	NC_013202	CGG	2	6	2880714	2880719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389036
78250	NC_013202	CGA	2	6	2880738	2880743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78251	NC_013202	CGGT	2	8	2880788	2880795	0 %	25 %	50 %	25 %	257389036
78252	NC_013202	ACC	2	6	2880812	2880817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257389036
78253	NC_013202	CG	3	6	2880834	2880839	0 %	0 %	50 %	50 %	257389036
78254	NC_013202	CGC	2	6	2880847	2880852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
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78256	NC_013202	CGT	2	6	2880922	2880927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78257	NC_013202	GAT	2	6	2880940	2880945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389036
78258	NC_013202	CTG	2	6	2881051	2881056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78259	NC_013202	CGC	2	6	2881068	2881073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78260	NC_013202	TCG	2	6	2881115	2881120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78261	NC_013202	TCG	2	6	2881122	2881127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78262	NC_013202	GGA	2	6	2881143	2881148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389036
78263	NC_013202	GTC	2	6	2881159	2881164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78264	NC_013202	CGA	2	6	2881227	2881232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
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78267	NC_013202	CGCT	2	8	2881288	2881295	0 %	25 %	25 %	50 %	257389036
78268	NC_013202	GTC	2	6	2881303	2881308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78269	NC_013202	CTT	2	6	2881330	2881335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257389036
78270	NC_013202	CGACC	2	10	2881356	2881365	20 %	0 %	20 %	60 %	257389036
78271	NC_013202	CGA	2	6	2881377	2881382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78272	NC_013202	GAC	2	6	2881411	2881416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78273	NC_013202	CGA	2	6	2881443	2881448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78274	NC_013202	GCTC	2	8	2881451	2881458	0 %	25 %	25 %	50 %	257389036
78275	NC_013202	CGC	2	6	2881491	2881496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78276	NC_013202	TCG	2	6	2881499	2881504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78277	NC_013202	GAC	3	9	2881522	2881530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78278	NC_013202	CGT	2	6	2881545	2881550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78279	NC_013202	GA	3	6	2881551	2881556	50 %	0 %	50 %	0 %	257389036
78280	NC_013202	GTA	2	6	2881573	2881578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389036
78281	NC_013202	TCGC	2	8	2881581	2881588	0 %	25 %	25 %	50 %	257389036
78282	NC_013202	CTG	2	6	2881663	2881668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
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78284	NC_013202	TCC	2	6	2881694	2881699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257389036
78285	NC_013202	GAG	2	6	2881709	2881714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257389036
78286	NC_013202	CGA	2	6	2881722	2881727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
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78288	NC_013202	CCA	2	6	2881752	2881757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257389036
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78291	NC_013202	GCC	2	6	2881877	2881882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78292	NC_013202	ACGA	2	8	2881901	2881908	50 %	0 %	25 %	25 %	257389036
78293	NC_013202	ACG	2	6	2881928	2881933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78294	NC_013202	GA	3	6	2881975	2881980	50 %	0 %	50 %	0 %	257389036
78295	NC_013202	GCC	2	6	2881982	2881987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78296	NC_013202	GCC	2	6	2881990	2881995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389036
78297	NC_013202	CGT	2	6	2882007	2882012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78298	NC_013202	GTC	2	6	2882023	2882028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389036
78299	NC_013202	CAT	2	6	2882061	2882066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78300	NC_013202	GAAG	2	8	2882125	2882132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78301	NC_013202	GCG	2	6	2882171	2882176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78302	NC_013202	GAT	2	6	2882187	2882192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389037
78303	NC_013202	GTC	3	9	2882193	2882201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78304	NC_013202	CGT	2	6	2882235	2882240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78305	NC_013202	CCGC	3	12	2882243	2882254	0 %	0 %	25 %	75 %	257389037
78306	NC_013202	CGT	2	6	2882264	2882269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78307	NC_013202	ACG	2	6	2882281	2882286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78308	NC_013202	GGCCG	2	10	2882294	2882303	0 %	0 %	60 %	40 %	257389037
78309	NC_013202	CGA	3	9	2882324	2882332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78310	NC_013202	CGG	3	9	2882390	2882398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389037
78311	NC_013202	CG	3	6	2882446	2882451	0 %	0 %	50 %	50 %	257389037
78312	NC_013202	TCG	2	6	2882456	2882461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78313	NC_013202	CGC	2	6	2882535	2882540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389037
78314	NC_013202	AGT	2	6	2882573	2882578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389037
78315	NC_013202	CGA	2	6	2882588	2882593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389037
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78317	NC_013202	CGG	2	6	2882702	2882707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389037
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78319	NC_013202	CGT	3	9	2882747	2882755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78320	NC_013202	CGATCT	2	12	2882756	2882767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257389037
78321	NC_013202	GCG	2	6	2882842	2882847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389037
78322	NC_013202	GCC	2	6	2882900	2882905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389037
78323	NC_013202	TCG	2	6	2882914	2882919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
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78325	NC_013202	TCG	2	6	2882980	2882985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78326	NC_013202	GTCC	2	8	2882990	2882997	0 %	25 %	25 %	50 %	257389037
78327	NC_013202	ACG	2	6	2883007	2883012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78328	NC_013202	CCG	2	6	2883014	2883019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257389037
78329	NC_013202	TCG	2	6	2883037	2883042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78330	NC_013202	CGA	2	6	2883053	2883058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389037
78331	NC_013202	CGC	2	6	2883094	2883099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78332	NC_013202	TGG	2	6	2883113	2883118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78333	NC_013202	CGCCGA	2	12	2883135	2883146	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78334	NC_013202	GGC	2	6	2883153	2883158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78335	NC_013202	CGA	3	9	2883174	2883182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78336	NC_013202	CTG	2	6	2883202	2883207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78337	NC_013202	GCT	2	6	2883228	2883233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78338	NC_013202	GTC	2	6	2883262	2883267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78339	NC_013202	CTG	2	6	2883289	2883294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78340	NC_013202	GC	3	6	2883320	2883325	0 %	0 %	50 %	50 %	257389038
78341	NC_013202	TCG	2	6	2883362	2883367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78342	NC_013202	CGA	2	6	2883380	2883385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78343	NC_013202	CGT	3	9	2883414	2883422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
78344	NC_013202	CGG	2	6	2883440	2883445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257389038
78345	NC_013202	GAT	2	6	2883447	2883452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257389038
78346	NC_013202	TCG	3	9	2883518	2883526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389038
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78377	NC_013202	TAG	2	6	2884485	2884490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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78380	NC_013202	GT	3	6	2884538	2884543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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78450	NC_013202	TCG	2	6	2886951	2886956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257389041
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78458	NC_013202	CGA	2	6	2887238	2887243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389041
78459	NC_013202	CGA	2	6	2887273	2887278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389041
78460	NC_013202	CGA	3	9	2887342	2887350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389041
78461	NC_013202	CGA	2	6	2887402	2887407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389041
78462	NC_013202	CGA	2	6	2887423	2887428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257389041
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78465	NC_013202	GACC	2	8	2887537	2887544	25 %	0 %	25 %	50 %	257389041
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