MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 5721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013201	GCG	2	6	22816	22821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
502	NC_013201	GGCGA	2	10	22896	22905	20 %	0 %	60 %	20 %	257372919
503	NC_013201	GCT	2	6	22916	22921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
504	NC_013201	CGC	3	9	22928	22936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372919
505	NC_013201	CAGCG	2	10	22944	22953	20 %	0 %	40 %	40 %	257372919
506	NC_013201	GC	3	6	22982	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
507	NC_013201	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
508	NC_013201	CGT	2	6	23015	23020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
509	NC_013201	CG	3	6	23055	23060	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
510	NC_013201	TAC	2	6	23079	23084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372919
511	NC_013201	CACGCC	2	12	23130	23141	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257372919
512	NC_013201	CGG	2	6	23150	23155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
513	NC_013201	CGT	2	6	23159	23164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
514	NC_013201	CGAC	2	8	23170	23177	25 %	0 %	25 %	50 %	257372919
515	NC_013201	GAC	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
516	NC_013201	GTC	2	6	23253	23258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
517	NC_013201	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
518	NC_013201	CGT	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
519	NC_013201	CGA	2	6	23303	23308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
520	NC_013201	CGT	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
521	NC_013201	CCGC	2	8	23398	23405	0 %	0 %	25 %	75 %	257372919
522	NC_013201	CGA	2	6	23429	23434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
523	NC_013201	CTG	2	6	23448	23453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
524	NC_013201	CGA	2	6	23456	23461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
525	NC_013201	GCCA	2	8	23490	23497	25 %	0 %	25 %	50 %	257372919
526	NC_013201	ACG	2	6	23530	23535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
527	NC_013201	CCG	2	6	23551	23556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372919
528	NC_013201	GTCGCG	2	12	23559	23570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257372919
529	NC_013201	CGA	2	6	23627	23632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
530	NC_013201	GTC	3	9	23772	23780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
531	NC_013201	CTT	2	6	23849	23854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372919
532	NC_013201	GAG	2	6	23856	23861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372919
533	NC_013201	GA	3	6	23863	23868	50 %	0 %	50 %	0 %	257372919
534	NC_013201	GCC	2	6	23967	23972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
535	NC_013201	TACGAC	2	12	23980	23991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257372920
536	NC_013201	CA	3	6	24002	24007	50 %	0 %	0 %	50 %	257372920
537	NC_013201	CAC	2	6	24031	24036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372920
538	NC_013201	CCA	2	6	24042	24047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372920
539	NC_013201	CGC	2	6	24072	24077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
540	NC_013201	GGCG	2	8	24105	24112	0 %	0 %	75 %	25 %	257372920
541	NC_013201	TCC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372920
542	NC_013201	TCG	2	6	24124	24129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
543	NC_013201	TCC	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372920
544	NC_013201	CGG	2	6	24207	24212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372920
545	NC_013201	CGA	2	6	24213	24218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372920
546	NC_013201	GC	3	6	24227	24232	0 %	0 %	50 %	50 %	257372920
547	NC_013201	GAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372920
548	NC_013201	GCC	3	9	24292	24300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
549	NC_013201	GCC	2	6	24304	24309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
550	NC_013201	GCT	2	6	24321	24326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
551	NC_013201	CGT	3	9	24360	24368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
552	NC_013201	CTA	2	6	24438	24443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372920
553	NC_013201	CCCG	2	8	24457	24464	0 %	0 %	25 %	75 %	257372920
554	NC_013201	TCG	2	6	24473	24478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
555	NC_013201	CTT	2	6	24483	24488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372920
556	NC_013201	GTC	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
557	NC_013201	CAGC	2	8	24513	24520	25 %	0 %	25 %	50 %	257372920
558	NC_013201	GTC	2	6	24532	24537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
559	NC_013201	TG	3	6	24568	24573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013201	G	6	6	24590	24595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013201	CCG	2	6	24655	24660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_013201	GTC	2	6	24745	24750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
563	NC_013201	CGA	2	6	24757	24762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
564	NC_013201	CGA	3	9	24804	24812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
565	NC_013201	TCGA	2	8	24833	24840	25 %	25 %	25 %	25 %	257372921
566	NC_013201	GAC	2	6	24859	24864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
567	NC_013201	GATC	2	8	24879	24886	25 %	25 %	25 %	25 %	257372921
568	NC_013201	ACG	3	9	24890	24898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
569	NC_013201	GCG	2	6	24918	24923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372921
570	NC_013201	CGT	2	6	24945	24950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
571	NC_013201	CGA	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
572	NC_013201	CAGC	2	8	24972	24979	25 %	0 %	25 %	50 %	257372921
573	NC_013201	TCG	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
574	NC_013201	GCT	2	6	24999	25004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
575	NC_013201	CGA	2	6	25035	25040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
576	NC_013201	TCG	3	9	25064	25072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
577	NC_013201	CGAC	2	8	25140	25147	25 %	0 %	25 %	50 %	257372921
578	NC_013201	TCG	3	9	25148	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
579	NC_013201	CGG	2	6	25194	25199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372921
580	NC_013201	GTCG	2	8	25222	25229	0 %	25 %	50 %	25 %	257372921
581	NC_013201	CTC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372921
582	NC_013201	GTA	2	6	25252	25257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372921
583	NC_013201	GTCG	2	8	25344	25351	0 %	25 %	50 %	25 %	257372921
584	NC_013201	TCG	2	6	25355	25360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
585	NC_013201	CGC	2	6	25368	25373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372921
586	NC_013201	GTGACG	2	12	25391	25402	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257372921
587	NC_013201	GGTCCG	2	12	25420	25431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257372921
588	NC_013201	TCG	2	6	25439	25444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
589	NC_013201	GC	3	6	25452	25457	0 %	0 %	50 %	50 %	257372921
590	NC_013201	CGC	3	9	25455	25463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372921
591	NC_013201	CGT	2	6	25492	25497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
592	NC_013201	TCGT	2	8	25562	25569	0 %	50 %	25 %	25 %	257372921
593	NC_013201	CGTC	2	8	25584	25591	0 %	25 %	25 %	50 %	257372921
594	NC_013201	CGA	3	9	25614	25622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
595	NC_013201	GGC	2	6	25633	25638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372921
596	NC_013201	AGG	2	6	25640	25645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372921
597	NC_013201	TG	3	6	25732	25737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013201	CGAC	2	8	25796	25803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_013201	CTT	2	6	25958	25963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013201	GGA	2	6	25965	25970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013201	GTG	2	6	26013	26018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372922
602	NC_013201	CGG	2	6	26042	26047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372922
603	NC_013201	GCG	2	6	26085	26090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372922
604	NC_013201	CAC	2	6	26095	26100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372922
605	NC_013201	CGA	2	6	26123	26128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372922
606	NC_013201	TCG	2	6	26137	26142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372922
607	NC_013201	GGT	2	6	26168	26173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372922
608	NC_013201	CGAG	2	8	26192	26199	25 %	0 %	50 %	25 %	257372922
609	NC_013201	TCG	2	6	26227	26232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372922
610	NC_013201	CGA	2	6	26236	26241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372922
611	NC_013201	CG	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	257372922
612	NC_013201	CGG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372922
613	NC_013201	CCGA	2	8	26357	26364	25 %	0 %	25 %	50 %	257372922
614	NC_013201	CCG	2	6	26389	26394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372922
615	NC_013201	GAGC	2	8	26469	26476	25 %	0 %	50 %	25 %	257372922
616	NC_013201	CGT	3	9	26483	26491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372922
617	NC_013201	TGG	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372922
618	NC_013201	TCG	2	6	26536	26541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372922
619	NC_013201	GA	3	6	26554	26559	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
620	NC_013201	CGT	3	9	26570	26578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372922
621	NC_013201	AG	3	6	26619	26624	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
622	NC_013201	CGA	2	6	26656	26661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372923
623	NC_013201	CCG	2	6	26671	26676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372923
624	NC_013201	TCG	2	6	26682	26687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
625	NC_013201	CCG	2	6	26688	26693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372923
626	NC_013201	TCG	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
627	NC_013201	GCC	2	6	26732	26737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372923
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754	NC_013201	CGT	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
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775	NC_013201	GAGAG	2	10	32437	32446	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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789	NC_013201	TCA	2	6	33728	33733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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