MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 5721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013201	CCG	2	6	179358	179363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373046
4502	NC_013201	CAG	2	6	179411	179416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373046
4503	NC_013201	CAC	2	6	179512	179517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373046
4504	NC_013201	AGC	2	6	179520	179525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373046
4505	NC_013201	CGA	2	6	179527	179532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373046
4506	NC_013201	GAC	2	6	179540	179545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373046
4507	NC_013201	AG	3	6	179561	179566	50 %	0 %	50 %	0 %	257373046
4508	NC_013201	GACA	2	8	179585	179592	50 %	0 %	25 %	25 %	257373046
4509	NC_013201	GCC	2	6	179607	179612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373047
4510	NC_013201	CCG	2	6	179630	179635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373047
4511	NC_013201	ATG	2	6	179644	179649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373047
4512	NC_013201	CCAG	2	8	179705	179712	25 %	0 %	25 %	50 %	257373047
4513	NC_013201	CCA	2	6	179750	179755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373047
4514	NC_013201	ACACC	2	10	179797	179806	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4515	NC_013201	TC	3	6	179827	179832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_013201	CTG	2	6	179902	179907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013201	T	6	6	179938	179943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013201	CT	3	6	179944	179949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_013201	CGG	2	6	179983	179988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373048
4520	NC_013201	CTC	2	6	179999	180004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373048
4521	NC_013201	CTCG	2	8	180013	180020	0 %	25 %	25 %	50 %	257373048
4522	NC_013201	CGC	2	6	180022	180027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373048
4523	NC_013201	TCG	2	6	180069	180074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4524	NC_013201	CGA	2	6	180079	180084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4525	NC_013201	CGA	2	6	180088	180093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4526	NC_013201	CGA	2	6	180136	180141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4527	NC_013201	CAG	2	6	180179	180184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4528	NC_013201	TCGG	3	12	180198	180209	0 %	25 %	50 %	25 %	257373048
4529	NC_013201	CAG	2	6	180221	180226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4530	NC_013201	ACT	2	6	180285	180290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257373048
4531	NC_013201	CTA	2	6	180370	180375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257373048
4532	NC_013201	TCG	2	6	180420	180425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4533	NC_013201	GACA	2	8	180433	180440	50 %	0 %	25 %	25 %	257373048
4534	NC_013201	CGG	2	6	180460	180465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373048
4535	NC_013201	GTCG	2	8	180496	180503	0 %	25 %	50 %	25 %	257373048
4536	NC_013201	TCG	2	6	180510	180515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4537	NC_013201	GAA	2	6	180518	180523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257373048
4538	NC_013201	GTC	2	6	180584	180589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4539	NC_013201	TCGA	2	8	180632	180639	25 %	25 %	25 %	25 %	257373048
4540	NC_013201	AGC	2	6	180648	180653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4541	NC_013201	CCG	2	6	180708	180713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373048
4542	NC_013201	CCA	2	6	180723	180728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373048
4543	NC_013201	CGA	2	6	180733	180738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4544	NC_013201	TCGC	2	8	180750	180757	0 %	25 %	25 %	50 %	257373048
4545	NC_013201	CAGG	2	8	180761	180768	25 %	0 %	50 %	25 %	257373048
4546	NC_013201	GAC	2	6	180769	180774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4547	NC_013201	GAG	2	6	180818	180823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373048
4548	NC_013201	CGA	2	6	180838	180843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4549	NC_013201	CGAG	2	8	180855	180862	25 %	0 %	50 %	25 %	257373048
4550	NC_013201	CCG	4	12	180894	180905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373048
4551	NC_013201	GTC	2	6	180937	180942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4552	NC_013201	CGT	2	6	180949	180954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4553	NC_013201	CGA	2	6	180994	180999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4554	NC_013201	GCC	2	6	181067	181072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373048
4555	NC_013201	CGT	2	6	181102	181107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4556	NC_013201	CA	3	6	181144	181149	50 %	0 %	0 %	50 %	257373048
4557	NC_013201	GAG	2	6	181163	181168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373048
4558	NC_013201	GAG	2	6	181175	181180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373048
4559	NC_013201	TCG	2	6	181287	181292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4560	NC_013201	CGT	2	6	181294	181299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4561	NC_013201	CGAC	2	8	181338	181345	25 %	0 %	25 %	50 %	257373048
4562	NC_013201	GGC	2	6	181351	181356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373048
4563	NC_013201	TGG	2	6	181380	181385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373048
4564	NC_013201	TCG	2	6	181392	181397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4565	NC_013201	CGA	2	6	181417	181422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373048
4566	NC_013201	CGG	2	6	181485	181490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373048
4567	NC_013201	GTG	2	6	181533	181538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013201	ACC	2	6	181603	181608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_013201	GCGCGT	2	12	181620	181631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_013201	CAC	2	6	181707	181712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_013201	ACGG	2	8	181798	181805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_013201	GTT	2	6	181857	181862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013201	GCCA	2	8	181888	181895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_013201	CCG	2	6	181904	181909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_013201	ACG	2	6	181940	181945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_013201	TCG	3	9	181970	181978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_013201	ACC	2	6	181991	181996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_013201	CAG	2	6	182002	182007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013201	CTA	2	6	182033	182038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_013201	CGT	2	6	182070	182075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_013201	CTG	2	6	182119	182124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_013201	CGA	2	6	182130	182135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013201	GCC	2	6	182146	182151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_013201	CGC	2	6	182177	182182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_013201	GACG	2	8	182185	182192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_013201	GCTG	2	8	182208	182215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_013201	CCAG	2	8	182232	182239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_013201	GAC	2	6	182262	182267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_013201	GTCG	2	8	182286	182293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_013201	CGCGA	2	10	182301	182310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4591	NC_013201	TGG	2	6	182342	182347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013201	CGA	2	6	182358	182363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_013201	CGA	2	6	182373	182378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_013201	GGC	2	6	182412	182417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013201	GACC	2	8	182436	182443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_013201	GAG	2	6	182479	182484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013201	CGA	2	6	182502	182507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_013201	TCCTC	2	10	182531	182540	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4599	NC_013201	GAG	2	6	182554	182559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013201	TAC	2	6	182560	182565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_013201	GCG	2	6	182591	182596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_013201	GAA	2	6	182605	182610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013201	CCG	2	6	182622	182627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_013201	TAC	2	6	182644	182649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013201	C	6	6	182666	182671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4606	NC_013201	CGA	3	9	182676	182684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013201	GGT	2	6	182691	182696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_013201	ACGAC	2	10	182717	182726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_013201	CAG	2	6	182812	182817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013201	CTGG	2	8	182830	182837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_013201	CCG	2	6	182853	182858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_013201	CGA	2	6	182878	182883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013201	TCC	2	6	182916	182921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_013201	CGG	2	6	182923	182928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_013201	GGC	2	6	183010	183015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373049
4616	NC_013201	TCG	2	6	183038	183043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373049
4617	NC_013201	TCG	2	6	183092	183097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373049
4618	NC_013201	CT	3	6	183106	183111	0 %	50 %	0 %	50 %	257373049
4619	NC_013201	GCG	2	6	183121	183126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373049
4620	NC_013201	CGC	2	6	183165	183170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373049
4621	NC_013201	GAGC	2	8	183202	183209	25 %	0 %	50 %	25 %	257373049
4622	NC_013201	GCG	2	6	183230	183235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373049
4623	NC_013201	GTC	2	6	183239	183244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373049
4624	NC_013201	CGA	3	9	183261	183269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373049
4625	NC_013201	CGG	2	6	183285	183290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373049
4626	NC_013201	ACGTCG	2	12	183335	183346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257373049
4627	NC_013201	AGT	2	6	183353	183358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373049
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4739	NC_013201	GAGT	2	8	187360	187367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4740	NC_013201	TCG	2	6	187379	187384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4742	NC_013201	CGA	2	6	187409	187414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4743	NC_013201	CG	3	6	187419	187424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4744	NC_013201	ACGTG	2	10	187426	187435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4989	NC_013201	CGG	2	6	195839	195844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373061
4990	NC_013201	CGGCC	2	10	195855	195864	0 %	0 %	40 %	60 %	257373061
4991	NC_013201	AGG	2	6	195893	195898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373061
4992	NC_013201	CGG	2	6	195909	195914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373061
4993	NC_013201	GGC	2	6	195942	195947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373061
4994	NC_013201	TCC	2	6	195977	195982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373061
4995	NC_013201	GAC	2	6	195985	195990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373061
4996	NC_013201	ACC	2	6	196036	196041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373061
4997	NC_013201	CGACGC	2	12	196071	196082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257373061
4998	NC_013201	GCC	2	6	196105	196110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373061
4999	NC_013201	AGC	2	6	196112	196117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373061
5000	NC_013201	GAG	2	6	196135	196140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373061

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