MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 5721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013201	TCT	2	6	61561	61566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372944
1502	NC_013201	GAAG	2	8	61574	61581	50 %	0 %	50 %	0 %	257372944
1503	NC_013201	GCTC	2	8	61588	61595	0 %	25 %	25 %	50 %	257372944
1504	NC_013201	CTTC	2	8	61607	61614	0 %	50 %	0 %	50 %	257372944
1505	NC_013201	CTT	2	6	61649	61654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372944
1506	NC_013201	CTC	2	6	61659	61664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372944
1507	NC_013201	TCC	2	6	61723	61728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372944
1508	NC_013201	CGT	2	6	61751	61756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372944
1509	NC_013201	CGG	2	6	61880	61885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013201	GC	3	6	61904	61909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013201	GACG	2	8	61939	61946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_013201	CCG	2	6	61947	61952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_013201	GCT	2	6	61982	61987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013201	GAC	2	6	62004	62009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1515	NC_013201	TC	3	6	62019	62024	0 %	50 %	0 %	50 %	257372945
1516	NC_013201	TCG	2	6	62104	62109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1517	NC_013201	GTC	3	9	62127	62135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1518	NC_013201	GGC	2	6	62142	62147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372945
1519	NC_013201	GGC	2	6	62154	62159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372945
1520	NC_013201	CGG	2	6	62187	62192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372945
1521	NC_013201	GC	3	6	62238	62243	0 %	0 %	50 %	50 %	257372945
1522	NC_013201	GCCGTC	2	12	62286	62297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257372945
1523	NC_013201	GGGC	2	8	62328	62335	0 %	0 %	75 %	25 %	257372945
1524	NC_013201	CGGGGC	2	12	62342	62353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372945
1525	NC_013201	GTC	2	6	62385	62390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1526	NC_013201	TCG	2	6	62413	62418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1527	NC_013201	CTC	2	6	62457	62462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372945
1528	NC_013201	CGTCT	2	10	62515	62524	0 %	40 %	20 %	40 %	257372945
1529	NC_013201	CGTCG	2	10	62529	62538	0 %	20 %	40 %	40 %	257372945
1530	NC_013201	CCG	2	6	62543	62548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372945
1531	NC_013201	GTC	2	6	62556	62561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372945
1532	NC_013201	CACC	2	8	62567	62574	25 %	0 %	0 %	75 %	257372945
1533	NC_013201	CCG	2	6	62579	62584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1534	NC_013201	TC	3	6	62596	62601	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
1535	NC_013201	CCG	2	6	62611	62616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1536	NC_013201	CGA	2	6	62667	62672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1537	NC_013201	CAC	2	6	62683	62688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372946
1538	NC_013201	CGT	2	6	62719	62724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1539	NC_013201	CGTC	2	8	62733	62740	0 %	25 %	25 %	50 %	257372946
1540	NC_013201	CGC	2	6	62757	62762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1541	NC_013201	CGGCG	2	10	62776	62785	0 %	0 %	60 %	40 %	257372946
1542	NC_013201	CGA	2	6	62865	62870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1543	NC_013201	CCG	2	6	62930	62935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1544	NC_013201	GAG	2	6	63043	63048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372946
1545	NC_013201	GAC	2	6	63052	63057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1546	NC_013201	AGG	2	6	63161	63166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372946
1547	NC_013201	CGC	2	6	63228	63233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1548	NC_013201	CCG	2	6	63282	63287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372946
1549	NC_013201	CAG	2	6	63316	63321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1550	NC_013201	CGGC	2	8	63338	63345	0 %	0 %	50 %	50 %	257372946
1551	NC_013201	TG	3	6	63347	63352	0 %	50 %	50 %	0 %	257372946
1552	NC_013201	AGC	2	6	63407	63412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1553	NC_013201	GAC	2	6	63445	63450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1554	NC_013201	CGAA	2	8	63475	63482	50 %	0 %	25 %	25 %	257372946
1555	NC_013201	GAA	2	6	63496	63501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372946
1556	NC_013201	CCGA	2	8	63520	63527	25 %	0 %	25 %	50 %	257372946
1557	NC_013201	CGA	2	6	63552	63557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1558	NC_013201	GAA	2	6	63619	63624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372946
1559	NC_013201	GC	3	6	63630	63635	0 %	0 %	50 %	50 %	257372946
1560	NC_013201	GAT	2	6	63640	63645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372946
1561	NC_013201	GCCC	2	8	63648	63655	0 %	0 %	25 %	75 %	257372946
1562	NC_013201	CGA	2	6	63666	63671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1563	NC_013201	ATG	2	6	63686	63691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372946
1564	NC_013201	CTG	2	6	63739	63744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372946
1565	NC_013201	ACGCCC	2	12	63753	63764	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257372946
1566	NC_013201	AGG	2	6	63791	63796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372946
1567	NC_013201	TC	3	6	63865	63870	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
1568	NC_013201	CAC	2	6	63879	63884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372946
1569	NC_013201	TCA	2	6	63885	63890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372946
1570	NC_013201	TCA	2	6	63892	63897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372947
1571	NC_013201	GTC	2	6	63948	63953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1572	NC_013201	CCT	2	6	63956	63961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372947
1573	NC_013201	TCG	2	6	63976	63981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1574	NC_013201	TCG	2	6	64069	64074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1575	NC_013201	TCG	3	9	64126	64134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1576	NC_013201	AC	3	6	64174	64179	50 %	0 %	0 %	50 %	257372947
1577	NC_013201	TCCT	2	8	64191	64198	0 %	50 %	0 %	50 %	257372947
1578	NC_013201	CGA	2	6	64229	64234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1579	NC_013201	GGC	2	6	64326	64331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372947
1580	NC_013201	CGT	2	6	64484	64489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372947
1581	NC_013201	TCA	2	6	64734	64739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372948
1582	NC_013201	CCA	2	6	64850	64855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372948
1583	NC_013201	TTG	2	6	64893	64898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257372948
1584	NC_013201	ACC	2	6	64914	64919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372948
1585	NC_013201	CT	3	6	65018	65023	0 %	50 %	0 %	50 %	257372948
1586	NC_013201	TCG	2	6	65118	65123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1587	NC_013201	TCG	2	6	65166	65171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1588	NC_013201	CGT	4	12	65200	65211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1589	NC_013201	GTT	2	6	65302	65307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257372948
1590	NC_013201	GTC	2	6	65321	65326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1591	NC_013201	ATG	2	6	65409	65414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372948
1592	NC_013201	TAG	2	6	65415	65420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372948
1593	NC_013201	CTG	2	6	65453	65458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1594	NC_013201	CGT	2	6	65486	65491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1595	NC_013201	CGGC	2	8	65521	65528	0 %	0 %	50 %	50 %	257372948
1596	NC_013201	ATA	2	6	65532	65537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257372948
1597	NC_013201	GTC	2	6	65550	65555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1598	NC_013201	CAGC	2	8	65609	65616	25 %	0 %	25 %	50 %	257372948
1599	NC_013201	GCC	2	6	65687	65692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372948
1600	NC_013201	ACCG	2	8	65738	65745	25 %	0 %	25 %	50 %	257372948
1601	NC_013201	ACG	2	6	65794	65799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1602	NC_013201	GTC	2	6	66057	66062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1603	NC_013201	ACC	2	6	66098	66103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372948
1604	NC_013201	TCA	2	6	66145	66150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372948
1605	NC_013201	CGA	2	6	66151	66156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1606	NC_013201	TCG	2	6	66174	66179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1607	NC_013201	CGT	2	6	66208	66213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1608	NC_013201	GGA	2	6	66250	66255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372948
1609	NC_013201	TCG	2	6	66261	66266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1610	NC_013201	CAT	2	6	66293	66298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372948
1611	NC_013201	GA	3	6	66300	66305	50 %	0 %	50 %	0 %	257372948
1612	NC_013201	CCG	2	6	66358	66363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372948
1613	NC_013201	CGA	3	9	66382	66390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1614	NC_013201	GAT	3	9	66473	66481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372948
1615	NC_013201	TCG	2	6	66514	66519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1616	NC_013201	CCA	2	6	66609	66614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372948
1617	NC_013201	GTT	2	6	66619	66624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257372948
1618	NC_013201	GTC	2	6	66642	66647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1619	NC_013201	A	6	6	66673	66678	100 %	0 %	0 %	0 %	257372948
1620	NC_013201	TGG	2	6	66703	66708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372948
1621	NC_013201	CAC	2	6	66775	66780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372948
1622	NC_013201	G	6	6	66793	66798	0 %	0 %	100 %	0 %	257372948
1623	NC_013201	CTG	2	6	66917	66922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372948
1624	NC_013201	TTC	2	6	66930	66935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372948
1625	NC_013201	TCT	2	6	67014	67019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372948
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1674	NC_013201	GCG	2	6	69124	69129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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